条目-*607182-FYVE和线圈-线圈域包含1;财务报告1-OMIM公司
 
*607182

FYVE和包含1的线圈-线圈域;财务报告1


HGNC批准的基因符号:财务报告1

细胞遗传学位置:第21.31页   基因组坐标(GRCh38):3:45,917,903-45,995,824 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
第21.31页 白内障18,常染色体隐性遗传 610019 应收账

文本

克隆和表达

Kiss等人(2002年)构建了一个涵盖3p21.3上3号染色体共同消除区1(C3CER1)1.4 Mb的全面转录图,3p上的染色体缺失通常会丢失,几乎所有类型的实体肿瘤都会出现这种缺失。在该区域内,他们鉴定了4个新基因,包括FYCO1。该cDNA长8500 bp,开放阅读框(ORF)为4434 bp,编码推导出的1478氨基酸蛋白,预测分子量为167 kD。Northern blot分析显示8.5 kb转录本,主要在心脏和骨骼肌中表达。FYCO1蛋白预计包含一个FYVE锌指结构域、一个参与Ras-like GTPase信号传导的RUN结构域和多个线圈结构域。STRL33基因(605163)定位于FYCO1基因的第14个内含子内,具有反平行转录方向。

Chen等人(2011)注意到FYCO1的C末端区域包含高尔基动力学(GOLD)域和连接FYVE和GOLD域的非结构化环路区域。他们证明了Fyco1在小鼠胚胎和成年晶状体中的表达,在出生后第12天达到峰值。


基因结构

Kiss等人(2002年)确定FYCO1基因由18个外显子组成,基因组大小为77.8 kb,具有典型的其他人类基因结构,第一内含子较大(10.7 kb)。


映射

通过序列分析,Kiss等人(2002年)将FYCO1基因映射到染色体3p21.3上的C3CER1。


基因功能

Raiborg等人(2015)在突出的人和大鼠细胞系中显示(610243)是一种促进突起和神经突起生长的内质网(ER)蛋白,通过同时检测小GTPase RAB7与晚期内体(LE)形成接触位点(602298)磷脂酰肌醇3-磷酸。这些接触位点介导微管运动驱动蛋白-1的转移(参见148760)从突出到LEs上的电机适配器FYCO1。重复的LE-ER接触促进了LEs向细胞外周的微管依赖性移位,并随后促进了突触素VII(SYT7;604146)-与质膜的依赖性融合。这种融合诱导突起和神经突起的生长,这需要突起蛋白和FYCO1与LEs和驱动蛋白-1相互作用的能力。Raiborg等人(2015)结论是,含有突起的ER-LE接触位点是驱动蛋白-1加载到LEs上的平台,而驱动蛋白1介导的LEs向质膜的移位,在反复ER接触的推动下,促进突起和突起生长。


分子遗传学

来自12个无血缘关系的巴基斯坦先天性白内障家族的受累个体,染色体3p22-p21定位(CTRCT18;610019),Chen等人(2011)鉴定了候选基因FYCO1中突变的纯合性(参见例如。,607182.0001-607182.0005)这些基因在每个家族中与疾病分离,在300条不相关的种族匹配的控制染色体中没有发现。他们还在一个患有先天性白内障的阿拉伯-以色列血亲家庭的一名受累成员身上发现了一个纯合子FYCO1突变,该突变定位于染色体3p(607182.0006).Chen等人(2011)注意到大多数已鉴定的突变截断了蛋白质,并预测在GOLD结构域形成之前会导致肽链终止,从而导致活性丧失。


ALLELIC变体( 6精选示例):

.0001 CATARACT 18,自体移植

FYCO1,GLN349TER公司
   RCV000023620型

先天性核性白内障(CTRCT18;610019),Chen等人(2011)确定FYCO1基因第8外显子1045C-T转换的纯合子,导致gln349-to-ter(Q349X)替换。该突变与家族中的疾病分离,在300条不相关的种族匹配的控制染色体中未发现。


.0002 CATARACT 18,自体移植

巴基斯坦3个有先天性白内障血缘家族的患者(CTRCT18;610019),Chen等人(2011)确定FYCO1基因第8外显子2206C-T转换的纯合子,导致gln736-to-ter(Q736X)替代。该突变在每个家族中与疾病分离,在300条不相关的种族匹配的控制染色体中未发现。


.0003 CATARACT 18,自体移植

在患有先天性白内障2型(CATC2)的巴基斯坦血亲家庭的受累成员中;610019),Chen等人(2011)确定FYCO1基因(3150+1G-T)保守内含子9供体剪接位点中G-T颠倒的纯合性,预测将消除剪接位点。该突变与家族中的疾病分离,在300条不相关的种族匹配的控制染色体中未发现。


.0004 CATARACT 18,自体移植

第一财季,5个碱基重复,3858GGAAT
   RCV000023623型

巴基斯坦2个有先天性白内障(CTRCT18;610019),Chen等人(2011)确定FYCO1基因第14外显子中5 bp重复(3858dupGGAAT)的纯合子,导致移码,并预测会导致下游提前终止密码子37氨基酸。该突变在两个家族中都与疾病分离,在300条不相关的种族匹配的控制染色体中没有发现。这两个家族共有一个共同的14-SNP基因内单倍型,表明突变等位基因来自共同的祖先。


0.0005白内障18,常染色体隐性遗传

巴基斯坦2个有先天性白内障(CTRCT18;610019),Chen等人(2011)确定了FYCO1基因外显子16中4127T-C转换的纯合性,导致GOLD结构域内保守残基处的leu1376到pro(L1376P)取代。该突变在两个家族中都与疾病分离,在300条不相关的种族匹配的控制染色体中没有发现。这两个家族共有一个共同的14-SNP基因内单倍型,表明突变等位基因来自共同的祖先。


.0006 CATARACT 18,自体移植

FYCO1,GLN516TER公司
   RCV000023625型

在一个阿拉伯-以色列血缘家族中患有先天性白内障的患者中(CTRCT18;610019),最初研究者Pras等人(2001年)(“家族1”),Chen等人(2011)确定FYCO1基因第8外显子1546C-T转换的纯合子,导致gln516-to-ter(Q516X)替代。


参考文献

  1. Chen,J.、Ma,Z.、Jiao,X.、Fariss,R.、Kantorow,W.L.、Katorow,M.、Pras,E.、Frydman,M.,Pras。FYCO1突变导致常染色体隐性遗传先天性白内障。Am.J.Hum.遗传学。88: 827-838, 2011.[公共医学:21636066,图像,相关引文][全文]

  2. Kiss,H.、Yang,Y.、Kiss,C.、Andersson,K.、Klein,G.、Imreh,S.、Dumanski,J.P。3p21.3中共同消除区域1(C3CER1)的转录图谱。欧洲。J.Hum.遗传学。10: 52-61, 2002.[公共医学:11896456,相关引文][全文]

  3. 普拉斯,E.,普拉斯,E..,巴坎,T.,列维尼森鲍姆,E.,拉哈特,H.,阿西娅,E.I.,加佐齐,H.J.,卡斯特纳,D.L.,戈德曼,B.,Frydman,M。一个导致常染色体隐性白内障的基因映射到3号染色体的短臂。以色列。医学协会杂志3:559-5622001。[公共医学:11519376,相关引文]

  4. Raiborg,C.,Wenzel,E.M.,Pedersen,N.M.,Olsvik,H.,Schink,K.O.,Schultz,S.W.,Vietri,M.,Nisi,V.,Bucci,C.,Brech,A.,Johansen,T.,Stenmark,H。ER-内体反复接触促进内体易位和神经突起生长。《自然》520:234-2382015。[公共医学:25855459,相关引文][全文]


Ada Hamosh-更新时间:2015年7月6日
Marla J.F.O'Neill-更新时间:2013年6月13日
Marla J.F.O'Neill-更新日期:8/12/2011
创建日期:
迈克尔·彼得森:2002年8月28日
脱发:2015年6月7日
阿洛佩兹:2015年7月6日
卡罗尔:2013年6月13日
wwang:2011年8月18日
毛圈布:2011年8月12日
cwells:2002年8月28日

*607182

FYVE和包含1的线圈-线圈域;财务报告1


HGNC批准的基因符号:FYCO1

细胞遗传学位置:3p21.31   基因组坐标(GRCh38):3:45917903-45995824 (来自NCBI)


基因-表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
第21.31页 白内障18,常染色体隐性遗传 610019 常染色体隐性

文本

克隆和表达

Kiss等人(2002年)构建了一个全面的转录图,覆盖了3p21.3上染色体3共同消除区1(C3CER1)的1.4 Mb,在几乎所有类型的实体肿瘤中,3p上的染色体缺失通常会丢失。在该区域内,他们鉴定了4个新基因,包括FYCO1。该cDNA长8500 bp,开放阅读框(ORF)为4434 bp,编码推导出的1478氨基酸蛋白,预测分子量为167 kD。Northern blot分析显示8.5 kb转录本,主要在心脏和骨骼肌中表达。FYCO1蛋白预计包含一个FYVE锌指结构域、一个参与Ras-like GTPase信号传导的RUN结构域和多个线圈结构域。STRL33基因(605163)定位于FYCO1基因的第14内含子内,具有反平行转录方向。

Chen等人(2011年)指出,FYCO1的C末端区域包含高尔基动力学(GOLD)域和连接FYVE和GOLD域的非结构化环路区域。他们证明了Fyco1在小鼠胚胎和成年晶状体中的表达,在出生后第12天达到峰值。


基因结构

Kiss等人(2002年)确定FYCO1基因由18个外显子组成,基因组大小为77.8 kb,具有典型的其他人类基因结构,第一内含子较大(10.7 kb)。


映射

通过序列分析,Kiss等人(2002)将FYCO1基因定位到染色体3p21.3上的C3CER1。


基因功能

Raiborg等人(2015年)在人类和大鼠细胞系中发现,通过同时检测小GTPase RAB7(602298)和磷脂酰肌醇3-磷酸,一种促进突起和神经突起生长的内质网蛋白(ER)与晚期内体(LE)形成接触位点。这些接触位点介导微管运动驱动蛋白-1(见148760)从突起蛋白转移到LEs上的运动适配器FYCO1。重复的LE-ER接触促进了LEs向细胞外周的微管依赖性移位,随后又促进了突触素VII(SYT7;604146)与质膜的依赖性融合。这种融合诱导突起和神经突起的生长,这需要突起蛋白和FYCO1与LEs和驱动蛋白-1相互作用的能力。Raiborg等人(2015年)的结论是,含有ER-LE的突起接触位点是驱动蛋白-1加载到LEs上的平台,而驱动蛋白1介导的LEs向质膜的移位,在反复ER接触的推动下,促进突起和神经突起的生长。


分子遗传学

Chen等人(2011年)在来自12个不相关的巴基斯坦近亲家族的患有先天性白内障且染色体3p22-p21定位为先天性白内障的患者中,确定了候选基因FYCO1突变的纯合子(例如,参见607182.0001-607182.00 05)这些基因在每个家族中与疾病分离,在300条不相关的种族匹配的控制染色体中没有发现。他们还在一个患有先天性白内障的阿拉伯-以色列血亲家庭的一名受累成员身上发现了一个纯合子FYCO1突变,其染色体定位为3p(607182.0006)。Chen等人(2011年)指出,大多数已鉴定的突变截断了蛋白质,并预计会在GOLD结构域形成之前导致肽链终止,从而导致活性丧失。


ALLELIC变体 6个精选示例):

.0001 CATARACT 18,自体移植

FYCO1,GLN349TER公司
单号:rs387906963,临床变量:RCV000023620

在患有先天性核性白内障(CTRCT18;610019)的巴基斯坦近亲家庭的受影响成员中,Chen等人(2011年)确定了FYCO1基因第8外显子1045C-T转变的纯合子,导致gln349-to-ter(Q349X)替代。该突变与家族中的疾病分离,在300条不相关的种族匹配的控制染色体中未发现。


.0002 CATARACT 18,自体移植

FYCO1、GLN736TER
单号:rs387906964,gnomAD:rs387906964,临床变量:RCV000023621

在患有先天性白内障(CTRCT18;610019)的3个巴基斯坦近亲家庭的受影响成员中,Chen等人(2011年)确定了FYCO1基因第8外显子中2206C-T转换的纯合子,导致gln736-to-ter(Q736X)替代。该突变在每个家族中与疾病分离,在300条不相关的种族匹配的对照染色体中没有发现。


.0003 CATARACT 18,自体移植

FYCO1、IVS9DS、G-T、+1
SNP:rs766522434,gnomAD:rs766522434,临床变量:RCV000599010,RCV001613393

在患有先天性白内障-2(CATC2;610019)的巴基斯坦近亲家族的受影响成员中,Chen等人(2011年)确定了FYCO1基因保守内含子9供体剪接位点(3150+1G-T)中G-T横截的纯合子,预测该剪接位点将被消除。该突变与家族中的疾病分离,在300条不相关的种族匹配的控制染色体中未发现。


.0004 CATARACT 18,自体移植

FYCO1、5-BP DUP、3858GGAAT
SNP:rs1240503246,gnomAD:rs1240503246,临床变量:RCV000023623

在患有先天性白内障的两个巴基斯坦近亲家族(CTRCT18;610019)的受影响成员中,Chen等人(2011年)确定了FYCO1基因第14外显子中5 bp重复(3858dupGGAAT)的纯合子,导致移码,并预测会导致下游提前终止密码子37氨基酸。该突变在两个家族中都与疾病分离,在300条不相关的种族匹配的控制染色体中没有发现。这两个家族共享一个共同的14-SNP基因内单倍型,这表明突变等位基因来自一个共同的祖先。


.0005 CATARACT 18,自体移植

第1财季,LEU1376PRO
单号:rs387906965,gnomAD:rs387906965,临床变量:RCV000023624

在患有先天性白内障的两个巴基斯坦近亲家族(CTRCT18;610019)的受影响成员中,Chen等人(2011年)确定了FYCO1基因第16外显子中4127T-C转变的纯合子,导致在GOLD域的保守残基处发生leu1376-to-pro(L1376P)替代。该突变在两个家族中都与疾病分离,在300条不相关的种族匹配的控制染色体中没有发现。这两个家族共有一个共同的14-SNP基因内单倍型,表明突变等位基因来自共同的祖先。


.0006 CATARACT 18,自体移植

FYCO1,GLN516TER公司
单号:rs387906966,临床变量:RCV000023625

在Pras等人(2001)(“家族1”)最初研究的一个患有先天性白内障的阿拉伯-以色列近亲家庭(CTRCT18;610019)的受影响成员中,Chen等人(2011)鉴定了FYCO1基因外显子8中1546C-T转变的纯合性,导致gln516到ter(Q516X)的取代。


参考文献

  1. Chen,J.、Ma,Z.、Jiao,X.、Fariss,R.、Kantorow,W.L.、Katorow,M.、Pras,E.、Frydman,M.,Pras。FYCO1基因突变导致常染色体隐性遗传性先天性白内障。Am.J.Hum.遗传学。88: 827-838, 2011.[公共医学:21636066][全文:https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2011.05.008]

  2. Kiss,H.、Yang,Y.、Kiss,C.、Andersson,K.、Klein,G.、Imreh,S.、Dumanski,J.P。3p21.3中共同消除区域1(C3CER1)的转录图谱。欧洲。J.Hum.遗传学。10: 52-61, 2002.[公共医学:11896456][全文:https://doi.org/10.1038/sj.ejhg.5200758]

  3. 普拉斯,E.,普拉斯,E..,巴坎,T.,列维尼森鲍姆,E.,拉哈特,H.,阿西娅,E.I.,加佐齐,H.J.,卡斯特纳,D.L.,戈德曼,B.,Frydman,M。一个导致常染色体隐性白内障的基因映射到3号染色体的短臂。以色列。医学协会杂志3:559-5622001。[公共医学:11519376]

  4. Raiborg,C.,Wenzel,E.M.,Pedersen,N.M.,Olsvik,H.,Schink,K.O.,Schultz,S.W.,Vietri,M.,Nisi,V.,Bucci,C.,Brech,A.,Johansen,T.,Stenmark,H。ER-内体反复接触促进内体易位和神经突起生长。《自然》520:234-2382015。[公共医学:25855459][全文:https://doi.org/10.1038/nature14359]


贡献者:
Ada Hamosh-更新时间:2015年7月6日
Marla J.F.O'Neill-更新时间:2013年6月13日
Marla J.F.O'Neill-更新日期:8/12/2011

创建日期:
迈克尔·彼得森:2002年8月28日

编辑历史记录:
阿洛佩兹:2015年6月7日
脱发:2015年7月6日
卡罗尔:2013年6月13日
网址:2011年8月18日
特里:2011年8月12日
cwells:2002年8月28日