Kelter等人(2000年)使用cDNA行走策略,从胎脑和脊髓文库克隆了TFNR的重叠部分序列。推导出的2254氨基酸蛋白质的计算分子量为250 kD。从一个胎脑cDNA文库中分离的所有cDNA都缺少外显子15,导致796个氨基酸的截短蛋白。TFNR蛋白具有高度亲水性。它包含一个55个氨基酸的基序,由外显子17编码,重复为6个高度保守和3个不太保守的拷贝。它还包含一个二分核定位信号、一个DNA-连接酶A1 ATP依赖性(126391)结合位点和C末端的第二个二分核子定位信号。与编码545个氨基酸的小鼠Tfnr前11个外显子的序列比较表明,与人类Tfnr蛋白的同源性为77%。人类TFNR的300多个氨基酸片段与酵母TFC5蛋白(TFIIIB转录起始复合物的组成部分)的同源性为29%。Northern blot分析检测到所有检测组织中9.5-、3.1-和1.6-kb转录物的弱表达,而1.9-kb的转录物仅在大脑中表达。对来自多个脑区的mRNA的分析显示,小脑中9.5 kb和1.9 kb的信号较强,而其他所有脑区的信号较弱。胎儿和成人组织的Western blot分析显示5条谱带,范围为55至250kD。TFNR在HeLa细胞中的免疫荧光定位显示出点状核染色模式。
Schramm等人(2000年)还克隆了BDP1,他们称之为hB-double prime,并发现该蛋白具有几个潜在的磷酸化位点。Schramm等人(2000年)分离出2个变体,其中一个可能是剪接变体。另一个变体包含一个插入,导致用5种不同的氨基酸替换最后21个氨基酸。HeLa细胞的Western blot分析显示BDP1在160和250 kD左右出现条带。
Girotto等人(2013年)分析了出生后第5天小鼠内耳中Bdp1的表达,并观察到血管纹毛细血管、间充质衍生细胞和耳蜗管周围的细胞外基质(包括螺旋韧带和基底膜)中明确表达。免疫组织化学标记模式分析表明,Bdp1在血管纹内皮细胞中表达。
Kelter等人(2000年)确定TFNR基因包含32个外显子,跨度约为80kb。
通过FISH,Kelter等人(2000年)将TFNR基因映射到染色体5q13。对该区域的进一步分析表明,TFNR正好位于重复SMA1(253300)区域之外。对小鼠BAC克隆的测序显示,Tfnr和Serf1(603011)基因之间存在一个面对面的方向。
Schramm等人(2000年)通过在体外转录反应中使用抗BDP1抗体,确定了Ad2 VAI和人类U6(180692)RNA聚合酶III(pol III;见606007)启动子的转录需要BPD1。通过染色质免疫沉淀分析,他们还发现BDP1在体内与U6启动子区域结合,进一步表明BDP1是U6启动复合物的一部分。
使用酿酒酵母的交联实验,Hu等人(2015)验证了Bdp1 SANT结构域与Brf1的C末端(604902)相互作用,并在形成用于转录的pol III起始前复合物(PIC)中发挥作用。Hu等人(2015)还发现了另一个Brf1结合位点,称为Bdp1区域II,位于SANT域上游,其功能是与Brf1和pol III的C128亚基(614366)相互作用的结构域。功能分析表明,Bdp1区II参与了PIC形成后的蛋白质相互作用网络。其他研究表明,Bdp1区域II在pol III活性位点间隙中与Brf1和C128的N末端半部分以及C37的C末端结构域相互作用。
Gouge等人(2017)确定了人类转录因子IIIB(TFIIIB)复合体的晶体结构,并发现BDP1在TATA盒上游的DNA区域、TBP(600075)N末端箍筋和BRF2 C末端的高亲和力TBP结合位点(607023)之间的界面上相互作用。BDP1连接子是SANT结构域侧翼的N末端区域,跨越结合DNA的小凹槽,插入2个Brf2周期蛋白重复序列之间,从而在启动子开放中发挥作用。向BRF2-TBP-DNA复合物中添加BDP1对DNA的弯曲状态没有影响,但增加了复合物的估计寿命,导致与DNA结合的复合物极其稳定。功能研究表明,BDP1的N端和C端区域能够与上游因子SNAPc结合(参见600591),并且这些相互作用对于驱动pol III转录至关重要。作者提出,在pol III转录起始期间,BDP1可能通过涉及RNA pol III亚单位的变构机制,刺激从封闭PIC向开放PIC的转换。
在一个有舌后进行性感音神经性耳聋的近亲卡塔尔家族中,其染色体5q13定位为(DFNB112;618257),Girotto等人(2013)确定了BDP1基因中一个不间断突变的纯合子(X2625E;6070120001)。该突变与家族中的疾病完全分离,在66名卡塔尔对照中未发现,尽管在公共变异数据库中出现频率较低。