条目-*606731-氧化甾醇结合蛋白样蛋白2;操作系统业务流程2-OMIM公司
 
*606731

氧化甾醇结合蛋白样蛋白2;操作系统业务流程2


备选标题;符号

OSBP相关蛋白2;ORP2公司
KIAA0772号


HGNC批准的基因符号:操作系统业务流程2

细胞遗传学位置:2013年第20季度   基因组坐标(GRCh38):20:62,238,521-62,296,183 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
2013年第20季度 耳聋,常染色体显性67 616340 AD公司

文本

描述

OSBPL2是细胞内脂质受体OSBP家族的成员。有关OSBP的背景信息,请参阅OSBP2(606729).


克隆和表达

通过筛选可能编码大脑中表达的大蛋白的cDNA,长濑等人(1998)鉴定出一个编码OSBPL2的cDNA,他们称之为KIAA0772。KIAA0772编码推导出的468氨基酸蛋白质。RT-PCR分析检测到KIAA0772广泛但中度表达,在骨骼肌和肺中含量较低。

通过EST数据库搜索与OSBP同源的序列(167040),然后是RT-PCR,Laitine等人(1999年)鉴定了6种OSBP相关蛋白,包括OSBPL2,他们称之为ORP2。Northern blot分析显示主要4.4和2.8 kb转录物广泛表达,在大脑、心脏、肾脏、肝脏和胎盘中最为丰富。在骨骼肌和心肌中检测到6.6kb和1.2kb的转录物,在大脑中检测到少量6.0kb转录物。

Xu等人(2001)通过数据库检索和多轮cDNA文库筛选克隆出ORP2。ORP2编码一个推导出的468氨基酸蛋白质。荧光显微镜显示ORP2在高尔基体中表达,布雷费尔丁A处理导致其重新定位。

Lehto等人(2001年)用特异性引物进行RT-PCR分析,分离出编码ORP2的全长cDNA。序列分析预测,480-氨基酸蛋白包含约400个氨基酸的C末端固醇结合(SB)结构域,其中包括OSBP基序(EQVSHHPP)。ORP2没有N末端折叠同源(PH)结构域。它与OSBPL1B最为同源(606730),在其SB域中具有85%的身份。

Jaworski等人(2001年)克隆了多个OSBP,包括OSBPL2。RT-PCR分析检测到OSBPL2的普遍表达,在视网膜、视网膜色素上皮脉络膜、松果腺和培养的视网膜色素上皮细胞中表达最高。

使用RT-PCR,Xing等人(2015)发现Osbpl2在小鼠耳蜗和大脑中强烈表达,也在心脏、肝脏、脾脏、肺、肾和肌肉中表达。通过免疫组织化学分析,他们发现Osbpl2定位于小鼠耳蜗的血管纹、螺旋神经节、螺旋韧带、内毛细胞和外毛细胞。通过免疫组化分析,Thoenes等人(2015)发现Osbpl2在P20和6月龄小鼠耳蜗内外毛细胞的静纤毛中显著表达。


基因功能

使用酵母补体分析,Xu等人(2001)显示ORP2过度表达导致细胞生长停止。结合分析显示ORP2与磷脂酸的结合最强,与心磷脂和磷脂酰肌醇3-磷酸的结合较弱。


基因结构

通过序列分析,Lehto等人(2001年)确定OSBPL2基因包含14个外显子。Jaworski等人(2001年)发现它包含15个外显子。


映射

通过序列分析,Lehto等人(2001年)将OSBPL2基因定位到20号染色体。Jaworski等人(2001年)证实了20q染色体的定位。


分子遗传学

Xing等人(2015)研究了一个7代汉族大家族(JSNY-028)分离的常染色体显性非综合征性耳聋(DFNA67;616340)其中已排除已知DFNA基因的突变。通过对25个受影响的家族成员进行全基因组测序,他们确定了2 bp缺失的杂合性(c.153_154delCT;606731.0001)对应于OSBPL2基因第3外显子中的第51/52密码子。他们还研究了26名未受影响的家庭成员,发现突变与疾病完全分离。根据dbSNP(构建135)、1000基因组项目、HapMap和YanHuang数据库筛选突变。Xing等人(2015)然后从无关的常染色体显性非综合征性耳聋家系中筛选出452名散发患者和38名先证者,并在OSBPL2基因第7外显子中鉴定出错义变异体(c.583C-a;L195M)。在300名对照中未发现这种突变;然而,没有家庭成员可用于分离分析。

利用全基因组连锁分析和全基因组测序对一个分离出常染色体显性感音神经性耳聋的德国家系进行研究,Thoenes等人(2015)鉴定出杂合2-bp缺失(c.141_142delTG;606731.0002)在OSBPL2基因中。在1000基因组项目(构建20110521)或Exome Variant Server(ESP6500)数据库中未发现与表型分离的突变。


历史

通过辐射混合分析,长濑等人(1998)将OSBPL2基因定位到9号染色体。


ALLELIC变体( 2精选示例):

.0001失聪,自动控制67

OSBPL2,2-BP DEL,153CT
   RCV000170349型

通过对一个非综合征性听力损失(DFNA67;616340),Xing等人(2015)在OSBPL2基因第3外显子中发现了杂合2-bp缺失(c.153_154delCT,NM_144498.2)。该缺失将导致残基52后的移码,如果被翻译,将从密码子52到151产生99个新氨基酸,并在密码子152处终止翻译(Gln53ArgfsTer100)。在300名种族匹配的对照组中未发现与该家族疾病分离的突变。根据dbSNP(构建135)、1000基因组项目、HapMap和YanHuang数据库筛选突变。对正常和预测突变的OSBPL2蛋白结构的比较表明,突变可能破坏OSBP-相关结构域,该结构域被认为对配体结合至关重要。


.0002失聪,自动控制67

OSBPL2、2-BP DEL、141TG
   RCV000170350型

通过全基因组连锁分析,然后对一个患有常染色体显性非综合征性听力损失的6代德国家庭的受影响成员进行全外显子组测序(DFNA67;616340),Thoenes等人(2015)在OSBPL2基因中发现了杂合2-bp缺失(c.141_142delTG,NM_144498.2)。该突变预计会导致移码和提前终止(Arg50AlafsTer103)。该缺失与家族中的表型分离,在dbSNP(构建135)、1000基因组项目(构建20110521)或Exome Variant Server(ESP6500)数据库中不存在。


参考文献

  1. 贾沃斯基,C.J.,莫雷拉,E.,李,A.,李,R.,罗德里格斯,I.R。一个包含氧甾醇结合域的12个人类基因家族。基因组学78:185-1962001。[公共医学:11735225,相关引文][全文]

  2. Laitine,S.、Olkkonen,V.M.、Ehnholm,C.、Ikonen和E。人类氧甾醇结合蛋白(OSBP)同源物家族:一个与脑甾醇代谢相关的新成员。《脂质研究杂志》40:2204-2211,1999年。[公共医学:10588946,相关引文][全文]

  3. Lehto,M.、Laitine,S.、Chinetti,G.、Johansson,M.和Ehnholm,C.、Staels,B.、Ikonen,E.、Olkkonen和V.M。人类OSBP相关蛋白家族。《脂质研究杂志》42:1203-12132001。[公共医学:11483621,相关引文][全文]

  4. Nagase,T.、Ishikawa,K.、Suyama,M.、Kikuno,R.、Miyajima,N.、Tanaka,A.、Kotani,H.、Nomura,N.、Ohara,O。未知人类基因编码序列的预测。十一、。来自大脑的100个新cDNA克隆的完整序列,这些克隆在体外编码大蛋白。DNA研究5:277-2861998年。[公共医学:9872452,相关引文][全文]

  5. Thoenes,M.、Zimmermann,U.、Ebermann,I.、Ptok,M.,Lewis,M.A.、Thiele,H.、Morlot,S.、Hess,M.M.、Gal,A.、Eisenberger,T.、Bergmann,C.、Nurnberg,G.、Nurnberg,P.、Steel,K.P.、Knipper,M.和Bolz,H.J。OSBPL2编码一种内外毛细胞静纤毛蛋白,在常染色体显性聋(DFNA67)中发生突变。孤儿J.罕见疾病。10: 15, 2015. 注:电子文章。[公共医学:25759012,图像,相关引文][全文]

  6. Xing,G.,Yao,J.,Wu,B.,Liu,T.,Wei,Q.,刘,C.,Lu,Y.,Chen,Z.,Zheng,H.,Yang,X.,Cao,X。通过全基因组测序鉴定OSBPL2作为进展性非综合征性聋的新候选基因。遗传学。医学17:210-2182015。[公共医学:25077649,相关引文][全文]

  7. Xu,Y.,Liu,Y..,Ridgway,N.D.,McMaster,C.R。人类氧甾醇结合蛋白家族的新成员结合磷脂并调节囊泡运输。生物学杂志。化学。276: 18407-18414, 2001.[公共医学:11279184,相关引文][全文]


贡献者:
Joanna S.Amberger-更新日期:2015年4月29日
创建日期:
保罗·匡威:2002年2月28日
卡罗尔:2015年4月30日
mcolton:2015年4月30日
卡罗尔:2015年4月30日
乔安娜:2015年4月30日
乔安娜:2015年4月29日
mgross:2002年2月28日

*606731

氧化甾醇结合蛋白样蛋白2;操作系统业务流程2


备选标题;符号

OSBP相关蛋白2;ORP2号机组
KIAA0772号


HGNC批准的基因符号:OSBPL2

细胞遗传学位置:20q13.33   基因组坐标(GRCh38):20:62238521-62296183 (来自NCBI)


基因-表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
2013年第20季度 耳聋,常染色体显性67 616340 常染色体显性

文本

描述

OSBPL2是细胞内脂质受体OSBP家族的成员。有关OSBP的背景信息,请参阅OSBP2(606729)。


克隆和表达

通过筛选可能编码大脑中表达的大蛋白的cDNA,Nagase等人(1998年)确定了一个编码OSBPL2的cDNA(他们称之为KIAA0772)。KIAA0772编码推导出的468氨基酸蛋白质。RT-PCR分析检测到KIAA0772的广泛但中度表达,在骨骼肌和肺中的表达水平较低。

通过EST数据库搜索与OSBP(167040)同源的序列,然后进行RT-PCR,Laitinen等人(1999)鉴定出6种OSBP相关蛋白,包括OSBPL2,他们称之为ORP2。Northern blot分析显示主要4.4和2.8 kb转录物广泛表达,在大脑、心脏、肾脏、肝脏和胎盘中最为丰富。在骨骼肌和心肌中,检测到6.6-kb和1.2-kb的转录物,在大脑中,检测到少量6.0-kb的转录物。

Xu等人(2001)通过数据库搜索和多轮cDNA文库筛选克隆了ORP2。ORP2编码一个推导出的468氨基酸蛋白质。荧光显微镜显示ORP2在高尔基体中表达,布雷费尔丁A处理导致其重新定位。

Lehto等人(2001年)使用特定引物进行RT-PCR分析,分离出编码ORP2的全长cDNA。序列分析预测,480-氨基酸蛋白包含约400个氨基酸的C末端固醇结合(SB)结构域,其中包括OSBP基序(EQVSHHPP)。ORP2没有N末端折叠同源(PH)结构域。它与OSBPL1B(606730)最为同源,在其SB域中具有85%的同源性。

Jaworski等人(2001年)克隆了多个OSBP,包括OSBPL2。RT-PCR分析检测到OSBPL2的普遍表达,在视网膜、视网膜色素上皮脉络膜、松果腺和培养的视网膜色素上皮细胞中表达最高。

Xing等人(2015)使用RT-PCR发现Osbpl2在小鼠耳蜗和大脑中强烈表达,在心脏、肝脏、脾脏、肺、肾脏和肌肉中也表达。通过免疫组织化学分析,他们发现Osbpl2定位于小鼠耳蜗的血管纹、螺旋神经节、螺旋韧带、内毛细胞和外毛细胞。通过免疫组织化学分析,Thoenes等人(2015)发现,Osbpl2在P20和6月龄小鼠耳蜗内外毛细胞的静纤毛中显著表达。


基因功能

Xu等人(2001年)使用酵母互补分析表明,ORP2过度表达会导致细胞生长停止。结合分析显示,ORP2与磷脂酸的结合最强,与心磷脂和磷脂酰肌醇3-磷酸的结合较弱。


基因结构

通过序列分析,Lehto等人(2001年)确定OSBPL2基因包含14个外显子。Jaworski等人(2001年)发现它包含15个外显子。


映射

通过序列分析,Lehto等人(2001年)将OSBPL2基因映射到第20号染色体。Jaworski等人(2001)确认了20q染色体上的定位。


分子遗传学

Xing等人(2015)研究了一个分离常染色体显性非综合征性聋(DFNA67;616340)的7代汉族大家族(JSNY-028),其中排除了已知DFNA基因的突变。通过对25个受影响的家族成员进行全基因组测序,他们确定了与OSBPL2基因第3外显子51/52密码子相对应的2-bp缺失杂合性(c.153_154delCT;606731.0001)。他们还研究了26名未受影响的家庭成员,发现突变与疾病完全分离。根据dbSNP(构建135)、1000基因组项目、HapMap和YanHuang数据库筛选突变。Xing等人(2015年)随后从无关常染色体显性非综合征性耳聋家系中筛选了452名散发患者和38名先证者,并在OSBPL2基因第7外显子中鉴定了错义变异体(c.583C-a;L195M)。在300名对照中未发现这种突变;然而,没有家庭成员可用于分离分析。

Thoenes等人(2015年)利用全基因组连锁分析和全基因组测序对一个分离出常染色体显性感音神经性耳聋的德国家系进行了研究,发现OSBPL2基因中存在杂合2-bp缺失(c.141_142delTG;606731.002)。在1000基因组项目(构建20110521)或Exome Variant Server(ESP6500)数据库中未发现与表型分离的突变。


历史

通过辐射杂交分析,Nagase等人(1998年)将OSBPL2基因定位到9号染色体。


ALLELIC变体 2个选定示例):

.0001失聪,自动控制67

OSBPL2,2-BP DEL,153CT
单号:rs786205880,临床变量:RCV000170349

通过对一个患有非综合征性听力损失(DFNA67;616340)的7代汉族家庭(JSNY-028)的受累成员进行全基因组测序,Xing等人(2015)在OSBPL2基因外显子3中发现了一个杂合2-bp缺失(c.153_154delCT,NM_144498.2)。该缺失将导致残基52后的移码,如果被翻译,将从密码子52到151产生99个新氨基酸,并在密码子152处终止翻译(Gln53ArgfsTer100)。在300个种族匹配的对照中没有发现与该家族疾病分离的突变。根据dbSNP(构建135)、1000基因组项目、HapMap和YanHuang数据库筛选突变。对正常和预测突变的OSBPL2蛋白结构的比较表明,突变可能破坏OSBP-相关结构域,该结构域被认为对配体结合至关重要。


.0002耳聋,常染色体显性遗传67

OSBPL2、2-BP DEL、141TG
SNP:rs786205881,临床变量:RCV000170350

通过全基因组连锁分析,然后对一个患有常染色体显性非综合征性聋的6代德国家系的受累成员进行全基因组测序(DFNA67;616340),Thoenes等人(2015)在OSBPL2基因中发现了一个杂合2-bp缺失(c.141_142delTG,NM_144498.2)。该突变预计会导致移码和提前终止(Arg50AlafsTer103)。该缺失与家族中的表型分离,在dbSNP(构建135)、1000基因组项目(构建20110521)或Exome Variant Server(ESP6500)数据库中不存在。


参考文献

  1. 贾沃斯基,C.J.,莫雷拉,E.,李,A.,李,R.,罗德里格斯,I.R。一个包含氧甾醇结合域的12个人类基因家族。基因组学78:185-1962001。[公共医学:11735225][全文:https://doi.org/10.1006/geno.2001.6663]

  2. Laitine,S.、Olkkonen,V.M.、Ehnholm,C.、Ikonen和E。人类氧甾醇结合蛋白(OSBP)同源物家族:一个与脑甾醇代谢相关的新成员。《脂质研究杂志》第40期:2204-22111999年。[公共医学:10588946][全文:https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0022-2275(20)32095-2]

  3. Lehto,M.、Laitine,S.、Chinetti,G.、Johansson,M.和Ehnholm,C.、Staels,B.、Ikonen,E.、Olkkonen和V.M。人类OSBP相关蛋白家族。《脂质研究杂志》42:1203-12132001。[公共医学:11483621][全文:https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0022-2275(20)31570-4]

  4. 长濑,T.,石川庆,K.,杉山,M.,Kikuno,R.,宫岛,N.,田中,A.,Kotani,H.,野村,N。未知人类基因编码序列的预测。十一、。来自大脑的100个新cDNA克隆的完整序列,这些克隆在体外编码大蛋白。DNA研究5:277-2861998年。[公共医学:9872452][全文:https://doi.org/10.1093/dnares/5.5.277]

  5. Thoenes,M.、Zimmermann,U.、Ebermann,I.、Ptok,M.,Lewis,M.A.、Thiele,H.、Morlot,S.、Hess,M.M.、Gal,A.、Eisenberger,T.、Bergmann,C.、Nurnberg,G.、Nurnberg,P.、Steel,K.P.、Knipper,M.和Bolz,H.J。OSBPL2编码一种内外毛细胞静纤毛蛋白,在常染色体显性聋(DFNA67)中发生突变。孤儿J.罕见疾病。10: 15, 2015. 注:电子文章。[公共医学:25759012][全文:https://doi.org/10.1186/s13023-015-0238-5]

  6. Xing,G.,Yao,J.,Wu,B.,Liu,T.,Wei,Q.,刘,C.,Lu,Y.,Chen,Z.,Zheng,H.,Yang,X.,Cao,X。通过全基因组测序鉴定OSBPL2作为进展性非综合征性聋的新候选基因。遗传学。医学文献17:210-2182015。[公共医学:25077649][全文:https://doi.org/10.1038/gim.2014.90]

  7. Xu,Y.、Liu,Y.、Ridgway,N.D.、McMaster,C.R。人类氧甾醇结合蛋白家族的新成员结合磷脂并调节囊泡运输。生物学杂志。化学。276: 18407-18414, 2001.[公共医学:11279184][全文:https://doi.org/10.1074/jbc.M101204200]


贡献者:
Joanna S.Amberger-更新日期:2015年4月29日

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保罗·匡威:2002年2月28日

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卡罗尔:2015年4月30日
mcolton:2015年4月30日
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乔安娜:2015年4月29日
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