条目-*606440-立体声;STRC公司-OMIM公司
 
*606440

立体定向素;STRC公司


HGNC批准的基因符号:STRC公司

细胞遗传学位置:15季度15.3 基因组坐标(GRCh38):15:43,599,563-43,618,800 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
15季度15.3 耳聋,常染色体隐性遗传16 603720 应收账

文本

描述

STRC基因编码立体纤毛,立体纤毛是一种大型细胞外结构蛋白,存在于内耳外毛细胞的立体纤毛中。它与水平顶部连接件和顶盖膜附着冠有关,这对静睫状体尖端的正确内聚和定位很重要(Verpy等人,2001年; 汇总依据Francey等人,2012年).


克隆和表达

为了鉴定遗传性耳聋的突变基因,Verpy等人(2001)开发了一种基于内耳特异或优先表达基因鉴定的候选基因方法。他们鉴定了一个来自前庭文库的小鼠克隆,该文库与DFNB16基因座内来自15q15染色体区域的几个人类基因组克隆同源。人类STRC蛋白由1809个氨基酸组成,包含一个假定的信号肽和几个疏水片段。使用免疫组织标记,Verpy等人(2001)结果表明,在小鼠内耳中,立体纤毛蛋白仅在感觉毛细胞中表达,并与立体纤毛(形成声音刺激机械感受结构的硬微绒毛)相关。


基因结构

STRC基因包含29个外显子,约19kb,并且是串联复制的,第二个拷贝的编码序列被外显子20中的终止密码子中断(Verpy等人,2001年). 这两个拷贝位于端粒到着丝粒的方向,相距不到100kb。


映射

Verpy等人(2001)在DFNB16的候选区域内,在染色体15q15上鉴定了STRC基因。

假基因

STRC位于一个复杂的基因组区域,其特征是存在大量片段重复,其中包括一个STRC假基因,其编码序列为99.6%的保守序列(总结如下Francey等人,2012年).


分子遗传学

常染色体隐性聋16

在患有常染色体隐性遗传非综合征感音神经性耳聋-16(DFNB16;603720),Verpy等人(2001)在STRC基因中发现了一个纯合截断突变(606440.0001). 一个患有该疾病的法国家庭的受影响成员是移码突变的复合杂合子(606440.0002)和大量删除(606440.0003)在含有29个编码外显子的STRC基因拷贝中。

Francey等人(2012年)使用3种不同的基因分型阵列平台和Sanger测序分析659个GJB2(121011)突变阴性的感音神经性聋儿童先证者。利用阵列基因分型信息和测序数据,作者鉴定出17个STRC缺失,包括7个纯合缺失和9个杂合缺失;仅用2例患者的测序数据,他们鉴定出1例杂合缺失。在对点突变进行测序后,他们发现9个杂合缺失先证者中有6个携带STRC基因的新变体;其中4个变异体经亲本分析证实为反式等位基因。所有双等位基因STRC改变患者均有轻度至中度听力损失。研究结果表明,STRC可能是非综合征性感音神经性聋的常见病因。没有对缺失和变异进行功能研究。

在4名患有DFNB16的无关儿童中,Vona等人(2015)确定STRC基因的双等位基因改变。三名患者因基因缺失和假定致病点突变而为复合杂合子,1名患者因2个假定致病点变异而为复合混合子。未对变体进行功能研究。这些患者是从94名GJB2的较大队列中确定的(121011)/GJB6型(604418)-接受基因分析的感音神经性耳聋阴性患儿。Vona等人(2015)强调了STRC基因缺失和突变的技术检测、评估和解释方面的困难。

耳聋-无能综合征

Dgany等人(2002年)报道了一个法国家庭,其中一名56岁男性及其两个兄弟患有I型先天性红细胞生成障碍性贫血(CDA1;224120)弱畸胎精子症和非综合征性耳聋。他们确定了codanin基因(N598S;607465.0003)作为I型CDA的原因。Avidan等人(2003年)发现这3个同胞也是纯合子,在染色体15q15上有大约70-kb的缺失,这删除了整个立体纤毛基因并截断了CATSPER2基因(607249).Avidan等人(2003年)提示在非综合征性感音神经性耳聋中突变的功能性立体纤维素酶的缺乏和CATSPER2,一种只在精子中表达的电压门控阳离子通道,可以解释所观察到的耳聋和男性不育表型(611102)分别是。

在3个伊朗血亲家庭中,非综合征性耳聋和男性不育被隔离,Zhang等人(2007)在染色体15q15.3上发现一个约100-kb的缺失区域,涉及KIAA0377(610979)、CKMT1B(123290)、STRC和CATSPER2。这些家族没有相同的缺失,单倍型分析表明这些家族没有共同的祖先;作者指出,染色体15q15.3上的大量串联重复序列使其易于重排。Zhang等人(2007)指出,通过听力谱分析,这些家族的听力损失表型与DFNB16的表型相似,这表明STRC的缺失与他们的耳聋有因果关系。

Vona等人(2015)报告了3例感音神经性耳聋患者,包括2名男孩和1名女孩,发病时间为出生至儿童早期。所有人都有STRC和CATSPER2基因的纯合缺失。研究时,所有人都处于青春期前,未进行生育评估。一名男孩患有其他先天性异常和共病,这可能与耳聋无关。这些患者是从94名GJB2/GJB6阴性的感音神经性耳聋患儿中确定的,这些患儿接受了基因分析。


动物模型

Verpy等人(2008)检测到立体纤毛蛋白与水平顶端连接物相关,即连接外毛细胞发束内相邻立体纤毛的横向连接。作者发现,这些联系在进行性失聪的stereocilin-null突变小鼠中不存在。然而,在听力开始时,他们的耳蜗灵敏度和频率调谐几乎正常,尽管掩蔽大大减少,并且完全没有声波和电波失真。从这种独特的功能情况来看,Verpy等人(2008)结论是,耳蜗波形畸变的主要来源是由水平顶部连接器施加的约束而非机电换能器通道的固有非线性行为所导致的与偏转相关的发束刚度。


ALLELIC变体( 3精选示例):

0.0001耳聋,常染色体隐性遗传16

在患有常染色体隐性遗传非综合征感音神经性耳聋-16(DFNB16;603720),Verpy等人(2001)在STRC基因的第13外显子中发现了一个纯合1-bp插入(c.3157_3158insC)。该插入预计会导致19个框架外氨基酸的易位,并在外显子13的3214位产生下游提前终止密码子。


.0002耳聋,自动耳塞16

常染色体隐性遗传性耳聋16例(DFNB16;603720),Verpy等人(2001)已确定STRC基因中的复合杂合缺失:第5外显子(c.2171_2174delTTTG)中有一个4 bp的缺失是从父亲那里遗传来的,还有一个较大的缺失,包括第17至29外显子(606440.0003)从母亲那里继承的。据预测,4-bp的缺失将导致5个框架外氨基酸的翻译和外显子5第2185位下游提前终止密码子的翻译。作者在内含子7和内含子16的三素数末端之间定位了较大缺失的五素数边界,以及最三素数外显子下游的三素性边界,表明缺失至少从外显子17延伸到29。


.0003耳聋,自动耳塞16

STRC,EX17-29DEL公司
   加拿大皇家银行000004593

讨论常染色体隐性遗传非综合征感音神经性耳聋16(DFNB16;603720)由Verpy等人(2001),请参阅606440.0002.


参考文献

  1. Avidan,N.、Tamary,H.、Dgany,O.、Cattan,D.、Pariente,A.、Thulliez,M.、Borot,N.,Moati,L.、Bartheme,A.、Shalmon,L.,Krasnov,T.、Ben-Asher,E.和其他9人。人类常染色体非综合征男性不育基因CATSPER2。欧洲。J.Hum.遗传学。11: 497-502, 2003.[公共医学:12825070,相关引文][全文]

  2. Dgany,O.、Avidan,N.、Delaunay,J.、Krasnov,T.、Shalmon,L.、Shalev,H.、Eidelitz-Markus,T.,Kapelushnik,J.,Cattan,D.、Pariente,A.、Tulliez,M.、Cretien,A.和其他13人。先天性红细胞生成障碍性贫血I型是由可待因-1突变引起的。Am.J.Hum.遗传学。71: 1467-1474, 2002.[公共医学:12434312,图像,相关引文][全文]

  3. Francey,L.J.、Conlin,L.K.、Kadesch,H.E.、Clark,D.、Berrodin,D.、Sun,Y.、Glessner,J.、Hakonarson,H.、Jalas,C.、Landau,C.,Spinner,N.B.、Kenna,M.、Sagi,M.,Rehm,H.L.、Krantz,I.D。全基因组SNP基因分型确定了立体交叉素(STRC)基因是儿童双侧感音神经性听力损伤的主要原因。美国医学遗传学杂志。158A:298-3082012年。[公共医学:22147502,图像,相关引文][全文]

  4. Verpy,E.,Masmoudi,S.,Zwaenepoel,I.,Leibovic,M.,Hutchin,T.P.,Del Castillo,I。编码发束蛋白的新基因突变导致DFNB16基因座的非综合征性耳聋。自然遗传学。29: 345-349, 2001.[公共医学:11687802,相关引文][全文]

  5. Verpy,E.,Weil,D.,Leibovic,M.,Goodyear,R.J.,Hamard,G.,Houdon,C.,Lefevre,G.M.,Hardelin,J.-P.,Richardson,G.P.,Avan,P.,Petit,C。立体定向素缺乏小鼠揭示了耳蜗波形畸变的起源。《自然》456:255-2582008。[公共医学:18849963,图像,相关引文][全文]

  6. Vona,B.,Hofrichter,M.A.H.,Neuner,C.,Schroder,J.,Gehrig,A.,Hennermann,J.B.,Kraus,F.,Shehata-Dieler,W.,Klopocki,E.,Nanda,I.,Haaf,T。DFNB16是先天性听力损伤的常见原因:在常规诊断中实施STRC突变分析。临床。遗传学。87: 49-55, 2015.[公共医学:26011646,图像,相关引文][全文]

  7. Zhang,Y.,Malekpour,M.,Al-Madani,N.,Kahrizi,K.,Zanganeh,M。感音神经性耳聋与男性不育:一种邻近基因缺失综合征。医学遗传学杂志。44: 233-240, 2007. 注:勘误表:J.Med.Genet。仅44:544,2007年。[公共医学:17098888,图像,相关引文][全文]


Cassandra L.Kniffin-更新日期:2015年4月2日
Ada Hamosh-更新时间:2008年11月26日
Marla J.F.O'Neill-更新时间:6/5/2007
Marla J.F.O'Neill-更新日期:12/21/2004
Patricia A.Hartz-更新日期:12/2/2004
创建日期:
Victor A.McKusick:2001年5月11日
卡罗尔:2016年10月18日
卡罗尔:2015年7月30日
卡罗尔:2015年4月3日
mcolton:2015年4月3日
ckniffin:2015年4月2日
特里:2012年6月8日
脱发:2008年10月12日
特里:2008年11月26日
wwang:2007年6月8日
毛圈布:2007年6月5日
颂歌:2004年12月21日
mgross:2004年2月12日
阿洛佩兹:2001年11月5日

*606440

立体定向素;STRC公司


HGNC批准的基因符号:STRC

细胞遗传学定位:15q15.3 基因组坐标(GRCh38): 15:43,599,563-43,618,800 (来自NCBI)


基因-表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
15季度15.3 耳聋,常染色体隐性遗传16 603720 常染色体隐性

文本

描述

STRC基因编码立体纤毛,立体纤毛是一种大型细胞外结构蛋白,存在于内耳外毛细胞的立体纤毛中。它与水平顶部连接件和顶盖膜附着冠有关,这对睫状体尖端的正确内聚和定位很重要(Verpy等人,2001;Francey等人,2012总结)。


克隆和表达

为了识别遗传性耳聋中突变的基因,Verpy等人(2001年)开发了一种基于内耳中特异或优先表达基因识别的候选基因方法。他们鉴定了一个来自前庭文库的小鼠克隆,该文库与DFNB16基因座内来自15q15染色体区域的几个人类基因组克隆同源。人类STRC蛋白由1809个氨基酸组成,包含一个假定的信号肽和几个疏水片段。Verpy等人(2001年)使用免疫组织标记法证明,在小鼠内耳中,立体纤毛仅在感觉毛细胞中表达,并与静纤毛相关,静纤毛是形成声音刺激机械感受结构的硬微绒毛。


基因结构

STRC基因包含29个外显子,约19 kb,并且是串联复制的,第二个拷贝的编码序列被外显子20中的终止密码子中断(Verpy等人,2001)。这两个拷贝位于端粒到着丝粒的方向,相距不到100kb。


映射

Verpy等人(2001年)在DFNB16的候选区域内的染色体15q15上确定了STRC基因。

假基因

STRC位于一个复杂的基因组区域,其特征是存在大量片段重复,其中包括一个STRC假基因,其编码序列99.6%保守(由Francey等人总结,2012年)。


分子遗传学

常染色体隐性聋16

在患有常染色体隐性遗传非综合征感音神经性耳聋-16(DFNB16;603720)的巴基斯坦近亲家族的受影响成员中,Verpy等人(2001)在STRC基因(606440.001)中发现了纯合截断突变。患有该疾病的一个法国家庭的受影响成员是移码突变(606440.002)和含有29个编码外显子的STRC基因拷贝中的大缺失(60644.0003)的复合杂合子。

Francey等人(2012年)使用3种不同的基因分型阵列平台和Sanger测序分析了659名GJB2(121011)突变阴性的感音神经性耳聋先证者。利用阵列基因分型信息和测序数据,作者鉴定出17个STRC缺失,包括7个纯合缺失和9个杂合缺失;仅用2例患者的测序数据,他们鉴定出1例杂合缺失。在对点突变进行测序后,他们发现9个杂合缺失先证者中有6个携带STRC基因的新变体;其中4个变异体经亲本分析证实为反式等位基因。所有双等位基因STRC改变患者均有轻度至中度听力损失。研究结果表明,STRC可能是非综合征性感音神经性聋的常见病因。没有对缺失和变异进行功能研究。

Vona等人(2015年)在4名患有DFNB16的无关儿童中发现了STRC基因的双等位基因改变。三名患者因基因缺失和假定致病点突变而为复合杂合子,1名患者因2个假定致病点变异而为复合混合子。未对变体进行功能研究。这些患者是从94名GJB2(121011)/GJB6(604418)阴性的感音神经性耳聋患儿中确定的,这些患儿接受了基因分析。Vona等人(2015)强调了STRC基因缺失和突变的技术检测、评估和解释方面的困难。

耳聋-无能综合征

Dgany等人(2002)报道了一个法国家庭,其中一名56岁的男性和他的两个兄弟患有I型先天性红细胞生成障碍性贫血(CDA1;224120)、弱精子症和非综合征性耳聋。他们确定codanin基因(N598S;607465.003)内的点突变纯合子是I型CDA的原因。Avidan等人(2003年)发现,这3个同胞也是纯合子,在染色体15q15中约有70-kb的缺失,这删除了整个立体纤毛基因并截断了CATSPER2基因(607249)。Avidan等人(2003年)认为,功能性立体交叉素的缺乏(在非综合征性感音神经性耳聋中突变)和CATSPER2(精子中唯一表达的电压门控阳离子通道)可能分别解释了所观察到的耳聋和男性不育表型(611102)。

在分离非综合征性耳聋和男性不育的3个伊朗近亲家庭中,Zhang等人(2007)在染色体15q15.3上发现了一个约100-kb的缺失区域,涉及KIAA0377(610979)、CKMT1B(123290)、STRC和CATSPER2。这些家族没有相同的缺失,单倍型分析表明这些家族没有共同的祖先;作者指出,染色体15q15.3上的大量串联重复序列使其易于重排。Zhang等人(2007年)指出,这些家庭的听力损失表型与DFNB16相似,表明STRC缺失与他们的耳聋有因果关系。

Vona等人(2015年)报告了3名患者,其中包括2名男孩和1名女孩,他们在出生到儿童早期之间出现感音神经性耳聋。所有人都有STRC和CATSPER2基因的纯合缺失。研究时,所有人都处于青春期前,未进行生育评估。一名男孩患有其他先天性异常和共病,这可能与耳聋无关。这些患者是从94名GJB2/GJB6阴性的感音神经性耳聋患儿中确定的,这些患儿接受了基因分析。


动物模型

Verpy等人(2008)检测到立体纤毛与水平顶部连接物有关,该连接物是连接外部毛细胞发束内相邻立体纤毛的横向连接物。作者发现,这些联系在进行性失聪的stereocilin-null突变小鼠中不存在。然而,在听力开始时,他们的耳蜗灵敏度和频率调谐几乎正常,尽管掩蔽大大减少,并且完全没有声波和电波失真。根据这种独特的功能情况,Verpy等人(2008年)得出结论,耳蜗波形畸变的主要来源是由水平顶部连接器施加的约束而非机电换能器通道的固有非线性行为导致的偏转依赖性发束刚度。


ALLELIC变体 3个选定示例):

.0001耳聋,自动耳塞16

STRC,1-p-INS,3157C
SNP:rs786200882,临床变量:RCV000004591

在患有常染色体隐性遗传非综合征感音神经性耳聋-16(DFNB16;603720)的巴基斯坦近亲家族的受影响成员中,Verpy等人(2001年)在STRC基因第13外显子中发现了一个纯合1-bp插入(c.3157_3158insC)。该插入预计会导致19个框架外氨基酸的易位,并在外显子13的3214位产生下游提前终止密码子。


.0002耳聋,自动耳塞16

STRC,4-BP DEL,NT2171
SNP:rs786200883,gnomAD:rs786200883,临床变量:RCV000004592、RCV004696631

在常染色体隐性遗传性耳聋-16(DFNB16;603720)家系的受累成员中,Verpy等人(2001年)确定了STRC基因中的复合杂合缺失:外显子5(c.2171_2174delTTTG)中的4-bp缺失是从父亲遗传来的,外显子17至29中的较大缺失是从母亲遗传来的(606440.003)。据预测,4-bp的缺失将导致5个框架外氨基酸的翻译和外显子5第2185位下游提前终止密码子的翻译。作者在内含子7和内含子16的三素数末端之间定位了较大缺失的五素数边界,以及最三素数外显子下游的三素性边界,表明缺失至少从外显子17延伸到29。


.0003耳聋,自动耳塞16

STRC,EX17-29DEL公司
临床变量:RCV000004593

Verpy等人(2001年)在常染色体隐性遗传非综合征感音神经性耳聋-16(DFNB16;603720)家系的受影响成员中发现STRC基因第17至29外显子缺失的讨论,见606440.002。


参考文献

  1. Avidan,N.、Tamary,H.、Dgany,O.、Cattan,D.、Pariente,A.、Thulliez,M.、Borot,N.,Moati,L.、Bartheme,A.、Shalmon,L.,Krasnov,T.、Ben-Asher,E.和其他9人。人类常染色体非综合征男性不育基因CATSPER2。欧洲。J.Hum.遗传学。11: 497-502, 2003.[PubMed:12825070][全文:https://doi.org/10.1038/sj.ejhg.5200991]

  2. Dgany,O.、Avidan,N.、Delaunay,J.、Krasnov,T.、Shalmon,L.、Shalev,H.、Eidelitz-Markus,T.,Kapelushnik,J.,Cattan,D.、Pariente,A.、Tulliez,M.、Cretien,A.和其他13人。先天性红细胞生成障碍性贫血I型是由可待因-1突变引起的。Am.J.Hum.遗传学。71: 1467-1474, 2002.[公共医学:12434312][全文:https://doi.org/10.1086/344781]

  3. Francey,L.J.、Conlin,L.K.、Kadesch,H.E.、Clark,D.、Berrodin,D.、Sun,Y.、Glessner,J.、Hakonarson,H.、Jalas,C.、Landau,C.,Spinner,N.B.、Kenna,M.、Sagi,M.,Rehm,H.L.、Krantz,I.D。全基因组SNP基因分型确定了立体交叉素(STRC)基因是儿童双侧感音神经性听力损伤的主要原因。美国医学遗传学杂志。158A:298-3082012年。[公共医学:22147502][全文:https://doi.org/10.1002/ajmg.a.34391]

  4. Verpy,E.,Masmoudi,S.,Zwaenepoel,I.,Leibovic,M.,Hutchin,T.P.,Del Castillo,I。编码发束蛋白的新基因突变导致DFNB16基因座的非综合征性耳聋。自然遗传学。29: 345-349, 2001.[公共医学:11687802][全文:https://doi.org/10.1038/ng726]

  5. Verpy,E.,Weil,D.,Leibovic,M.,Goodyear,R.J.,Hamard,G.,Houdon,C.,Lefevre,G.M.,Hardelin,J.-P.,Richardson,G.P.,Avan,P.,Petit,C。立体定向素缺乏小鼠揭示了耳蜗波形畸变的起源。《自然》456:255-2582008。[公共医学:18849963][全文:https://doi.org/10.1038/nature07380]

  6. Vona,B.,Hofrichter,M.A.H.,Neuner,C.,Schroder,J.,Gehrig,A.,Hennermann,J.B.,Kraus,F.,Shehata-Dieler,W.,Klopocki,E.,Nanda,I.,Haaf,T。DFNB16是先天性听力损伤的常见原因:在常规诊断中实施STRC突变分析。临床。遗传学。87: 49-55, 2015.[公共医学:26011646][全文:https://doi.org/10.1111/cge.12332]

  7. Zhang,Y.,Malekpour,M.,Al-Madani,N.,Kahrizi,K.,Zanganeh,M。感音神经性耳聋与男性不育:一种邻近基因缺失综合征。医学遗传学杂志。44: 233-240, 2007. 注:勘误表:J.Med.Genet。仅44:544,2007年。[PubMed:17098888][全文:https://doi.org/10.1136/jmg.2006.045765]


贡献者:
Cassandra L.Kniffin-更新日期:2015年4月2日
Ada Hamosh-更新时间:2008年11月26日
Marla J.F.O'Neill-更新时间:6/5/2007
Marla J.F.O'Neill-更新日期:12/21/2004
Patricia A.Hartz-更新日期:12/2/2004

创建日期:
Victor A.McKusick:2001年5月11日

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卡罗尔:2015年7月30日
卡罗尔:2015年4月3日
mcolton:2015年4月3日
ckniffin:2015年4月2日
特里:2012年6月8日
脱发:2008年10月12日
特里:2008年11月26日
wwang:2007年6月8日
毛圈布:2007年6月5日
颂歌:2004年12月21日
mgross:2004年2月12日
阿洛佩兹:2001年11月5日