条目-*605564-钙和整合素结合蛋白2;CIB2公司-OMIM公司
 
*605564

钙与整合素结合蛋白2;CIB2公司


备选标题;符号

依赖DNA的蛋白激酶-相互作用蛋白2
激酶相互作用蛋白2;知识产权2


HGNC批准的基因符号:CIB2公司

细胞遗传学位置:15季度25.1 基因组坐标(GRCh38):15:78,104,606-78,131,535 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
15季度25.1 耳聋,常染色体隐性遗传48 609439 应收账
IJ型Usher综合征 614869 应收账

文本

描述

CIB2基因编码一种属于钙和整合素结合蛋白家族的蛋白质,该蛋白质包含3或4个EF-hand结构域,这些结构域在钙结合时改变构象,并可能介导细胞内钙信号。CIB2在钙稳态中具有保守作用(总结如下Riazuddin等人,2012年).


克隆和表达

DNA-依赖性蛋白激酶(DNA-PK)在淋巴发育过程中修复双链DNA断裂和V(D)J重组过程中发挥作用。通过EST数据库搜索与DNA-PK基因KIP/CIB同源的序列(602293)和5-prime RACE,Seki等人(1999)从人类胎儿大脑cDNA文库中分离出全长cDNA,他们将其命名为KIP2。KIP2编码一个推断的187-氨基酸蛋白,预测分子量为22 kD。KIP2蛋白与钙结合蛋白KIP/CIB的序列同源性分别为46%、39%和30%(602293),钙调神经磷酸酶B(601302),和钙调蛋白(114180)分别是。KIP2的序列分析显示2个EF-hand基序和一个螺旋-环-螺旋基序参与钙离子的协调,表明KIP2也可能结合钙。RT-PCR分析表明,KIP2在人体多种组织中广泛表达。

Riazuddin等人(2012年)发现CIB2在人类、成年和胚胎小鼠组织中广泛表达,包括内耳和视网膜。出生后第7天,小鼠耳蜗毛细胞中Cib2 mRNA的富集程度是支持细胞的57倍。首次在皮层器官和前庭器官的P2处观察到Cib2免疫反应。在成年小鼠中,在支持细胞的细胞质中观察到Cib2,并集中在内外毛细胞和前庭毛细胞的立纤毛顶端。其在那里的定位可能反映了参与调节机械电转导的钙信号传导。在小鼠视网膜中,Cib2存在于感光细胞的内外段和视网膜色素上皮中。在内外丛状层和神经节细胞中也有免疫反应性。


基因结构

CIB2基因包含6个外显子,编码3种不同的亚型(Riazuddin等人,2012年).


映射

使用辐射混合面板和FISH分析,Seki等人(1999)将KIP2基因定位于染色体15q24。由于KIP/CIB基因定位于15q25.3-q26.1,作者认为KIP2和CIB可能是来自染色体内基因重复的2个同源基因。


基因功能

在COS-7细胞中,Riazuddin等人(2012年)发现与转染空载体的细胞相比,野生型CIB2的表达导致ATP诱导的钙释放减少40%,表明CIB2对钙反应具有抑制作用。CIB2与旋涡蛋白相互作用并与之复合(WHRN;607928)肌球蛋白VIIa(MYO7A;276903),2种与Usher综合征有关的蛋白质(参见,例如。,276900).


分子遗传学

常染色体隐性聋48

在54个巴基斯坦常染色体隐性遗传性耳聋家族的受影响成员中-48(DFNB48;609439),Riazuddin等人(2012年)在CIB2基因(F91S;605564.0001). 在其他DFNB48(C99W,605564.0002和I123T,605564.0003).Riazuddin等人(2012年)据估计,CIB2突变可能占巴基斯坦常染色体隐性聋家庭的7.25%。与野生型相比,在COS-7细胞中转染F91S和C99W突变降低或消除了CIB2减少ATP诱导的细胞钙释放的能力,而与野生型相比,转染I123T突变增加了CIB2减少钙释放的能力。这些发现表明,突变对CIB2钙结合或缓冲活性有影响。对斑马鱼和果蝇的研究(见动物模型)表明,Cib2对耳朵毛细胞和眼睛感光细胞的功能和正常发育很重要。总的来说,结果表明Cib2的缺失导致钙调节缺陷。

Usher综合征,IJ型

在患有IJ型Usher综合征(USH1J;614869)最初报告人Ahmed等人(2009年)作为家族PKDF117,Riazuddin等人(2012年)在CIB2基因(E64D;605564.0004). 与野生型相比,将突变基因转染COS-7细胞显著降低了CIB2降低ATP诱导的细胞钙释放的能力。


动物模型

Riazuddin等人(2012年)发现斑马鱼Cib2基因敲除导致突变表型,包括小眼症、卷尾、色素减退和心脏水肿。突变斑马鱼的机械感觉毛细胞数量和功能显著减少,对声音刺激没有反应,在游泳时无法保持直立。果蝇Cib2相关基因的敲除降低了光反应振幅,并损害了对高频闪烁刺激的反应。这些苍蝇在恒定光照下饲养时表现出光感受器退化,这表明Cib2是正确的光传导和防止光依赖性视网膜退化所必需的。表型表明,Cib2的缺失导致钙调节缺陷,可导致机械转导缺陷和光感受器维持缺陷。


等位基因变体( 4精选示例):

.0001耳聋,自动耳塞48

在54个巴基斯坦常染色体隐性聋-48(DFNB48;609439),Riazuddin等人(2012年)在CIB2基因中发现了纯合272T-C转换,导致在第一个EF-hand结合域的高度保守残基处发生了phe91-to-ser(F91S)替换。单倍型分析与创始人效应一致。F91S突变在1068条巴基斯坦控制染色体中的1条中发现,但在几个大型外显子数据库中没有发现。与野生型相比,将突变基因转染COS-7细胞显著降低了CIB2降低ATP诱导的细胞钙释放的能力。


.0002耳聋,自动耳塞48

患有DFNB48的2个巴基斯坦家庭的受影响成员(609439),Riazuddin等人(2012年)在CIB2基因中发现了纯合297C-G颠倒,导致cys99-trp(C99W)在高度保守的残基上发生替换。单倍型分析与创始人效应一致。在1068条巴基斯坦控制染色体中的5条中发现了C99W突变,但在几个大型外显子数据库中没有发现。将突变基因转染到COS-7细胞后,CIB2降低ATP诱导的细胞钙释放的能力消失。


0.0003耳聋,常染色体隐性遗传48

患有DFNB48的土耳其家庭受影响成员(609439),Riazuddin等人(2012年)在CIB2基因中鉴定了纯合368T-C转变,导致在第二EF手结合结构域中的高度保守残基处的ile123到thr(I123T)取代。724条控制染色体未发现突变。与野生型相比,将突变基因转染COS-7细胞显著增加了CIB2降低ATP诱导的细胞钙释放的能力。


.0004引座综合征,IJ型

在患有IJ型Usher综合征(USH1J;614869)最初报告人Ahmed等人(2009年)作为PKDF117家族,Riazuddin等人(2012年)在CIB2基因中鉴定出一个纯合192G-C颠倒,导致在高度保守的残基上发生glu64-to-asp(E64D)取代。676条控制染色体未发现突变。与野生型相比,将突变基因转染COS-7细胞显著降低了CIB2降低ATP诱导的细胞钙释放的能力。


参考文献

  1. Ahmed,Z.M.,Riazuddin,S.,Khan,S.N.,Friedman,P.L.,Riazuddin。USH1H是I型Usher综合征的一个新基因座,定位于染色体15q22-23。临床。遗传学。75: 86-91, 2009.[公共医学:18505454,图像,相关引文][全文]

  2. Riazuddin,S.、Belyantseva,I.A.、Giese,A.P.J.、Lee,K.、Indzhykulian,A.A.、Nandamuri,S.P.、Yousaf,R.、Sinha,G.P.,Lee,S.,Terrell,D.、Hegde,R.S.、Ali,R.A.和其他19人。CIB2钙和整合素结合蛋白的改变导致Usher综合征1J型和非综合征性耳聋DFNB48。自然遗传学。44: 1265-1271, 2012.[公共医学:23023331,图像,相关引文][全文]

  3. Seki,N.、Hattori,A.、Hayashi,A.、Kozuma,S.、Ohira,M.、Hori,T.、Saito,T。DNA-PKcs相互作用蛋白(KIP)基因同源物的结构、表达谱和染色体定位。生物化学。生物物理学。《学报》1444:143-1471999。[公共医学:9931475,相关引文][全文]


贡献者:
Cassandra L.Kniffin-更新时间:2012年10月15日
创建日期:
Yen-Pei C.Chang:2001年1月19日
卡罗尔:2016年4月10日
颂歌:2016年4月8日
特里:2012年6月11日
卡罗尔:2012年10月15日
ckniffin:2012年10月15日
mgross:2006年12月12日
卡罗尔:2001年12月19日
卡罗尔:2001年1月22日
cwells:2001年1月22日
cwells:2001年1月22日
cwells:2001年1月19日

*605564

钙与整合素结合蛋白2;CIB2公司


备选标题;符号

依赖DNA的蛋白激酶-相互作用蛋白2
激酶相互作用蛋白2;知识产权2


HGNC批准的基因符号:CIB2

细胞遗传学位置:15q25.1 基因组坐标(GRCh38): 15:78,104,606-78,131,535 (来自NCBI)


基因-表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
15季度25.1 耳聋,常染色体隐性遗传48 609439 常染色体隐性
IJ型Usher综合征 614869 常染色体隐性

文本

描述

CIB2基因编码一种属于钙和整合素结合蛋白家族的蛋白质,该蛋白质包含3或4个EF-hand结构域,这些结构域在钙结合时改变构象,并可能介导细胞内钙信号。CIB2在钙稳态中具有保守作用(Riazudin等人综述,2012年)。


克隆和表达

DNA-依赖性蛋白激酶(DNA-PK)在淋巴发育过程中修复双链DNA断裂和V(D)J重组过程中发挥作用。通过EST数据库搜索与DNA-PK基因KIP/CIB(602293)和5-prime RACE同源的序列,Seki等人(1999)从人类胎脑cDNA文库中分离出全长cDNA,他们将其命名为KIP2。KIP2编码一个推断的187-氨基酸蛋白,预测分子量为22 kD。KIP2蛋白分别与钙结合蛋白KIP/CIB(602293)、钙调神经磷酸酶B(601302)和钙调素(114180)具有46%、39%和30%的序列同源性。KIP2的序列分析显示2个EF-hand基序和一个螺旋-环-螺旋基序参与钙离子的协调,表明KIP2也可能结合钙。RT-PCR分析表明,KIP2在人体多种组织中广泛表达。

Riazuddin等人(2012年)发现,CIB2在人类、成年和胚胎小鼠组织中广泛表达,包括内耳和视网膜。出生后第7天,小鼠耳蜗毛细胞中Cib2 mRNA的富集程度是支持细胞的57倍。首次在皮层器官和前庭器官的P2处观察到Cib2免疫反应。在成年小鼠中,Cib2存在于支持细胞的细胞质中,并集中于内外毛细胞和前庭毛细胞的静纤毛尖端。其在那里的定位可能反映了参与调节机械电转导的钙信号传导。在小鼠视网膜中,Cib2存在于感光细胞的内外段和视网膜色素上皮中。在内外丛状层和神经节细胞中也有免疫反应。


基因结构

CIB2基因包含6个外显子,编码3种不同的亚型(Riazudin等人综述,2012)。


映射

Seki等人(1999年)利用辐射杂交面板和FISH分析将KIP2基因定位到染色体15q24。由于KIP/CIB基因定位于15q25.3-q26.1,作者认为KIP2和CIB可能是来自染色体内基因复制的2个同源基因。


基因功能

在COS-7细胞中,Riazudin等人(2012)发现,与用空载体转染的细胞相比,野生型CIB2的表达导致ATP诱导的钙释放减少40%,这表明CIB2对钙反应具有抑制作用。CIB2与旋涡蛋白(WHRN;607928)和肌球蛋白VIIa(MYO7A;276903)相互作用并多重聚合,这两种蛋白与Usher综合征有关(参见例如276900)。


分子遗传学

常染色体隐性聋48

Riazuddin等人(2012年)在54个巴基斯坦常染色体隐性聋-48(DFNB48;609439)家系的受影响成员中发现CIB2基因的纯合子突变(F91S;605564.0001)。在其他DFNB48家族中发现了另外两个纯合子CIB2突变(C99W,605564.002和I123T,605544.003)。Riazuddin等人(2012年)估计,CIB2突变可能占巴基斯坦常染色体隐性聋家庭的7.25%。与野生型相比,COS-7细胞中F91S和C99W突变的转染降低或消除了CIB2减少ATP诱导的细胞钙释放的能力,而与野生型比较,I123T突变的转导增加了CIB2s减少钙释放的功能。这些发现表明,突变对CIB2钙结合或缓冲活性有影响。对斑马鱼和果蝇的研究(见动物模型)表明,Cib2对耳朵毛细胞和眼睛感光细胞的功能和正常发育很重要。总的来说,结果表明Cib2的缺失导致钙调节缺陷。

Usher综合征,IJ型

在一个患有Usher综合征IJ型(USH1J;614869)的土耳其大近亲家族的受影响成员中,最初由Ahmed等人(2009年)报告为PKDF117家族,Riazuddin等人(2012年)发现了CIB2基因的纯合子突变(E64D;605564.004)。与野生型相比,将突变基因转染COS-7细胞显著降低了CIB2降低ATP诱导的细胞钙释放的能力。


动物模型

Riazuddin等人(2012年)发现,斑马鱼中Cib2的敲除导致突变表型,包括小眼症、卷尾、色素减退和心脏水肿。突变斑马鱼的机械感觉毛细胞数量和功能显著减少,对声音刺激没有反应,在游泳时无法保持直立。果蝇Cib2相关基因的敲除降低了光反应振幅,并损害了对高频闪烁刺激的反应。这些苍蝇在恒定光照下饲养时表现出光感受器退化,这表明Cib2是正确的光传导和防止光依赖性视网膜退化所必需的。表型表明,Cib2缺失导致钙调节缺陷可能导致机械传导缺陷和光感受器维持缺陷。


ALLELIC变体 4个选定示例):

.0001耳聋,自动耳塞48

CIB2、PHE91SER
SNP:rs397515411,gnomAD:rs397515411,临床变量:RCV000032887、RCV001291223、RCV002496493

在54个常染色体隐性聋-48(DFNB48;609439)巴基斯坦家庭的受影响成员中,Riazuddin等人(2012)在CIB2基因中发现了纯合272T-C过渡,导致在第一EF-hand结合域中高度保守的残基处发生phe91-to-ser(F91S)替代。单倍型分析与创始人效应一致。F91S突变在1068条巴基斯坦控制染色体中的1条中发现,但在几个大型外显子数据库中没有发现。与野生型相比,将突变基因转染COS-7细胞显著降低了CIB2降低ATP诱导的细胞钙释放的能力。


.0002耳聋,自动耳塞48

CIB2、CYS99TRP
SNP:rs370965183,gnomAD:rs370965183,临床变量:RCV000032888、RCV001291224

在2个患有DFNB48(609439)的巴基斯坦家庭的受影响成员中,Riazuddin等人(2012年)在CIB2基因中发现了纯合297C-G颠倒,导致cys99-trp(C99W)在高度保守的残基上发生替换。单倍型分析与创始人效应一致。在1068条巴基斯坦对照染色体中的5条中发现了C99W突变,但在几个大型外显子组数据库中没有发现。将突变基因转染到COS-7细胞后,CIB2降低ATP诱导的细胞钙释放的能力消失。


.0003耳聋,自动耳塞48

CIB2,ILE123THR
SNP:rs397515412,临床变量:RCV000032889

在患有DFNB48(609439)的土耳其家族的受影响成员中,Riazuddin等人(2012)在CIB2基因中发现了纯合子368T-C转换,导致在第二EF-hand结合域中高度保守的残基处发生ile123-thr(I123T)替代。724条控制染色体未发现突变。与野生型相比,将突变基因转染COS-7细胞显著增加了CIB2降低ATP诱导的细胞钙释放的能力。


.0004 USHER综合征,IJ型

CIB2、GLU64ASP
SNP:rs145415848,gnomAD:rs145415848,临床变量:RCV000032890、RCV000223233

在一个患有Usher综合征IJ型(USH1J;614869)的土耳其大近亲家族的受影响成员中,最初由Ahmed et al.(2009)报告为PKDF117家族,Riazuddin et al。676条控制染色体未发现突变。与野生型相比,将突变基因转染COS-7细胞显著降低了CIB2降低ATP诱导的细胞钙释放的能力。


参考文献

  1. Ahmed,Z.M.,Riazuddin,S.,Khan,S.N.,Friedman,P.L.,Riazuddin。USH1H是I型Usher综合征的一个新基因座,定位于染色体15q22-23。临床。遗传学。75: 86-91, 2009.[公共医学:18505454][全文:https://doi.org/10.1111/j.1399-0004.2008.01038.x]

  2. Riazuddin,S.、Belyantseva,I.A.、Giese,A.P.J.、Lee,K.、Indzhykulian,A.A.、Nandamuri,S.P.、Yousaf,R.、Sinha,G.P.,Lee,S.,Terrell,D.、Hegde,R.S.、Ali,R.A.和其他19人。CIB2钙和整合素结合蛋白的改变导致Usher综合征1J型和非综合征性耳聋DFNB48。自然遗传学。44: 1265-1271, 2012.[公共医学:23023331][全文:https://doi.org/10.1038/ng.2426]

  3. Seki,N.、Hattori,A.、Hayashi,A.、Kozuma,S.、Ohira,M.、Hori,T.、Saito,T。DNA-PKcs相互作用蛋白(KIP)基因等位基因的结构、表达谱和染色体定位。生物化学。生物物理学。《学报》1444:143-1471999。[公共医学:9931475][全文:https://doi.org/10.1016/s0167-4781(98)00253-x]


贡献者:
Cassandra L.Kniffin-更新时间:2012年10月15日

创建日期:
Yen-Pei C.Chang:2001年1月19日

编辑历史记录:
卡罗尔:2016年4月10日
颂歌:2016年4月8日
特里:2012年6月11日
卡罗尔:2012年10月15日
ckniffin:2012年10月15日
mgross:2006年12月12日
卡罗尔:2001年12月19日
颂歌:2001年1月22日
cwells:2001年1月22日
cwells:2001年1月22日
cwells:2001年1月19日