条目-*603537-钾通道,电压额定,KQT类子家族,成员4;KCNQ4号机组-OMIM公司
 
*603537

钾通道,电压额定,KQT类子家族,成员4;KCNQ4号机组


备选标题;符号

元件4 Q族电压额定钾通道


HGNC批准的基因符号:KCNQ4号机组

细胞遗传学位置:第14.2页 基因组坐标(GRCh38):1:40,783,787-40,840,452 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
第14.2页 耳聋,常染色体显性2A 600101 AD公司

文本

描述

钾通道调节生物流体的电信号和离子组成。KCNQ4是电压门控钾通道基因家族的成员,形成同源的四聚体结构(Kubisch等人,1999年).


克隆和表达

Kubisch等人(1999年)克隆了KCNQ4 cDNA,该cDNA编码695个氨基酸的推导多肽,预测质量为77kD。其与KCNQ1的整体氨基酸同一性(607542),KCNQ2(602235)和KCNQ3(602232)分别为38%、44%和37%。KCNQ4具有6个预测的跨膜结构域和跨膜结构域S5和S6之间的P环。钾通道是相同或同源亚基的四聚体,其中4个高度保守的P环结合形成离子选择孔。与其他KCNQ通道一样,KCNQ4有一个长期预测的细胞质C末端,约占蛋白质的一半。KCNQ4在耳蜗中表达;感觉外毛细胞强烈表达KCNQ4,而内毛细胞呈阴性。


基因结构

Kubisch等人(1999年)确定了KCNQ4基因的基因组结构。


映射

通过FISH,Kubisch等人(1999年)将该基因定位到1p34。使用该区域的YAC对照,他们在包括常染色体显性非综合征性耳聋2型(DFNA2;600101)轨迹。


基因功能

在小鼠耳蜗中,Kcnq4转录物只存在于外毛细胞中。使用特定抗体,哈尔科维茨等人(2000年)表明Kcnq4位于这些感觉细胞的基膜上。在前庭器官中,Kcnq4仅限于I型毛细胞,传入的萼状神经末梢包裹着这些感觉细胞。Kcnq4也在中枢听觉通路的许多但不是所有核团的神经元中表达,并且在大多数其他脑区中不存在。例如,它存在于耳蜗核、外侧丘系核和下丘。哈尔科维茨等人(2000年)表示这是第一个在感觉通路中特异表达的离子通道。此外,该基因在小鼠听觉系统中的表达模式增加了DFNA2听力损失中核心成分的可能性。对DFNA2离子通道突变体的药理学修饰的理解可能允许开发对感觉方式甚至感知质量具有选择性的新治疗方法(特鲁塞尔,2000).

通过记录注射cRNA的非洲爪蟾卵母细胞产生的通道电流,Zhang等人(2003)发现磷脂酰肌醇(4,5)-二磷酸激活了所分析的KCNQ通道家族的所有成员,包括KCNQ4。


生物化学特征

Kv7通道具有不同的组装偏好,这些偏好由其细胞质C末端组装域或A结构域尾部控制。霍华德等人(2007)以2.07埃分辨率测定了Kv7.4的C末端A域尾部(残基610至640)的晶体结构。A域尾部的整体结构是一个紧密扭曲的左旋四股线圈。最后3个C末端残基形成了一个宽的碱基,并参与了与晶格中相邻分子的晶体接触。A结构域尾部复合物的表面主要是极性的,有两个不同的侧链盐桥和氢键网络。这两个网络通过螺旋界面进行螺旋间接触。对水溶液中Kv7.4 A结构域尾的分析表明,其估计螺旋含量为66%,以四聚体形式存在,反映了KCNQ电压门控钾通道的晶体结构和预期化学计量比。序列比较显示,所有5个Kv7亚型的A结构域尾部的卷曲-卷曲基序保持不变。


分子遗传学

Kubisch等人(1999年)确定了一个杂合突变(603537.0001)在常染色体显性遗传性耳聋(DFNA2A;600101). 该突变消除了野生型KCNQ4的钾电流,对其产生了强烈的显性负效应。Kubisch等人(1999年)结论是KCNQ4相关的听力损失是外毛细胞固有的。作者还发现KCNQ4与KCNQ3形成异聚通道。

Coucke等人(1999年)分析了5个先前报道的DFNA2A家系中的KCNQ4基因,其中3个来自荷兰和比利时(Van Camp等人,1997年)印尼和美国各2家(Coucke等人,1994年). 他们发现错义突变改变了3个家族中的保守氨基酸,而第四个家族中有一个失活缺失。在印尼DFNA2A家族中未发现KCNQ4突变。Van Hauwe等人(1999)分析了相同5个家族中的GJB3基因,没有发现任何突变。Coucke等人(1999年)结论是,至少有2个甚至可能有3个导致听力损伤的基因位于1p34上,这表明KCNQ4突变可能是常染色体显性遗传性听力损失的相对常见原因。

Talebizadeh等人(1999年)描述了leu281到ser的错义突变(603537.0006)KCNQ4基因在一个5代美国家族非综合征显性进行性聋的所有病例中的表达。他们还检测了20个显性非综合征性聋家系的先证者和60个隐性非综合征聋家系先证者的KCNQ4突变;这些患者中没有一例KCNQ4出现截断突变。

Van Hauwe等人(2000年)识别了一个leu274(603537.0007)另一个患有DFNA2A的荷兰家系成员KCNQ4基因突变。对所有已知KCNQ4突变位置的检查显示,基因孔区域的突变聚集,这是通道离子选择性的原因。

在一个4代西班牙分离常染色体显性遗传性听力损失家系的受累成员中,Mencia等人(2008)确定突变的杂合性(G296S;603537.0009)在KCNQ4基因中。表达和功能研究表明,通过贩运缺陷对野生型渠道活动产生强烈的显性负效应。

在电生理研究中,Kim等人(2011)发现转染KCNQ4突变体的中国仓鼠卵巢细胞影响孔隙区域(L274H,603537.0007; W276S、,603537.0002; L281S,603537.0006; G285C中,603537.0004; 和G296S,603537.0009)与转染野生型蛋白的细胞相比,没有可测量的外向电流。当与野生型共存时,突变W276S蛋白导致电流密度降低,这与显性负效应一致,尽管通道的门控特性没有改变。电流抑制随着野生型:突变体比率的降低而增加,与通道的四聚体结构一致。大多数突变体也缩短了失活动力学。G321S突变体的类似研究(603537.0003)在C端表现出与孔道相似的作用。免疫组织化学研究表明,当孔突变蛋白单独表达时,没有一个定位于质膜,表明内质网中存在运输缺陷和滞留。然而,与野生型蛋白共表达导致一些膜表达。这些发现表明功能性通道缺陷与致病性KCNQ4突变相关,但也表明与野生型蛋白的相互作用导致不同的影响。最后Kim等人(2011)表明在台湾一名耳聋患者中发现的F182L变异体(Su等人,2007年)具有正常的细胞表面表达和功能特征,提示其无致病性。


ALLELIC变体( 9精选示例):

.0001失聪,自动控制2A

常染色体显性遗传性耳聋(DFNA2A;600101),Kubisch等人(1999年)在杂合子状态下鉴定了gly285至ser(GGC至AGC)突变。该突变与该家系中所有受影响的成员分离,在150条控制白种人染色体上未发现。

Kim等人(2011)称该突变是由外显子6中的853G-A转换引起的,导致蛋白质孔区中的G285S取代。


.0002失聪,自动控制2A

荷兰常染色体显性聋家系(DFNA2A;600101),Coucke等人(1999年)在KCNQ4基因第5外显子中发现827G-C颠倒,导致蛋白质孔隙区域的trp276-to-ser(W276S)突变。

秋田等人(2001)在一个连续4代患有耳聋的日本家庭中发现了这种突变。

Van Camp等人(2002年)描述了另外两个起源于欧洲和日本的W276S突变家族。他们使用紧密连锁的微卫星标记和基因内SNPS比较了3个W276S携带家族的疾病相关单倍型。Van Camp等人(2002年)发现了单倍型之间的差异,排除了家族的单一创始人突变。因此,W276S突变已独立发生3次,很可能是KCNQ4基因突变的热点。


0.0003耳聋,常染色体显性2A

荷兰常染色体显性聋家系(DFNA2A;600101),Coucke等人(1999年)在KCNQ4基因第7外显子中鉴定出961G-a转换,预计该转换将在蛋白质的S6跨膜结构域中产生gly321-ser(G321S)变化。


.0004失聪,自动控制2A

美国常染色体显性遗传性耳聋(DFNA2A;600101),Coucke等人(1999年)在KCNQ4基因第6外显子中发现853G-T颠倒,导致gly285-to-cys(G285C)替代。gly285-ser突变(G285S;603537.0001)发现于一个法国家庭Kubisch等人(1999年).


.0005失聪,自动控制2A

KCNQ4,13-BP德尔塔,NT211
   RCV000006623号机组

比利时常染色体显性聋家系(DFNA2A;600101),Coucke等人(1999年)发现KCNQ4 cDNA序列的211和224位核苷酸之间有13 bp的缺失。这种缺失导致gly70后的移码,随后是63个新氨基酸和134位氨基酸处的提前终止密码子。该突变有望产生一个KCNQ4蛋白,该蛋白在第一个跨膜区域之前被截断。


.0006失聪,自动控制2A

在一个5代奥地利裔美国家庭中,51名成员患有与DFNA2A相关的非综合征显性进行性聋(600101)1p34基因座,Talebizadeh等人(1999年)在KCNQ4基因中鉴定了824T-C转变,导致leu281到ser(L281S)取代。突变发生在蛋白质的孔隙区域(Kim等人,2011年).


0.0007耳聋,常染色体显性2A

Van Hauwe等人(2000年)在荷兰常染色体显性聋(DFNA2A;600101). 突变发生在蛋白质的孔隙区域(Kim等人,2011年).


.0008失聪,自动控制2A

KCNQ4,1-BP模型,211C
   RCV000006626号机组

常染色体显性遗传性耳聋(DFNA2A;600101),Kamada等人(2006年)在KCNQ4基因的外显子1中发现一个杂合1-bp缺失(211delC),导致一个没有跨膜结构域的截短蛋白。受影响的个体患有迟发性(8至50岁)纯高频听力损失,与之前报道的KCNQ4基因错义突变患者相比,其严重程度较低。Kamada等人(2006年)假设了不同的致病机制来解释表型差异:缺失突变中的单倍充足性和错义突变中的显性负效应。


.0009失聪,自动控制2A

常染色体显性遗传性耳聋(DFNA2A;600101),Mencia等人(2008)确定了KCNQ4基因第6外显子886G-A转换的杂合性,导致在连接孔区P-loop结构域和S6段的5个氨基酸中的一段高度保守的残基处发生gly296-to-ser(G296S)替换。在100名听力正常的西班牙无关个体中未发现该突变。在爪蟾卵母细胞和转染NIH-3T3细胞中的表达和功能研究表明,G296S突变体通过导致KCNQ4通道向细胞表面膜的转运缺陷,对野生型通道活性产生强烈的显性负效应。


参考文献

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钾通道,电压额定,KQT类子家族,成员4;KCNQ4号机组


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元件4 Q族电压额定钾通道


HGNC批准的基因符号:KCNQ4

细胞遗传学位置:1p34.2 基因组坐标(GRCh38): 1:40,783,787-40,840,452 (来自NCBI)


基因-表型关系

位置 表型 表型
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第14.2页 耳聋,常染色体显性2A 600101 常染色体显性

文本

描述

钾通道调节生物流体的电信号和离子组成。KCNQ4是电压门控钾通道基因家族的成员,形成同源的四聚体结构(Kubisch等人,1999年)。


克隆和表达

Kubisch等人(1999年)克隆了KCNQ4 cDNA,该cDNA编码695个氨基酸的推导多肽,预测质量为77kD。其与KCNQ1(607542)、KCNQ2(602235)和KCNQ3(602232)的总氨基酸同一性分别为38%、44%和37%。KCNQ4具有6个预测的跨膜结构域和跨膜结构区S5和S6之间的P环。钾通道是相同或同源亚基的四聚体,其中4个高度保守的P环结合形成离子选择孔。与其他KCNQ通道一样,KCNQ4有一个长期预测的细胞质C末端,约占蛋白质的一半。KCNQ4在耳蜗中表达;感觉外毛细胞强烈表达KCNQ4,而内毛细胞呈阴性。


基因结构

Kubisch等人(1999年)确定了KCNQ4基因的基因组结构。


映射

通过FISH,Kubisch等人(1999年)将该基因映射到1p34。使用该区域的YAC对照,他们在包含常染色体显性非综合征性耳聋2型(DFNA2;600101)基因座的区域内细化了定位。


基因功能

在小鼠耳蜗中,Kcnq4转录物只存在于外毛细胞中。Kharkovets等人(2000年)使用特异性抗体表明,Kcnq4位于这些感觉细胞的基底膜上。在前庭器官中,Kcnq4仅限于I型毛细胞,传入的萼状神经末梢包裹着这些感觉细胞。Kcnq4也在中枢听觉通路的许多但不是所有核团的神经元中表达,并且在大多数其他脑区中不存在。例如,它存在于耳蜗核、外侧丘系核和下丘。Kharkovets等人(2000年)指出,这是第一个在感觉通路中特异表达的离子通道。此外,该基因在小鼠听觉系统中的表达模式增加了DFNA2听力损失中核心成分的可能性。对DFNA2中离子通道突变的药理学修饰的理解可能会允许开发对感官形态甚至知觉质量具有选择性的新治疗方法(Trussell,2000)。

通过记录注射cRNA的非洲爪蟾卵母细胞产生的通道电流,Zhang等人(2003年)发现磷脂酰肌醇(4,5)-二磷酸激活了所分析的KCNQ通道家族的所有成员,包括KCNQ4。


生物化学特征

Kv7通道具有不同的组装偏好,这些偏好由其细胞质C末端组装域或A结构域尾部控制。Howard等人(2007年)以2.07埃分辨率测定了Kv7.4的C末端A域尾部(残基610至640)的晶体结构。A区尾的整体结构是一个紧扭的左手四股螺旋线圈。最后3个C末端残基形成了一个宽的碱基,并参与了与晶格中相邻分子的晶体接触。A结构域尾部复合物的表面主要是极性的,并且具有2个不同的侧链盐桥和氢键网络。这两个网络通过螺旋界面进行螺旋间接触。对水溶液中Kv7.4 A结构域尾的分析表明,其估计螺旋含量为66%,以四聚体形式存在,反映了KCNQ电压门控钾通道的晶体结构和预期化学计量比。序列比较显示,所有5个Kv7亚型的A结构域尾部的卷曲-卷曲基序保持不变。


分子遗传学

Kubisch等人(1999年)在一个常染色体显性遗传性耳聋(DFNA2A;600101)家族的所有受影响成员中,在KCNQ4基因第6外显子的孔隙区域发现了一个杂合突变(603537.001)。突变消除了野生型KCNQ4的钾电流,对钾电流产生了强烈的显性负效应。Kubisch等人(1999)得出结论,KCNQ4相关的听力损失是外毛细胞固有的。作者还发现KCNQ4与KCNQ3形成异聚通道。

Coucke等人(1999年)分析了5个先前报道的DFNA2A家族中的KCNQ4基因,其中3个来自荷兰和比利时(Van Camp等人,1997年),2个来自印度尼西亚和美国(Coucke等,1994年)。他们发现错义突变改变了3个家族中的保守氨基酸,而第四个家族中有一个失活缺失。在印尼DFNA2A家族中未发现KCNQ4突变。Van Hauwe等人(1999年)分析了同样5个家族中的GJB3基因,没有发现任何突变。Coucke等人(1999年)得出结论,至少2个和可能3个导致听力损伤的基因位于1p34上,并表明KCNQ4突变可能是常染色体显性遗传性听力损失的相对常见原因。

Talebizadeh等人(1999年)描述了KCNQ4基因的leu281-to ser错义突变(603537.006),发生在一个5代美国家庭的所有非综合征显性进行性聋病例中。他们还测试了20个显性非综合征性耳聋家族的先证者和60个隐性非综合征型耳聋家族先证者的KCNQ4突变;这些患者中没有一例表现出KCNQ4的截短突变。

Van Hauwe等人(2000年)在另一个患有DFNA2A的荷兰家庭的受影响成员中发现KCNQ4基因中存在leu274-his(603537.007)突变。对所有已知KCNQ4突变位置的检查显示,基因孔区域的突变聚集,这是通道离子选择性的原因。

Mencia等人(2008年)在一个分离常染色体显性遗传性耳聋的4代西班牙家系的受累成员中,确定了KCNQ4基因突变(G296S;603537.009)的杂合性。表达和功能研究表明,通过贩运缺陷对野生型渠道活动产生强烈的显性负效应。

在电生理研究中,Kim等人(2011年)发现,与转染野生型蛋白的细胞相比,转染影响孔隙区域的KCNQ4突变体的中国仓鼠卵巢细胞(L274H,603537.007;W276S,6035370002;L281S,60537.0006;G285C,603537.004;和G296S,6035.07.009)没有可测量的外向电流。当与野生型共存时,突变W276S蛋白导致电流密度降低,这与显性负效应一致,尽管通道的门控特性没有改变。电流抑制随着野生型:突变体比率的降低而增加,这与通道的四聚体结构一致。大多数突变体也缩短了失活动力学。在C末端与G321S突变体(603537.003)进行的类似研究表明,与孔通道中的作用类似。免疫组织化学研究表明,当孔突变蛋白单独表达时,没有一个定位于质膜,表明内质网中存在运输缺陷和滞留。然而,与野生型蛋白共表达导致一些膜表达。这些发现表明功能性通道缺陷与致病性KCNQ4突变相关,但也表明与野生型蛋白的相互作用导致不同的影响。最后,Kim等人(2011年)的结果表明,在台湾耳聋患者(Su等人,2007年)中发现的F182L变异体具有正常的细胞表面表达和功能特征,表明它不是致病性的。


等位基因变体 9个精选示例):

.0001失聪,自动控制2A

KCNQ4、GLY285SER
SNP:rs28937588,临床变量:RCV000006619、RCV000211722、RCV00844633、RCV002512841

在一个常染色体显性遗传性耳聋(DFNA2A;600101)家族中,Kubisch等人(1999年)发现了一个杂合状态的gly285-to-ser(GGC-to-AGC)突变。该突变与该家系中所有受影响的成员分离,在150条控制白种人染色体上未发现。

Kim等人(2011年)提到,这种突变是由外显子6中的853G-A转变引起的,导致蛋白质孔隙区域发生G285S替代。


.0002失聪,自动控制2A

KCNQ4、TRP276SER
SNP:rs80358277,临床变量:RCV000006620、RCV000211784、RCV001723546

在一个常染色体显性聋荷兰家系(DFNA2A;600101)中,Coucke等人(1999年)在KCNQ4基因第5外显子中发现了827G-C颠倒,导致蛋白质孔隙区域的trp276-to-ser(W276S)突变。

秋田等人(2001年)在一个连续四代患有耳聋的日本家庭中发现了这种突变。

Van Camp等人(2002年)描述了另外两个起源于欧洲和日本的W276S突变家族。他们使用紧密连锁的微卫星标记和基因内SNPS比较了3个W276S携带家族的疾病相关单倍型。Van Camp等人(2002)发现了单倍型之间的差异,排除了家族的单一创始人突变。因此,W276S突变已独立发生3次,很可能是KCNQ4基因突变的热点。


.0003失聪,自动控制2A

KCNQ4、GLY321SER
SNP:rs28939710,gnomAD:rs28939710,临床变量:RCV000006621、RCV001195307、RCV002512842

在一个常染色体显性聋荷兰家系(DFNA2A;600101)中,Coucke等人(1999年)在KCNQ4基因的第7外显子中发现了961G-a转换,预计该转换将在蛋白质的S6跨膜结构域中产生gly321-ser(G321S)变化。


.0004失聪,自动控制2A

KCNQ4,甘氨酸285半胱氨酸
SNP:rs28937588,临床变量:RCV000006622、RCV001851702

在一个美国常染色体显性聋家系(DFNA2A;600101)中,Coucke等人(1999)在KCNQ4基因第6外显子中发现了853G-T颠倒,导致gly285-to-cys(G285C)替代。Kubisch等人(1999年)在一个法国家族中发现的gly285-to ser突变(G285S;603537.001)涉及相同的密码子。


.0005失聪,自动控制2A

KCNQ4,13-BP DEL,NT211
单号:rs80358271,临床变量:RCV000006623

在一个常染色体显性聋比利时家系(DFNA2A;600101)中,Coucke等人(1999)发现KCNQ4 cDNA序列的211和224位核苷酸之间有13 bp的缺失。这种缺失导致gly70后的移码,随后是63个新氨基酸和134位氨基酸处的提前终止密码子。该突变有望产生一个KCNQ4蛋白,该蛋白在第一个跨膜区域之前被截断。


.0006失聪,自动控制2A

KCNQ4、LEU281SER
单号:rs80358278,临床变量:RCV000006624,RCV001567939

Talebizadeh等人(1999年)在一个5代奥地利裔美国家庭中,51名成员患有与1p34上DFNA2A(600101)基因座相关的非综合征显性进行性聋,在KCNQ4基因中发现824T-C转换,导致leu281-to ser(L281S)替代。突变发生在蛋白质的孔隙区域(Kim等人,2011年)。


.0007失聪,自动控制2A

KCNQ4、LEU274HIS
单号:rs80358276,临床变量:RCV000006625

Van Hauwe等人(2000年)在一个荷兰常染色体显性遗传性耳聋(DFNA2A;600101)家系的受影响成员中发现KCNQ4基因的leu274-to-his(L274H)突变。突变发生在蛋白质的孔隙区域(Kim等人,2011)。


.0008失聪,自动控制2A

KCNQ4,1-BP DEL,211C
SNP:rs80358272,临床变量:RCV000006626

在一个常染色体显性遗传性耳聋(DFNA2A;600101)日本家系的受累成员中,Kamada等人(2006年)在KCNQ4基因的外显子1中发现了一个杂合1-bp缺失(211delC),导致了一个没有跨膜结构域的截短蛋白。受影响的个体有晚发性(8至50年)纯高频听力损失,与先前报道的KCNQ4基因错义突变患者相比,其严重程度较低。Kamada等人(2006年)假设了不同的致病机制来解释表型差异:缺失突变的单倍体不足和错义突变的显性负效应。


.0009失聪,自动控制2A

KCNQ4、GLY296SER
单号:rs80358279,临床变量:RCV000006627

在一个4代常染色体显性聋西班牙家系(DFNA2A;600101)的受累成员中,Mencia等人(2008年)确定了KCNQ4基因第6外显子886G-a转变的杂合性,导致gly296-to-ser(G296S)在连接孔区P-loop结构域和S6段的5个氨基酸中的一个高度保守的残基上进行替换。在100名听力正常的西班牙无关个体中未发现该突变。在爪蟾卵母细胞和转染的NIH-3T3细胞中的表达和功能研究表明,G296S突变体通过导致KCNQ4通道向细胞表面膜的运输缺陷,对野生型通道活性产生强烈的显性负效应。


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