条目-*603356-CD164抗原;CD164型-OMIM公司
 
*603356

CD164抗原;CD164型


备选标题;符号

SIALOMUCIN CD164
ENDOLYN公司


HGNC批准的基因符号:CD164型

细胞遗传学位置:第6季度21 基因组坐标(GRCh38):6:109,366,514-109,382,467 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
第6季度21 ?耳聋,常染色体显性66 616969 AD公司

文本

描述

唾液粘蛋白是一组异质的分泌性或膜相关粘蛋白,在体内似乎起着两个关键但相反的作用:第一是作为细胞保护剂或抗粘附剂,第二是作为粘附受体。CD164是一种I型完整的跨膜唾液酸幻觉,作为粘附受体发挥作用(Watt等人,1998年;Forde等人,2007年).


克隆和表达

使用2种单克隆抗体和逆转录病毒表达克隆策略,Zannettino等人(1998年)分离出一个编码黏液样糖蛋白MGC24的新型跨膜亚型的cDNA,他们将其命名为CD164。成熟的CD164蛋白含有178个氨基酸,分子量为80至90 kD,富含丝氨酸和苏氨酸。CD164由人CD34表达(142230)-阳性造血祖细胞(HPCs)。

Nyegaard等人(2015)在出生后第5天,在小鼠耳蜗切片中发现Cd164基因的表达。在耳蜗神经元、Corti器官的内外毛细胞以及其他几个区域都有表达。


基因功能

Zannettino等人(1998年)发现CD164受体似乎通过促进CD34阳性细胞与骨髓基质的粘附和负调控CD34阳性HPC的生长而在造血中发挥作用。这些功能效应由至少2个空间上不同的表位介导,由特定的单克隆抗体定义。Watt等人(1998年)发现这些和其他CD164单克隆抗体在对正常人骨髓、脐血和外周血的造血细胞进行分析时显示出不同的反应模式。CD164表位的表达在骨髓中发育中的骨髓单核细胞上发现,在成熟的中性粒细胞上下调,但在外周血的单核细胞中保持不变。

使用CD133(PROM1;604365)-阳性HPC和T细胞系,Forde等人(2007)证明CD164与CXCR4相关(162643). CD164 N-连接聚糖依赖表位抗体或通过小干扰RNA敲低CD164抑制CD133阳性HPC向CXCL12的迁移(600835),CXCR4配体。CXCL12与纤维连接蛋白(FN1;135600)在CXCR4与纤维连接蛋白受体VLA4结合后,诱导CD164与CXCR4结合(参见ITGA4;192975)和VLA5(见ITGA5;135620). CD164-CXCR4与PKC-zeta(PRKCZ;176982)和AKT(164730)通过CXCR4发送信号。Forde等人(2007)结论是,包括CD164在内的3个不同的细胞表面受体家族之间的联系调节细胞迁移反应,并可能对这些细胞在骨髓中的归巢和倒伏具有特异性。


映射

Watt等人(1998年)鉴定了含有CD164基因的PAC克隆,并利用这些克隆通过FISH将CD164定位到染色体6q21。


分子遗传学

常染色体显性聋66(DFNA66;616969),Nyegaard等人(2015)鉴定了CD164基因中的杂合截短突变(R192X;603356.0001). 结合连锁分析和候选基因测序发现的突变与该家族中的疾病分离。体外功能表达研究表明,突变导致突变蛋白的异常细胞内运输。46例耳聋先证者CD164基因的直接测序没有发现任何额外的突变。


ALLELIC变体( 1选定示例):

.0001失聪,自动控制66(1个家族)

常染色体显性聋66(DFNA66;616969),Nyegaard等人(2015)在CD164基因第6外显子末端鉴定出杂合子c.574C-T转换(c.574C-T,NM_006016.4),导致arg192-ter(R192X)替换和c末端包含排序基序的高度保守残基的缺失。预计突变只影响膜结合亚型(亚型1-3)。该突变是通过连锁分析和候选基因测序组合发现的,与该家族中的疾病分离,在任何公共数据库或1200名无关的荷兰对照个体中均未发现。将突变基因转染HEK293细胞表明,突变蛋白主要位于质膜上,而野生型蛋白主要位于细胞内小泡中,表明突变蛋白的细胞内运输异常。免疫沉淀研究表明,突变蛋白得到了表达,并且与野生型CD164共定位并形成异二聚体。然而,没有证据表明野生型内化具有显性负效应。


参考文献

  1. Forde,S.、Tye,B.J.、Newey,S.E.、Roubelakis,M.、Smythe,J.、McGuckin,C.P.、Pettengell,R.、Watt,S.M。Endolyn(CD164)调节CXCL12介导的脐血CD133+细胞的迁移。《血液》109:1825-18332007。[公共医学:17077324,相关引文][全文]

  2. Nyegaard,M.、Rendtorff,N.D.、Nielsen,M.S.、Corydon,T.J.、Demontis,D.、Starnawska,A.、Hedemand,A.、Buniello,A.、Niola,F.、Overgaard,M.T.、Leal,S.M.、Ahmad,W.和其他10人。在一个患有非综合征性听力障碍的丹麦大家族中发现了一个携带功能性CD164无义突变的新基因座。公共科学图书馆-遗传学。11:e1005386,2015年。注:电子文章。[公共医学:26197441,相关引文][全文]

  3. Watt,S.M.、Buhring,H.-J.、Rappold,I.、Chan,J.Y.-H.、Lee-Prudhoe,J.、Jones,T.、Zannettino,A.C.W.、Simmons,P.J.、Doyonnas,R.、Sheer,D.、Butler,L.H。CD164位于人类染色体6q21上,是CD34+和红细胞亚群上的一种新型唾液酸幻觉。血液92:849-8661998。[公共医学:9680353,相关引文]

  4. Zannettino,A.C.W.、Buhring,H.-J、Niutta,S.、Watt,S.M.、Benton,M.A.、Simmons,P.J。唾液粘蛋白CD164(MGC-24v)是一种由人类造血祖细胞和骨髓基质细胞表达的粘附性糖蛋白,是造血的有效负调控因子。《血液》92:2613-26281998。[公共医学:9763543,相关引文]


Cassandra L.Kniffin-更新时间:2016年5月31日
Paul J.Converse-更新时间:2008年7月24日
创建日期:
维克托·麦库西克:1998年12月13日
卡罗尔:2019年7月30日
卡罗尔:2016年5月31日
ckniffin:2016年5月31日
mgross:2008年8月15日
特里:2008年7月24日
dkim:12/14/1998年
卡罗尔:1998年12月13日

*603356

CD164抗原;CD164型


备选标题;符号

SIALOMUCIN CD164
ENDOLYN公司


HGNC批准的基因符号:CD164

细胞遗传学位置:6q21 基因组坐标(GRCh38): 6:109,366,514-109,382,467 (来自NCBI)


基因-表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
第6季度21 ?耳聋,常染色体显性66 616969 常染色体显性

文本

描述

唾液粘蛋白是一组异质的分泌性或膜相关粘蛋白,在体内似乎起着两个关键但相反的作用:第一是作为细胞保护剂或抗粘附剂,第二是作为粘附受体。CD164是一种I型完整的跨膜唾液酸,作为粘附受体发挥作用(Watt等人,1998年;Forde等人,2007年)。


克隆和表达

利用2种单克隆抗体和逆转录病毒表达克隆策略,Zannettino等人(1998年)分离出一个cDNA,该cDNA编码粘蛋白样糖蛋白MGC24的一种新的跨膜亚型,他们将其命名为CD164。成熟的CD164蛋白含有178个氨基酸,分子量为80至90 kD,富含丝氨酸和苏氨酸。CD164由人CD34(142230)阳性造血祖细胞表达。

Nyegaard等人(2015年)在出生后第5天的小鼠耳蜗切片中发现Cd164基因的表达。在耳蜗神经元、Corti器官的内外毛细胞以及其他几个区域都有表达。


基因功能

Zannettino等人(1998年)发现,CD164受体似乎通过促进CD34阳性细胞与骨髓基质的粘附和负调控CD34阳性HPC的生长,在造血中发挥作用。这些功能效应由至少2个空间上不同的表位介导,由特定的单克隆抗体定义。Watt等人(1998)发现,当对来自正常人骨髓、脐带血和外周血的造血细胞进行分析时,这些和其他CD164单克隆抗体显示出不同的反应模式。CD164表位的表达在骨髓中发育中的骨髓单核细胞上发现,在成熟的中性粒细胞上下调,但在外周血的单核细胞中保持不变。

使用CD133(PROM1;604365)阳性HPC和T细胞系,Forde等人(2007)证明CD164与CXCR4相关(162643)。CD164 N-连接聚糖依赖表位的抗体或通过小干扰RNA敲除的CD164抑制CD133阳性HPC向CXCL12(600835),即CXCR4配体的迁移。CXCL12与纤维连接蛋白(FN1;135600)相关,在CXCR4与纤维联蛋白受体VLA4(参见ITGA4;192975)和VLA5(参见ITGA5;135620)相关后,诱导CD164与CXCR4相关。CD164-CXCR4关联与PKC-zeta(PRKCZ;176982)和AKT(164730)信号通过CXCR4一致。Forde等人(2007年)得出结论,包括CD164在内的3个不同的细胞表面受体家族之间的关联调节细胞迁移反应,并可能对这些细胞在骨髓中的归巢和倒伏具有特异性。


映射

Watt等人(1998)鉴定了含有CD164基因的PAC克隆,并使用这些克隆通过FISH将CD164基因定位到染色体6q21上。


分子遗传学

在一个患有常染色体显性耳聋66(DFNA66;616969)的多代荷兰家族的受影响成员中,Nyegaard等人(2015)在CD164基因(R192X;603356.0001)中发现了一个杂合截短突变。结合连锁分析和候选基因测序发现的突变与该家族中的疾病分离。体外功能表达研究表明,突变导致突变蛋白的异常细胞内运输。46例耳聋先证者CD164基因的直接测序没有发现任何额外的突变。


ALLELIC变体 1选定示例):

.0001失聪,自动控制66(1个家族)

CD164、ARG192TER
单号:rs876661402,临床变量:RCV000223938

在一个患有常染色体显性聋-66(DFNA66;616969)的多代荷兰家庭的受影响成员中,Nyegaard等人(2015)在CD164基因第6外显子末端发现了杂合c.574C-T转换(c.574C-T,NM_006016.4),导致arg192-ter(R192X)C末端包含排序基序的高度保守残基的替换和缺失。预计突变只影响膜结合亚型(亚型1-3)。该突变是通过连锁分析和候选基因测序组合发现的,与该家族中的疾病分离,在任何公共数据库或1200名无关的荷兰对照个体中均未发现。将突变基因转染HEK293细胞表明,突变蛋白主要位于质膜上,而野生型蛋白主要位于细胞内小泡中,表明突变蛋白的细胞内运输异常。免疫沉淀研究表明,突变蛋白得到了表达,并且与野生型CD164共定位并形成异二聚体。然而,没有证据表明野生型内化具有显性负效应。


参考文献

  1. Forde,S.、Tye,B.J.、Newey,S.E.、Roubelakis,M.、Smythe,J.、McGuckin,C.P.、Pettengell,R.、Watt,S.M。Endolyn(CD164)调节CXCL12介导的脐血CD133+细胞的迁移。《血液》109:1825-18332007。[公共医学:17077324][全文:https://doi.org/10.1182/bloud-2006-05-023028]

  2. Nyegaard,M.、Rendtorff,N.D.、Nielsen,M.S.、Corydon,T.J.、Demontis,D.、Starnawska,A.、Hedemand,A.、Buniello,A.、Niola,F.、Overgaard,M.T.、Leal,S.M.、Ahmad,W.和其他10人。在一个患有非综合征性听力障碍的丹麦大家族中发现一个新的基因座,该基因座含有功能性CD164无义突变。公共科学图书馆-遗传学。11:e1005386,2015年。注:电子文章。[公共医学:26197441][全文:https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1005386]

  3. Watt,S.M.、Buhring,H.-J.、Rappold,I.、Chan,J.Y.-H.、Lee-Prudhoe,J.、Jones,T.、Zannettino,A.C.W.、Simmons,P.J.、Doyonnas,R.、Sheer,D.、Butler,L.H。CD164位于人类染色体6q21上,是CD34+和红细胞亚群上的一种新型唾液酸幻觉。血液92:849-8661998。[公共医学:9680353]

  4. Zannettino,A.C.W.,Buhring,H.-J.,Niutta,S.,Watt,S.M.,Benton,M.A.,Simmons,P.J。唾液粘蛋白CD164(MGC-24v)是一种由人类造血祖细胞和骨髓基质细胞表达的粘附性糖蛋白,是造血的有效负调控因子。《血液》92:2613-26281998。[公共医学:9763543]


贡献者:
Cassandra L.Kniffin-更新时间:2016年5月31日
Paul J.Converse-更新时间:2008年7月24日

创建日期:
维克托·麦库西克:1998年12月13日

编辑历史记录:
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