条目-*602336-酪氨酸激酶样受体1;风险回报率1-OMIM公司
 
*602336

酪氨酸激酶样受体1;风险回报率1


备选标题;符号

神经营养性酪氨酸激酶,受体相关1;NTRKR1号机组


HGNC批准的基因符号:风险回报率1

细胞遗传学位置:第11.3页   基因组坐标(GRCh38):1:63,774,017-64,181,498 (来自NCBI)


基因表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
第11.3页 ?耳聋,常染色体隐性遗传108 617654 应收账

文本

描述

受体酪氨酸激酶(RTK),包括ROR1基因,是一个跨膜糖蛋白大超家族,作为细胞表面受体发挥作用。RTK在控制最基本的细胞过程中发挥作用,包括细胞增殖、分化、迁移和代谢(由Afzal和Jeffery,2003年).


克隆和表达

使用基于NTRK1保守区的引物进行简并PCR(191315)和NTRK2(600456),马西亚科夫斯基和卡罗尔(1992)确定了ROR1,他们称之为NTRKR1,和ROR2(602337)他们称之为NTRKR2,是神经营养性TRK基因家族的成员。NTRKR1编码一个预测的937氨基酸蛋白质。通过Northern印迹分析,Reddy等人(1996)显示6-kb NTRKR1 mRNA在人类心脏、肺和肾中强烈表达,但在中枢神经系统中弱表达。然而,缺少细胞外和跨膜结构域的截短2.4-kb mRNA在胎儿和成人中枢神经系统和多种人类癌症中强烈表达,包括源于中枢神经系统或PNS神经外胚层的癌症。

通过小鼠出生后第0天的qPCR,Diaz-Horta等人(2016)发现Ror1在肺部的表达最高,其次是肾脏、肝脏和内耳。脾脏、心脏和大脑中的表达较低。胚胎第14.5天,在螺旋神经节和耳蜗上皮(CE)中检测到Ror1。在此阶段,螺旋神经节神经元(SGN)已经通过CE投射,到达分化的听觉毛细胞。Ror1也在前庭表达。E17.5时,靠近听觉毛细胞的SGN轴突终末中Ror1信号增强。通过P0,Ror1在螺旋神经节和SGN终末表达。


映射

通过FISH分析,Reddy等人(1997)将ROR1基因定位到染色体1p32-p31。

总额(2017年)根据ROR1序列的比对(GenBankBC080541号)具有基因组序列(GRCh38)。


分子遗传学

2名兄弟姐妹出生于土耳其近亲父母,患有非综合征性感音神经性聋(DFNB108;617654),Diaz-Horta等人(2016)在ROR1基因(R736T;602336.0001). 通过外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变与听力损失分离。ExAC、EVS或1000基因组项目数据库或330名土耳其对照中均未发现该突变。


动物模型

使用靶向基因破坏,Nomi等人(2001年)生成的小鼠缺乏功能性Ror1基因。这些小鼠没有明显的骨骼或心脏异常,但出生后不久就死于呼吸功能障碍。Nomi等人(2001年)假设缺乏骨骼和心脏表型可能是由于Ror2的补偿。作者培育了同时缺乏Ror1和Ror2基因的双突变小鼠。使用骨骼制剂,他们观察到Ror1/Ror2双突变小鼠的骨骼异常比Ror2突变小鼠的更严重,包括胸骨缺损、耻骨联合发育不良。心脏切片的组织学分析显示,双突变小鼠表现出完全的大动脉转位,这在任何一个突变中都没有发现。Nomi等人(2001年)得出结论,Ror1和Ror2在功能上是多余的,它们在骨骼和心脏发育中具有遗传相互作用。

Diaz-Horta等人(2016)证明Ror1突变小鼠耳聋严重,耳声发射保持不变。他们的耳蜗被压扁并缩短。螺旋神经节神经元轴突显示束状缺陷。I型神经元与内毛细胞的突触受损,II型神经元通过耳蜗感觉上皮显示异常投射。Diaz-Horta等人(2016)结论ROR1对螺旋神经节神经元支配听觉毛细胞至关重要。


ALLELIC变体( 1选定示例)以下为:

.0001死亡,自体凹陷108(1个家族)

错误1,ARG736THR
   RCV000504579型

2名兄弟姐妹出生于土耳其近亲父母,患有非综合征性感音神经性聋(DFNB108;617654),Diaz-Horta等人(2016)已确定ROR1基因中c.2207G-c颠倒(c.2207C-c,NM_005012.3)的纯合子,导致arg736-to-thr(R736T)替代。通过外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变与听力损失分离。ExAC、EVS或1000基因组项目数据库或330名土耳其对照中均未发现该突变。分子模拟表明,突变氨基酸定位于酪氨酸激酶催化域,导致构象变化,可能损害底物结合。在MDCK II细胞的转染研究中,野生型ROR1定位于质膜,而突变型ROR2仅在质膜上低表达。其他研究表明,突变型ROR1由于错误折叠或底物保护而增强泛素化。WNT5A在场(164975)已知ROR1配体,突变的ROR1未能激活NFKB(参见164011).


参考文献

  1. Afzal,A.R.,Jeffery,S。一个基因,两种表型:常染色体隐性Robinow综合征和常染色体显性短趾B型的ROR2突变。嗯,变种人。22: 1-11, 2003.[公共医学:12815588,相关引文][全文]

  2. Diaz-Horta,O.,Abad,C.,Sennaroglu,L.,Foster,J.,II,DeSmidt,A.,Bademci,G.,Tokgoz-Yilmaz,S.,Duman,D.,Cengiz,F.B.,Grati,M.,Fitoz,S..,Liu,X.Z.和其他9人。ROR1对人和小鼠的听觉毛细胞和听力的正常神经支配至关重要。程序。美国国家科学院。科学。113: 5993-5998, 2016.[公共医学:27162350,相关引文][全文]

  3. 毛重,M.B。个人沟通。马里兰州巴尔的摩,2017年9月13日。

  4. 马西亚科夫斯基,P.,卡罗尔,R.D。一个新的具有酪氨酸激酶样结构域的细胞表面受体家族。生物学杂志。化学。267: 26181-26190, 1992.[公共医学:1334494,相关引文]

  5. Nomi,M.、Oishi,I.、Kani,S.、Suzuki,H.、Matsuda,T.、Yoda,A.、Kitamura,M.、Itoh,K.、Takeuchi,S.、Takeda,K.、Akira,S.、Ikeya,M.、Takada,S.、Minami,Y。mRor1缺失增强了mRor2缺乏小鼠的心脏和骨骼异常:mRor1-mRor2-受体酪氨酸激酶的冗余和多效性功能。摩尔。单元格。生物学21:8329-83352001。[公共医学:11713269,图像,相关引文][全文]

  6. Reddy,U.R.、Phatak,S.、Allen,C.、Nycum,L.M.、Sulman,E.P.、White,P.S.、Biegel,J.A。通过荧光原位杂交和体细胞杂交分析将人类Ror1基因(NTRKR1)定位到染色体1p31-p32。基因组学41:283-2851997。[公共医学:9143508,相关引文][全文]

  7. Reddy,U.R.、Phatak,S.、Pleasure,D。人类神经组织表达截断的Ror1受体酪氨酸激酶,缺乏细胞外和跨膜结构域。癌基因13:1555-15591996。[公共医学:8875995,相关引文]


Matthew B.Gross-更新日期:2017年9月13日
Carol A.Bocchini-更新时间:2017年8月30日
Dawn Watkins-展示-更新日期:4/17/2002
创建日期:
丽贝卡·S·拉苏利:1998年2月10日
mgross:2017年9月13日
卡罗尔:2017年8月31日
卡罗尔:2017年8月30日
wwang:2010年12月10日
wwang:2010年11月10日
mgross:2002年4月17日
mgross:2002年4月17日
mgross:2002年4月17日
mgross:2000年2月28日
阿洛佩兹:1998年2月10日

*602336

酪氨酸激酶样受体1;风险回报率1


备选标题;符号

神经营养性酪氨酸激酶,受体相关1;NTRKR1号机组


HGNC批准的基因符号:ROR1

细胞遗传学位置:1p31.3   基因组坐标(GRCh38):1:63774017-64181498 (来自NCBI)


基因表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
第11.3页 ?耳聋,常染色体隐性遗传108 617654 常染色体隐性遗传

文本

描述

受体酪氨酸激酶(RTK),包括ROR1基因,是一个跨膜糖蛋白大超家族,作为细胞表面受体发挥作用。RTK在控制最基本的细胞过程中发挥作用,包括细胞增殖、分化、迁移和代谢(由Afzal和Jeffery总结,2003年)。


克隆和表达

通过使用基于NTRK1(191315)和NTRK2(600456)保守区域的引物进行简并PCR,Masiakowski和Carroll(1992)将ROR1(他们称之为NTRKR1)和ROR2(602337)(他们称其为NTRQR2)鉴定为神经营养性TRK基因家族的成员。NTRKR1编码一个预测的937氨基酸蛋白质。通过Northern印迹分析,Reddy等人(1996)表明,6-kb的NTRKR1 mRNA在人类心脏、肺和肾中强烈表达,但在中枢神经系统中表达较弱。然而,缺少细胞外和跨膜结构域的截短2.4-kb mRNA在胎儿和成人中枢神经系统和多种人类癌症中强烈表达,包括源于中枢神经系统或PNS神经外胚层的癌症。

通过在小鼠出生后第0天进行qPCR,Diaz-Horta等人(2016)发现Ror1在肺部的表达最高,其次是肾脏、肝脏和内耳。脾脏、心脏和大脑中的表达较低。胚胎第14.5天,在螺旋神经节和耳蜗上皮(CE)中检测到Ror1。在此阶段,螺旋神经节神经元(SGN)已经通过CE投射,到达分化的听觉毛细胞。Ror1也在前庭表达。E17.5时,靠近听觉毛细胞的SGN轴突终末中Ror1信号增强。P0时,Ror1在螺旋神经节和SGN终末表达。


映射

通过FISH分析,Reddy等人(1997年)将ROR1基因映射到染色体1p32-p31。

Gross(2017)根据ROR1序列(GenBank BC080541)与基因组序列(GRCh38)的比对,将ROR1基因映射到染色体1p31.3。


分子遗传学

Diaz-Horta等人(2016年)在2名患有非综合征性感音神经性耳聋(DFNB108;617654)的兄弟姐妹中,发现ROR1基因(R736T;602336.001)存在纯合子错义突变。通过外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变与听力损失分离。ExAC、EVS或1000基因组项目数据库或330名土耳其对照中均未发现该突变。


动物模型

Nomi等人(2001年)通过靶向基因破坏,培育出缺乏功能性Ror1基因的小鼠。这些小鼠没有明显的骨骼或心脏异常,但出生后不久就死于呼吸功能障碍。Nomi等人(2001年)假设,骨骼和心脏表型的缺乏可能是由于Ror2的补偿所致。作者培育了同时缺乏Ror1和Ror2基因的双突变小鼠。使用骨骼制剂,他们观察到Ror1/Ror2双突变小鼠的骨骼异常比Ror2突变小鼠的更严重,包括胸骨缺损、耻骨联合发育不良。心脏切片的组织学分析显示,双突变小鼠表现出完全的大动脉转位,这在任何一个突变中都没有发现。Nomi等人(2001年)得出结论,Ror1和Ror2在功能上是多余的,它们在骨骼和心脏发育中具有遗传相互作用。

Diaz-Horta等人(2016年)证明Ror1突变小鼠有严重的耳聋,耳声发射保持不变。他们的耳蜗被压扁并缩短。螺旋神经节神经元轴突显示束状缺陷。I型神经元与内毛细胞的突触受损,II型神经元通过耳蜗感觉上皮显示异常投射。Diaz-Horta等人(2016年)得出结论,ROR1对螺旋神经节神经元支配听觉毛细胞至关重要。


ALLELIC变体 1选定示例):

.0001耳聋,自动耳塞108(1个家族)

ARG736THR ROR1
SNP:rs1553163562,临床变量:RCV000504579

Diaz-Horta等人(2016年)在2名患有非综合征性感音神经性耳聋(DFNB108;617654)的兄弟姐妹中,确定了ROR1基因中c.2207G-c颠换(c.2207C-c,NM_005012.3)的纯合子,导致arg736-to-thr(R736T)替代。通过外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变与听力损失分离。ExAC、EVS或1000基因组项目数据库或330名土耳其对照中均未发现该突变。分子模拟表明,突变氨基酸定位于酪氨酸激酶催化域,导致构象变化,可能损害底物结合。在MDCK II细胞的转染研究中,野生型ROR1定位于质膜,而突变型ROR2仅在质膜上低表达。其他研究表明,突变型ROR1由于错误折叠或底物保护而增强泛素化。在已知ROR1配体WNT5A(164975)存在的情况下,突变的ROR1未能激活NFKB(参见164011)。


参考文献

  1. 阿夫扎尔,A.R.,杰弗里,S。一个基因,两种表型:常染色体隐性Robinow综合征和常染色体显性短趾B型的ROR2突变。嗯,变种人。22: 1-11, 2003.[PubMed:12815588][全文:https://doi.org/10.1002/humu.10233]

  2. Diaz-Horta,O.,Abad,C.,Sennaroglu,L.,Foster,J.,II,DeSmidt,A.,Bademci,G.,Tokgoz-Yilmaz,S.,Duman,D.,Cengiz,F.B.,Grati,M.,Fitoz,S..,Liu,X.Z.和其他9人。ROR1对人和小鼠的听觉毛细胞和听力的正常神经支配至关重要。程序。美国国家科学院。科学。113: 5993-5998, 2016.[公共医学:27162350][全文:https://doi.org/10.1073/pnas.1522512113]

  3. 毛重,M.B。个人沟通。马里兰州巴尔的摩,2017年9月13日。

  4. 马西亚科夫斯基,P.,卡罗尔,R.D。一个新的具有酪氨酸激酶样结构域的细胞表面受体家族。生物学杂志。化学。267: 26181-26190, 1992.[公共医学:1334494]

  5. Nomi,M.、Oishi,I.、Kani,S.、Suzuki,H.、Matsuda,T.、Yoda,A.、Kitamura,M.,Itoh,K.、Takeuchi,S.,Takeda,K.,Akira,S.和Ikeya,M..、Takada,S.以及Minami,Y。mRor1缺失增强了mRor2缺乏小鼠的心脏和骨骼异常:mRor1-mRor2-受体酪氨酸激酶的冗余和多效性功能。摩尔。单元格。生物杂志21:8329-83352001。[公共医学:11713269][全文:https://doi.org/10.1128/MCB.21.24.8329-8335.2001]

  6. Reddy,U.R.、Phatak,S.、Allen,C.、Nycum,L.M.、Sulman,E.P.、White,P.S.、Biegel,J.A。通过荧光原位杂交和体细胞杂交分析将人类Ror1基因(NTRKR1)定位到染色体1p31-p32。基因组学41:283-2851997。[公共医学:9143508][全文:https://doi.org/10.1006/geno.1997.4653]

  7. Reddy,U.R.、Phatak,S.、Pleasure,D。人类神经组织表达截断的Ror1受体酪氨酸激酶,缺乏细胞外和跨膜结构域。癌基因13:1555-15591996。[公共医学:8875995]


贡献者:
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丽贝卡·S·拉苏利:1998年2月10日

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