条目-*314990-锌指蛋白711;ZNF711型-OMIM公司
 
*314990

锌指蛋白711;ZNF711型


备选标题;符号

锌指蛋白6;ZNF6型
CMPX1型


HGNC批准的基因符号:ZNF711型

细胞遗传学位置:Xq21.1号机组   基因组坐标(GRCh38):X: 852243991-85273357 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
Xq21.1号机组 智力发育障碍,X连锁97 300803 特大号

文本

克隆和表达

Habeebu等人(1989年)用含锌指基序的探针筛选,从人睾丸cDNA文库中分离出2条DNA序列。

Lloyd等人(1991年)注意到ZNF6基因在物种间高度保守。雄性和雌性小鼠的剂量表明,在该物种中也存在X连锁。ZFX公司(314980)ZFY和ZNF6可能来自一个共同的祖先基因。


映射

利用Southern blot分析含有各种常染色体补体和各种缺失X染色体的体细胞杂种的基因组DNA,Habeebu等人(1989年)将CMPX1基因映射到Xq13-q24。通过原位杂交、体细胞杂种分析和携带缺失X染色体的雄性研究,Lloyd等人(1991年)将CMPX1(ZNF6)基因映射到Xq21.1-q21.3。原位杂交显示CMPX1映射到Xq13和Xq21之间的边界。

Lloyd等人(1991年)将ZNF6基因定位到X染色体的近端长臂中显示与Y染色体的区域同源的区域。


分子遗传学

Tarpey等人(2009年)对208个分离出X连锁智力发育障碍的家族中X染色体的所有外显子进行测序。两个家族被鉴定为ZNF711基因的截断突变(314990.0001314990.0002). 这种非特异性智力发育障碍被命名为XLID97(300803).

在两个不相关的XLID97家族的男性患者中,van der Werf等人(2017)确定ZNF711基因的半合子突变(314990.0003314990.0004). 结合连锁分析和全基因组测序发现的突变与家族中的疾病分离。与对照组相比,患者细胞显示出大脑中已知表达的几个基因的差异表达,这与ZNF711作为转录因子的假定功能一致。


历史

Habeebu等人(1989年)据报道,5CMP1定位于5号染色体上的两个不同的基因座,一个位于5p14-p13,另一个位于5q12-q13。Habeebu等人(1989年)建议用符号TZF1和TZF2表示第5染色体上的2个锌指位点,用符号XF1表示X染色体上的位点。人类基因图谱研讨会常设命名委员会分别推荐这3个位点的ZNF4、ZNF5和ZNF6。斯科特(2007)表示没有支持指定ZNF4和ZNF5基因座的证据。


ALLELIC变体( 4精选示例):

.0001智力发育障碍,X-LINKED 97

ZNF711,2-BP DEL,2157TG
   RCV000010416。。。

在一个分离X染色体连锁智力发育障碍的家庭中——97(XLID97;300803),Tarpey等人(2009年)在ZNF711基因的2157核苷酸处发现一个2 bp的TG缺失,导致移码和提前终止(719fsTer1)。突变与表型分离。


.0002智力发育障碍,X-LINKED 97

在一个大家庭中分离出X连锁智力发育障碍-97(XLID97;300803),Tarpey等人(2009年)在ZNF711基因的1573核苷酸处发现了C-T转换,导致精氨酸-525(R525X)提前终止。突变与受累男性的表型分离。


.0003智力发育障碍,X-LINKED 97

ZNF711,1-BP DEL,2054T
   RCV000477669号机组

来自4代比利时家庭(a家族)的3名患有X连锁智力发育障碍的受影响男性97(XLID97;300803),van der Werf等人(2017)在ZNF711基因的最后一个外显子中发现一个1 bp的缺失(c.2054del,NM_021998.4),导致移码和提前终止(Phe685SerfsTer7)。该突变是通过连锁分析和全基因组测序相结合发现的,并经Sanger测序证实,与该家族中的疾病分离。在ExAC数据库中找不到它。据预测,突变转录物可以逃避非传感介导的mRNA衰变。


.0004智力发育障碍,X连锁97

荷兰一个三代家族(B家族)中6名患有X连锁智力发育障碍-97(XLID97;300803)最初报告人Yntema等人(1999)同MRX65,van der Werf等人(2017)在ZNF711基因中发现了c.731T-c转换(c.731C-c,NM_021998.4),导致了ile244-thr(I244T)替换。通过全基因组测序发现并经Sanger测序证实的突变位于先前确定的连锁区间内,并与家族中的疾病分离。在ExAC数据库中找不到它。


参考文献

  1. Habeebu,S.S.M.,Gibson,J.E.,Afara,N.A.,Ferguson-Smith,M.A。将两个锌指蛋白基因定位到(a)第5染色体5p13-14和5q12-q13上的两个位点和(b)Xq13-q21处的X长臂。(摘要)细胞遗传学。细胞遗传学。仅51:1009,1989年。

  2. Lloyd,S.L.、Sargent,C.A.、Chalmers,J.、Lim,E.、Habeebu,S.S.M.、Afara,N.A。与ZFX和ZFY密切相关的Xq21.1-q21.3的X连锁锌指基因定位:可能起源于一个共同的祖先基因。核酸研究19:4835-48411991。[公共医学:1923752,相关引文][全文]

  3. A.F.斯科特。个人沟通。马里兰州巴尔的摩,2007年2月7日。

  4. Tarpey,P.S.、Smith,R.、Pleasance,E.、Whibley,A.、Edkins,S.、Hardy,C.、O'Meara,S.,Latimer,C.、Dicks,E.、Menzies,A.、Stephens,P.、Blow,M.和其他67人。精神发育迟滞患者X染色体编码外显子的系统、大规模重测序筛查。自然遗传学。41: 535-543, 2009.[公共医学:19377476,相关引文][全文]

  5. 范德沃夫,I.M.,范迪克,A.,雷尼尔,E.,赫尔斯莫特尔,C.,库马尔,A.A.,卡尔谢尔,V.M.,德布罗沃,A.P.M.,克莱夫斯特拉,T.,范博霍文,H.,莫蒂尔,G.,詹森,S.,范德韦厄,G。两个大家系的突变突显了ZNF711在X连锁智力残疾中的作用。基因605:92-982017。[公共医学:27993705,相关引文][全文]

  6. Yntema,H.G.,van den Helm,B.,Knoers,N.V.A.M.,Smits,A.P.T.,van-Roosmalen,T.,Smeets,D.F.C.M.,Mariman,E.C.M.、van der Burgt,I.,van-Bokhoven,H.,Ropers,H.-H.,Kremer,H.、Hamel,B.C.J。X染色体连锁精神发育迟滞:一个与着丝粒周围区域相关的五代家族(MRX65)最近发生突变的证据。美国医学遗传学杂志。85: 305-308, 1999.[公共医学:10398247,相关引文][全文]


Cassandra L.Kniffin-更新日期:2017年3月23日
Ada Hamosh-更新时间:2009年10月1日
创建日期:
维克托·麦库西克:1989年9月5日
卡罗尔:2021年8月20日
卡罗尔:2018年6月21日
卡罗尔:2017年12月20日
阿洛佩兹:2017年3月29日
ckniffin:2017年3月23日
卡罗尔:2011年10月28日
脱发:2009年7月10日
特里:2009年10月1日
卡罗尔:2007年2月7日
dkim:1998年6月25日
mimadm:1994年2月28日
超级模特:1992年3月17日
卡罗尔:1991年11月19日
超级模特:1990年3月20日
日期:1989年10月26日
根:1989年9月5日

*314990

锌指蛋白711;ZNF711型


备选标题;符号

锌指蛋白6;ZNF6型
CMPX1型


HGNC批准的基因符号:ZNF711

细胞遗传学位置:Xq21.1   基因组坐标(GRCh38):X:85243991-85273357 (来自NCBI)


基因-表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
Xq21.1号机组 智力发育障碍,X连锁97 300803 X链接

文本

克隆和表达

Habeebu等人(1989年)通过使用含有锌指基序的探针进行筛选,从人类睾丸cDNA文库中分离出2个DNA序列。

Lloyd等人(1991年)指出,ZNF6基因在物种间高度保守。雄性和雌性小鼠的剂量表明,在该物种中也存在X连锁。ZFX(314980)、ZFY和ZNF6可能来源于共同的祖先基因。


映射

Habeebu等人(1989年)通过对含有各种常染色体补体和各种缺失X染色体的体细胞杂种的基因组DNA进行Southern blot分析,将CMPX1基因映射到Xq13-q24。通过原位杂交、体细胞杂种分析和携带缺失X染色体的雄性研究,Lloyd等人(1991年)将CMPX1(ZNF6)基因定位到Xq21.1-q21.3。原位杂交显示CMPX1映射到Xq13和Xq21之间的边界。

Lloyd等人(1991年)将ZNF6基因映射到X染色体近端长臂中的区域,该区域与Y染色体的某个区域具有同源性。


分子遗传学

Tarpey等人(2009年)对208个分离出X连锁智力发育障碍的家族中X染色体的所有外显子进行了测序。两个家族被鉴定为ZNF711基因存在截断突变(314990.0001和314990.00 02)。这种非特异性智力发育障碍被命名为XLID97(300803)。

van der Werf等人(2017年)在两个不相关的XLID97家族的受影响男性中发现了ZNF711基因的半合子突变(314990.0003和314990.00 04)。结合连锁分析和全基因组测序发现的突变与家族中的疾病分离。与对照组相比,患者细胞显示出大脑中已知表达的几个基因的差异表达,这与ZNF711作为转录因子的假定功能一致。


历史

Habeebu等人(1989年)报告称,5CMP1映射到5号染色体上的两个不同位点,一个位于5p14-p13,另一个位于5 q12-q13。Habeebu等人(1989年)建议用符号TZF1和TZF2表示第5染色体上的2个锌指位点,用符号XF1表示X染色体上的位点。人类基因图谱研讨会常设命名委员会分别推荐这3个位点的ZNF4、ZNF5和ZNF6。Scott(2007)表示,没有支持指定ZNF4和ZNF5基因座的证据。


ALLELIC变体 4个选定示例):

.0001智力发育障碍,X-LINKED 97

ZNF711,2-BP DEL,2157TG
SNP:rs1603009115,临床变量:RCV00010416,RCV003313027

在一个分离X连锁智力发育障碍-97(XLID97;300803)的家族中,Tarpey等人(2009年)在ZNF711基因的核苷酸2157处发现TG的2 bp缺失,导致移码和提前终止(719fsTer1)。突变与表型分离。


.0002智力发育障碍,X-LINKED 97

ZNF711、ARG525TER
SNP:rs199422240,临床变量:RCV000010417

在分离X连锁智力发育障碍-97(XLID97;300803)的一个大家族中,Tarpey等人(2009年)在ZNF711基因的核苷酸1573处发现了一个C-T转换,导致精氨酸-525(R525X)提前终止。突变与受影响男性的表型分离。


.0003智力发育障碍,X-LINKED 97

ZNF711,1-BP DEL,2054T
SNP:rs1060505032,临床变量:RCV000477669

在患有X连锁智力发育障碍-97(XLID97;300803)的4代比利时家族(a家族)的3名受影响男性中,van der Werf等人(2017年)在ZNF711基因的最后一个外显子中发现了1 bp缺失(c.2054del,NM_021998.4),导致移码和提前终止(Phe685SerfsTer7)。该突变是通过连锁分析和全基因组测序相结合发现的,并经Sanger测序证实,与该家族中的疾病分离。在ExAC数据库中找不到它。据预测,突变转录物可以逃避非传感介导的mRNA衰变。


.0004智力发育障碍,X-LINKED 97

ZNF711,ILE244THR
SNP:rs1060505033,临床变量:RCV000477705,RCV000850219

在荷兰X染色体连锁智力发育障碍97(XLID97;300803)三代家族(B家族)的6名男性患者中,最初由Yntema等人(1999年)报告为MRX65,van der Werf等人(2017年)在ZNF711基因中发现了c.731T-c转换(c.731C-c,NM_021998.4),导致ile244-thr(I244T)替代。通过全基因组测序发现并经Sanger测序证实的突变位于先前确定的连锁区间内,并与家族中的疾病分离。在ExAC数据库中找不到它。


参考文献

  1. Habeebu,S.S.M.,Gibson,J.E.,Afara,N.A.,Ferguson-Smith,M.A。将两个锌指蛋白基因定位到(a)第5染色体5p13-14和5q12-q13上的两个位点和(b)Xq13-q21处的X长臂。(摘要)细胞遗传学。细胞遗传学。仅51:1009,1989年。

  2. Lloyd,S.L.、Sargent,C.A.、Chalmers,J.、Lim,E.、Habeebu,S.S.M.、Afara,N.A。与ZFX和ZFY密切相关的Xq21.1-q21.3的X连锁锌指基因定位:可能起源于一个共同的祖先基因。核酸研究19:4835-48411991。[公共医学:1923752][全文:https://doi.org/10.1093/nar/19.18.4835]

  3. A.F.斯科特。个人沟通。马里兰州巴尔的摩,2007年2月7日。

  4. Tarpey,P.S.、Smith,R.、Pleasance,E.、Whibley,A.、Edkins,S.、Hardy,C.、O'Meara,S.、Latimer,C.、Dicks,E.、Menzies,A.、Stephens,P.、Blow,M.和其他67人。精神发育迟滞患者X染色体编码外显子的系统、大规模重测序筛查。自然遗传学。41: 535-543, 2009.[公共医学:19377476][全文:https://doi.org/10.1038/ng.367]

  5. 范德沃夫,I.M.,范迪克,A.,雷尼尔,E.,赫尔斯莫特尔,C.,库马尔,A.A.,卡尔谢尔,V.M.,德布罗沃,A.P.M.,克莱夫斯特拉,T.,范博霍文,H.,莫蒂尔,G.,詹森,S.,范德韦厄,G。两个大家系的突变突显了ZNF711在X连锁智力残疾中的作用。基因605:92-982017。[公共医学:27993705][全文:https://doi.org/10.1016/j.gene.2016.12.013]

  6. Yntema,H.G.,van den Helm,B.,Knoers,N.V.A.M.,Smits,A.P.T.,van-Roosmalen,T.,Smeets,D.F.C.M.,Mariman,E.C.M.、van der Burgt,I.,van-Bokhoven,H.,Ropers,H.-H.,Kremer,H.、Hamel,B.C.J。X染色体连锁精神发育迟滞:一个与着丝粒周围区域相关的五代家族(MRX65)最近发生突变的证据。美国医学遗传学杂志。85: 305-308, 1999.[公共医学:10398247][全文:https://doi.org/10.1002/(sici)1096-8628(19990730)85:3<305::aid-ajmg22>3.0.co;2-5]


贡献者:
Cassandra L.Kniffin-更新日期:2017年3月23日
Ada Hamosh-更新时间:2009年10月1日

创建日期:
维克托·麦库西克:1989年9月5日

编辑历史记录:
卡罗尔:2021年8月20日
卡罗尔:2018年6月21日
颂歌:2017年12月20日
阿洛佩兹:2017年3月29日
ckniffin:2017年3月23日
卡罗尔:2011年10月28日
阿洛佩兹:2009年7月10日
特里:2009年10月1日
卡罗尔:2007年2月7日
dkim:1998年6月25日
mimadm:1994年2月28日
超级模特:1992年3月17日
卡罗尔:1991年11月19日
超级模特:1990年3月20日
日期:1989年10月26日
根:1989年9月5日