条目-#300997-智力发育障碍,X-LINKED 106;XLID106号-OMIM公司
#300997

智力发育障碍,X-LINKED 106;XLID106号


备选标题;符号

精神发育迟滞,X-LINKED 106;MRX106型


表型-基因关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
基因/位点 基因/位点
MIM编号
Xq13.1号机组 智力发育障碍,X连锁106 300997 卡侬 OGT公司 300255
临床简介
 
表型系列
 

继承
-X连锁隐性
增长
高度
-身材矮小
重量
-低出生体重
头部和颈部
头部
-小头畸形(罕见)
- 多头畸形(部分患者)
面对
-长人中
- 全人字
- 额毛向上垂
耳朵
-大耳朵
- 复发性中耳炎
- 传导性听力损失(1名患者)
眼睛
-高血压
- 弱视
- 眼球震颤
- 高度远视
嘴巴
-张开嘴
- 口腔张力减退
- 脱水
GENITOURINARY公司
外生殖器(男性)
-尿道下裂
- 小睾丸
- 小阴茎
内生殖器(男性)
-隐睾症
骨骼
脊椎
-短椎骨
-斜行扫描
- 长而细的手指
神经病学
中枢神经系统
-癫痫发作(1例患者)
- 精神运动发育迟缓(所有患者)
- 智力发育受损,中度至重度
- 低血压
其他
-可能存在可变畸形特征
分子基础
-由O-连接N-乙酰氨基葡萄糖转移酶基因(OGT,300255.0001)
智力发育障碍,非综合征,X连锁-PS309530型-54个条目
位置 表型 继承 表型
映射键
表型
MIM编号
基因/位点 基因/位点
MIM编号
Xp22.3系列 智力发育障碍,X连锁2 特大号 2 300428 XLID2号机组 300428
Xp22.2版本 智力发育障碍,X连锁73 卡侬 2 300355 XLID73号 300355
Xp22.2版本 智力发育障碍,X连锁104 特大号 300983 FRMPD4系列 300838
Xp22.12像素 智力发育障碍,X连锁19 XLD(XLD) 300844 RPS6KA3系列 300075
Xp22.11变速箱 智力发育障碍,X连锁103 卡侬 300982 KLHL15号机组 300980
Xp21.3解决方案 智力发育障碍,X连锁29 卡侬 300419 ARX公司 300382
Xp21.3-p21.2接线板 智力发育障碍,X连锁21 卡侬 300143 IL1区域1 300206
Xp11-q21型 智力发育障碍,X连锁20 特大号 2 300047 XLID20型 300047
Xp11.4解决方案 智力发育障碍,X连锁58 卡侬 300210 TSPAN7公司 300096
Xp11.4解决方案 智力发育障碍,X连锁99,综合征,女性受限 XLD(XLD) 300968 美国药典9X 300072
Xp11.4解决方案 智力发育障碍,X连锁99 卡侬 300919 美国药典9X 300072
Xp11.3-q13.3 智力发育障碍,X连锁14 特大号 2 300062 XLID14号 300062
Xp11.3-p11.21型 智力发育障碍,X连锁45 特大号 2 300498 XLID45号 300498
Xp11.3-q22.3解决方案 智力发育障碍,X连锁84 卡侬 2 300505 XLID84号 300505
Xp11.3解决方案 智力发育障碍,X连锁89 XLD(XLD) 2 300848 XLID89号 300848
Xp11.3解决方案 智力发育障碍,X连锁92 卡侬 2 300851 XLID92号 300851
Xp11.3解决方案 智力发育障碍,X连锁108 卡侬 301024 SLC9A7系列 300368
Xp11.3-p11.23型 智力发育障碍,X连锁50 特大号 300115 同步1 313440
Xp11.2-q12解决方案 智力发育障碍,X连锁81 卡侬 2 300433 XLID81号 300433
Xp11.23解决方案 智力发育障碍,X连锁9 卡侬 309549 FTSJ1型 300499
Xp11.23解决方案 智力发育障碍,X连锁96 卡侬 300802 SYP公司 313475
Xp11.23解决方案 智力发育障碍,X连锁105 卡侬 300984 美国药典27X 300975
Xp11.22解决方案 Xp11.22微复制综合征 4 300705 DUPXp11.22型 300705
Xp11.22解决方案 智力发育障碍,X连锁1 XLD(XLD) 309530 IQSEC2型 300522
Xq12-q21.3型 智力发育障碍,X连锁77 卡侬 2 300454 XLID77 300454
Xq13.1号机组 智力发育障碍,X连锁100 卡侬 300923 KIF4A(基辅) 300521
Xq13.1号机组 智力发育障碍,X连锁90 卡侬 300850 DLG3(数据链路3) 300189
Xq13.1号机组 智力发育障碍,X连锁112 卡侬 301111 ZMYM3型 300061
Xq13.1号机组 智力发育障碍,X连锁106 卡侬 300997 OGT公司 300255
Xq13.2 Tonne-Kalscheuer综合征 特大号 300978 RLIM公司 300379
Xq13.3号机组 智力发育障碍,X连锁91 XLD(XLD) 4 300577 XLID91号 300577
Xq13.3号机组 智力发育障碍,X连锁98 XLD(XLD) 300912 NEXMIF公司 300524
Xq21.1号机组 智力发育障碍,X连锁93 卡侬 300659 BRWD3(刹车3) 300553
Xq21.1号机组 智力发育障碍,X连锁97 特大号 300803 ZNF711型 314990
Xq22.1号机组 ?智力发育障碍,X连锁113 卡侬 301116 CSTF2(CSTF2) 300907
Xq22.2-q26 智力发育障碍,X连锁53 卡侬 2 300324 XLID53号 300324
Xq22.3号机组 ?智力发育障碍,X连锁101 卡侬 300928 中频2 300204
Xq23-q24型 智力发育障碍,X连锁23 特大号 2 300046 XLID23号 300046
Xq23型 智力发育障碍,X连锁63 XLD(XLD) 300387 ACSL4系列 300157
Xq23型 智力发育障碍,X连锁30 卡侬 300558 PAK3系列 300142
Xq24-q25 智力发育障碍,X连锁82 卡侬 2 300518 XLID82号 300518
许继24 智力发育障碍,X连锁88 特大号 2 300852 XLID88号 300852
许继24 ?智力发育障碍,X连锁107 特大号 301013 STEEP1型 301012
Xq25-q26 智力发育障碍,X连锁46 卡侬 2 300436 XLID46号 300436
Xq25型 智力发育障碍,X连锁综合征,吴型 卡侬 300699 网格接口3 305915
Xq25型 智力发育障碍,X连锁12 卡侬 300957 THOC2号机组 300395
许继26 智力发育障碍,X连锁42 2 300372 XLID42号 300372
Xq26.3-q27.1 智力发育障碍,X连锁110 卡侬 301095 FGF13公司 300070
Xq27.3号机组 智力发育障碍,X连锁111 特大号 301107 SLITRK2系列 300561
许继28 智力发育障碍,X连锁109 卡侬 309548 楼面竣工标高2 300806
许继28 甲基丙二酸尿和同型半胱氨酸血症,cblX型 卡侬 309541 氟氯烃1 300019
许继28 智力发育障碍,X连锁41 XLD(XLD) 300849 GDI1号机组 300104
许继28 智力发育障碍,X连锁72 卡侬 300271 RAB39B型 300774
变更。X(X) 智力发育障碍,X连锁95 XLD(XLD) 2 300716 XLID95型 300716

文本

此条目使用数字符号(#),因为有证据表明X连锁智力发育障碍-106(XLID106)是由OGT基因的半合子突变引起的(300255)在染色体Xq13上。


临床特征

Willems等人(2017年)据报道,2名无关男孩患有X染色体连锁精神发育迟滞。一名患者有更显著的畸形特征,包括高音、低耳、宽鼻子、丰满嘴唇、多余乳头、脚趾发育不全、轻度下颌后缩、手指长而细、斜趾、小头、弱视和可能的散光。还出现了其他神经系统症状,包括锥体综合征、轻度痉挛性双瘫和行为行为障碍。脑显像显示他患有二叶主动脉瓣和脑室周围白质软化症。第二名患者出现口腔张力减退,伴有流口水、眼球震颤、散光和远视。其他特征包括小阴茎、双颞叶狭窄和室间隔缺损。

Vaidyanathan等人(2017)报告了一个智力残疾家庭的3名男性患者。患者年龄分别为56.5岁、14.7岁和6.7岁,智商范围为49至61。可变的其他轻微异常包括头围小、无名指倾斜、毛发卷曲、张口、上唇薄、尿道下裂和睾丸小。

Selvan等人(2018)报告了来自2个家庭的3名患者,包括一对同胞。所有3名患者都有智力残疾、发育迟缓和畸形特征。患者1还患有小头畸形和甲状腺功能减退。他从4岁开始癫痫发作,7岁时的脑部MRI显示胼胝体较薄,脑室周围区域信号异常。7岁时的脊柱MRI显示椎体高度降低,尤其是胸椎和腰椎区域,以及第一颈椎发育不良的短斜坡。两个兄弟姐妹(患者2和3)都有复发性中耳感染。这对兄弟姐妹有两个叔父和一个叔父患有智力残疾,但尚未进行分子检测。

Pravata等人(2020年)据报道,一名爱沙尼亚患者在4个月大时出现复发性中耳炎。在鼓膜切开术后,他出现了低肌张力和发育迟缓。19个月大时,他患有躯干共济失调、张力减退和轻度心包积液。7岁8个月大的时候,他有斜视、大耳朵和流口水。他有超弹性结缔组织,经常出现关节脱位和脊柱侧凸。脑MRI显示脑萎缩和大池。

Pravata等人(2020)报告了来自7个家庭的13名患者的临床特征。所有13名患者都有发育迟缓和智力残疾。5名患者出现脑部异常,3名患者出现小头畸形。其他神经系统特征包括行为问题(7/11)和张力减退(4/5)。畸形特征包括长头畸形(4/6)、额毛上垂畸形(4/9)、人中全长畸形(5/9)和斜趾畸形(9/13)。其他特征包括眼睛异常(5/10)、耳朵异常/听力损伤(5/11)和生殖器异常(3/8)。


继承

XLID106在家系中的传播模式Vaidyanathan等人(2017)与X连锁隐性遗传一致。


分子遗传学

在XLID106家族(K9427)的3名男性患者中,Vaidyanathan等人(2017)在OGT基因(L254F;300255.0001). 通过外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变与该家族中的疾病分离。患者细胞显示OGT蛋白水平降低,表明突变蛋白不稳定,但细胞转染研究表明突变酶保留OGT催化活性。由于代偿机制,即OGA(MGEA5;604039)蛋白质和mRNA水平。OGA启动子活性降低与含有mSin3A的OGT转录抑制复合物的富集有关(607776)和HDAC1(601241)定位于OGA近端启动子区。突变细胞的转录组分析显示了几个基因的差异表达。女性突变携带者表现出高度偏斜的X失活。

在2例XLID106无关男孩中,Willems等人(2017年)确定OGT基因的半合子突变(300255.0002300255.0003). 通过外显子组测序发现突变并通过Sanger测序证实;其中一个突变是从头发生的,而另一个是从未受影响的母亲那里遗传来的。患者细胞的OGT蛋白水平略有降低,OGA蛋白水平也有所降低,但总体O-GlcNAc水平与对照组相似。1个突变的重组研究(R284P;300255.0002)结果表明,突变OGT易于去折叠,并对复杂的糖基化底物阵列降低了糖基化活性。HCFC1的蛋白质水解处理(300019)也减少了。研究结果表明,O-GlcNAc稳态和HCFC1蛋白水解缺陷可能在OGT突变患者的智力残疾中起作用。

Selvan等人(2018)OGT基因(A259T,300255.0004和E339G,300255.0005)来自2个家庭的3名患者,包括一对同胞,XLID106。这两个家族的突变都是母系遗传的。具有A259T或E339G突变的重组OGT的功能评估显示,与野生型蛋白相比,稳定性降低,催化活性降低。人类胚胎干细胞系中表达OGT的A259T或E339G突变的RNA-seq转录组学分析显示LXR/RXR通路下调,这与神经元发育有关。与野生型相比,在任一突变细胞系中均未观察到O-GlcNAc总谱的变化。

Pravata等人(2020年)报道了OGT基因中的一个半合子错义突变(N648Y;300255.0006)XLID106患者。与野生型相比,具有N648Y突变的重组OGT蛋白的底物结合降低,模型受体底物TAB1的糖基化降低。


参考文献

  1. Pravata,V.M.、Gundogdu,M.、Bartual,S.G.、Ferenbach,A.T.、Stavridis,M.、Ounap,K.、Pajusalu,S.、Zordania,R.、Wojcik,M.H.、van Aalten,D.M.F。O-GlcNAc转移酶催化域中的错义突变将蛋白质O-GlcNA酰化的扰动与X-连锁智力残疾联系在一起。FEBS信函。594: 717-727, 2020.[公共医学:31627256,图像,相关引文][全文]

  2. Pravata,V.M.、Omelkova,M.、Stavridis,M.P.、Desbiens,C.M.、Stephen,H.M.,Lefeber,D.J.、Gecz,J.、Gundogdu,M、Ounap,K.、Joss,S.、Schwartz,C.E.、Wells,L.、van Aalten,D.M.F。O-GlcNAc转移酶单核苷酸变异的智力残疾综合征。欧洲。J.Hum.遗传学。28: 706-714, 2020.[公共医学:32080367,图像,相关引文][全文]

  3. Selvan,N.、George,S.、Serajee,F.J.、Shaw,M.、Hobson,L.、Kalscheuer,V.、Prasad,N.,Levy,S.E.、Taylor,J.、Aftimos,S.,Schwartz,C.E.、Huq,A.M.、Gecz,J.和Wells,L。O-GlcNAc转移酶错义突变与X-连锁智力残疾解除调控基因相关,涉及细胞命运决定和信号传导。生物学杂志。化学。293: 10810-10824, 2018.[公共医学:29769320,图像,相关引文][全文]

  4. Vaidyanathan,K.、Niranjan,T.、Selvan,N.、Teo,C.F.、May,M.、Patel,S.、Weatherly,B.、Skinner,C.、Opitz,J.、Carey,J.,Viskochil,D.、Gecz,J..、Shaw,M.,Peng,Y.、Alexov,E.、Wang,T.,Schwartz,C.、Wells,L。O-连锁β-N-乙酰氨基葡萄糖(O-GlcNAc)转移酶基因错义突变的鉴定和特征,该基因与X-连锁智力残疾分离。生物学杂志。化学。292: 8948-8963, 2017.[公共医学:28302723,图像,相关引文][全文]

  5. Willems,A.P.,Gundogdu,M.,Kempers,M.J.E.,Giltay,J.C.,Pfundt,R.,Elferink,M,Loza,B.F.,Fuijkschot,J.,Ferenbach,A.T.,van Gassen,K.L.I.,van-Aalten,D.M.F.,Lefeber,D.J。X连锁智力残疾患者的N-乙酰氨基葡萄糖(O-GlcNAc)转移酶突变。生物学杂志。化学。292: 12621-12631, 2017.[公共医学:28584052,图像,相关引文][全文]


贡献者:
Hilary J.Vernon-更新日期:2022年9月25日
创建日期:
卡桑德拉·克尼芬(Cassandra L.Kniffin):2017年6月21日
阿洛佩兹:2023年3月27日
颂歌:2022年9月25日
阿洛佩兹:2021年8月19日
卡罗尔:2017年8月8日
卡罗尔:2017年6月23日
ckniffin:2017年6月21日

#300997

智力发育障碍,X连锁106;XLID106号


备选标题;符号

精神发育迟滞,X-LINKED 106;MRX106型


完成日期:0080240;  


表型-基因关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
基因/位点 基因/位点
MIM编号
Xq13.1号机组 智力发育障碍,X连锁106 300997 X连锁隐性 OGT公司 300255

文本

此条目使用数字符号(#),因为有证据表明X连锁智力发育障碍-106(XLID106)是由染色体Xq13上OGT基因(300255)的半合子突变引起的。


临床特征

Willems等人(2017年)报告了两名与X相关的精神发育迟滞无关的男孩。一名患者有更显著的畸形特征,包括高音、低耳、宽鼻子、丰满嘴唇、多余乳头、脚趾发育不全、轻度下颌后缩、手指细长、斜趾、小头、弱视和可能的散光。还出现了其他神经系统症状,包括锥体综合征、轻度痉挛性双瘫和行为行为障碍。他有一个二叶主动脉瓣和脑室周围白质软化的脑部影像。第二名患者出现口腔张力减退,伴有流口水、眼球震颤、散光和远视。其他特征包括小阴茎、双颞叶狭窄和室间隔缺损。

Vaidyanathan等人(2017年)报告了来自一个智障家庭的3名男性患者。患者年龄分别为56.5岁、14.7岁和6.7岁,智商范围为49至61。可变的其他轻微异常包括头围小、无名指倾斜、毛发卷曲、张口、上唇薄、尿道下裂和睾丸小。

Selvan等人(2018年)报告了来自2个家庭的3名患者,包括一对同胞。所有3名患者都有智力残疾、发育迟缓和畸形特征。患者1还患有小头畸形和甲状腺功能减退。他从4岁开始癫痫发作,7岁时的脑部MRI显示胼胝体较薄,脑室周围区域信号异常。7岁时的脊柱MRI显示椎体高度降低,尤其是胸椎和腰椎区域,以及第一颈椎发育不良的短斜坡。两个兄弟姐妹(患者2和3)都有复发性中耳感染。这对兄弟姐妹有两个叔父和一个叔父患有智力残疾,但尚未进行分子检测。

Pravata等人(2020年)报告了一名爱沙尼亚患者,他从4个月大时开始出现复发性中耳炎。在鼓膜切开术后,他出现了低肌张力和发育迟缓。19个月大时,他患有躯干共济失调、张力减退和轻度心包积液。7岁8个月大的时候,他有斜视、大耳朵和流口水。他有超弹性结缔组织,经常出现关节脱位和脊柱侧凸。脑MRI显示脑萎缩和大池。

Pravata等人(2020年)在对来自7个家庭的13名患者的回顾中报告了临床特征。所有13名患者都有发育迟缓和智力残疾。5名患者出现脑部异常,3名患者出现小头畸形。其他神经系统特征包括行为问题(7/11)和张力减退(4/5)。畸形特征包括多头畸形(4/6)、额毛上翘畸形(4/9)、全/长人中畸形(5/9)和斜指畸形(9/13)。其他特征包括眼睛异常(5/10)、耳朵异常/听力损伤(5/11)和生殖器异常(3/8)。


继承

Vaidyanathan等人(2017)报告的XLID106在家系中的传播模式与X连锁隐性遗传一致。


分子遗传学

Vaidyanathan等人(2017年)在一个XLID106家族(K9427)的3名受影响男性中,发现OGT基因(L254F;300255.0001)存在半合子错义突变。通过外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变与该家族中的疾病分离。患者细胞显示OGT蛋白水平降低,表明突变蛋白不稳定,但细胞转染研究表明突变酶保留了OGT催化活性。由于代偿机制,即OGA(MGEA5;604039)蛋白和mRNA水平降低,患者细胞具有正常的稳态全局O-GlcNAc水平。OGA启动子活性降低与含有OGT的转录抑制复合物的富集有关,该复合物含有定位于OGA近端启动子区域的mSin3A(607776)和HDAC1(601241)。突变细胞的转录组分析显示了几个基因的差异表达。女性突变携带者表现出高度偏斜的X失活。

Willems等人(2017年)在2名患有XLID106的无关男孩中发现OGT基因的半合子突变(300255.0002和300255.0003)。通过外显子组测序发现突变并通过Sanger测序证实;其中一个突变是从头发生的,而另一个是从未受影响的母亲那里遗传来的。患者细胞的OGT蛋白水平略有降低,OGA蛋白水平也有所降低,但总体O-GlcNAc水平与对照组相似。对其中一个突变(R284P;300255.0002)的重组研究表明,突变OGT易于去折叠,并对复杂的糖基化底物阵列具有降低的糖基化度活性。HCFC1(300019)的蛋白质水解处理也有所减少。研究结果表明,O-GlcNAc稳态和HCFC1蛋白水解缺陷可能在OGT突变患者的智力残疾中起作用。

Selvan等人(2018年)在2个家族的3名患者中发现了OGT基因的半合子突变(A259T,300255.0004和E339G,300255.00 05),包括一对XLID106的同胞对。这两个家族的突变都是母系遗传的。具有A259T或E339G突变的重组OGT的功能评估表明,与野生型蛋白相比,稳定性降低,催化活性降低。人类胚胎干细胞系中表达OGT的A259T或E339G突变的RNA-seq转录组学分析显示LXR/RXR通路下调,这与神经元发育有关。与野生型相比,在任一突变细胞系中均未观察到O-GlcNAc总谱的变化。

Pravata等人(2020年)报告了一名XLID106患者OGT基因(N648Y;300255.0006)中的半合子错义突变。与野生型相比,具有N648Y突变的重组OGT蛋白的底物结合降低,模型受体底物TAB1的糖基化降低。


参考文献

  1. Pravata,V.M.,Gundogdu,M.,Bartual,S.G.,Ferenbach,A.T.,Stavridis,M..,Ounap,K.,Pajusalu,S.,Zodania,R.,Wojcik,M.H.,van Aalten,D.M.F。O-GlcNAc转移酶催化域中的错义突变将蛋白质O-GlcNA酰化的扰动与X-连锁智力残疾联系在一起。FEBS信函。594: 717-727, 2020.[公共医学:31627256][全文:https://doi.org/10.1002/1873-3468.13640]

  2. Pravata,V.M.、Omelkova,M.、Stavridis,M.P.、Desbiens,C.M.、Stephen,H.M.,Lefeber,D.J.、Gecz,J.、Gundogdu,M、Ounap,K.、Joss,S.、Schwartz,C.E.、Wells,L.、van Aalten,D.M.F。O-GlcNAc转移酶单核苷酸变异的智力残疾综合征。欧洲。J.Hum.遗传学。28: 706-714, 2020.[公共医学:32080367][全文:https://doi.org/10.1038/s41431-020-0589-9]

  3. Selvan,N.、George,S.、Serajee,F.J.、Shaw,M.、Hobson,L.、Kalscheuer,V.、Prasad,N.,Levy,S.E.、Taylor,J.、Aftimos,S.,Schwartz,C.E.、Huq,A.M.、Gecz,J.和Wells,L。O-GlcNAc转移酶错义突变与X-连锁智力残疾解除调控基因相关,涉及细胞命运决定和信号传导。生物学杂志。化学。293: 10810-10824, 2018.[公共医学:29769320][全文:https://doi.org/10.1074/jbc.RA118.002583]

  4. Vaidyanathan,K.、Niranjan,T.、Selvan,N.、Teo,C.F.、May,M.、Patel,S.、Weatherly,B.、Skinner,C.、Opitz,J.、Carey,J.,Viskochil,D.、Gecz,J..、Shaw,M.,Peng,Y.、Alexov,E.、Wang,T.,Schwartz,C.、Wells,L。O-连锁β-N-乙酰氨基葡萄糖(O-GlcNAc)转移酶基因错义突变的鉴定和特征,该基因与X-连锁智力残疾分离。生物学杂志。化学。292: 8948-8963, 2017.[公共医学:28302723][全文:https://doi.org/10.1074/jbc.M116.771030]

  5. Willems,A.P.,Gundogdu,M.,Kempers,M.J.E.,Giltay,J.C.,Pfundt,R.,Elferink,M,Loza,B.F.,Fuijkschot,J.,Ferenbach,A.T.,van Gassen,K.L.I.,van-Aalten,D.M.F.,Lefeber,D.J。X连锁智力残疾患者的N-乙酰氨基葡萄糖(O-GlcNAc)转移酶突变。生物学杂志。化学。292: 12621-12631, 2017.[公共医学:28584052][全文:https://doi.org/10.1074/jbc.M117.790097]


贡献者:
Hilary J.Vernon-更新日期:2022年9月25日

创建日期:
卡桑德拉·克尼芬(Cassandra L.Kniffin):2017年6月21日

编辑历史记录:
阿洛佩兹:2023年3月27日
卡罗尔:2022年9月25日
脱发:2021年8月19日
卡罗尔:2017年8月8日
卡罗尔:2017年6月23日
ckniffin:2017年6月21日