条目-*300980-KELCH-LIKE 15;KLHL15号机组-OMIM公司
 
*300980

KELCH-LIKE 15;KLHL15号机组


备选标题;符号

KIAA1677号


HGNC批准的基因符号:KLHL15号机组

细胞遗传学位置:Xp22.11变速箱 基因组坐标(GRCh38):十: 23983720-24027186 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
Xp22.11变速箱 智力发育障碍,X连锁103 300982 卡侬

文本

描述

KLHL15属于Kelch样蛋白大家族,包含Kelch和BTB蛋白-蛋白相互作用模块。Dimeric KLHL15用作CUL3的基板适配器(603136)-含E3泛素连接酶(Oberg等人,2012年).


克隆和表达

通过对从尺寸分离的胎脑cDNA文库中获得的克隆进行测序,长濑等人(2000年)获得了部分KLHL15克隆,他们将其命名为KIAA1677。RT-PCR ELISA检测到KIAA1677在除成人肺外的所有人类和胎儿组织中的表达。在成人大脑、肾脏、睾丸和卵巢中检测到最高表达。在特定的成人大脑区域内,KIAA1677在杏仁核、小脑、胼胝体和丘脑中的表达最高。

通过生物信息分析,吉田(2005)确认全长人类KLHL15。推导出的604-氨基酸蛋白具有一个N端BTB结构域和一个C端Kelchβ-螺旋桨结构域,由3个大约50个残基的Kelch重复序列组成。KLHL15与它的鸡和斑马鱼同源基因分别具有93%和85%的氨基酸同源性。电子分析表明,KLHL15在人体组织中普遍表达。


基因功能

蛋白磷酸酶-2A(PP2A)由催化a亚基的核心二聚体组成(见605983)和结构C亚单位(参见176915)其与可变调节B亚基结合。通过免疫沉淀和质谱分析与B原-β亚单位(PPP2R5B;601644)HEK293细胞中PP2A的含量,Oberg等人(2012年)除了PP2A的A和C亚单位外,还鉴定了KLHL15和CUL3。KLHL15不与其他B质体亚单位相互作用。KLHL15招募了CUL3-ROC1(RBX1;603814)E3连接酶促进PP2A复合物中分离的B原β和B原β的多泛素化和蛋白酶体降解。突变分析表明,KLHL15 BTB结构域内的asp32对KLHL15homedimerization是必需的,KLHP15的N末端ILK基序招募了CUL3。asp32和ILK基序都需要用于KLHL15依赖的B基序降解。KLHL15β螺旋桨顶部的残留物形成了一个基质结合囊,并介导了KHL15与B基质结合。B原β的N端含有泛素化位点,并介导与KLHL15和E3连接酶的相互作用。在tyr52处B原β的磷酸化对与KLHL15的相互作用至关重要。除了增加蛋白酶体介导的B原β降解外,KLHL15的过度表达还增加了其他B原亚基并入PP2A全酶的程度。Oberg等人(2012年)结论是,KLHL15通过指导B原β的降解并促进其与其他调节性B亚单位的交换,控制PP2A全酶组成和下游磷酸化事件。


基因结构

吉田(2005)确定KLHL15基因包含4个外显子。


映射

通过人-啮齿动物杂交面板的PCR,长濑等人(2000年)将KLHL15基因定位到X染色体。吉田(2005)通过基因组序列分析将KLHL15基因定位到染色体Xp22.1。


分子遗传学

X染色体连锁智力发育障碍-103(XLID103;300982),Mignon-Ravix等人(2014)在KLHL15基因中发现了一个半合子基因内缺失(300980.0001). 他患有轻微疾病的母亲被发现携带这种缺失,并且淋巴细胞DNA中的XCI发生了扭曲(90:10)。该患者来自54名患有X染色体连锁智力残疾的男性队列,这些男性通过阵列CGH进行分析。对16例不同类型多小脑回患者的KLHL15基因编码外显子进行Sanger测序,未发现任何其他突变。未对变体和患者细胞进行功能研究。

在XLID103的多代大家庭(D60)的8名受影响男性中,胡等(2016)在KLHL15基因中发现了一个半合子截断突变(300980.0002). 该突变是通过X染色体外显子组测序发现的,并与该家族中的疾病分离。未对变体进行功能研究。


ALLELIC变体( 2精选示例):

.0001智力发育障碍,X连锁103

KLHL15,22.5-KB戴尔
   RCV000241538型

一名患有X连锁智力发育障碍的男孩-103(XLID103;300982),Mignon-Ravix等人(2014)鉴定出一个涉及KLHL15基因前3个外显子的22.5-kb半合子缺失(chrX.24020361_24042839,GRCh37)。没有进行该变体的功能研究和对患者细胞的研究。


.0002智力发育障碍,X-LINKED 103

KLHL15,1-BP DEL
   RCV000241532型

来自一个多代大家庭(D60)的8名患有X连锁智力发育障碍-103(XLID103;300982),胡等(2016)在KLHL15基因中发现一个半合子1-bp缺失(chrX.24006674del,GRCh37),导致过早终止(Tyr394IlefsTer61)。该突变是通过X染色体外显子组测序发现的,并与该家族中的疾病分离。未对变体进行功能研究。


参考文献

  1. Hu,H.,Haas,S.A.,Chelly,J.,Van Esch,H.、Raynaud,M.、de Brouwer,A.P.M.、Weinert,S.、Froyen,G.、Frints、S.G.M.,Laumonier,F.、Zemojtel,T.、Love,M.I.和其他72人。405个未解决家族的X外显子组测序确定了7个新的智力残疾基因。摩尔。精神病。21: 133-148, 2016.[公共医学:25644381,图像,相关引文][全文]

  2. Mignon Ravix,C.、Cacciagli,P.、Choucair,N.、Popovici,C.、Missirian,C.、Milh,M.、Megarbane,A.、Busa,T.、Julia,S.、Girard,N.,Badens,C.、Sigaudy,S.,Philip,N.和Villard,L。X连锁智力缺陷症的基因内重排:54例患者的a-CGH结果,以及TRPC5和KLHL15作为潜在XLID基因的鉴定。美国医学遗传学杂志。164A:1991-1997年,2014年。[公共医学:24817631,相关引文][全文]

  3. 长濑,T.,Kikuno,R.,Hattori,A.,Kondo,Y.,Okumura,K.,Ohara,O。未知人类基因编码序列的预测,XIX。来自大脑的100个新cDNA克隆的完整序列,在体外编码大蛋白。DNA研究7:347-3552000。[公共医学:11214970,相关引文][全文]

  4. Oberg,E.A.、Nifoussi,S.K.、Gingras,A.-C.、Strack,S。E3泛素连接酶适配器Kelch-like 15选择性降解蛋白磷酸酶2A的B原β亚基。生物学杂志。化学。287: 43378-43389, 2012.[公共医学:23135275,图像,相关引文][全文]

  5. 吉田,K。硅片中一个新的类瘢痕基因KLHL15的鉴定和特性。昂科尔。代表13:1133-11372005年。[公共医学:15870933,相关引文]


贡献者:
Cassandra L.Kniffin-更新时间:2016年9月21日
创建日期:
Patricia A.Hartz:2016年8月8日
阿洛佩兹:2021年8月20日
卡罗尔:2016年9月22日
ckniffin:2016年9月21日
mgross:2016年8月8日

*300980

KELCH-LIKE 15;KLHL15号机组


备选标题;符号

KIAA1677号


HGNC批准的基因符号:KLHL15

细胞遗传学位置:Xp22.11 基因组坐标(GRCh38):X:23983720-24027186 (来自NCBI)


基因-表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
Xp22.11变速箱 智力发育障碍,X连锁103 300982 X连锁隐性

文本

描述

KLHL15属于类Kelch蛋白的大家族,包含Kelch和BTB蛋白相互作用模块。二聚体KLHL15作为含CUL3(603136)的E3泛素连接酶的底物适配器发挥作用(Oberg等人,2012年)。


克隆和表达

通过对从尺寸分离的胎脑cDNA文库中获得的克隆进行测序,Nagase等人(2000年)获得了部分KLHL15克隆,他们将其命名为KIAA1677。RT-PCR ELISA检测到KIAA1677在除成人肺外的所有人和胎儿组织中的表达。在成人大脑、肾脏、睾丸和卵巢中检测到最高表达。在特定的成人大脑区域内,KIAA1677在杏仁核、小脑、胼胝体和丘脑中的表达最高。

通过生物信息学分析,Yoshida(2005)确定了全长人类KLHL15。推导出的604-氨基酸蛋白具有一个N端BTB结构域和一个C端Kelchβ-螺旋桨结构域,由3个大约50个残基的Kelch重复序列组成。KLHL15与它的鸡和斑马鱼同源基因分别具有93%和85%的氨基酸同源性。电子分析表明,KLHL15在人体组织中普遍表达。


基因功能

蛋白磷酸酶2A(PP2A)由催化a亚基(见605983)和与可变调节B亚基结合的结构C亚基(参见176915)的核心二聚体组成。通过对与HEK293细胞中PP2A的B原-β亚基(PPP2R5B;601644)相互作用的蛋白质进行免疫沉淀和质谱分析,Oberg等人(2012年)确定了KLHL15和CUL3,以及PP2A A和C亚基。KLHL15不与其他B质体亚单位相互作用。KLHL15招募CUL3-ROC1(RBX1;603814)E3连接酶,以促进PP2A复合物中分离的B原β和B原β的多泛素化和蛋白酶体降解。突变分析表明,KLHL15 BTB结构域内的asp32对KLHL15homedimerization是必需的,KLHP15的N末端ILK基序招募了CUL3。asp32和ILK基序都需要用于KLHL15依赖的B基序降解。KLHL15β螺旋桨顶部的残留物形成了一个基质结合囊,并介导了KHL15与B基质结合。B原β的N端含有泛素化位点,并介导与KLHL15和E3连接酶的相互作用。在tyr52处B原β的磷酸化对与KLHL15的相互作用至关重要。除了增加蛋白酶体介导的B原β降解外,KLHL15的过度表达还增加了其他B原亚基并入PP2A全酶的程度。Oberg等人(2012年)的结论是,KLHL15通过指导B质体β的降解并促进其与其他调节性B亚单位的交换来控制PP2A全酶组成和下游磷酸化事件。


基因结构

Yoshida(2005)确定KLHL15基因包含4个外显子。


映射

长濑等人(2000)通过对人-啮齿动物杂交小组进行PCR,将KLHL15基因定位到X染色体上。吉田(2005)通过基因组序列分析将KLHP15基因定位在Xp22.1染色体上。


分子遗传学

在一名患有X连锁智力发育障碍-103(XLID103;300982)的男孩中,Mignon-Ravix等人(2014年)发现KLHL15基因中存在半合子基因内缺失(300980.0001)。他患有轻微疾病的母亲被发现携带这种缺失,并且淋巴细胞DNA中的XCI发生了扭曲(90:10)。该患者来自54名患有X染色体连锁智力残疾的男性队列,这些男性通过阵列CGH进行分析。对16例不同类型多小脑回患者的KLHL15基因编码外显子进行Sanger测序,未发现任何其他突变。未对变体和患者细胞进行功能研究。

Hu等人(2016)在一个患有XLID103的多代大家族(D60)的8名受影响男性中发现了KLHL15基因的半合子截短突变(300980.0002)。该突变是通过X染色体外显子组测序发现的,并与该家族中的疾病分离。未对变体进行功能研究。


ALLELIC变体 2个选定示例):

.0001智力发育障碍,X-LINKED 103

KLHL15,22.5-KB德尔氏体
临床变量:RCV000241538

在一名患有X连锁智力发育障碍-103(XLID103;300982)的男孩中,Mignon-Ravix等人(2014)发现了一个涉及KLHL15基因前3个外显子的半合子22.5-kb缺失(chrX.24020361_24042839,GRCh37)。未对变体和患者细胞进行功能研究。


.0002智力发育障碍,X-LINKED 103

KLHL15,1-BP DEL
SNP:rs1929024034,临床变量:RCV000241532

在患有X连锁智力发育障碍-103(XLID103;300982)的多代大家族(D60)的8名受影响男性中,Hu等人(2016)在KLHL15基因中发现了一个半合子1-bp缺失(chrX.24006674del,GRCh37),导致过早终止(Tyr394IlefsTer61)。该突变是通过X染色体外显子组测序发现的,并与该家族的疾病分离。未对变体进行功能研究。


参考文献

  1. Hu,H.,Haas,S.A.,Chelly,J.,Van Esch,H.、Raynaud,M.、de Brouwer,A.P.M.、Weinert,S.、Froyen,G.、Frints、S.G.M.,Laumonier,F.、Zemojtel,T.、Love,M.I.和其他72人。405个未解决家族的X外显子组测序确定了7个新的智力残疾基因。摩尔。精神病。21: 133-148, 2016.[公共医学:25644381][全文:https://doi.org/10.1038/mp.2014.193]

  2. Mignon Ravix,C.、Cacciagli,P.、Choucair,N.、Popovici,C.、Missirian,C.、Milh,M.、Megarbane,A.、Busa,T.、Julia,S.、Girard,N.,Badens,C.、Sigaudy,S.,Philip,N.和Villard,L。X连锁智力缺陷症的基因内重排:54例患者的a-CGH结果,以及TRPC5和KLHL15作为潜在XLID基因的鉴定。美国医学遗传学杂志。164A:1991-1997年,2014年。[公共医学:24817631][全文:https://doi.org/10.1002/ajmg.a.36602]

  3. 长濑,T.,Kikuno,R.,Hattori,A.,Kondo,Y.,Okumura,K.,Ohara,O。未知人类基因编码序列的预测,XIX。来自大脑的100个新cDNA克隆的完整序列,在体外编码大蛋白。DNA研究7:347-3552000。[公共医学:11214970][全文:https://doi.org/10.1093/dnares/7.6.347]

  4. Oberg,E.A.、Nifoussi,S.K.、Gingras,A.-C.、Strack,S。E3泛素连接酶适配器Kelch-like 15选择性降解蛋白磷酸酶2A的B原β亚基。生物学杂志。化学。287: 43378-43389, 2012.[公共医学:23135275][全文:https://doi.org/10.1074/jbc.M112.420281]

  5. 吉田,K。硅片中一个新的类瘢痕基因KLHL15的鉴定和特性。昂科尔。代表13:1133-11372005年。[公共医学:15870933]


贡献者:
Cassandra L.Kniffin-更新日期:2016年9月21日

创建日期:
Patricia A.Hartz:2016年8月8日

编辑历史记录:
阿洛佩兹:2021年8月20日
卡罗尔:2016年9月22日
ckniffin:2016年9月21日
mgross:2016年8月8日