条目-*300553-溴化酶和WD重复蛋白3;BRWD3(刹车3)-OMIM公司
 
*300553

含溴化酶和WD重复序列的蛋白质3;BRWD3(刹车3)


HGNC批准的基因符号:BRWD3(刹车3)

细胞遗传学位置:Xq21.1号机组   基因组坐标(GRCh38):十: 80669503-80809877 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
Xq21.1号机组 智力发育障碍,X连锁93 300659 XLR公司


文本

克隆和表达

通过检查一名B细胞慢性淋巴细胞白血病(BCLL)患者中受易位影响的X染色体区域,Kalla等人(2005)鉴定了BRWD3基因。通过EST数据库分析和5-prime RACE,他们获得了15个具有交替5-prime末端的BRWD3转录变体。两个最丰富的转录物编码1802和1631个氨基酸的蛋白质,仅在前171个氨基酸的存在与否上有所不同。这两种蛋白质都含有8个N端WD40重复序列和2个C端溴代腺嘌呤。Northern blot分析检测到大多数成人组织和胎儿肝脏中的主要BRWD3转录本约为10.5 kb和11.5 kb;还检测到约9.0、7.0和6.5的小转录本。


基因功能

Kalla等人(2005)发现与对照B细胞相比,在大多数22个BCLL病例中BRWD3的表达下调。

Muller等人(2005)描述了JAK/STAT通路活性所需基因的系统全基因组调查。对20026年培养的果蝇类血细胞细胞中RNA干扰(RNAi)诱导的表型进行分析,确定了编码4个已知蛋白和86个非特征化蛋白的相互作用基因。随后,基于细胞的上位性实验被用于根据这些蛋白质与信号级联的已知成分的相互作用对其进行分类。除了多种人类疾病基因同源物之外,Muller等人(2005)发现酪氨酸磷酸酶Ptp61F和BRWD3的果蝇同源物,BRWD3是一种在白血病中被破坏的含溴蛋白。此外,体内分析表明,破坏果蝇BRWD3和过度表达的Ptp61F作为白血病样血细胞肿瘤的抑制剂发挥作用。Muller等人(2005)结论是,他们的筛选代表了对JAK/STAT信号所需的新基因座的全面识别,并提供了对与人类癌症相关的重要途径的分子见解。


基因结构

Kalla等人(2005)确定BRWD3基因包含44个外显子,跨度为133 kb。


映射

通过基因组序列分析,Kalla等人(2005)将BRWD3基因定位到染色体Xq13。


细胞遗传学

Kalla等人(2005)在一名BCLL患者中发现了一个t(X;11)(q13;q23)易位。染色体Xq13上的断点发生在BRWD3基因的内含子22内,而染色体11q23上的断口中断了ARHGAP20基因(609568). 未检测到融合转录本。


分子遗传学

在对250个非综合征性X连锁智力发育障碍家庭的X染色体编码序列进行系统筛查的过程中,Field等人(2007)确定了2个BRWD3截断突变家族(XLID93;300659). 在这两个家族中,突变与受影响男性的表型分离。受影响的男性患有大头畸形,前额突出,耳朵呈杯状,轻度至中度智力残疾。第三个患有轻度智力障碍但没有大头畸形的家庭在BRWD3中有错义突变。在520条控制染色体中未发现截断变异。Field等人(2007)提示突变可能通过改变影响细胞增殖的细胞内信号通路而导致疾病。

Tarpey等人(2009年)对208个X连锁精神发育迟滞家庭的X染色体编码外显子进行了测序。在两个个体中,他们在BRWD3基因中发现了非电流截断突变,这些突变在他们的家族中与智力迟钝分离。除了X染色体连锁的精神发育迟滞外,受影响的个体还患有巨头症。

使用两组与生长过度综合征相关的定制基因从生长过度登记处筛选患者后,Tenorio等人(2019年)鉴定了来自4个家族的具有与XLID93一致的特征且在BRWD3基因中具有突变的5名男性患者(包括2名同胞)(参见例如。,300553.0004-300553.0005). 对其中3个家庭的患者母亲进行测试,发现其突变为杂合子;这些母亲表现出轻微的临床特征,如大头畸形和面部畸形,但没有智力障碍。根据他们对文献(14名患者)和5名新确定的患者的回顾,Tenorio等人(2019年)提示截断突变是XLID93的常见致病机制。


ALLELIC变体( 5精选示例):

.0001智力发育障碍,X-LINKED 93

BRWD3、IVS29DS、G-T、+1
   RCV000011549号机组

在一个叔叔和侄子患有智力发育障碍的家庭中,93人患有巨头畸形(XLID93;300659),Field等人(2007年)描述了BRWD3基因内含子29中的一个剪接位点突变:3325+1G-T。对从一个受影响个体的淋巴母细胞系中分离的cDNA进行分析表明,该突变导致外显子29的跳跃和过早终止密码子(Trp1089CysfsTer4)的引入。鉴定出三个携带突变的雌性,所有3条携带突变的染色体优先失活。


.0002智力发育障碍,X-LINKED 93

轴承3,1-BP INS,946A
   RCV000011550型

在一个家族中,两个同父异母兄弟患有智力发育障碍并伴有巨头畸形(XLID93;300659),Field等人(2007)在BRWD3基因946_947insA中发现了一个1-bp的插入,导致arg316转化为lys和移码提前终止(Arg316LysfsTer21)。


.0003智力发育障碍,X-LINKED 93

LYS1596GLU轴承3
   RCV00011551型

在一个有三个兄弟、一个堂兄和一个叔叔患有X染色体连锁智力发育障碍的家庭中,他们的智力发育障碍为93(XLID93;300659),Field等人(2007)确定BRWD3基因中的4786A-G转换导致谷氨酸替代赖氨酸1596(K1596E)。Lysine-1596在从人类到小鼠的哺乳动物物种和鸡中都是保守的。这对兄弟的智力发展处于临界或轻度受损状态。所有受影响的男性在童年时都没有出现过大头畸形或身材高大。他们有一对大而突出的耳朵,三角形的脸和尖尖的下巴。这家人最初是由Gedeon等人(1994年)作为“E”族


.0004智力发育障碍,X-LINKED 93

通过对生长过度登记患者中2组生长过度基因的外显子组测序,Tenorio等人(2019年)确定一名男性患者(患者1)患有X染色体连锁智力发育障碍-93(XLID93;300659)在BRWD3基因中具有c.3976C-T转换(c.3976C-T,NM_153252.4),导致溴代多巴胺中的arg1326-to-ter(R1326X)替代。在包括gnomAD在内的控制人群数据库中未发现R1326X变体。


.0005智力发育障碍,X-LINKED 93

通过对生长过度登记患者中2组生长过度基因的外显子组测序,Tenorio等人(2019年)确定了一名患有X连锁智力发育障碍-93(XLID93;300659)的男性患者(患者2),该患者在BRWD3基因的第30外显子中有c.3413G-T颠倒(c.3413G-T,NM_153252.4),导致在溴代烷中高度保守的残基处出现trp1138-to-leu(W1138L)替代。作者指出,外显子30似乎是突变的热点,因为50%的BRWD3突变发生在该外显子或改变了典型剪接序列。W1138L变体不存在于对照人群数据库中,包括gnomAD。


参考文献

  1. Field,M.、Tarpey,P.S.、Smith,R.、Edkins,S.、O'Meara,S.,Stevens,C.、Tofts,C.,Teague,J.、Butler,A.、Dicks,E.、Barthorpe,S.和Buck,G.以及其他34人。BRWD3基因突变导致X连锁精神发育迟滞与巨头畸形相关。Am.J.Hum.Genet。81: 367-374, 2007.[公共医学:17668385,图像,相关引文][全文]

  2. Gedeon,A.、Kerr,B.、Mulley,J.、Turner,G。非特异性X连锁精神发育迟滞(MRX)的着丝粒周围基因。美国医学遗传学杂志。51: 553-564, 1994.[公共医学:7943039,相关引文][全文]

  3. 卡拉·C·、奈特维奇·H·、施洛特·M·、梅滕斯·D·、威尔登伯格·K·、多纳·H·,斯蒂尔根鲍尔·S·、利希特·P·。B细胞慢性淋巴细胞白血病中的易位t(X;11)(q13;q23)破坏了两个新基因。基因染色体癌症42:128-1432005。[公共医学:15543602,相关引文][全文]

  4. Muller,P.、Kuttenkeuler,D.、Gesellchen,V.、Zeidler,M.P.、Boutros,M。通过全基因组RNA干扰鉴定JAK/STAT信号成分。(信件)《自然》436:871-8752005。[公共医学:16094372,相关引文][全文]

  5. Tarpey,P.S.、Smith,R.、Pleasance,E.、Whibley,A.、Edkins,S.、Hardy,C.、O'Meara,S.,Latimer,C.、Dicks,E.、Menzies,A.、Stephens,P.、Blow,M.和其他67人。精神发育迟滞患者X染色体编码外显子的系统、大规模重测序筛查。自然遗传学。41: 535-543, 2009.[公共医学:19377476,相关引文][全文]

  6. Tenorio,J.、Alarcon,P.、Arias,P.,Ramos,F.J.、Campistol,J.,Climent,S.、Garcia-Munaur,S.,Dapia,I.、Hernandez,A.、Nevado,J.和Solis,M.、Ruiz-Perez,V.L.、Sogri Consortium、Lapunzina,P。MRX93综合征(BRWD3基因):五名新的突变患者。临床。遗传学。95: 726-731, 2019.[公共医学:30628072,相关引文][全文]


Sonja A.Rasmussen-更新日期:2022年3月29日
Ada Hamosh-更新时间:2009年10月1日
Victor A.McKusick-更新时间:2007年7月26日
Ada Hamosh-更新日期:9/8/2005
创建日期:
Patricia A.Hartz:2005年9月2日
卡罗尔:2022年3月29日
卡罗尔:2021年8月20日
乔安娜:2018年10月8日
卡罗尔:2015年4月3日
mgross:2010年2月26日
阿洛佩兹:2009年6月10日
特里:2009年10月1日
ckniffin:2008年4月17日
阿洛佩兹:2007年7月30日
特里:2007年7月26日
阿洛佩兹:2005年9月9日
特里:2005年9月8日
米格罗斯:2005年9月2日
米格罗斯:2005年9月2日

*300553

含溴化酶和WD重复序列的蛋白质3;BRWD3(刹车3)


HGNC批准的基因符号:BRWD3

细胞遗传学位置:Xq21.1   基因组坐标(GRCh38):X:80669503-80809877 (来自NCBI)


基因-表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
Xq21.1号机组 智力发育障碍,X连锁93 300659 X连锁隐性

文本

克隆和表达

通过检测B细胞慢性淋巴细胞白血病(BCLL)患者中受易位影响的X染色体区域,Kalla等人(2005年)确定了BRWD3基因。通过EST数据库分析和5-prime RACE,他们获得了15个具有交替5-prime末端的BRWD3转录变体。两个最丰富的转录物编码1802和1631个氨基酸的蛋白质,仅在前171个氨基酸的存在与否上有所不同。这两种蛋白质都含有8个N端WD40重复序列和2个C端溴代腺嘌呤。Northern blot分析检测到大多数成人组织和胎儿肝脏中的主要BRWD3转录本约为10.5 kb和11.5 kb;还检测到约9.0、7.0和6.5的小转录本。


基因功能

Kalla等人(2005年)发现,与对照B细胞相比,22例BCLL病例中的大多数BRWD3表达下调。

Muller等人(2005年)描述了一项针对JAK/STAT通路活性所需基因的全基因组系统调查。对培养的果蝇血细胞样细胞中20026种RNA干扰(RNAi)诱导的表型的分析确定了编码4种已知和86种未表征蛋白质的相互作用基因。随后,基于细胞的上位性实验被用于根据这些蛋白质与信号级联的已知成分的相互作用对其进行分类。除了多种人类疾病基因同源物外,Muller等人(2005年)还发现了酪氨酸磷酸酶Ptp61F和BRWD3的果蝇同源物,BRWD3是一种在白血病中被破坏的含溴蛋白。此外,体内分析表明,破坏果蝇BRWD3和过度表达的Ptp61F作为白血病样血细胞肿瘤的抑制剂发挥作用。Muller等人(2005年)得出结论,他们的筛查代表了对JAK/STAT信号所需的新基因座的全面识别,并提供了对与人类癌症相关的重要途径的分子见解。


基因结构

Kalla等人(2005年)确定BRWD3基因包含44个外显子,跨度为133 kb。


映射

通过基因组序列分析,Kalla等人(2005年)将BRWD3基因映射到染色体Xq13。


细胞遗传学

Kalla等人(2005年)在一名BCLL患者中发现了t(X;11)(q13;q23)易位。染色体Xq13上的断点发生在BRWD3基因的内含子22内,而染色体11q23上的断口中断了ARHGAP20基因(609568)。未检测到融合转录本。


分子遗传学

在对250个患有非综合征性X染色体连锁智力发育障碍的家庭的X染色体编码序列进行系统筛查的过程中,Field等人(2007年)确定了2个BRWD3截断突变的家庭(XLID93;300659)。在这两个家族中,突变与受影响男性的表型分离。受影响的男性患有大头畸形,前额突出,耳朵呈杯状,轻度至中度智力残疾。第三个患有轻度智力障碍但没有大头畸形的家庭在BRWD3中有错义突变。在520条控制染色体中未发现截断变异。Field等人(2007)认为,突变可能通过改变影响细胞增殖的细胞内信号通路而导致疾病。

Tarpey等人(2009年)对208个X连锁精神发育迟滞家庭的X染色体编码外显子进行了测序。在2名患者中,他们在BRWD3基因中发现了非电流截断突变,这些突变在他们的家族中与精神发育迟滞分离。除了X染色体连锁的精神发育迟滞外,受影响的个体还患有巨头症。

在使用2组与生长过度综合征相关的定制基因从生长过度登记处筛选患者后,Tenorio等人(2019年)从4个特征与XLID93一致的家族中确定了5名男性患者(包括2名同胞),他们的BRWD3基因发生了突变(参见例如300553.0004-300553.0005)。对其中3个家庭的患者母亲进行测试,发现其突变为杂合子;这些母亲表现出轻微的临床特征,如大头畸形和面部畸形,但没有智力障碍。根据对文献(14名患者)和5名新发现患者的回顾,Tenorio等人(2019年)认为截断突变是XLID93的常见致病机制。


ALLELIC变体 5个精选示例):

.0001智力发育障碍,X-LINKED 93

BRWD3、IVS29DS、G-T、+1
SNP:rs730882185,临床变量:RCV000011549

在一个叔叔和侄子患有智力发育障碍-93并伴有巨头畸形(XLID93;300659)的家庭中,Field等人(2007年)描述了BRWD3基因内含子29中的剪接位点突变:3325+1G-T。对从一名受累个体的淋巴母细胞系中分离的cDNA进行分析,结果表明,突变导致外显子29跳过,并引入了提前终止密码子(Trp1089CysfsTer4)。鉴定出三个携带突变的雌性,所有3条携带突变的染色体优先失活。


.0002智力发育障碍,X-LINKED 93

轴承3,1-BP INS,946A
SNP:rs730882186,临床变量:RCV00011550

在一个有两个同父异母兄弟患有智力发育障碍并伴有巨头畸形的家族中(XLID93;300659),Field等人(2007年)在BRWD3基因946_947insA中发现了一个1 bp的插入,导致arg316转化为lys和移码提前终止(Arg316LysfsTer21)。


.0003智力发育障碍,X-LINKED 93

BRWD3,赖氨酸1596glu
SNP:rs137853272,临床变量:RCV00011551

Field等人(2007年)在一个有三个兄弟、一个堂兄和一个叔叔患有X连锁智力发育障碍-93(XLID93;300659)的家庭中,发现BRWD3基因中存在4786A-G转换,导致谷氨酸替代赖氨酸1596(K1596E)。Lysine-1596在从人类到小鼠的哺乳动物物种和鸡中都是保守的。兄弟俩的智力发展处于轻度受损的边缘。所有受影响的男性在童年时都没有出现过大头畸形或身材高大。他们有一对大而突出的耳朵,三角形的脸和尖尖的下巴。Gedeon等人(1994年)最初将该家族称为“E”家族


.0004智力发育障碍,X-LINKED 93

ARG1326TER轴承3
单号:rs866592729,临床变量:RCV002052427

通过对过度生长登记中患者的两组过度生长基因进行外显子组测序,Tenorio等人(2019年)确定了一名患有X连锁智力发育障碍-93(XLID93;300659)的男性患者(患者1),该患者BRWD3基因中存在c.3976C-T转换(c.3976C-T,NM_153252.4),导致arg1326-to-ter(R1326X)溴代多巴胺的取代。在包括gnomAD在内的控制人群数据库中未发现R1326X变体。


.0005智力发育障碍,X-LINKED 93

TRP1138LEU轴承3
单号:rs2147693460,临床变量:RCV002052428

通过对过度生长登记中患者的两组过度生长基因进行外显子组测序,Tenorio等人(2019年)确定了一名患有X连锁智力发育障碍-93(XLID93;300659)的男性患者(患者2),其BRWD3基因第30外显子存在c.3413G-T颠换(c.3413G-T,NM_153252.4),导致trp1138-leu(W1138L)溴代多巴胺中一个高度保守的残基的取代。作者指出,外显子30似乎是突变的热点,因为50%的BRWD3突变发生在该外显子或改变了典型剪接序列。W1138L变异体在控制人群数据库中不存在,包括gnomAD。


参考文献

  1. Field,M.、Tarpey,P.S.、Smith,R.、Edkins,S.、O'Meara,S.,Stevens,C.、Tofts,C.,Teague,J.、Butler,A.、Dicks,E.、Barthorpe,S.和Buck,G.以及其他34人。BRWD3基因突变导致X连锁精神发育迟滞与巨头畸形相关。Am.J.Hum.Genet。81: 367-374, 2007.[公共医学:17668385][全文:https://doi.org/10.1086/520677]

  2. Gedeon,A.、Kerr,B.、Mulley,J.、Turner,G。非特异性X连锁精神发育迟滞(MRX)的着丝粒周围基因。美国医学遗传学杂志。51: 553-564, 1994.[公共医学:7943039][全文:https://doi.org/10.1002/ajmg.1320510453]

  3. 卡拉·C·、奈特维奇·H·、施洛特·M·、梅滕斯·D·、威尔登伯格·K·、多纳·H·,斯蒂尔根鲍尔·S·、利希特·P·。B细胞慢性淋巴细胞白血病t(X;11)(q13;q23)易位破坏了两个新基因。基因染色体癌症42:128-1432005。[公共医学:15543602][全文:https://doi.org/10.1002/gc.20131]

  4. Muller,P.、Kuttenkeuler,D.、Gesellchen,V.、Zeidler,M.P.、Boutros,M。通过全基因组RNA干扰鉴定JAK/STAT信号成分。(信件)《自然》436:871-8752005。[公共医学:16094372][全文:https://doi.org/10.1038/nature03869]

  5. Tarpey,P.S.、Smith,R.、Pleasance,E.、Whibley,A.、Edkins,S.、Hardy,C.、O'Meara,S.,Latimer,C.、Dicks,E.、Menzies,A.、Stephens,P.、Blow,M.和其他67人。精神发育迟滞患者X染色体编码外显子的系统、大规模重测序筛查。自然遗传学。41: 535-543, 2009.[公共医学:19377476][全文:https://doi.org/10.1038/ng.367]

  6. Tenorio,J.、Alarcon,P.、Arias,P.,Ramos,F.J.、Campistol,J.,Climent,S.、Garcia-Munaur,S.,Dapia,I.、Hernandez,A.、Nevado,J.和Solis,M.、Ruiz-Perez,V.L.、Sogri Consortium、Lapunzina,P。MRX93综合征(BRWD3基因):五名新的突变患者。临床。遗传学。95: 726-731, 2019.[公共医学:30628072][全文:https://doi.org/10.1111/cge.13504]


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mgross:2010年2月26日
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特里:2007年7月26日
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米格罗斯:2005年9月2日
米格罗斯:2005年9月2日