条目-*300255-O-连接N-乙酰基谷氨酰胺转移酶;OGT公司-OMIM公司
 
*300255

O-连接N-乙酰基谷氨酰胺转移酶;OGT公司


备选标题;符号

UDP-N-乙酰葡萄糖胺:多肽β-N-乙酰葡萄糖胺转移酶
GlcNAc转移酶


HGNC批准的基因符号:OGT公司

细胞遗传学位置:Xq13.1号机组 基因组坐标(GRCh38):十: 71533104-71575892 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
Xq13.1号机组 智力发育障碍,X连锁106 300997 卡侬

文本

描述

O-连接N-乙酰氨基葡萄糖(O-GlcNAc)转移酶(OGT)催化O-糖苷键中单个N-乙酰氨基葡糖添加到丝氨酸或苏氨酸残基。由于磷酸化和糖基化都竞争类似的丝氨酸或苏氨酸残基,这两个过程可能会竞争位点,或者它们可能会通过空间或静电效应改变邻近位点的底物特异性(Lubas等人,1997年). O-连接N-乙酰氨基葡萄糖酶(OGA;604039)(汇总人Vaidyanathan等人,2017年). OGT在宿主细胞因子C1(HCFC1;300019)(汇总人Willems等人,2017年).


克隆和表达

Haltiwanger等人(1992年)纯化大鼠肝脏OGT并测定其分子量为340 kD。他们提出OGT是一种异三聚体复合物,有2个110 kD的亚基和1个78 kD的亚基。然而,使用兔子OGT,Lubas等人(1997年)对这两种多肽的蛋白水解指纹图谱进行了分析,发现两者之间存在相关性。他们认为78-kD带是110-kD多肽的蛋白水解产物或替代翻译起始位点的产物。Kreppel等人(1997年)编码110-kD亚单位的克隆大鼠cDNA。表达OGT的人细胞的免疫荧光表明,OGT存在于细胞核和胞浆中。

通过搜索含有兔OGT部分蛋白序列的EST数据库,Lubas等人(1997年)鉴定了人类和秀丽隐杆线虫OGT cDNA。预测的920-氨基酸人类蛋白包含9个四肽重复序列和一个推测的二分核定位信号。表达OGT的HeLa细胞在长时间孵育期间不能很好地存活,这表明这种蛋白质可能对细胞有毒。Southern blot分析表明人类中存在一个OGT基因。Northern blot分析显示,OGT以多种转录物的形式表达,在不同的人体组织中以不同的数量存在,在胰腺中的表达水平最高。

Wu等人(2017)称OGT(他们称之为OGT1)具有N末端13.5 TPR超螺旋结构和C末端催化结构域。


基因功能

核蛋白和细胞质蛋白糖基化是真核细胞中广泛存在的可逆翻译后修饰。OGT催化通过向丝氨酸和苏氨酸中添加N-乙酰氨基葡萄糖进行细胞内糖基化。细胞内蛋白质的这种“O-GlcNAcylation”可能发生在磷酸化位点上,并与控制基因转录、神经丝组装以及糖尿病和神经疾病的发生有关。为了研究OGT在体内的功能,Shafi等人(2000年)在男性胚胎干细胞中使用基因靶向方法。他们发现OGT突变需要一种保留完整OGT基因的策略,就像使用Cre-loxP重组一样,因为OGT基因缺失会导致胚胎干细胞活性丧失。在大多数细胞类型中,小鼠OGT RNA的表达相对较高,而胰腺中的表达水平较低。小鼠生殖系OGT等位基因的分离表明,完整的OGT等位点是胚胎发生完成所必需的。这些研究说明了条件基因靶向方法在必要的X连锁基因突变和研究中的必要性,并表明OGT参与细胞内糖基化对胚胎干细胞存活和小鼠个体发育至关重要。

转录因子和RNA聚合酶II可以被丝氨酸或苏氨酸残基上的O-GlcNAc单糖修饰,但这种修饰的确切功能作用还不清楚。Yang等人(2002)表明OGT是一种催化翻译后修饰的酶,它通过与辅抑制剂Sin3A结合与组蛋白脱乙酰酶复合物相互作用(607776). 在功能上,OGT和Sin3A协同抑制转录,与组蛋白脱乙酰化平行。作者提出,Sin3A将OGT靶向启动子,通过O-GlcNAc修饰使转录因子和RNA聚合酶II失活,其与组蛋白脱乙酰化协同作用,以高效和特异的方式促进基因沉默。

Zhang等人(2003)证明了Ogt介导的修饰可以抑制哺乳动物26S蛋白酶体,从而抑制转录因子Sp1的蛋白水解(189906)和一种疏水性测试肽。在体内外,蛋白酶体19S帽中的Rpt2-ATP酶被O-GlcNAc修饰,随着修饰的增加,蛋白酶体功能降低。

Yang等人(2008)表明OGT含有一种以前未被识别的磷脂酰肌醇结合域。在用胰岛素诱导后,磷脂酰肌醇3,4,5-三磷酸将OGT从细胞核招募到质膜,在那里酶催化O-GlcNAc对胰岛素信号通路的动态修改。这导致关键信号分子磷酸化的改变和胰岛素信号转导的减弱。OGT在肝脏的过度表达会损害胰岛素反应基因的表达,并导致胰岛素抵抗和血脂异常。Yang等人(2008)结论是,他们的发现确定了营养线索通过O-GlcNAc调节胰岛素信号的分子机制,并强调了这种改变对胰岛素抵抗和2型糖尿病病因的贡献(125853).

循环葡萄糖浓度的增加激活己糖生物合成途径,并通过OGT促进蛋白质的O-糖基化。Dentin等人(2008)结果表明,OGT通过调控cAMP反应元件结合蛋白(CREB)2(TORC2或CRTC2)的转导子的O-糖基化激活肝糖异生;608972). CRTC2在通常通过磷酸化依赖机制将CRTC2固定在细胞质中的位置进行O-糖基化。通过表达脱糖基酶O-GlcNAcase减少O-糖基化CRTC2的数量(604039)阻断了葡萄糖对糖异生的影响,证明了己糖生物合成途径在葡萄糖不耐受发展中的重要性。

Fujiki等人(2011年)报告组蛋白H2B(参见609904)通过OGT在体外和活细胞中通过O-连接的N-乙酰氨基葡萄糖(GlcNAcylated)在残基S112处进行酰化。组蛋白GlcNAcylization通过己糖生物合成途径对细胞外葡萄糖作出反应而波动。H2B S112-GlcNAcylation促进K120单泛素化,其中GlcNAc部分可以作为组蛋白H2B泛素连接酶的锚定。H2B S112-GlcNAc定位于苍蝇多线染色体的常染色区。在全基因组分析中,H2B S112 GlcNAcylation位点广泛分布于包括转录基因位点在内的染色体上,一些位点与H2B K120单泛素化共定位。Fujiki等人(2011年)结论是H2B S112-GlcNAcylation是一种组蛋白修饰,促进H2BK120单泛素化,可能是为了转录激活。

利用蛋白质亲和纯化,Chen等人(2013)寻找TET蛋白的功能性伴侣,发现TET2(612839)和TET3(613555)与OGT结合,OGT是一种自身催化体内丝氨酸和苏氨酸残基上O-GlcNAc加成(O-GlcNA酰化)的酶。TET2直接与OGT相互作用,这对OGT在体内的染色质结合非常重要。尽管这种特殊的相互作用并不调节TET2的酶活性,但它促进OGT依赖的组蛋白O-GlcNA酰化。此外,OGT在转录起始位点与TET2相关。TET2的下调降低了体内组蛋白2B S112-GlcNAc标记的量,这与基因转录调控有关。Chen等人(2013)得出的结论是,综合起来,他们的结果揭示了染色质的TET2依赖性O-GlcNAcylation。TET2和OGT对DNA和组蛋白的双重表观遗传修饰协调了基因转录的调控。

Wu等人(2017)说明OGT1和NSL3(617742)是乙酰化组蛋白H4的非特异性致死(NSL)组蛋白乙酰转移酶复合物的亚基(见602822)残基lys5(K5)、K8和K16。OGT1或NSL3的敲除以剂量依赖的方式减少了H4K16的全局乙酰化。免疫沉淀分析显示内源性OGT1和NSL3在HEK293和HeLa细胞中相互作用,突变分析显示OGT1的N末端TPR重复域与NSL3的脱水解酶域相互作用。在体外,OGT1在供体UDP-O-GlcNAc存在下催化了NSL3的O-GlcNAc修饰。O-GlcNAc修饰稳定了NSL3,NSL-HAT复合物的H4K16乙酰化需要稳定的NSL3。


生物化学特征

晶体结构

Lazarus等人(2011年)报道了人类OGT的两种晶体结构,一种是UDP的二元络合物(2.8埃分辨率),另一种是具有UDP和肽底物的三元络合物,(1.95埃分辨率)。这些结构为酶机制提供了线索,显示了OGT如何识别目标肽序列,并揭示了催化区域的两个半部分之间独特结构域的折叠。

宿主细胞因子1的裂解

宿主细胞因子-1(HCFC1;300019),一种人类细胞周期进程的转录辅助调节因子,经历蛋白水解成熟,其中6个重复序列中的任何一个被营养应答性糖基转移酶OGT切割。Lazarus等人(2013)据报道,OGT的四三肽重复结构域结合HCFC1蛋白水解酶重复序列的羧基末端部分,从而使裂解区域位于二磷酸尿苷-GlcNAc上方的糖基转移酶活性部位。构象类似于糖基化竞争性肽底物的构象。半胱氨酸和谷氨酸残基之间发生裂解,产生焦谷氨酸产物。切割位点谷氨酸转化为丝氨酸将HCFC1蛋白水解重复序列转化为糖基化底物。Lazarus等人(2013)结论蛋白质糖基化和HCFC1裂解发生在同一活性部位。


映射

Shafi等人(2000年)确定OGT基因的单一拷贝存在于男性基因组中。通过FISH,他们将人类OGT基因映射到与神经疾病相关的Xq13区域。通过辐射杂交分析,他们将小鼠同源物映射到D区着丝粒附近的X染色体上。


分子遗传学

X连锁智力发育障碍-106(XLID106;300997),Vaidyanathan等人(2017)鉴定了OGT基因中的半合子错义突变(L254F;300255.0001). 通过外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变与该家族中的疾病分离。患者细胞显示OGT蛋白水平降低,表明突变蛋白不稳定,但细胞转染研究表明突变酶保留OGT催化活性。由于代偿机制,即OGA减少,患者细胞具有正常的稳态全局O-GlcNAc水平(604039)蛋白质和mRNA水平。OGA启动子活性降低与含有mSIN3A的OGT转录抑制复合物的富集有关(607776)和HDAC1(601241)定位于OGA近端启动子区。突变细胞的转录组分析显示了几个基因的差异表达。

在两个XLID106的无关男孩中,Willems等人(2017年)确定OGT基因的半合子突变(300255.0002300255.0003). 通过外显子组测序发现突变并通过Sanger测序证实;其中一个突变是从头发生的,而另一个是从未受影响的母亲那里遗传来的。患者细胞的OGT蛋白水平略有降低,OGA蛋白水平也有所降低,但总体O-GlcNAc水平与对照组相似。其中一个突变的重组研究(R284P;300255.0002)结果表明,突变OGT易于去折叠,并对复杂的糖基化底物阵列降低了糖基化活性。HCFC1的蛋白水解过程也减少了。研究结果表明,O-GlcNAc稳态和HCFC1蛋白水解缺陷可能在OGT突变患者的智力残疾中起作用。

Selvan等人(2018)OGT基因(A259T,300255.0004和E339G,300255.0005)来自2个家庭的3名患者,包括一对同胞,XLID106。这两个家族的突变都是母系遗传的。具有A259T或E339G突变的重组OGT的功能评估表明,与野生型蛋白相比,稳定性降低,催化活性降低。在表达具有A259T或E339G突变的OGT的人类胚胎干细胞系中进行的RNA-seq转录组分析表明,LXR/RXR途径下调,这与神经元发育有关。与野生型相比,在任一突变细胞系中均未观察到O-GlcNAc总谱的变化。

Pravata等人(2020年)报道了OGT基因中的半合子错义突变(N648Y;300255.0006)XLID106患者。与野生型相比,具有N648Y突变的重组OGT蛋白的底物结合降低,模型受体底物TAB1的糖基化降低。


动物模型

Lagerlof等人(2016)声明小鼠体内构成性Ogt缺失是胚胎致死性的。他们使用了字母-CamkII(CAMK2A;114078)启动子从成年小鼠大脑中的α-CamkII阳性神经元中删除Ogt基因。Ogt-/-小鼠因饮食过量而肥胖。他们还表现出过度活动,伴随着呼吸交换比率的增加。Ogt-/-室旁核(PVN)的原位杂交显示,在高吞噬之前,促甲状腺激素释放激素(TRH;613879),其他神经肽没有变化。与野生型相比,Ogt基因敲除使PVN神经元的平均微型兴奋性突触后电流(mEPSC)频率降低72%。Ogt基因敲除更适度地降低了mEPSC振幅,对其他mEPSC参数没有影响。Lagerlof等人(2016)结论是OGT活性通过调节α-CamkII阳性PVN神经元的兴奋性突触输入,将能量摄入与能量需要耦合,至少部分是这样。


ALLELIC变体( 6精选示例):

.0001智力发育障碍,X-LINKED 106

X连锁智力发育障碍-106(XLID106;300997),Niranjan等人(2015)在OGT基因中发现了一个半合子突变,导致了leu244对he的替代。通过X染色体外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变与该家族中的疾病分离。该变异体通过dbSNP、1000基因组项目和Exome variant Server数据库进行筛选,并与一小部分无关受影响男性进行比较,以进一步富集。尽管Niranjan等人(2015)报告突变为L244F,Willems等人(2017年)声明该突变是762G-T颠倒(762G-T,NM_181672.2),导致leu254-对(L254F)替换,与Vaidyanathan等人(2017).

在XLID106家族(K9427)的3名男性患者中,Vaidyanathan等人(2017)在OGT基因中鉴定出一个半合子c.759G-T颠倒,导致TPR调节域中的leu254tohe(L254F)替代。通过外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变与该家族中的疾病分离。它是根据dbSNP、1000基因组项目和Exome Variant Server数据库进行过滤的。患者细胞显示突变OGT蛋白水平降低,表明突变蛋白不稳定,但细胞转染研究表明突变酶保留OGT催化活性。由于代偿机制,即OGA减少,患者细胞具有正常的稳态全局O-GlcNAc水平(604039)蛋白质和mRNA水平。OGA启动子活性降低是由于含有mSIN3A的OGT转录抑制复合物的富集所致(607776)和HDAC1(601241)OGA近端启动子区。突变细胞的转录组分析显示了几个基因的差异表达。


.0002智力发育障碍,X-LINKED 106

X染色体连锁智力发育障碍-106(XLID106;300997),Willems等人(2017年)在OGT基因第7外显子中鉴定出一个从头开始的半合子c.851G-c颠倒(c.851G-c,NM_181672.2),导致在TTR结构域的保守残基处发生arg284-to-pro(R284P)取代。通过全基因组测序发现突变;在ExAC数据库中找不到它。患者细胞显示OGT蛋白水平略有降低,OGA水平降低,但总体O-GlcNAc水平似乎未受影响。重组突变体OGT易于去折叠,并表现出对复杂糖基化底物阵列的糖基化活性降低。转录因子HCFC1的蛋白质水解过程也减少了。研究结果表明,O-GlcNAc稳态和HCFC1蛋白水解缺陷可能在OGT突变患者的智力残疾中起作用。


.0003智力发育障碍,X-LINKED 106

X染色体连锁智力发育障碍-106(XLID106;300997),Willems等人(2017年)在OGT基因中发现了半合子T-G颠倒(c.463-6T-G,NM_181672.2),导致剪接缺陷、外显子4跳跃和过早终止。患者细胞显示剪接亚型发生改变,但未检测到截短蛋白。通过外显子组测序发现的突变是从未受影响的母亲遗传而来;在ExAC数据库中找不到它。与野生型相比,重组蛋白显示出降低的稳定性。患者细胞显示OGT蛋白水平略有降低,OGA蛋白水平降低,但总体O-GlcNAc水平似乎未受影响。未对该变体进行进一步研究。


.0004智力发育障碍,X-LINKED 106

在一名患有X连锁智力发育障碍-106(XLID106;300997),Selvan等人(2018)在OGT基因第7外显子中发现了一个半合子c.775G-a转换,导致ala259-thr(A259T)替换。通过全外显子组测序确定的突变是从他的母亲那里遗传的。ExAC、dbSNP和1000基因组项目数据库中均未出现突变。对带有A259T突变的重组OGT的功能评估表明,与野生型相比,稳定性降低,催化活性降低。Selvan等人(2018)使用CRISPR编辑生成具有A259T突变OGT的人类胚胎干细胞系,RNA-seq转录组分析显示LXR/RXR通路下调。


.0005智力发育障碍,X-LINKED 106

OGT,GLU339GLY公司
   RCV000991242号机组

X染色体连锁智力发育障碍-106(XLID106;300997),Selvan等人(2018)在OGT基因第8外显子中发现了一个半合子c.1016A-G转换,导致在TPR结构域的保守残基处发生glu339-to-gly(E339G)替换。该突变是通过X染色体外显子测序发现的,并经Sanger测序证实,在母亲体内呈杂合状态。ExAC、dbSNP和gnomAD数据库中没有突变。具有E339G突变的重组OGT的功能评估显示,与野生型相比,稳定性降低,催化活性降低。Selvan等人(2018)使用CRISPR编辑生成具有E339G突变的OGT的人类胚胎干细胞系,RNA-seq转录组学分析证明LXR/RXR途径下调。两位母舅舅和一位母舅曾受类似影响,但未进行分子检测。


.0006智力发育障碍,X连锁106

X染色体连锁智力发育障碍-106(XLID106;300997),Pravata等人(2020年)在OGT基因中鉴定出一个半合子c.1942A-T颠倒(c.1942A-T,NM_181672.2),导致催化结构域中保守残基的asn648-to-tyr(N648Y)取代。通过三重全基因组测序确定的突变是从头开始的。与野生型相比,具有N648Y突变的重组OGT蛋白的底物结合降低,模型受体底物TAB1的糖基化降低。


参考文献

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*300255

O-连接N-乙酰基谷氨酰胺转移酶;奥格特


备选标题;符号

UDP-N-乙酰葡萄糖胺:多肽β-N-乙酰葡萄糖胺转移酶
GlcNAc转移酶


HGNC批准的基因符号:OGT

细胞遗传学位置:Xq13.1 基因组坐标(GRCh38):传真:71533104-71575892 (来自NCBI)


基因-表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
Xq13.1号机组 智力发育障碍,X连锁106 300997 X连锁隐性

文本

描述

O-连接N-乙酰氨基葡萄糖(O-GlcNAc)转移酶(OGT)催化O-糖苷键中单个N-乙酰氨基葡糖添加到丝氨酸或苏氨酸残基。由于磷酸化和糖基化都会竞争类似的丝氨酸或苏氨酸残基,这两个过程可能会竞争位点,或者它们可能会通过立体或静电效应改变邻近位点的底物特异性(Lubas等人,1997年)。O-GlcNAc的去除由O-连接的N-乙酰氨基葡萄糖酶(OGA;604039)催化(由Vaidyanathan等人总结,2017年)。OGT也在宿主细胞因子C1(HCFC1;300019)的蛋白水解过程中发挥作用(Willems等人,2017年总结)。


克隆和表达

Haltiwanger等人(1992年)纯化了大鼠肝脏OGT,并确定其分子量为340 kD。他们提出OGT是一种异三聚体复合物,有2个110 kD的亚基和1个78 kD的亚基。然而,利用兔子OGT,Lubas等人(1997年)分析了这两种多肽的蛋白水解指纹图谱,发现两者是相关的。他们认为78-kD带是110-kD多肽的蛋白水解产物或替代翻译起始位点的产物。Kreppel等人(1997年)克隆了编码110-kD亚单位的大鼠cDNA。表达大鼠OGT的人细胞的免疫荧光表明,OGT存在于细胞核和胞质溶胶中。

通过搜索含有兔OGT部分蛋白序列的EST数据库,Lubas等人(1997年)鉴定了人类和秀丽线虫OGT cDNA。预测的920-氨基酸人类蛋白包含9个四肽重复序列和一个推测的二分核定位信号。表达OGT的HeLa细胞在长时间孵育过程中存活不佳,这表明该蛋白可能对细胞有毒。Southern blot分析表明人类中存在一个OGT基因。Northern blot分析显示,OGT以多种转录物的形式表达,在不同的人体组织中以不同的数量存在,在胰腺中的表达水平最高。

Wu等人(2017)表示,OGT(他们称之为OGT1)具有N末端13.5 TPR超螺旋结构和C末端催化结构域。


基因功能

核蛋白和细胞质蛋白糖基化是真核细胞中广泛存在的可逆翻译后修饰。OGT催化通过向丝氨酸和苏氨酸中添加N-乙酰氨基葡萄糖进行细胞内糖基化。细胞内蛋白质的这种“O-GlcNAcylation”可能发生在磷酸化位点上,并与控制基因转录、神经丝组装以及糖尿病和神经疾病的发生有关。为了在体内研究OGT功能,Shafi等人(2000年)在男性胚胎干细胞中使用基因靶向方法。他们发现OGT突变需要一种保留完整OGT基因的策略,就像使用Cre-loxP重组一样,因为OGT基因缺失会导致胚胎干细胞活性丧失。在大多数细胞类型中,小鼠OGT RNA的表达相对较高,而胰腺中的表达水平较低。小鼠生殖系OGT等位基因的分离表明,完整的OGT等位点是胚胎发生完成所必需的。这些研究说明了条件基因靶向方法在必要的X连锁基因突变和研究中的必要性,并表明OGT参与细胞内糖基化对胚胎干细胞存活和小鼠个体发育至关重要。

转录因子和RNA聚合酶II可以被丝氨酸或苏氨酸残基上的O-GlcNAc单糖修饰,但这种修饰的确切功能作用还不清楚。Yang等人(2002年)表明,OGT是一种催化这种翻译后修饰的酶,它通过与辅阻遏物Sin3A结合与组蛋白脱乙酰酶复合物相互作用(607776)。在功能上,OGT和Sin3A协同抑制转录,与组蛋白脱乙酰化平行。作者提出,Sin3A将OGT靶向启动子,通过O-GlcNAc修饰使转录因子和RNA聚合酶II失活,其与组蛋白脱乙酰化协同作用,以高效和特异的方式促进基因沉默。

Zhang等人(2003年)证明,Ogt介导的修饰可以抑制哺乳动物26S蛋白酶体,从而抑制转录因子Sp1(189906)和疏水性测试肽的蛋白水解。O-GlcNAc在体外和体内修饰了蛋白酶体19S帽中的Rpt2 ATP酶,随着其修饰的增加,蛋白酶体功能下降。

Yang等人(2008年)表明OGT含有一种以前未被识别的磷脂酰肌醇结合域。在用胰岛素诱导后,磷脂酰肌醇3,4,5-三磷酸将OGT从细胞核招募到质膜,在那里酶催化O-GlcNAc对胰岛素信号通路的动态修改。这导致关键信号分子磷酸化的改变和胰岛素信号转导的减弱。OGT在肝脏的过度表达会损害胰岛素反应基因的表达,并导致胰岛素抵抗和血脂异常。Yang等人(2008年)的结论是,他们的发现确定了营养线索通过O-GlcNAc调节胰岛素信号的分子机制,并强调了这种修饰对胰岛素抵抗和2型糖尿病病因的贡献(125853)。

循环葡萄糖浓度的增加激活己糖生物合成途径,并通过OGT促进蛋白质的O-糖基化。Dentin等人(2008年)表明,OGT通过调节cAMP反应元件结合蛋白(CREB)2(TORC2或CRTC2;608972)的换能器的O-糖基化作用触发肝糖异生。CRTC2在细胞质中通常通过磷酸化依赖性机制螯合CRTC2的位点被O-糖基化。通过表达去糖基化酶O-GlcNAcase(604039)减少O-糖基化CRTC2的数量,阻断了葡萄糖对糖异生的影响,证明了己糖生物合成途径在葡萄糖不耐受发展中的重要性。

Fujiki等人(2011年)报告称,组蛋白H2B(参见609904)在体外和活细胞中由OGT在S112残基处的O-连接N-乙酰氨基葡萄糖(GlcNAcylated)酰化。组蛋白GlcNAcylization通过己糖生物合成途径对细胞外葡萄糖作出反应而波动。H2B S112-GlcNAcylation促进K120单泛素化,其中GlcNAc部分可以作为组蛋白H2B泛素连接酶的锚定。H2B S112-GlcNAc定位于苍蝇多线染色体的常染色区。在全基因组分析中,H2B S112 GlcNAcylation位点广泛分布于包括转录基因位点在内的染色体上,一些位点与H2B K120单泛素化共定位。Fujiki等人(2011年)得出结论,H2B S112 GlcNAcylation是一种组蛋白修饰,促进H2BK120单泛素化,可能用于转录激活。

Chen等人(2013年)利用蛋白质亲和纯化技术寻找TET蛋白的功能性伴侣,发现TET2(612839)和TET3(613555)与OGT相关,OGT是一种酶,在体内催化将O-GlcNAc添加到丝氨酸和苏氨酸残基上(O-GlcNA酰化)。TET2直接与OGT相互作用,这对OGT在体内的染色质结合非常重要。尽管这种特定的相互作用不调节TET2的酶活性,但它促进了OGT依赖性组蛋白O-GlcNAcylation。此外,OGT在转录起始位点与TET2相关。TET2的下调降低了体内组蛋白2B S112 GlcNAc标记的数量,这与基因转录调控有关。Chen等人(2013年)的结论是,综合起来,他们的结果显示染色质的TET2依赖的O-GlcNA酰化。TET2和OGT对DNA和组蛋白的双重表观遗传修饰协调了基因转录的调控。

Wu等人(2017年)指出,OGT1和NSL3(617742)是一种非特异性致死(NSL)组蛋白乙酰转移酶复合物的亚单位,可乙酰化组蛋白H4(见602822)残基lys5(K5)、K8和K16。OGT1或NSL3的敲除以剂量依赖的方式减少了H4K16的全局乙酰化。免疫沉淀分析显示内源性OGT1和NSL3在HEK293和HeLa细胞中相互作用,突变分析显示OGT1的N末端TPR重复域与NSL3的脱水解酶域相互作用。在体外,OGT1在供体UDP-O-GlcNAc存在下催化NSL3的O-GlcNAc修饰。O-GlcNAc修饰稳定了NSL3,NSL-HAT复合物的H4K16乙酰化需要稳定的NSL3。


生物化学特征

晶体结构

Lazarus等人(2011年)报告了人类OGT的两种晶体结构,一种是UDP的二元络合物(2.8埃分辨率),另一种是具有UDP和肽底物的三元络合物。这些结构为酶机制提供了线索,显示了OGT如何识别目标肽序列,并揭示了催化区域的两个半部分之间独特结构域的折叠。

宿主细胞因子1的裂解

宿主细胞因子-1(HCFC1;300019)是人类细胞周期进程的转录协同调节因子,它经历了蛋白水解成熟过程,其中6个重复序列中的任何一个被营养反应性糖基转移酶OGT裂解。Lazarus等人(2013年)报告称,OGT的四三肽重复结构域结合HCFC1蛋白水解酶重复序列的羧基末端部分,从而使裂解区域位于二磷酸尿苷-GlcNAc上方的糖基转移酶活性部位。构象类似于糖基化竞争性肽底物的构象。半胱氨酸和谷氨酸残基之间发生裂解,产生焦谷氨酸产品。切割位点谷氨酸转化为丝氨酸将HCFC1蛋白水解重复序列转化为糖基化底物。Lazarus等人(2013年)得出结论,蛋白质糖基化和HCFC1裂解发生在同一活性部位。


映射

Shafi等人(2000)确定OGT基因的单个拷贝存在于男性基因组中。通过FISH,他们将人类OGT基因映射到与神经疾病相关的Xq13区域。通过辐射杂交分析,他们将小鼠同源物映射到D区着丝粒附近的X染色体上。


分子遗传学

在X连锁智力发育障碍-106(XLID106;300997)家族的3名男性患者中,Vaidyanathan等人(2017年)在OGT基因中发现了一个半合子错义突变(L254F;300255.0001)。通过外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变与该家族中的疾病分离。患者细胞显示OGT蛋白水平降低,表明突变蛋白不稳定,但细胞转染研究表明突变酶保留OGT催化活性。由于代偿机制,即OGA(604039)蛋白和mRNA水平降低,患者细胞具有正常的稳态全局O-GlcNAc水平。OGA启动子活性降低与含有OGT的转录抑制复合物的富集有关,该复合物含有定位于OGA近端启动子区域的mSIN3A(607776)和HDAC1(601241)。突变细胞的转录组分析显示几个基因的差异表达。

Willems等人(2017年)在2名患有XLID106的无关男孩中发现OGT基因的半合子突变(300255.0002和300255.0003)。通过外显子组测序发现突变并通过Sanger测序证实;其中一个突变是从头发生的,而另一个是从未受影响的母亲那里遗传来的。患者细胞的OGT蛋白水平略有降低,OGA蛋白水平也有所降低,但总体O-GlcNAc水平与对照组相似。对其中一个突变(R284P;300255.0002)的重组研究表明,突变OGT易于去折叠,并对复杂的糖基化底物具有降低的糖基化度。HCFC1的蛋白水解过程也减少了。研究结果表明,O-GlcNAc稳态和HCFC1蛋白水解缺陷可能在OGT突变患者的智力残疾中起作用。

Selvan等人(2018年)在2个家族的3名患者中发现了OGT基因的半合子突变(A259T,300255.0004和E339G,300255.00 05),包括一对XLID106的同胞对。这两个家族的突变都是母系遗传的。具有A259T或E339G突变的重组OGT的功能评估显示,与野生型蛋白相比,稳定性降低,催化活性降低。人类胚胎干细胞系中表达OGT的A259T或E339G突变的RNA-seq转录组学分析显示LXR/RXR通路下调,这与神经元发育有关。与野生型相比,在任一突变细胞系中均未观察到O-GlcNAc总谱的变化。

Pravata等人(2020年)报告了一名XLID106患者OGT基因(N648Y;300255.0006)中的半合子错义突变。与野生型相比,具有N648Y突变的重组OGT蛋白的底物结合降低,模型受体底物TAB1的糖基化降低。


动物模型

Lagerlof等人(2016年)指出,小鼠体内的组成性Ogt缺失是胚胎致死性的。他们使用α-CamkII(CAMK2A;114078)启动子从成年小鼠大脑中α-CamkⅡ阳性神经元中删除Ogt基因。Ogt-/-小鼠因饮食过量而肥胖。他们还表现出过度活动,伴随着呼吸交换比率的增加。Ogt-/-室旁核(PVN)的原位杂交显示,在吞咽过度之前,促甲状腺素释放激素(TRH;613879)降低,而其他神经肽没有变化。与野生型相比,Ogt基因敲除使PVN神经元的平均微型兴奋性突触后电流(mEPSC)频率降低72%。Ogt基因敲除更适度地降低了mEPSC振幅,对其他mEPSC参数没有影响。Lagerlof等人(2016年)得出结论,OGT活动通过调节来自α-CamkII阳性PVN神经元的兴奋性突触输入,将能量摄入与能量需要耦合,至少在一定程度上是这样。


等位基因变体 6个精选示例):

.0001智力发育障碍,X-LINKED 106

OGT、LEU254PHE
SNP:rs1131692155,临床变量:RCV000492058

在X连锁智力发育障碍-106(XLID106;300997)家系的受影响成员中,Niranjan等人(2015)发现OGT基因中存在半合子突变,导致leu244对he替代。该突变是通过X染色体外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,与该家族的疾病分离。该变异体通过dbSNP、1000基因组项目和Exome variant Server数据库进行筛选,并与一小部分无关受影响男性进行比较,以进一步富集。尽管Niranjan等人(2015年)报告该突变为L244F,Willems等人(2017年)指出,该突变是762G-T颠倒(762G-T,NM_181672.2),导致了leu254-tohe(L254F)替代,与Vaidyanathan等人(2017)报告的突变相同。

Vaidyanathan等人(2017年)在一个XLID106家族(K9427)的3名受影响男性中,在OGT基因中发现了一个半合子c.759G-T颠倒,导致TPR调节域中出现leu254tohe(L254F)替代。通过外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变与该家族中的疾病分离。它是根据dbSNP、1000基因组项目和Exome Variant Server数据库进行过滤的。患者细胞显示突变OGT蛋白水平降低,表明突变蛋白不稳定,但细胞转染研究表明突变酶保留OGT催化活性。由于一种补偿机制,即OGA(604039)蛋白和mRNA水平的降低,患者细胞具有正常的稳态全局O-GlcNAc水平。OGA启动子活性的降低是由于在OGA的近端启动子区富集了含有mSIN3A(607776)和HDAC1(601241)的含OGT的转录阻遏物复合物。突变细胞的转录组分析显示了几个基因的差异表达。


.0002智力发育障碍,X-LINKED 106

OGT,ARG284PRO公司
单号:rs1114167891,临床变量:RCV000492048

在一名患有X-连锁智力发育障碍-106(XLID106;300997)的男性患者中,Willems等人(2017年)在OGT基因第7外显子中发现了一个从头开始的半合子c.851G-c颠倒(c.851C-c,NM_181672.2),导致在TTR结构域的保守残基处发生arg284-to-pro(R284P)取代。通过全基因组测序发现突变;在ExAC数据库中找不到它。患者细胞显示OGT蛋白水平略有降低,OGA水平降低,但总体O-GlcNAc水平似乎未受影响。重组突变体OGT易于去折叠,并且对复杂的糖基化底物阵列显示出降低的糖基化活性。转录因子HCFC1的蛋白水解过程也减少。研究结果表明,O-GlcNAc稳态和HCFC1蛋白水解缺陷可能在OGT突变患者的智力残疾中起作用。


.0003智力发育障碍,X-LINKED 106

OGT,约463-6T-G
单核苷酸多态性:rs943295842,临床变量:RCV000492053

在一名患有X-连锁智力发育障碍-106(XLID106;300997)的男性患者中,Willems等人(2017年)在OGT基因中发现了半合子T-G颠倒(c.463-6T-G,NM_181672.2),导致剪接缺陷、外显子4跳跃和过早终止。患者细胞显示剪接亚型发生改变,但未检测到截短蛋白。通过外显子组测序发现的突变是从未受影响的母亲遗传而来;在ExAC数据库中找不到它。与野生型相比,重组蛋白的稳定性降低。患者细胞显示OGT蛋白水平略有降低,OGA蛋白水平降低,但总体O-GlcNAc水平似乎未受影响。未对该变体进行进一步研究。


.0004智力发育障碍,X-LINKED 106

阿拉259THR OGT
单核苷酸多态性:rs797044898,临床变量:RCV000190722,RCV000991240

在一名患有X-连锁智力发育障碍-106(XLID106;300997)的男性患者(患者1)中,Selvan等人(2018年)在OGT基因第7外显子中发现了一个半合子c.775G-a过渡,导致了ala259-thr(A259T)替代。通过全基因组测序确定的突变是从他母亲那里遗传来的。ExAC、dbSNP和1000基因组项目数据库中均未发现该突变。对带有A259T突变的重组OGT的功能评估表明,与野生型相比,稳定性降低,催化活性降低。Selvan等人(2018年)使用CRISPR编辑生成具有A259T突变OGT的人类胚胎干细胞系,RNA-seq转录组学分析显示LXR/RXR通路下调。


.0005智力发育障碍,X-LINKED 106

OGT,GLU339GLY公司
单号:rs1602147880,临床变量:RCV000991242

在2名患有X连锁智力发育障碍-106(XLID106;300997)的男性同胞(患者2和3)中,Selvan等人(2018年)在OGT基因第8外显子中发现了一个半合子c.1016A-G转换,导致在TPR域的保守残基处发生glu339-to-gly(E339G)替换。该突变是通过X染色体外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,在母亲体内以杂合子状态存在。ExAC、dbSNP和gnomAD数据库中没有突变。与野生型相比,E339G突变的重组OGT的功能评估显示稳定性降低,催化活性降低。Selvan等人(2018年)使用CRISPR编辑生成具有E339G突变OGT的人类胚胎干细胞系,RNA-seq转录组学分析显示LXR/RXR通路下调。两位母舅舅和一位母舅曾受类似影响,但未进行分子检测。


.0006智力发育障碍,X-LINKED 106

OGT,ASN648TYR
SNP:rs1602152230,临床变量:RCV000852378

在一名患有X连锁智力发育障碍-106(XLID106;300997)的男孩中,Pravata等人(2020年)在OGT基因中发现了一个半合子c.1942A-T颠倒(c.1942A-T,NM_181672.2),导致催化结构域中保守残基的asn648-to-tyr(N648Y)取代。通过三个完整外显子组测序确定的突变被证明是从头开始的。与野生型相比,具有N648Y突变的重组OGT蛋白的底物结合降低,模型受体底物TAB1的糖基化降低。


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