条目-*300189-椎间盘大型MAGUK支架蛋白3;DLG3(数据链路3)-OMIM公司
 
*300189

椎间盘大分子支架蛋白3;DLG3(数据链路3)


备选标题;符号

大圆盘,果蝇,同源,3
神经内分泌DLG;NEDLG公司
突触相关蛋白102;SAP102标准


HGNC批准的基因符号:DLG3(数据链路3)

细胞遗传学位置:Xq13.1号机组 基因组坐标(GRCh38):十: 70444835-70505490 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
Xq13.1号机组 智力发育障碍,X连锁90 300850 卡侬

文本

描述

DLG3编码突触相关蛋白102(SAP102),是膜相关鸟苷酸激酶(MAGUK)蛋白家族的成员。MAGUK蛋白是上皮极性的重要调节器,已知其在受体组织和突触内的下游信号通路中发挥重要作用(由Tarpey等人,2004年).


克隆和表达

通过搜索EST数据库中与果蝇dlg和人类DLG1相关的序列(601014),Makino等人(1997年)分离出一部分DLG3 cDNA,他们将其命名为NEDLG(神经内分泌DLG)。使用PCR,他们克隆了一个与整个NEDLG编码区相对应的cDNA。预测的817氨基酸蛋白包含3个DHR(圆盘大同源区)片段、中心SH3基序和MAGUK蛋白的C末端鸟苷酸激酶结构域特征。NEDLG与DLG1和果蝇dlg分别有75%和60%的蛋白质序列同源性。Northern blot分析显示NEDLG在神经元和内分泌组织中高度表达。免疫定位研究表明,该蛋白主要表达于非增殖细胞,如神经元、胰腺朗格汉斯岛细胞、心肌细胞、食管上皮棘层细胞和功能层细胞。在酵母双杂交试验中,NEDLG与APC的C末端区域相互作用(611731)抑癌蛋白。作者认为,NEDLG可能通过与APC蛋白的相互作用对细胞增殖进行负调控。

神经元SAP102在脑发育早期表达,定位于兴奋性突触的突触后密度。SAP102的3个N-末端PDZ结构域直接与NMDA谷氨酸受体的NR2亚单位相互作用(例如。,138253)以及负责NMDA受体定位、固定化和信号传导的其他蛋白质(综述Muller等人,1996年Tarpey等人,2004年).


映射

通过荧光原位杂交,Makino等人(1997年)将DLG3基因映射到Xq13。

使用辐射混合面板,Stathakis等人(1998年)将DLG3的地图位置细化为Xq13.1。这些作者指出,DLG3位于肌营养不良-帕金森综合征(DYT3;314250)轨迹。


分子遗传学

Tarpey等人(2004年)DLG3基因的截短突变(300189.0001-300189.0004)329个中度至重度X连锁智力发育障碍(XLID90;300850). 所有突变都在第三个PDZ结构域内或之前引入了提前终止密码子,可能会损害SAP102与NMDA受体和/或下游NMDA受体信号通路中涉及的其他蛋白质相互作用的能力。

在两个不相关的芬兰XLID90家庭的受影响成员中,Philips等人(2014)在DLG3基因中发现了2个不同的剪接位点突变(300189.0005300189.0006). 通过X染色体外显子组测序在14个患有X连锁精神发育迟滞的芬兰家庭中发现突变。


ALLELIC变体( 6精选示例):

.0001智力发育障碍,X-LINKED 90

DLG3、IVS6DS、G-A、+5
   RCV00012274型

在X连锁非综合征智力发育障碍家庭的受累成员中,显示出与Xq13区域的联系(XLID90;300850),Tarpey等人(2004年)在DLG3基因的内含子6(1218+5G-a)中发现了剪接供体突变。异常剪接预计会在326位引入移码和提前终止密码子。350条正常染色体未发现突变。


.0002智力发育障碍,X-LINKED 90

DLG3、IVS8DS、G-A、+1
   RCV00012275型

在患有非综合征X连锁智力发育障碍(Xq13,XLID90;300850),Tarpey等人(2004年)在DLG3基因第8内含子(1535+1G-a)中发现剪接供体突变。异常剪接预计在383位引入移码和提前终止密码子。350条正常染色体未发现突变。


.0003智力发育障碍,X-LINKED 90

DLG3,1-BP INS,1325C
   RCV000022834型

在一个分离出非综合征性X连锁智力发育障碍的受影响家庭成员中,映射到Xq13(XLID90;300850),Tarpey等人(2004年)在DLG3基因第7外显子中发现1 bp插入(1325insC),导致377位移码和终止密码子,去除了54%的正常翻译蛋白。350条正常染色体未发现突变。


.0004智力发育障碍,X-LINKED 90

在一个分离出非综合征性X连锁智力发育障碍的受影响家庭成员中,映射到Xq13(XLID90;300850),Tarpey等人(2004年)在DLG3基因第9外显子中发现1606C-G颠倒,导致ser458-to-ter(S458X)替换。在350条正常染色体中未发现该突变。


.0005智力发育障碍,X-LINKED 90

DLG3、IVS1DS、G-C、+1
   RCV000115022型

芬兰X连锁智力发育障碍90(XLID90;300850),Philips等人(2014)在DLG3基因的内含子1(C.357+1G-C)中发现了G-to-C颠倒,预计会导致剪接位点突变。通过X染色体外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变与该家族中的疾病分离。针对dbSNP(构建138)、Exome Variant Server和内部Exome数据库对突变进行筛选。未对变体进行功能研究。这些患者有延迟的精神运动发育和轻微的畸形特征。


.0006智力发育障碍,X-LINKED 90

DLG3、IVS6DS、G-C、+1
   RCV000115023型

芬兰X连锁智力发育障碍-90(XLID90;300850),Philips等人(2014)在DLG3基因的内含子6(C.985+1G-C)中发现了G-to-C颠倒,预计会导致剪接位点突变。通过X染色体外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变,根据dbSNP(构建138)、外显子变体服务器和内部外显子数据库进行筛选。未对变体进行功能研究。一只受感染的雌性也被发现携带突变;她的X射线失活模式为80:20。


参考文献

  1. Makino,K.、Kuwahara,H.、Masuko,N.、Nishiyama,Y.、Morisaki,T.、Sasaki,J.、Nakao,M.、Kuwano,A.、Nakata,M.,Ushio,Y.和Saya,H。NE dlg的克隆和鉴定:一种新的果蝇椎间盘大(dlg)肿瘤抑制蛋白的人类同源物,与APC蛋白相互作用。癌基因14:2425-24331997。[公共医学:9188857,相关引文][全文]

  2. Muller,B.M.,Kistner,U.,Kindler,S.,Chung,W.J.,Kuhlendahl,S.、Fenster,S.D.、Lau,L.-F.、Veh,R.W.、Huganir,R.L.、Gundelfinger,E.D.、Garner,C.C。SAP102,一种与体内NMDA受体复合体相互作用的新型突触后蛋白。神经元17:255-2651996。[公共医学:8780649,相关引文][全文]

  3. Philips,A.K.,Siren,A.,Avela,K.,Somer,M.,Peippo。芬兰智力残疾家庭的X外显子组测序——四种新突变和两种新的综合征表型。孤儿J.罕见疾病。9: 49, 2014. 注:电子文章。[公共医学:24721225,图像,相关引文][全文]

  4. Stathakis,D.G.,Lee,D.,Bryant,P.J。DLG3是编码人类神经内分泌Dlg(NE-Dlg)的基因,位于Xq13.1的1.8-Mb肌营养不良-帕金森综合征区域。基因组学49:310-3131998。[公共医学:9598320,相关引文][全文]

  5. Tarpey,P.,Parnau,J.,Blow,M.,Woffendin,H.,Bignell,G.,Cox,C.,Cox。DLG3基因突变导致非综合征性X连锁精神发育迟滞。Am.J.Hum.遗传学。75: 318-324, 2004.[公共医学:15185169,图像,相关引文][全文]


Cassandra L.Kniffin-更新时间:2014年4月30日
Carol A.Bocchini-更新时间:2011年8月9日
维克托·麦库西克-更新日期:7/12/2004
创建日期:
丽贝卡·S·拉苏利:1999年5月18日
阿洛佩兹:2021年8月20日
卡罗尔:2019年7月9日
颂歌:2019年6月9日
卡罗尔:2014年1月5日
卡罗尔:2014年5月1日
迈克尔顿:2014年4月30日
ckniffin:2014年4月30日
特里:2011年8月9日
卡罗尔:2011年8月9日
ckniffin:2008年2月5日
wwang:2006年2月20日
阿洛佩兹:2004年7月13日
阿洛佩兹:2004年7月13日
特里:2004年7月12日
阿洛佩兹:1999年5月18日

*300189

椎间盘大分子支架蛋白3;DLG3(数据链路3)


备选标题;符号

大圆盘,果蝇,同源,3
神经内分泌DLG;NEDLG公司
突触相关蛋白102;SAP102标准


HGNC批准的基因符号:DLG3

细胞遗传学位置:Xq13.1 基因组坐标(GRCh38):传真:70444835-70505490 (来自NCBI)


基因-表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
Xq13.1号机组 智力发育障碍,X连锁90 300850 X连锁隐性

文本

描述

DLG3编码突触相关蛋白102(SAP102),是膜相关鸟苷酸激酶(MAGUK)蛋白家族的成员。MAGUK蛋白是上皮极性的重要调节器,已知在受体组织和突触内的下游信号通路中发挥重要作用(由Tarpey等人总结,2004年)。


克隆和表达

通过搜索EST数据库中与果蝇dlg和人类DLG1相关的序列(601014),Makino等人(1997年)分离出一部分DLG3 cDNA,他们将其命名为NEDLG(神经内分泌dlg)。使用PCR,他们克隆了一个与整个NEDLG编码区相对应的cDNA。预测的817氨基酸蛋白包含3个DHR(圆盘大同源区)片段、中心SH3基序和MAGUK蛋白的C末端鸟苷酸激酶结构域特征。NEDLG与DLG1和果蝇dlg分别有75%和60%的蛋白质序列同源性。Northern blot分析显示NEDLG在神经元和内分泌组织中高度表达。免疫定位研究表明,该蛋白主要表达于非增殖细胞,如神经元、胰腺朗格汉斯岛细胞、心肌细胞、食管上皮棘层细胞和功能层细胞。在酵母双杂交试验中,NEDLG与APC(611731)抑癌蛋白的C末端区域相互作用。作者认为,NEDLG可能通过与APC蛋白的相互作用负调控细胞增殖。

神经元SAP102在脑发育早期表达,定位于兴奋性突触的突触后密度。SAP102的3个N-末端PDZ结构域直接与NMDA谷氨酸受体的NR2亚单位(例如,138253)以及负责NMDA受体定位、固定和信号传递的其他蛋白质相互作用(由Muller等人,1996年和Tarpey等人,2004年总结)。


映射

通过荧光原位杂交,Makino等人(1997年)将DLG3基因映射到Xq13。

Stathakis等人(1998年)使用辐射混合板将DLG3的地图位置细化为Xq13.1。这些作者指出,DLG3位于肌营养不良-帕金森综合征(DYT3;314250)位点。


分子遗传学

Tarpey等人(2004年)在329个患有中度至重度X连锁智力发育障碍(XLID90;300850)的家庭中的4个家庭中发现了DLG3基因的截断突变(300189.0001-300189.0004)。所有突变都在第三个PDZ结构域内或之前引入了过早的终止密码子,这可能会削弱SAP102与NMDA受体和/或参与下游NMDA受体信号通路的其他蛋白质相互作用的能力。

Philips等人(2014年)在两个不相关的芬兰XLID90家族的受影响成员中,在DLG3基因中发现了两种不同的剪接位点突变(300189.0005和300189.0006)。通过X染色体外显子组测序在14个患有X连锁精神发育迟滞的芬兰家庭中发现突变。


ALLELIC变体 6个精选示例):

.0001智力发育障碍,X连锁90

DLG3、IVS6DS、G-A、+5
SNP:rs2147771642,临床变量:RCV00012274

Tarpey等人(2004年)在一个X连锁非综合征智力发育障碍家族的受累成员中发现DLG3基因内含子6(1218+5G-a)存在剪接供体突变,该家族患有与Xq13区域相关的X连锁非综合症智力发育障碍(XLID90;300850)。异常剪接预计会在326位引入移码和提前终止密码子。350条正常染色体未发现突变。


.0002智力发育障碍,X-LINKED 90

DLG3、IVS8DS、G-A、+1
SNP:rs1373474125,gnomAD:rs1373474125,临床变量:RCV00012275

Tarpey等人(2004年)在一个非综合征X连锁智力发育障碍家族的受累成员中发现DLG3基因内含子8(1535+1G-a)存在剪接供体突变,该家族患有Xq13(XLID90;300850)的非综合征性X连锁智力发展障碍。异常剪接预计在383位引入移码和提前终止密码子。350条正常染色体未发现突变。


.0003智力发育障碍,X-LINKED 90

DLG3,1-BP INS,1325C
单号:rs398122846,临床变量:RCV000022834

Tarpey等人(2004年)在一个分离Xq13(XLID90;300850)非综合征性X连锁智力发育障碍家族的受影响成员中,发现DLG3基因外显子7中有1 bp的插入(1325insC),导致377位移码和终止密码子,去除了54%的正常翻译蛋白。350条正常染色体未发现突变。


.0004智力发育障碍,X-LINKED 90

DLG3、SER458TER
单号:rs398122847,临床变量:RCV000022835

Tarpey等人(2004年)在分离Xq13(XLID90;300850)非综合征性X连锁智力发育障碍家族的受累成员中发现DLG3基因第9外显子存在1606C-G颠倒,导致了一个ser458-to-ter(S458X)替代。350条正常染色体未发现突变。


.0005智力发育障碍,X-LINKED 90

DLG3、IVS1DS、G-C、+1
单号:rs587777359,临床变量:RCV000115022

在患有X-连锁智力发育障碍-90(XLID90;300850)的芬兰家族(D172)的3个成员中,Philips等人(2014)在DLG3基因的内含子1(C.357+1G-C)中发现了G-to-C颠倒,预计会导致剪接位点突变。通过X染色体外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变与该家族中的疾病分离。针对dbSNP(构建138)、Exome Variant Server和内部Exome数据库对突变进行筛选。没有对该变体进行功能研究。这些患者有延迟的精神运动发育和轻微的畸形特征。


.0006智力发育障碍,X-LINKED 90

DLG3、IVS6DS、G-C、+1
SNP:rs587777360,临床变量:RCV000115023

在患有X连锁智力发育障碍-90(XLID90;300850)的芬兰家族(D301)的5个成员中,Philips等人(2014)在DLG3基因的内含子6(C.985+1G-C)中发现了G-to-C颠倒,预计会导致剪接位点突变。通过X染色体外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变,根据dbSNP(构建138)、外显子变体服务器和内部外显子数据库进行筛选。未对变体进行功能研究。一只受感染的雌性也被发现携带突变;她的X射线失活模式为80:20。


参考文献

  1. Makino,K.、Kuwahara,H.、Masuko,N.、Nishiyama,Y.、Morisaki,T.、Sasaki,J.、Nakao,M.、Kuwano,A.、Nakata,M.,Ushio,Y.和Saya,H。NE-dlg的克隆和表征:果蝇圆盘大(dlg)抑癌蛋白的新人类同源物与APC蛋白相互作用。肿瘤基因14:2425-24331997。[公共医学:9188857][全文:https://doi.org/10.1038/sj.onc.1201087]

  2. Muller,B.M.,Kistner,U.,Kindler,S.,Chung,W.J.,Kuhlendahl,S.、Fenster,S.D.、Lau,L.-F.、Veh,R.W.、Huganir,R.L.、Gundelfinger,E.D.、Garner,C.C。SAP102,一种与体内NMDA受体复合体相互作用的新型突触后蛋白。神经元17:255-2651996。[公共医学:8780649][全文:https://doi.org/10.1016/s0896-6273(00)80157-9]

  3. Philips,A.K.,Siren,A.,Avela,K.,Somer,M.,Peippo。芬兰智力残疾家庭的X外显子组测序——四种新突变和两种新的综合征表型。孤儿J.罕见疾病。9: 49, 2014. 注:电子文章。[公共医学:24721225][全文:https://doi.org/10.1186/1750-1172-9-49]

  4. Stathakis,D.G.,Lee,D.,Bryant,P.J。DLG3是编码人类神经内分泌Dlg(NE-Dlg)的基因,位于Xq13.1的1.8-Mb肌营养不良-帕金森综合征区域。基因组学49:310-3131998。[公共医学:9598320][全文:https://doi.org/10.1006/geno.1998.5243]

  5. Tarpey,P.,Parnau,J.,Blow,M.,Woffendin,H.,Bignell,G.,Cox,C.,Cox。DLG3基因突变导致非综合征性X连锁精神发育迟滞。Am.J.Hum.遗传学。75: 318-324, 2004.[公共医学:15185169][全文:https://doi.org/10.1086/422703]


贡献者:
Cassandra L.Kniffin-更新时间:2014年4月30日
Carol A.Bocchini-更新时间:2011年8月9日
Victor A.McKusick-更新时间:2004年12月7日

创建日期:
丽贝卡·S·拉苏利:1999年5月18日

编辑历史记录:
阿洛佩兹:2021年8月20日
卡罗尔:2019年7月9日
颂歌:2019年6月9日
卡罗尔:2014年1月5日
卡罗尔:2014年5月1日
迈克尔顿:2014年4月30日
ckniffin:2014年4月30日
特里:2011年8月9日
卡罗尔:2011年8月9日
ckniffin:2008年2月5日
wwang:2006年2月20日
脱发:2004年7月13日
阿洛佩兹:2004年7月13日
特里:2004年7月12日
阿洛佩兹:1999年5月18日