条目-*300096-四SPANIN 7;TSPAN7公司-OMIM公司
 
*300096

四SPANIN 7;TSPAN7公司


备选标题;符号

膜成分,X染色体,表面标记1;MXS1型
跨膜蛋白A15
跨膜4超家族,成员2;TM4SF2型


HGNC批准的基因符号:TSPAN7公司

细胞遗传学位置:Xp11.4解决方案   基因组坐标(GRCh38):十: 38561542-38688918号 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
Xp11.4版本 智力发育障碍,X连锁58 300210 XLR公司

文本

克隆和表达

通过对未成熟T细胞系(HPB-ALL)cDNA文库的差异筛选,Emi等人(1993年)分离出一个新的cDNA,命名为A15。A15在HPB-ALL细胞中表达,但在外周血淋巴细胞或早幼粒细胞白血病细胞系HL-60中不表达。A15 cDNA编码一个推断的244-氨基酸蛋白,具有4个假定的跨膜结构域和4个可能的N-连接糖基化位点。A15编码的蛋白质序列最初由HUGO命名委员会指定为MXS1,与ME491(CD63;155740)在较小程度上,其他跨膜蛋白如CO-029和TAPA1(186845). A15的亲水性图与ME491相似。

大脑cDNA,CCG-B7由Li等人(1993)由于存在CCG三联体重复序列而被分离,并与MXS1编码区完全一致。在cDNA的5素数非翻译区出现7个三重重复。

通过RNA原位杂交,Zemni等人(2000年)发现Tm4sf2转录物首次在胚胎第10.5天的小鼠大脑中检测到。Tmsf2在包括大脑皮层和海马体在内的中枢神经系统中高度表达。


基因功能

TM4SF2编码四跨蛋白家族的一个成员,已知四跨蛋白家族在包括β-1整合素的分子复合物中起作用(ITGB1;135630).Zemni等人(2000年)推测通过这种相互作用,TM4SF2可能在神经突起生长的控制中发挥作用。


映射

Li等人(1993)通过体细胞杂交DNA的PCR,将CCG-B7 cDNA定位到X染色体上。Virtaneva等人(1994年)通过与人类/啮齿动物衍生杂交细胞系的DNA杂交,将A15/MXS1映射到Xq11。


分子遗传学

Zemni等人(2000年)指出TM4SF2基因定位于Xp11.4,并发现该基因已被X的X断裂点灭活;2非特异性智力发育障碍患者的平衡易位(见XLID58;300210). 进一步调查发现,在33个其他智力发育障碍家庭中,有2个家庭存在TM4SF2突变;看见300096.0001300096.0002.

Da Costa Maranduba等人(2004年)发现TM4SF2基因突变(300096.0002)一名21岁男性,XLID58。他的母亲和妹妹都是智力正常的人,被发现携带突变基因,但他精神正常的哥哥却不是。


ALLELIC变体( 3精选示例):

.0001智力发育障碍,X连锁58

TSPAN7,GLY218TER公司
   RCV000012395型

X染色体连锁智力发育障碍58(XLID58;300210),Zemni等人(2000年)在TM4SF2基因中发现一个提前终止密码子TGA(gly218-ter),预测缺失第四跨膜段和羧基末端结构域的截短蛋白。


.0002智力发育障碍,X连锁58

智力发育障碍58(XLID58;300210),Zemni等人(2000年)在TM4SF2基因中检测到C-a颠倒,导致非保守的pro172-to-his(P172H)替代。在对这个家庭成员的进一步认知调查中,Gomot等人(2002年)发现3名男性家庭成员智力发育迟滞程度较轻,其他3人智力发育迟缓程度较轻。他们记录了该家族中精神发育迟滞患者的认知特征,并基于认知状态进行了关联分析。重组排除了含有TM4SF2基因的区域。Gomot等人(2002年)指出,鉴于新的结果,只有在遗传该突变的1名家庭成员的正常认知表型反映出不完全外显率或可变表达的情况下,P172H变化才可能是该家族的致病突变。

Da Costa Maranduba等人(2004年)在105名患有智力发育障碍的男性患者中筛选了TM4SF2基因的7个外显子,并在一名21岁患者中鉴定了P172H替代物。他的母亲和妹妹都是智力正常的人,被发现是突变的携带者,但他精神正常的哥哥却不是。Da Costa Maranduba等人(2004年)结论是,不能排除P172H突变是智力发育受损的原因。


.0003智力发育障碍,X连锁58

TSPAN7,2-BP DEL,564GT
   RCV000012397型

在一个患有X连锁智力发育障碍58(XLID58;300210)报告人Holinski-Feder等人(1999),Abidi等人(2002年)在TM4SF2基因中发现了一个2 bp的缺失(564delGT),导致192位出现提前终止密码子。缺失落在第二个细胞外结构域,导致截短的蛋白质缺失第四个跨膜以及基因的羧基末端。


参考文献

  1. 阿比迪,F.E.,霍林斯基-费德,E.,里廷格,O.,库伊,F.,卢布斯,H.A.,史蒂文森,R.E.,施瓦茨,C.E。TM4SF2基因中一个新的2 bp缺失与MRX58相关。(信件)医学遗传学杂志。39: 430-433, 2002.[公共医学:12070254,相关引文][全文]

  2. da Costa Maranduba,C.M.、Moreira,E.S.、Orabona,G.M.、Pavanello,R.C.、Vianna Morgante,A.M.、Passos Bueno,M.R。TM4SF2基因的P172H突变会导致X连锁精神发育迟滞吗?(信件)美国医学遗传学杂志。124A:413-4152004年。[公共医学:14735593,相关引文][全文]

  3. Emi,N.、Kitaori,K.、Seto,M.、Ueda,R.、Saito,H.、Takahashi,T。一个与ME491/CD63超家族具有显著相似性的新cDNA克隆的分离。免疫遗传学37:193-1981993。[公共医学:8420826,相关引文][全文]

  4. Gomot,M.、Ronce,N.、Dessay,S.、Zemni,R.、Ayrault,A.-D.、Moizard,M.-P.、Nivelon,A.、Gilgenkrantz,S.,Dourlens,J.、Des Portes,V.、Chelly,J.和Moraine,C。神经心理学评估后,重新考虑XLMR家族中TM4SF2基因的参与。美国医学遗传学杂志。112: 400-404, 2002.[公共医学:12376945,相关引文][全文]

  5. Holinski-Feder,E.,Chahrockh-Zadeh,S.,Rittinger,O.,Jedele,K.B.,Gasteiger,M.,Lenski,C.,Murken,J.,Golla,A。非综合征性X连锁精神发育迟滞:MRX58与着丝粒周围区域的映射。美国医学遗传学杂志。86: 102-106, 1999.[公共医学:10449641,相关引文][全文]

  6. Li,S.-H.,McInnis,M.G.,Margolis,R.L.,Antonarakis,S.E.,Ross,C.A。人脑中新的含有三重重复序列的基因:克隆、表达和长度多态性。基因组学16:572-5791993。[公共医学:8325628,相关引文][全文]

  7. Virtaneva,K.I.,Emi,N.,Marken,J.S.,Aruffo,A.,Jones,C.,Spurr,N.K.,Schroder,J.P。编码A15、L6和S5.7(TAPA1)的三个人类基因的染色体定位:跨膜4超家族蛋白质的所有成员。免疫遗传学39:329-3341994。[公共医学:8168850,相关引文][全文]

  8. Zemni,R.、Bienvenu,T.Vinet,M.C.、Sefiani,A.、Carrie,A.、Billuart,P.、McDonell,N.、Couvert,P.,Francis,F.、Chafey,P.和Fauchereau,F.,Friocourt,G.等14人。通过X染色体分析发现一个与X连锁精神发育迟滞相关的新基因;2平衡易位。自然遗传学。24: 167-170, 2000.[公共医学:10655063,相关引文][全文]


马拉·J·F·奥尼尔:2004年6月8日
Cassandra L.Kniffin-更新时间:2003年10月31日
Deborah L.Stone-更新日期:6/9/2003
维克托·麦库西克-更新日期:2000年9月18日
维克托·麦库西克-更新日期:2000年1月28日
创建日期:
Alan F.Scott:1997年10月22日
卡罗尔:2021年8月20日
卡罗尔:2021年8月19日
卡罗尔:2012年3月26日
mgross:2011年8月8日
卡罗尔:2009年5月28日
特里:2004年6月8日
卡罗尔:2003年11月6日
ckniffin:2003年10月31日
颂歌:2003年6月9日
特里:2000年9月18日
卡罗尔:2000年7月19日
阿洛佩兹:2000年2月1日
特里:2000年1月28日
psherman:1999年11月1日
卡罗尔:1998年8月10日
乔安娜:1997年10月22日

*300096

四SPANIN 7;TSPAN7公司


备选标题;符号

膜成分,X染色体,表面标记1;MXS1型
跨膜蛋白A15
跨膜4超家族,膜2;TM4SF2型


HGNC批准的基因符号:TSPAN7

细胞遗传学位置:Xp11.4   基因组坐标(GRCh38):X:38561542-38688918 (来自NCBI)


基因-表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
Xp11.4解决方案 智力发育障碍,X连锁58 300210 X连锁隐性

文本

克隆和表达

通过对由未成熟T细胞系(HPB-ALL)制成的cDNA文库的差异筛选,Emi等人(1993)分离出一种新的cDNA,他们将其命名为A15。A15在HPB-ALL细胞中表达,但在外周血淋巴细胞或早幼粒细胞白血病细胞系HL-60中不表达。A15 cDNA编码一个推断的244-氨基酸蛋白,具有4个假定的跨膜结构域和4个可能的N-连接糖基化位点。A15编码的蛋白质序列最初由HUGO命名委员会指定为MXS1,与ME491(CD63;155740)和其他跨膜蛋白质(如CO-029和TAPA1(186845))的同源性约为30%。A15的亲水性图与ME491相似。

由于存在CCG三联体重复序列,分离出一个大脑cDNA,由Li等人(1993年)命名为CCG-B7,并与MXS1编码区完全一致。在cDNA的5素数非翻译区出现7个三重重复。

Zemni等人(2000年)通过RNA原位杂交发现,Tm4sf2转录物首次在胚胎第10.5天的小鼠大脑中检测到。Tmsf2在包括大脑皮层和海马体在内的中枢神经系统中高度表达。


基因功能

TM4SF2编码蛋白质四spanin家族的一个成员,已知其在包括β-1整合素的分子复合物中起作用(ITGB1;135630)。Zemni等人(2000年)推测,通过这种相互作用,TM4SF2可能在神经突起生长的控制中发挥作用。


映射

Li等人(1993)通过体细胞杂交DNA的PCR将CCG-B7 cDNA定位到X染色体上。Virtaneva等人(1994年)通过与人类/啮齿动物衍生杂交细胞系的DNA杂交,将A15/MXS1映射到Xq11。


分子遗传学

Zemni等人(2000年)指出,TM4SF2基因映射到Xp11.4,并发现该基因已被X断点灭活;2非特异性智力发育障碍患者的平衡易位(见XLID58;300210)。进一步调查发现,在33个其他智力发育障碍家庭中,有2个家庭存在TM4SF2突变;见300096.0001和300096.0002。

Da Costa Maranduba等人(2004年)在一名患有XLID58的21岁男性身上发现了TM4SF2基因(300096.0002)的突变。他的母亲和妹妹都是智力正常的人,被发现携带突变基因,但他精神正常的哥哥却不是。


ALLELIC变体 3个选定示例):

.0001智力发育障碍,X连锁58

TSPAN7,GLY218TER公司
SNP:rs104894950,临床变量:RCV00012395

在X连锁智力发育障碍-58(XLID58;300210)家族的先证者中,Zemni等人(2000年)在TM4SF2基因中发现了一个提前终止密码子TGA(gly218-ter),预测了一个缺失第四跨膜段和羧基末端结构域的截短蛋白。


.0002智力发育障碍,X连锁58

TSPAN7,PRO172HIS公司
SNP:rs104894951,gnomAD:rs104894951,临床变量:RCV000012396、RCV000721059、RCV00904077

在一个患有智力发育障碍-58(XLID58;300210)家族的先证者中,Zemni等人(2000)检测到TM4SF2基因中的C-a颠倒,导致pro172-to-his(P172H)的非保守替代。在对该家庭成员的进一步认知调查中,Gomot等人(2002年)发现,3名男性家庭成员的智力发育迟缓程度较轻,其他3名则为中度。他们记录了该家族中精神发育迟滞患者的认知特征,并基于认知状态进行了关联分析。重组排除了含有TM4SF2基因的区域。Gomot等人(2002年)指出,鉴于新的结果,只有在遗传该突变的1名家庭成员的正常认知表型反映出不完全外显率或可变表达的情况下,P172H变化才可能是该家族的致病突变。

Da Costa Maranduba等人(2004年)在105名患有智力发育障碍的男性中筛选了TM4SF2基因的7个外显子,并在一名21岁患者中鉴定了P172H替代物。他的母亲和妹妹都是智力正常的人,被发现携带突变基因,但他精神正常的哥哥却不是。Da Costa Maranduba等人(2004年)得出结论,不能排除P172H突变是智力发育受损的原因。


.0003智力发育障碍,X连锁58

TSPAN7,2-BP DEL,564GT
临床变量:RCV00012397

在Holinski-Feder等人(1999年)报告的一个X连锁智力发育障碍-58(XLID58;300210)家族中,Abidi等人(2002年)在TM4SF2基因中发现了一个2 bp的缺失(564delGT),导致192位的提前终止密码子。缺失落在第二个细胞外结构域,导致截短的蛋白质缺失第四个跨膜以及基因的羧基末端。


参考文献

  1. 阿比迪,F.E.,霍林斯基-费德,E.,里廷格,O.,库伊,F.,卢布斯,H.A.,史蒂文森,R.E.,施瓦茨,C.E。TM4SF2基因中一个新的2 bp缺失与MRX58相关。(信件)医学遗传学杂志。39: 430-433, 2002.[公共医学:12070254][全文:https://doi.org/10.1136/jmg.39.6.430]

  2. da Costa Maranduba,C.M.、Moreira,E.S.、Orabona,G.M.、Pavanello,R.C.、Vianna Morgante,A.M.、Passos Bueno,M.R。TM4SF2基因的P172H突变会导致X连锁精神发育迟滞吗?(信件)美国医学遗传学杂志。124A:413-4152004年。[公共医学:14735593][全文:https://doi.org/10.1002/ajmg.a.20401]

  3. Emi,N.、Kitaori,K.、Seto,M.、Ueda,R.、Saito,H.、Takahashi,T。分离出一个与ME491/CD63超家族有显著相似性的新cDNA克隆。免疫遗传学37:193-1981993。[公共医学:8420826][全文:https://doi.org/10.1007/BF00191884]

  4. Gomot,M.、Ronce,N.、Dessay,S.、Zemni,R.、Ayrault,A.-D.、Moizard,M.-P.、Nivelon,A.、Gilgenkrantz,S.,Dourlens,J.、Des Portes,V.、Chelly,J.和Moraine,C。神经心理学评估后,重新考虑XLMR家族中TM4SF2基因的参与。美国医学遗传学杂志。112: 400-404, 2002.[公共医学:12376945][全文:https://doi.org/10.1002/ajmg.10564]

  5. Holinski-Feder,E.,Chahrockh-Zadeh,S.,Rittinger,O.,Jedele,K.B.,Gasteiger,M.,Lenski,C.,Murken,J.,Golla,A。非综合征性X连锁精神发育迟滞:MRX58与着丝粒周围区域的映射。美国医学遗传学杂志。86: 102-106, 1999.[公共医学:10449641][全文:https://doi.org/10.1002/(sici)1096-8628(19990910)86:2<102::aid-ajmg2>3.0.co;2-c]

  6. Li,S.-H.,McInnis,M.G.,Margolis,R.L.,Antonarakis,S.E.,Ross,C.A。人脑中新的含有三重重复序列的基因:克隆、表达和长度多态性。基因组学16:572-5791993。[公共医学:8325628][全文:https://doi.org/10.1006/geno.1993.1232]

  7. Virtaneva,K.I.、Emi,N.、Marken,J.S.、Aruffo,A.、Jones,C.、Spurr,N.K.、Schroder,J.P。编码A15、L6和S5.7(TAPA1)的三个人类基因的染色体定位:跨膜4超家族蛋白质的所有成员。免疫遗传学39:329-3341994。[公共医学:8168850][全文:https://doi.org/10.1007/BF00189229]

  8. Zemni,R.、Bienvenu,T.Vinet,M.C.、Sefiani,A.、Carrie,A.、Billuart,P.、McDonell,N.、Couvert,P.,Francis,F.、Chafey,P.和Fauchereau,F.,Friocourt,G.等14人。通过X染色体分析发现一个与X连锁精神发育迟滞相关的新基因;2平衡易位。自然遗传学。24: 167-170, 2000.[公共医学:10655063][全文:https://doi.org/10.1038/72829]


贡献者:
Marla J.F.O'Neill:2004年6月8日
Cassandra L.Kniffin-更新时间:2003年10月31日
Deborah L.Stone-更新日期:6/9/2003
维克托·麦库西克-更新日期:2000年9月18日
维克托·麦库西克-更新日期:2000年1月28日

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Alan F.Scott:1997年10月22日

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卡罗尔:2003年11月6日
ckniffin:2003年10月31日
卡罗尔:2003年6月9日
特里:2000年9月18日
卡罗尔:2000年7月19日
阿洛佩兹:2000年2月1日
特里:2000年1月28日
psherman:1999年11月1日
卡罗尔:1998年8月10日
乔安娜:1997年10月22日