条目-*187380-TENASCIN C;TNC公司-OMIM公司
 
*187380

TENASCIN C;TNC公司


备选标题;符号

TENASCIN公司;TN公司
细胞凝集素
六角形;HXB公司


HGNC批准的基因符号:TNC公司

细胞遗传学位置:9季度33.1   基因组坐标(GRCh38):9:115,019,575-115,118,157 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
9季度33.1 耳聋,常染色体显性56 615629 AD公司

文本

说明

TNC基因编码tenascin,这是一种细胞外基质蛋白,其组织分布受时间和空间限制。它是一种具有190到240 kD二硫键亚基的六聚体多域蛋白,最初的特征是“肌腱抗原”在胚胎中,它存在于发育中的上皮细胞周围的致密间充质、腱原质以及发育中的软骨和骨骼中。在成人中,它仍然存在于软骨膜和骨膜的肌腱和肌腱连接处,以及平滑肌中(总结如下Pearson等人,1988年).


克隆和表达

Pearson等人(1988年)使用特异性tenascin抗血清从鸡成纤维细胞cDNA表达库中分离出tenascin-cDNA克隆。他们显示了胎牛血清和转化生长因子β在体外诱导tenascin(190180).

根据全长cDNA的序列,Nies等人(1991年)结论是该蛋白含有2203个氨基酸,是一个离散重复结构域的线性阵列。羧基末端的210-氨基酸结构域类似于纤维蛋白原(参见134820).


基因结构

Gulcher等人(1991年)据报道,HXB基因的编码区跨越约80kb,由27个外显子组成。该基因似乎是DNA模块的集合,在基因组的其他地方也可以找到。单个外显子可以编码一个模块、一个模块的一部分或一组模块。15个III型单位与纤维连接蛋白中发现的单位类似,每个单位由单个外显子或由内含子中断的2个外显子编码。已知所有从较小形式的蛋白质中剪接出来的III型单位都由1个外显子编码。210个氨基酸的纤维蛋白原样结构域由5个外显子编码。14.5个表皮生长因子样重复序列都由一个外显子编码。


映射

通过对啮齿动物-人类体细胞杂种的Southern分析和使用六臂类cDNA探针的原位杂交,Gulcher等人(1990年)将TNC基因定位于染色体9q32-q34。Rocchi等人(1991年)通过体细胞杂交和原位杂交相结合,将TNC基因定位于染色体9q32-q34。

通过FISH分析,怀特等人(1992)将TNC基因定位于染色体9q33。


基因功能

Olson和Srivastava(1996)回顾了将心导管分离到心房、心室和流出道的过程。他们指出,tenascin上调,NCAM(116930)在胚胎心内膜垫中下调。据认为,tenascin的这种上调会破坏细胞与底物的粘附,并允许细胞通过心脏垫的细胞外成分迁移。Olson和Srivastava(1996)提示这些过程中的异常或阻滞可能是导致婴儿某些房室管和圆锥管缺陷的原因。

Gherzi等人(1997)发现TNC基因受OTX2的转录控制(600037). 在共转染的哺乳动物细胞中,OTX2直接与人类TNC启动子中的一个基序高亲和力结合,并降低TNC启动因子的转录活性。

在固相蛋白质相互作用分析中使用重组蛋白,Day等人(2004年)显示TNC的纤维连接蛋白样结构域与聚集蛋白的C末端凝集素样球状结构域(ACAN;155760)是软骨的主要细胞外基质蛋白。

Tavazoie等人(2008)识别miR335(611768)作为一组microRNA中的一种,当人类乳腺癌细胞发生转移潜能时,其表达会被特异性地丢失。miR335在恶性细胞中的表达恢复抑制了体内人癌细胞的肺和骨转移。miR335通过靶向祖细胞转录因子SOX4抑制转移和迁移(184430)和细胞外基质成分tenascin C。

Orsmark-Pietras等人(2008年)确定tenascin C为NPS的下游靶基因(609513)-NPSR1号机组(608595)转染HEK-293H细胞和人肺上皮细胞系中的信号通路。

Midwood等人(2009年)注意到在急性和慢性炎症状态下,如类风湿关节炎(RA),TNC表达上调;180300). 他们发现TNC通过其纤维蛋白原样球结构域(FBG)诱导IL6(147620),IL8(146930)和TNF(191160)人类巨噬细胞以剂量和MYD88依赖的方式产生。此外,注射FBG可诱导野生型小鼠的剂量依赖性关节炎症。需要光纤光栅信号TLR4(603030),但不是CD14(158120)或MD2(LY96;605243).Midwood等人(2009年)结论:TNC可能通过增强炎症反应在RA发病机制中发挥作用。

在COS-7细胞中,Sergi和Kamnasaran(2011年)证明PRRX1(167420)负调控TNC启动子。


分子遗传学

常染色体显性聋56

在2个不相关的中国常染色体显性遗传性耳聋家族中-56(DFNA56;615629),Zhao等人(2013)在TNC基因(V1773M,187380.0001和T1796S,187380.0002). 通过连锁分析和全基因组测序发现了第一个家族的突变。这些家庭中的耳聋表现为舌后发病,且呈进行性。未对变体进行功能研究。Zhao等人(2013)声明TNC存在于耳蜗基底膜和骨螺旋板中;它在鸟类耳毒性损伤后的耳蜗发育和感觉受体恢复中发挥作用。Zhao等人(2013)提示TNC基因突变会中断其与其他蛋白质和受体的相互作用,导致修复机制的丧失。

挂起确认的关联

关于TNC基因变异与哮喘相关性状易感性之间可能存在的联系,请参阅ASRT8(613207).


动物模型

在中枢神经系统中,tenascin-C主要由星形胶质细胞表达。Tenascin-C精确定位于发育中的体感皮层与触须相关的桶区,这表明它可能在桶区边界的形成中起重要作用。Steindler等人(1995)在纯合基因敲除小鼠中展示了tenascin-C的正常桶形结构,尽管没有该分子,但桶形结构没有异常。然而,米特罗维奇和沙克纳(1995)在被设计为tenascin-C表达无效突变体的敲除小鼠中,能够检测到tenascin-C免疫反应,尽管其模式异常。

Forsberg等人(1996年)证实了早期的一项观察,即基因敲除小鼠中缺乏tenascin-C对发育、成年期、寿命和繁殖力没有影响。他们发现皮肤伤口和切断的神经恢复正常。

Midwood等人(2009年)发现缺乏Tnc的小鼠对酵母多糖无滑膜炎、细胞浸润或软骨肽聚糖丢失反应,并能防止甲基化牛血清白蛋白引起的关节破坏。


等位基因变体( 2精选示例):

.0001失聪,自动控制56

常染色体显性聋56(DFNA56;615629),Zhao等人(2013)在TNC基因第19外显子中发现了杂合c.5317G-a转换,导致FN-III结构域中一个高度保守的残基发生val1773-to-met(V1773M)替代。突变发生在连锁分析发现的候选区间内。通过全基因组测序发现并经Sanger测序证实的突变与该家族中的疾病分离。虽然在dbSNP(build 132)数据库中出现的频率很低(0.0005),但在1000基因组项目或HapMap数据库中,或387个地理匹配的对照中都没有出现。未进行功能研究。


.0002失聪,自动控制56

TNC,THR1796SER公司
   RCV000083260型

患有DFNA56的三代中国家庭(家族6957)的5名受影响成员(615629),Zhao等人(2013)在TNC基因第19外显子中发现了杂合c.5368A-T颠倒,导致FN-III结构域中高度保守的残基处出现了thr1796-to-ser(T1796S)替代。在387个地理位置匹配的对照组中没有出现突变。三名患者的线粒体基因MTRNR1也发生突变(1555A-G;561000.0001)这也会导致耳聋。未对TNC变体进行功能研究。


参考文献

  1. Day,J.M.,Olin,A.I.,Murdoch,A.D.,Canfield,A.,Sasaki,T.,Timpl,R.,Hardingham,T.E.,Aspberg,A。aggrecan G3结构域中的选择性剪接影响与tenascin-C和其他细胞外基质蛋白的结合作用。生物学杂志。化学。279: 12511-12518, 2004.[公共医学:14722076相关引文][全文]

  2. Forsberg,E.、Hirsch,E.、Frohlich,L.、Meyer,M.、Ekblom,P.、Aszodi,A.、Werner,S.、Fassler,R。在缺乏tenascin-C的小鼠中,皮肤伤口和切断的神经恢复正常。程序。美国国家科学院。科学。93: 6594-6599, 1996.[公共医学:8692862相关引文][全文]

  3. Gherzi,R.、Briata,P.、Boncinelli,E.、Ponassi,M.、Querze,G.、Viti,F.、Corte,G.和Zardi,L。人同源结构域蛋白OTX2与人腱蛋白-C启动子结合,并在转染细胞中反式抑制其活性。DNA细胞生物学。16: 559-567, 1997.[公共医学:9174161相关引文][全文]

  4. Gulcher,J.R.,Alexakos,M.J.,Le Beau,M.M.,Lemons,R.S.,Stefansson,K。人类六臂肌(tenascin)基因的染色体定位和该基因内最近重复的证据。基因组学6:616-6221990。[公共医学:1692804相关引文][全文]

  5. Gulcher,J.R.,Nies,D.E.,Alexakos,M.J.,Ravikant,N.A.,Sturgill,M.E.,Marton,L.S.,Stefansson,K。人类六臂肌(tenascin)基因的结构。程序。美国国家科学院。科学。88: 9438-9442, 1991.[公共医学:1719530相关引文][全文]

  6. Midwood,K.、Sacre,S.、Piccinini,A.M.、Inglis,J.、Trebaul,A.、Chan,E.、Drexler,S.,Sofat,N.、Kashiwagi,M.、Orend,G.、Brennan,F.、Foxwell,B。Tenascin-C是Toll样受体4的内源性激活剂,对维持关节炎炎症至关重要。《自然医学》15:774-7802009。[公共医学:19561617相关引文][全文]

  7. Mitrovic,N.和Schachner,M。tenascin-C突变小鼠神经系统中tenascin-C的检测。《神经科学杂志》。1995年第42:710-717号决议。[公共医学:8600304相关引文][全文]

  8. Nies,D.E.,Hemesath,T.J.,Kim,J.-H.,Gulcher,J.R.,Stefansson,K。人类六臂类(tenascin)的完整cDNA序列:一种含有独特表皮生长因子重复序列的多域蛋白。生物学杂志。化学。266: 2818-2823, 1991.[公共医学:1704365相关引文]

  9. Olson,E.,Srivastava,D。控制心脏发育的分子途径。《科学》272:671-6761996年。[公共医学:8614825相关引文][全文]

  10. Orsmark-Pietras,C.、Melen,E.、Vendelin,J.、Bruce,S.、Laitine,A.、Laitinen,L.A.、Lauener,R.、Riedler,J.,von Mutius,E.、Doekes,G.、Wickman,M.、van Hage,M.,Pershagen,G.,Scheynius,A.、Nyberg,F.、Kere,J.和PARSIFAL遗传学研究小组。过敏性疾病中tenascin C和神经肽S受体1之间的生物和遗传相互作用。嗯,鼹鼠。遗传学。17: 1673-1682, 2008.[公共医学:18305139相关引文][全文]

  11. 皮尔逊,C.A.,皮尔逊,D.,Shibahara,S.,霍夫斯滕格,J.,Chiquet-Ehrismann,R。Tenascin:转化生长因子β的cDNA克隆和诱导。EMBO J.7:2977-29811988年。[公共医学:2460335相关引文][全文]

  12. Rocchi,M.、Archidiacono,N.、Romeo,G.、Saginia,M.和Zardi,L。将人类tenascin基因分配到9号染色体的q32-q34区域。嗯,遗传学。86:621-623991年。[公共医学:1709136相关引文][全文]

  13. 塞尔吉,C.,卡姆纳萨兰,D。PRRX1在无脑病胎儿中发生突变。(信件)临床。遗传学。79: 293-295, 2011.[公共医学:21294718相关引文][全文]

  14. Steindler,D.A.,Settles,D.,Erickson,H.P.,Laywell,E.D.,Yoshiki,A.,Faissner,A.,Kusakabe,M。Tenascin基因敲除小鼠:桶、边界分子和胶质瘢痕。《神经科学杂志》。15: 1971-1983, 1995.[公共医学:7534342相关引文][全文]

  15. Tavazoie,S.F.、Alarcon,C.、Oskarsson,T.、Padua,D.、Wang,Q.、Bos,P.D.、Gerald,W.L.、Massague,J。抑制乳腺癌转移的内源性人类microRNA。《自然》451:147-1522008。[公共医学:18185580图像相关引文][全文]

  16. 怀特,D.M.,米科尔,D.D.,埃斯皮诺萨,R.,魏默,B.,勒博,M.M.,史蒂芬森,K。脑型前列腺素D-2合酶人类基因的结构和染色体定位。生物学杂志。化学。267: 23202-23208, 1992.[公共医学:1385416相关引文]

  17. 赵,Y,赵,F,宗,L,张,P,关,L,张,J,王,D,王,J,柴,W,兰,L,李,Q,韩,B和其他12人。外显子序列测定和连锁分析表明,tenascin-C(TNC)是非综合征性聋的一个新的致病基因。《公共科学图书馆·综合》8:e695492013。注:电子文章。[公共医学:23936043图像相关引文][全文]


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*187380

TENASCIN C;TNC公司


备选标题;符号

TENASCIN;TN公司
细胞凝集素
六角形;HXB公司


HGNC批准的基因符号:TNC

细胞遗传学位置:9q33.1   基因组坐标(GRCh38):9:115019575-115118157 (来自NCBI)


基因-表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
9季度33.1 耳聋,常染色体显性56 615629 常染色体显性

文本

说明

TNC基因编码tenascin,这是一种细胞外基质蛋白,其组织分布受时间和空间限制。它是一种具有190到240 kD二硫键亚基的六聚体多域蛋白,最初的特征是“肌腱抗原”在胚胎中,它存在于发育中的上皮周围的致密间充质中,存在于肌腱无拉根中,以及发育中的软骨和骨中。在成人中,它仍然存在于软骨膜和骨膜的肌腱和肌腱连接处,以及平滑肌中(由Pearson等人总结,1988年)。


克隆和表达

Pearson等人(1988年)使用特异性tenascin抗血清从鸡成纤维细胞cDNA表达库中分离出tenascincDNA克隆。他们显示了胎牛血清和转化生长因子-β在体外诱导tenascin(190180)。

根据全长cDNA的序列,Nies等人(1991年)得出结论,该蛋白质包含2203个氨基酸,是离散重复结构域的线性阵列。羧基末端的210-氨基酸结构域类似于纤维蛋白原(见134820)。


基因结构

Gulcher等人(1991年)报告称,HXB基因的编码区跨越约80 kb,由27个外显子组成。该基因似乎是DNA模块的集合,在基因组的其他地方也可以找到。单个外显子可以编码一个模块、一个模块的一部分或一组模块。15个III型单位与纤维连接蛋白中发现的单位类似,每个单位由单个外显子或由内含子中断的2个外显子编码。已知所有从较小形式的蛋白质中剪接出来的III型单位都由1个外显子编码。210个氨基酸的纤维蛋白原样结构域由5个外显子编码。14.5个表皮生长因子样重复序列都由一个外显子编码。


映射

通过对啮齿动物-人类体细胞杂种的Southern分析和使用六臂类cDNA探针的原位杂交,Gulcher等人(1990年)将TNC基因定位到染色体9q32-q34。Rocchi等人(1991年)还通过体细胞杂交和原位杂交的组合将TNC基因定位到染色体9q32-q34。

通过FISH分析,White等人(1992年)将TNC基因定位于染色体9q33。


基因功能

Olson和Srivastava(1996)回顾了将心脏导管分离到心房、心室和流出道的过程。他们注意到胚胎心内膜垫中tenascin上调,NCAM(116930)下调。据认为,tenascin的这种上调会破坏细胞与底物的粘附,并允许细胞通过心脏垫的细胞外成分迁移。Olson和Srivastava(1996)认为,这些过程中的异常或阻滞可能是婴儿某些房室管和圆锥管缺陷的原因。

Gherzi等人(1997年)发现,TNC基因受OTX2的转录控制(600037)。在共转染的哺乳动物细胞中,OTX2直接与人类TNC启动子中的一个基序高亲和力结合,并降低TNC启动因子的转录活性。

Day等人(2004年)在固相蛋白相互作用分析中使用重组蛋白表明,TNC的纤维连接蛋白样结构域与软骨的主要细胞外基质蛋白aggrecan(ACAN;155760)的C末端凝集素样球状结构域相互作用。

Tavazoie等人(2008年)确定miR335(611768)是一组microRNAs中的一种,当人类乳腺癌细胞具有转移潜能时,其表达会特别丢失。miR335在恶性细胞中的表达恢复抑制了体内人癌细胞的肺和骨转移。miR335通过靶向祖细胞转录因子SOX4(184430)和细胞外基质成分tenascin C抑制转移和迁移。

Orsmark-Pietras等人(2008年)在转染的HEK-293H细胞和人肺上皮细胞系中,将tenascin C确定为NPS(609513)-NPSR1(608595)信号通路的下游靶基因。

Midwood等人(2009年)指出,在急性和慢性炎症条件下,如类风湿关节炎,TNC表达上调(RA;180300)。他们发现,TNC通过其类纤维蛋白原球域(FBG)以剂量和MYD88依赖性的方式诱导人类巨噬细胞产生IL6(147620)、IL8(146930)和TNF(191160)。此外,FBG的注射在野生型小鼠中诱导了剂量依赖性的关节炎症。光纤光栅信号需要TLR4(603030),但不需要CD14(158120)或MD2(LY96;605243)。Midwood等人(2009年)得出结论,TNC可能通过放大炎症反应在RA发病机制中发挥作用。

在COS-7细胞中,Sergi和Kamnasaran(2011)证明PRRX1(167420)负调控TNC启动子。


分子遗传学

常染色体显性聋56

在2个不相关的常染色体显性遗传性耳聋56(DFNA56;615629)中国家庭中,Zhao等人(2013)在TNC基因中鉴定了2个不同的杂合错义突变(V1773M187380.0001和T1796S187380.0002)。通过连锁分析和全基因组测序发现了第一个家族的突变。这些家庭中的耳聋表现为舌后发病,且呈进行性。未对变体进行功能研究。Zhao等人(2013)指出,TNC存在于耳蜗的基底膜和骨螺旋板中;它在鸟类耳毒性损伤后的耳蜗发育和感觉受体恢复中发挥作用。Zhao等人(2013)认为,TNC基因的突变会中断其与其他蛋白质和受体的相互作用,导致修复机制的丧失。

挂起确认的关联

关于TNC基因变异与哮喘相关性状易感性之间可能存在的联系,请参阅ASRT8(613207)。


动物模型

在中枢神经系统中,tenascin-C主要由星形胶质细胞表达。Tenascin-C精确定位于发育中的体感皮层与触须相关的桶区,这表明它可能在桶区边界的形成中起重要作用。Steindler等人(1995年)在纯合敲除小鼠中证明了tenascin-C的桶形结构正常,尽管没有这种分子,但桶形结构没有异常。然而,Mitrovic和Schachner(1995)能够在被设计为tenascin-C表达的空突变体的敲除小鼠中检测到tenascin-C免疫反应,尽管其模式异常。

Forsberg等人(1996年)证实了早期的一项观察结果,即基因敲除小鼠中缺乏tenascin-C对发育、成年期、寿命和繁殖力没有影响。他们发现皮肤伤口和切断的神经恢复正常。

Midwood等人(2009年)发现,缺乏Tnc的小鼠在对酵母多糖的反应中没有出现滑膜炎、细胞浸润或软骨肽聚糖丢失,并且可以防止甲基化牛血清白蛋白引起的关节破坏。


ALLELIC变体 2个选定的示例):

.0001失聪,自动控制56

TNC,VAL1773MET公司
SNP:rs137933052,gnomAD:rs137933052,临床变量:RCV000083259、RCV002247481

在一个患有常染色体显性聋-56(DFNA56;615629)的多代中国大家族(F013)的受累成员中,Zhao等人(2013)在TNC基因第19外显子中发现了杂合c.5317G-a过渡,导致FN-III结构域中高度保守残基的val1773-to-met(V1773M)替代。突变发生在连锁分析发现的候选区间内。通过全基因组测序发现并经Sanger测序证实的突变与该家族中的疾病分离。虽然在dbSNP(build 132)数据库中出现的频率很低(0.0005),但在1000基因组项目或HapMap数据库中,或387个地理匹配的对照中都没有出现。未进行功能研究。


.0002失聪,自动控制56

TNC,THR1796SER公司
SNP:rs431905513,临床变量:RCV000083260

在患有DFNA56(615629)的3代中国家系(6957家系)的5名受影响成员中,Zhao等人(2013年)在TNC基因第19外显子中发现了杂合c.5368A-T颠倒,导致FN-III结构域中高度保守残基处出现了thr1796-to-ser(T1796S)替代。在387个地理位置匹配的对照组中没有出现突变。其中三名患者还携带线粒体基因MTRNR1的突变(1555A-G;561000.0001),也可能导致耳聋。没有进行TNC变体的功能研究。


参考文献

  1. Day,J.M.,Olin,A.I.,Murdoch,A.D.,Canfield,A.,Sasaki,T.,Timpl,R.,Hardingham,T.E.,Aspberg,A。aggrecan G3结构域中的选择性剪接影响与tenascin-C和其他细胞外基质蛋白的结合作用。生物学杂志。化学。279: 12511-12518, 2004.[公共医学:14722076][全文:https://doi.org/10.1074/jbc.M400242200]

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