条目-*173321-SERPIN肽酶抑制剂,B层(卵清蛋白),成员6;SERPINB6系列-OMIM公司
 
*173321

SERPIN肽酶抑制剂B层(卵清蛋白)6成员;SERPINB6系列


备选标题;符号

蛋白酶抑制剂6;个人信息6
胎盘凝血酶抑制剂;PTI公司
SPI3,小鼠,同源;SPI3公司


HGNC批准的基因符号:SERPINB6系列

细胞遗传学位置:第65.2页 基因组坐标(GRCh38):6:2,948,159-2,971,793 (来自NCBI)


基因-表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
第65.2页 ?耳聋,常染色体隐性遗传91 613453 应收账

文本

克隆和表达

Coughlin等人(1993年)描述了一种编码丝氨酸蛋白酶抑制剂的cDNA,该抑制剂存在于胎盘组织和白血病细胞系K562的细胞溶质部分。根据其与凝血酶的相互作用,该抑制剂在操作上被命名为胎盘凝血酶抑制剂(PTI)。氨基酸序列比较表明,其反应中心位于arg341和cys342,缺乏典型的N末端信号序列,与细胞内丝氨酸蛋白酶抑制剂(serpins)具有最高程度的相似性,例如人类单核细胞/中性粒细胞弹性蛋白酶抑制剂(ELANH2;130135). 人类组织mRNA分析表明PTI广泛表达,在心肌、骨骼肌和胎盘中表达最高。Coughlin等人(1993年)结论是PTI是一类新兴的细胞内蛇毒蛋白。

Sun等人(1995)结果表明,小鼠PI6同源物Spi3的表达受发育调控,与人类的情况不同,小鼠胎盘中没有Spi3。

Nishibori等人(1995年)从牛脑中分离出一种血清蛋白酶,命名为B43。他们使用组织化学染色证明其存在于纤维状星形胶质细胞中,尤其是在端足样细胞结构中,表明其参与血脑屏障。蛋白酶的部分氨基酸序列表明它与人PI6和小鼠Spi3同源。


基因结构

Sun等人(1995)确定小鼠Spi3基因跨越20kb,包含7个外显子和6个内含子,并且在转录起始点上游24bp处包含TATA基序。


映射

Coughlin等人(1995年)使用荧光原位杂交将SERPINB6基因定位到染色体6p25。

在研究卵清蛋白家族的丝氨酸蛋白酶抑制剂簇时,包括maspin(SERPINB6;154790)位于染色体18q21.3上,Schneider等人(1995年)为PTI的3引物非翻译区制备PCR引物集。使用NIGMS单色体细胞杂交面板,他们将PTI基因映射到6号染色体。Evans等人(1995年)通过证明PI6与另一个Ov-serpin基因ELANH2共定位,确认了6号染色体的归属并将其区域化为6pter-p24(130135). 用6号染色体区域杂交DNA板进行定位。

Sun等人(1995)将小鼠Spi3基因映射到Pl1和ctla2a基因之间的13号染色体。


基因功能

Sirmaci等人(2010年)发现Serpinb6在胚胎第16.5天在小鼠内耳嵴毛细胞中表达。毛细胞在成年小鼠中持续表达。Serpinb6在胚胎和出生后早期均表达于耳蜗和椭圆囊毛细胞的细胞质中,在出生后早期表达于大上皮嵴区。


分子遗传学

通过全基因组连锁分析和候选基因测序,对一个患有非综合征进展性听力损失(DFNB91;613453),Sirmaci等人(2010年)在SERPINB6基因(E245X;173321.0001),导致功能丧失。Sirmaci等人(2010年)结论是,SERPINB6在内耳中对防止应激期间溶酶体内容物泄漏起着重要作用,这种保护作用的丧失会导致细胞死亡和感音神经性聋。

希勒等人(2014)表示他们已确定SERPINB6基因的部分缺失是常染色体隐性遗传非综合征性听力损失的原因(他们的表1),但没有提供其他信息。


动物模型

Scarff等人(2004)发现Spi3缺陷小鼠发育正常,有生育能力,没有明显的病理。突变小鼠组织中Elanh2水平的增加表明,其他蛇蛋白的补偿降低了Spi3缺乏的影响。

Tan等人(2013)注意到小鼠表达不具有人类对应物的多个相关分支B serpins,并且小鼠Serpinb6a是人类SERPINB6的直系同源物。他们发现,用绿色荧光蛋白纯合替换Serpinb6a对耳蜗或前庭发育没有影响,但在2周后会导致进行性听力损失,并伴有耳蜗退化。这种效应首先表现为外毛细胞的丢失,然后扩散到内毛细胞和初级听觉神经元,最后扩散到1型、2型和4型纤维细胞。由于Serpinb6a表达缺失对耳蜗发育没有影响,Tan等人(2013)假设耳蜗稳态需要Serpinb6a的表达。


ALLELIC变体( 1选定示例):

.0001耳聋,自动口腔接收器91(1个家族)

塞平B6,GLU245TER
   RCV00014571型

非综合征渐进性听力损失的土耳其血亲家庭受影响成员(DFNB91;613453),Sirmaci等人(2010年)在SERPINB6基因中发现一个纯合744G-T颠倒,导致gly245-ter(E245X)取代,该取代去除了包括反应中心环的C末端区域中的131个氨基酸。进一步的研究表明,突变导致mRNA衰变和蛋白表达完全缺失。在300名土耳其对照组或542个土耳其、希腊、美国和巴勒斯坦家庭中均未发现该突变,这些家庭大多患有先天性听力损失。在HeLa细胞中的体外功能表达研究表明,与用野生型SERPINB6转染的细胞相比,E245X突变导致响应渗透休克的溶酶体完整性损失增加。这些发现表明,野生型SERPINB6需要对抗各种应激条件下泄漏溶酶体蛋白酶的潜在细胞毒性成分。虽然无法确定确切的发病年龄,但受影响最年轻的患者(23岁)在20岁后报告听力丧失。听力损失具有渐进性和年龄依赖性,与细胞内蛋白酶抑制剂的功能丧失一致。


参考文献

  1. 考夫林·P、尼科尔·J、孙·J、塞勒姆·H、伯德·P、萨瑟兰·G·R。通过荧光原位杂交将人类蛋白酶抑制剂6(PI6)基因定位到6p25。基因组学26:431-4331995。[公共医学:7601482,相关引文][全文]

  2. Coughlin,P.、Sun,J.、Cerruti,L.、Salem,H.H.、Bird,P。一种人细胞内丝氨酸蛋白酶抑制剂的克隆和分子表征。程序。美国国家科学院。科学。90: 9417-9421, 1993.[公共医学:8415716,相关引文][全文]

  3. Evans,E.,Cooley,J.,Remold-O'Donnell,E。编码人单核细胞/中性粒细胞弹性蛋白酶抑制剂的基因ELANH2的特征和染色体定位。基因组学28:235-2401995。[公共医学:8530031,相关引文][全文]

  4. Nishibori,M.、Ohtsuka,A.、Kawabata,M.,Nakaya,N.、Murakami,T.、Saeki,K。一种新的蛇毒样蛋白B-43存在于神经元和星形胶质细胞中:牛大脑顶叶区域的免疫组织化学研究。神经科学。莱特。200: 125-128, 1995.[公共医学:8614560,相关引文][全文]

  5. Scarff,K.L.,Ung,K.S.,Nandurkar,H.,Crack,P.J.,Bird,C.H.,Bild,P.I。SPI3/Serpinb6的靶向破坏不会导致发育或生长缺陷、白细胞功能障碍或中风易感性。摩尔。单元格。生物学24:4075-40822004。[公共医学:15082799,图像,相关引文][全文]

  6. Schneider,S.S.、Schick,C.、Fish,K.E.、Miller,E.、Pena,J.C.、Treter,S.D、Hui,S.M.、Silverman,G.A。丝氨酸蛋白酶抑制剂基因座18q21.3包含人类鳞状细胞癌抗原基因的串联重复。程序。美国国家科学院。科学。92: 3147-3151, 1995.[公共医学:7724531,相关引文][全文]

  7. 希勒,A.E.,科尔贝,D.L.,阿扎伊兹,H.,斯隆,C.M.,弗里斯,K.L.,韦弗,A.E。拷贝数变异是非综合征性听力损失的常见原因。《基因组医学》,6:372014年。注:电子文章。[公共医学:24963352,图像,相关引文][全文]

  8. Sirmaci,A.、Erbek,S.、Price,J.、Huang,M.、Duman,D.、Cengiz,F.B.、Bademci,G.、Tokgoz-Yilmaz,S.,Hismi,B.、Ozdag,H.、Ozturk,B.、Kulaksizoglu,S.和其他13人。SERPINB6中的截断突变与常染色体隐性遗传非综合征感音神经性聋相关。Am.J.Hum.遗传学。86: 797-804, 2010.[公共医学:20451170,图像,相关引文][全文]

  9. Sun,J.、Rose,J.B.、Bird,P。人类蛋白酶抑制剂6(PI-6)的小鼠同源物的基因结构、染色体定位和表达表明PI-6与卵清蛋白血清存在差异。生物学杂志。化学。270: 16089-16096, 1995.[公共医学:7608171,相关引文][全文]

  10. Tan,J.、Prakash,M.D.、Kaiserman,D.、Bird,P.I。SERPINB6A缺失会导致感音神经性耳聋,小鼠内耳出现多种组织病理学改变。Am.J.路径。183: 49-59, 2013.[公共医学:23669344,相关引文][全文]


Patricia A.Hartz-更新时间:2014年7月29日
Carol A.Bocchini-更新时间:2014年7月28日
Cassandra L.Kniffin-更新时间:2010年6月17日
Patricia A.Hartz-更新日期:6/25/2004
创建日期:
维克托·麦库西克:1993年9月11日
2014年7月8日
迈克尔顿:2014年7月29日
卡罗尔:2014年7月28日
wwang:2010年6月17日
ckniffin:2010年6月17日
卡罗尔:2009年10月12日
mgross:2004年7月6日
特里:2004年6月25日
特里:2002年3月13日
标记:10/15/1997
标记:10/14/1997
特里:1996年5月22日
标记:1995年9月10日
特里:1995年4月18日
卡罗尔:1993年9月11日

*173321

SERPIN肽酶抑制剂B层(卵清蛋白)6成员;SERPINB6系列


备选标题;符号

蛋白酶抑制剂6;个人信息6
胎盘凝血酶抑制剂;PTI公司
SPI3,小鼠,同源;SPI3公司


HGNC批准的基因符号:SERPINB6

细胞遗传学位置:6p25.2 基因组坐标(GRCh38): 6:2,948,159-2,971,793 (来自NCBI)


基因-表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
第65.2页 ?耳聋,常染色体隐性遗传91 613453 常染色体隐性

文本

克隆和表达

Coughlin等人(1993年)描述了一种编码丝氨酸蛋白酶抑制剂的cDNA,该抑制剂存在于胎盘组织和白血病细胞系K562的细胞溶质部分。根据其与凝血酶的相互作用(通过凝血酶被发现),该抑制剂在操作上被命名为胎盘凝血酶抑制剂(PTI)。氨基酸序列比较表明,其反应中心位于arg341和cys342,缺乏典型的N末端信号序列,并且与细胞内丝氨酸蛋白酶抑制剂(serpins)具有最高程度的相似性,例如人类单核细胞/中性粒细胞弹性蛋白酶抑制剂(ELANH2;130135)。人类组织mRNA分析表明PTI广泛表达,在心肌、骨骼肌和胎盘中表达最高。Coughlin等人(1993年)得出结论,PTI是一类新兴的细胞内蛇毒蛋白。

Sun等人(1995年)表明,小鼠PI6同源物Spi3的表达受发育调控,与人类的情况不同,小鼠胎盘中没有Spi3。

Nishibori等人(1995年)从牛脑中分离出一种血清蛋白酶,命名为B43。他们使用组织化学染色证明其存在于纤维状星形胶质细胞中,尤其是在端足样细胞结构中,表明其参与血脑屏障。蛋白酶的部分氨基酸序列表明它与人PI6和小鼠Spi3同源。


基因结构

Sun等人(1995年)确定,小鼠Spi3基因跨越20 kb,包含7个外显子和6个内含子,并且在转录起始点上游24 bp处包含TATA基序。


映射

Coughlin等人(1995)使用荧光原位杂交将SERPINB6基因定位到染色体6p25上。

在研究卵清蛋白家族的丝氨酸蛋白酶抑制剂簇时,包括位于染色体18q21.3上的maspin(SERPINB6;154790),Schneider等人(1995年)为PTI的3素数非翻译区制备了PCR引物集。使用NIGMS单色体细胞杂交面板,他们将PTI基因映射到6号染色体。Evans等人(1995)通过证明PI6与另一个Ov-serpin基因ELANH2(130135)共定位,确认了6号染色体的归属,并将其区域化为6pter-p24。定位是用6号染色体区域杂交DNA小组实现的。

Sun等人(1995年)将小鼠Spi3基因映射到Pl1和ctla2a基因之间的13号染色体。


基因功能

Sirmaci等人(2010年)发现,Serpinb6在胚胎第16.5天在小鼠内耳嵴毛细胞中表达。成年小鼠的毛细胞表达持续。Serpinb6在胚胎和出生后早期均表达于耳蜗和椭圆囊毛细胞的细胞质中,在出生后早期表达于大上皮嵴区。


分子遗传学

通过对一个患有非综合征进行性听力损失的土耳其近亲家族受影响成员进行全基因组连锁分析,然后进行候选基因测序(DFNB91;613453),Sirmaci等人(2010年)在SERPINB6基因(E245X;173321.0001)中发现了一个纯合截断突变,导致功能丧失。Sirmaci等人(2010年)得出结论认为,SERPINB6在内耳中对防止应激期间溶酶体内容物泄漏起着重要作用,这种保护作用的丧失会导致细胞死亡和感音神经性听力损失。

Shearer等人(2014年)表示,他们已确定SERPINB6基因的部分缺失是常染色体隐性遗传非综合征性听力损失的原因(他们的表1),但没有提供其他信息。


动物模型

Scarff等人(2004年)发现,缺乏Spi3的小鼠发育正常,有生育能力,没有明显的病理变化。突变小鼠组织中Elanh2水平的增加表明,其他蛇蛋白的补偿降低了Spi3缺乏的影响。

Tan等人(2013年)指出,小鼠表达没有人类对应物的多相关B族蛇蛋白,而小鼠Serpinb6a是人类SERPINB6的同源基因。他们发现,用绿色荧光蛋白纯合替换Serpinb6a对耳蜗或前庭发育没有影响,但在2周后会导致进行性听力损失,并伴有耳蜗退化。这种效应首先表现为外毛细胞的丢失,然后扩散到内毛细胞和初级听觉神经元,最后扩散到1型、2型和4型纤维细胞。由于Serpinb6a表达缺失对耳蜗发育没有影响,Tan等人(2013年)假设耳蜗稳态需要Serpinb6表达。


ALLELIC变体 1选定示例):

.0001耳聋,自动口腔接收器91(1个家族)

塞平B6,GLU245TER
SNP:rs267607037,临床变量:RCV000014571

在一个患有非综合征进行性听力损失(DFNB91;613453)的土耳其近亲家族的受影响成员中,Sirmaci等人(2010年)在SERPINB6基因中发现了纯合744G-T颠倒,导致gly245-ter(E245X)替代,它去除了包括反应中心环的C末端区域中的131个氨基酸。进一步的研究表明,突变导致mRNA衰变和蛋白表达完全缺失。在300名土耳其对照组或542个土耳其、希腊、美国和巴勒斯坦家庭中均未发现该突变,这些家庭大多患有先天性听力损失。HeLa细胞的体外功能表达研究表明,与野生型SERPINB6转染细胞相比,E245X突变导致渗透性休克反应中溶酶体完整性损失增加。这些发现表明,野生型SERPINB6需要对抗各种应激条件下泄漏溶酶体蛋白酶的潜在细胞毒性成分。虽然无法确定确切的发病年龄,但受影响最年轻的患者(23岁)在20岁后报告听力丧失。听力损失是进行性和年龄依赖性的,与细胞内蛋白酶抑制剂的功能丧失一致。


参考文献

  1. 考夫林·P、尼科尔·J、孙·J、塞勒姆·H、伯德·P、萨瑟兰·G·R。通过荧光原位杂交将人类蛋白酶抑制剂6(PI6)基因定位到6p25。基因组学26:431-4331995。[公共医学:7601482][全文:https://doi.org/10.1016/0888-7543(95)80240-m]

  2. Coughlin,P.、Sun,J.、Cerruti,L.、Salem,H.H.、Bird,P。人细胞内丝氨酸蛋白酶抑制剂的克隆和分子特征。程序。美国国家科学院。科学。90: 9417-9421, 1993.[公共医学:8415716][全文:https://doi.org/10.1073/pnas.90.20.9417]

  3. Evans,E.,Cooley,J.,Remold-O'Donnell,E。编码人单核细胞/中性粒细胞弹性蛋白酶抑制剂的基因ELANH2的特征和染色体定位。基因组学28:235-2401995。[公共医学:8530031][全文:https://doi.org/10.1006/geno.1995.1136]

  4. Nishibori,M.、Ohtsuka,A.、Kawabata,M.,Nakaya,N.、Murakami,T.、Saeki,K。一种新的蛇毒样蛋白B-43存在于神经元和星形胶质细胞中:牛大脑顶叶区域的免疫组织化学研究。神经科学。莱特。200: 125-128, 1995.[公共医学:8614560][全文:https://doi.org/10.1016/0304-3940(95)12095-l]

  5. Scarff,K.L.,Ung,K.S.,Nandurkar,H.,Crack,P.J.,Bird,C.H.,Bild,P.I。SPI3/Serpinb6的靶向破坏不会导致发育或生长缺陷、白细胞功能障碍或中风易感性。摩尔。单元格。生物学24:4075-40822004。[公共医学:15082799][全文:https://doi.org/10.128/MCB.24.9.4075-4082.2004]

  6. Schneider,S.S.、Schick,C.、Fish,K.E.、Miller,E.、Pena,J.C.、Treter,S.D、Hui,S.M.、Silverman,G.A。丝氨酸蛋白酶抑制剂基因座18q21.3包含人类鳞状细胞癌抗原基因的串联重复。程序。美国国家科学院。科学。92: 3147-3151, 1995.[公共医学:7724531][全文:https://doi.org/10.1073/pnas.92.8.3147]

  7. 希勒,A.E.,科尔贝,D.L.,阿扎伊兹,H.,斯隆,C.M.,弗里斯,K.L.,韦弗,A.E。拷贝数变异是非综合征性听力损失的常见原因。《基因组医学》,6:372014年。注:电子文章。[公共医学:24963352][全文:https://doi.org/10.1186/gm554]

  8. Sirmaci,A.、Erbek,S.、Price,J.、Huang,M.、Duman,D.、Cengiz,F.B.、Bademci,G.、Tokgoz-Yilmaz,S.,Hismi,B.、Ozdag,H.、Ozturk,B.、Kulaksizoglu,S.和其他13人。SERPINB6中的截断突变与常染色体隐性遗传非综合征感音神经性聋相关。Am.J.Hum.遗传学。86: 797-804, 2010.[公共医学:20451170][全文:https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2010.04.004]

  9. Sun,J.、Rose,J.B.、Bird,P。基因结构、染色体定位和人类蛋白酶抑制剂6(PI-6)小鼠同源物的表达表明PI-6与卵清蛋白蛇蛋白不同。生物学杂志。化学。270: 16089-16096, 1995.[PubMed:7608171][全文:https://doi.org/10.1074/jbc.270.27.16089]

  10. Tan,J.、Prakash,M.D.、Kaiserman,D.、Bird,P.I。SERPINB6A缺失会导致感音神经性耳聋,小鼠内耳出现多种组织病理学改变。Am.J.路径。183: 49-59, 2013.[公共医学:23669344][全文:https://doi.org/10.1016/j.ajpath.2013.03.009]


贡献者:
Patricia A.Hartz-更新时间:2014年7月29日
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标记:10/14/1997
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