条目-*120290-胶原蛋白,XI型,α-2;COL11A2系列-OMIM公司
 
*120290

胶原蛋白,XI型,α-2;COL11A2系列


HGNC批准的基因符号:COL11A2系列

细胞遗传学位置:第61.32页   基因组坐标(GRCh38):6:33,162,694-33,193,519 (来自NCBI)


基因表型关系
位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
第61.32页 耳聋,常染色体显性13 601868 AD公司
耳聋,常染色体隐性遗传53 609706 应收账
纤维软骨生成2 614524 AD公司,应收账
常染色体显性耳蜗发育异常 184840 AD公司
常染色体隐性耳蜗发育异常 215150 应收账

文本

说明

XI型胶原蛋白是一种主要存在于软骨细胞外基质中的形成纤维的胶原蛋白,对骨骼的完整性和发育至关重要(总结如下Lui等人,1996年).


克隆和表达

Kimura等人(1989年)克隆人COL11A2,编码与COL11A1序列高度相似的推导蛋白质(120280). 通过Northern印迹分析,Kimura等人(1989年)表明COL11A2在软骨中表达,但在成人肝脏、皮肤和肌腱中不表达。


映射

Law等人(1989,1990)使用含有COL11A2基因的cosmid克隆作为探针,对一组含有不同数量和组合人类染色体的人/仓鼠体细胞杂种的DNA进行Southern blot分析。他们得出结论,该基因位于6号染色体上,而对一个仅含有6q的细胞杂种的研究表明,COL11A2基因位于6p上。

通过结合体细胞杂交图谱和原位杂交,Hanson等人(1989,1989)将COL11A2基因定位于6p21.3。通过脉冲场凝胶电泳对Ⅱ类HLA区域进行物理定位,Hanson等人(1991年)证明COL11A2基因约为HLA-DPA1的45 kb着丝粒(142880)并以相反的方向(即端粒)转录。

Kimura等人(1989年)通过原位杂交将COL11A2基因指定为6p21.2。核苷酸序列显示,尽管XI型胶原属于胶原的纤维形成类,但当比较COL11A2基因与I、II和III型胶原的基因时,该基因的3质点末端的外显子大小存在显著差异。人们认为XI型胶原的α-3链是II型胶原或软骨胶原亚基的翻译后变体,即由COL2A1基因编码(120140).

Stubbs等人(1993年)表明小鼠中的同源基因也“嵌入”在17号染色体上的主要组织相容性复合体中。


基因结构

Vuoristo等人(1995年)分析了在搜索人类主要组织相容性区域的过程中分离出的两个重叠cosmid克隆的COL11A2基因。核苷酸序列定义超过28000 bp的基因。它被证明含有66个外显子。与大多数纤维胶原基因一样,第一个内含子是最大的,基因5质素端的内含子通常比3质素端大。对编码主要三螺旋结构域的外显子的分析表明,基因结构没有随着主要原纤维胶原基因的进化而进化,外显子数量、外显子大小和密码子使用存在显著差异。该基因位于视黄醇X受体β基因附近(180246)与之前所见的2个小鼠基因的头尾排列相似。此外,基因间序列具有明显的种间同源性。

Lui等人(1996年)表明COL11A2包含至少62个外显子,跨越30.5kb。该基因与其他胶原蛋白的不同之处在于,氨基前肽由14个外显子编码,而不是通常的5到8个外显。启动子富含GC-并且缺少TATA框。作者认为该基因可能经历选择性剪接。该基因位于MHC区域,来自视黄醇X受体β的基因只有1.1kb(180246)和来自DPB2的约40kb(142880).


分子遗传学

Melkoniemi等人(2000年)表示尽管Stickler之间存在部分重叠(参见108300)、马歇尔(154780)Weissenbacher-Zweymuller(OSMEDA;184840)和耳脊柱巨骺发育不良(OSMEDB;215150)COL2A1突变引起的表型(120140),COL11A1(120280)和COL11A2基因,在携带COL11A1突变的患者中没有眼睛受累是值得注意的。这最好的解释是发现COL11A2基因在玻璃体中不表达,并且COL5A2(120190)链取代了眼玻璃体中的COL11A2链(Mayne等人,1993年).

耳软骨巨骺发育不良,常染色体显性

Pihlajama等人(1998年)证明了Weissenbacher-Zweymuller综合征(WZS)的原始患者(魏森巴赫和兹韦穆勒,1964年)COL11A2基因发生杂合突变(120290.0004). 他们注意到WZS和一种称为“非眼部Stickler综合征”的疾病之间的表型重叠,这种疾病也被发现是由COL11A2基因的杂合突变引起的。Pihlajama等人(1998年)斯普朗格(1998)结论:这些疾病是相同的,并建议将其命名为常染色体显性遗传耳脊柱巨骺发育不良(OSMEDA;184840).

此前有报道称,荷兰大家族中患有Stickler综合征骨骼和耳科特征但无眼部异常的患者Brunner等人(1994年),Vikkula等人(1995年)在COL11A2基因中发现一个杂合突变(120290.0001).

在一个Stickler综合征家族中无眼部受累的受累成员中,Sirko-Osadsa等人(1998年)COL11A2基因27-bp缺失的杂合性鉴定(120290.0003). 受影响的家庭成员有感音神经性听力损失、腭裂/悬雍垂、小颌畸形、颧骨扁平、关节疼痛和多发性遗传性外生骨疣。

骨骺发育不良,常染色体隐性

Vikkula等人(1995年)研究了一个荷兰家族,其中一个近亲交配的3个同胞患有严重的退行性关节疾病,类似于成年早期出现的骨关节炎,主要影响臀部、膝盖、肘部和肩膀(OSMEDB;215150).Vikkula等人(1995年)发现这些同胞中的突变是COL11A2基因的纯合gly175-to-arg突变(120290.0002).van Steensel等人(1997年)描述了这些同胞中耳脊柱巨骺发育不良的临床和影像学特征。

Melkoniemi等人(2000年)据报道有7个家庭患有OSMED。所有受累个体都有一个非常相似的表型:严重的感音神经性听力损失、骨骼发育不良伴肢体缩短和大骨骺、腭裂、面部非常平坦、下颌骨发育不良、鼻孔前倾的短鼻子和鼻梁平坦。COL11A2基因在每个家族中都有不同的突变。在4个家族中,包括3个有近亲父母的家族,突变为纯合子。其他3个家庭的个体为复合杂合子,其父母均为非血缘。在10个确定的突变中,9个被预测会导致翻译提前终止,1个被预测将导致帧内缺失。

在与OSMED的埃及兄弟姐妹中,Temtamy等人(2006年)COL11A2基因中1 bp缺失的鉴定纯合子(120290.0011). 第一代近亲父母为杂合子;一个弟弟没有受到影响。

耳聋,常染色体显性13

在2个家族中,1个美国人和1个荷兰人患有常染色体显性遗传的非综合征性听力损失(DFNA13;601868)之前已映射到6p,McGuirt等人(1999年)COL11A2基因的杂合突变(120290.0005-120290.0006)预测会影响胶原蛋白的三螺旋结构域。McGuirt等人(1999年)发现Col11a2靶向性破坏的小鼠也表现出听力损失。这些小鼠的顶盖膜的电子显微镜显示胶原纤维的组织丢失。该发现揭示了与非综合征性听力损失相关的内耳结构独特的超微结构畸形,并提示顶盖膜异常可能是主要影响中频的感音神经性听力损失的病因之一。

耳聋,常染色体隐性53

一个非综合征性听力损失的伊朗血亲家庭的2个同胞的5名受累成员(DFNB53;609706),Chen等人(2005)确定COL11A2基因错义突变的纯合子(P621T;120290.0010). 该突变的4个亲本和1个同胞为杂合子。

在患有非综合征性听力损失的突尼斯家庭和土耳其家庭的受影响成员中,Chakchouk等人(2015)COL11A2基因中两种不同错义突变的纯合性鉴定(120290.0014;120290.0015)在各自的家庭中与疾病隔离。

纤维软骨生成2

一名患有纤维软骨生成症(FBCG2;614524)出生于血亲父母,汤普森等人(2012)COL11A2基因剪接位点突变的纯合性鉴定(120290.0012). 在另一名患有纤维软骨生成症的死亡婴儿中,该婴儿出生于健康的非血液性父母,他们确定了9 bp缺失的杂合性(120290.0013).

挂起确认的关联

日本人中,脊柱后纵韧带骨化(OPLL;602475)是脊髓病的主要病因,表现为椎旁韧带异位骨形成。Maeda等人(2001年)提供了COL11A2基因座构成OPLL易感性的遗传证据。将COL11A2中发现的五个不同SNP结合起来构建单倍型。发现COL11A2单倍型与OPLL存在雄性特异性关联。在一项针对711名日本OPLL患者和896名对照者的病例对照研究中,Horikoshi等人(2006年)发现COL11A2基因中的2个SNPs与OPLL之间没有关联。


ALLELIC变体( 15个精选示例):

.0001耳蜗多囊上皮发育不良,自体染色体显性

COL11A2、IVSDS、G-A、+1
   RCV00018657。。。

在一个表型类似Stickler综合征但无眼部异常的荷兰大家族中(OSMEDA;184840),由发现Brunner等人(1994年)映射到与COL11A2基因相同的6p区域,Vikkula等人(1995年)发现了外显子-内显子边界处1-bp变化的杂合性,因此内含子多位序列GTGAG被ATGAG取代。这种改变在基因组序列中创造了一个新的NlaIII限制位点。G到A的转换导致54bp的内框缺失,这表示突变的外显子5-基的缺失。该外显子序列位于编码α-2(XI)链的三螺旋结构域和C-前肽结构域的序列之间的连接上游108个核苷酸处。


.0002大骨骺发育不良,常染色体隐性遗传

Vikkula等人(1995年)研究了一个荷兰家族,其中3个同胞患有严重的退行性关节疾病,类似于成年早期出现的骨关节炎,主要影响臀部、膝盖、肘部和肩部(OSMEDB;215150). 脊椎受影响较小,成人身高仅略低于未受影响的同胞。腰椎前凸增加,指间关节突出。在所有3个同胞中都发现了短的第五掌骨。患者面部特征独特,面部中部发育不全,鼻子短而上翻,眼睛突出,鼻梁凹陷,眶上嵴突出。感音神经性耳聋从出生时就存在,所有3名受累同胞都需要使用助听器。3例患者均无近视或玻璃体视网膜变性。他们的父母是四表亲。在COL11A2基因座附近6p21的7个CA二核苷酸重复序列多态性的扩展单倍型中,发现受影响的同胞是纯合子。使用异常等位基因频率的保守估计值0.002和标记单倍型频率的保守估算值0.005,Vikkula等人(1995年)当θ=0.0时,疾病表型与6p21的关联度为3.09。为了找到导致常染色体隐性遗传病的突变,他们使用从EBV转化的淋巴母细胞中提取的总RNA进行RT-PCR,并测定了1个个体的COL11A2基因的完整编码序列。这确定了在α-2(XI)链的三螺旋结构域内的G-to-a转换,将一个甘氨酰转换为精氨酰密码子。序列的改变消除了一个MspI限制位点。受影响儿童精氨酸密码子纯合子,而未受影响儿童甘氨酸密码子纯合;由于序列改变,双亲均为杂合子。突变发生在Gly-X-Y三联体中。gly175至arg错义突变的3个同胞的临床发现由van Steensel等人(1997).


.0003耳蜗多囊上皮发育不良,自体染色体显性

COL11A2,27-BP戴尔
   RCV00018659型

在一个患有类似Stickler综合征但无眼部异常综合征的家族中(OSMEDA;184840),Sirko-Osadsa等人(1998年)在COL11A2基因第39外显子内发现一个杂合27-bp缺失。


.0004耳蜗多囊上皮发育不良,自体染色体显性

COL11A2、GLY955GLU
   RCV00018660型

Weissenbacher-Zweymuller综合征(WZS;魏森巴赫和兹韦穆勒,1964年),现在被指定为常染色体显性遗传的大骨骺发育不良(OSMEDA;184840),Pihlajama等人(1998年)已确定COL11A2基因中G-to-A转换的杂合性,该基因将密码子955从蛋白质主要三螺旋中的专性甘氨酸(GGG)转换为谷氨酸密码子(GAG)。


.0005失聪,自动控制13

COL11A2,ARG549CYS公司
   RCV00018662。。。

常染色体显性非综合征感音神经性耳聋(DFNA13;601868),McGuirt等人(1999年)在第42外显子中发现了一个杂合C-to-T错义突变,预测了arg549-to-cys氨基酸替代。


.0006失聪,自动控制13

荷兰常染色体显性非综合征感音神经性耳聋(DFNA13;601868),McGuirt等人(1999年)在外显子31中发现了杂合子G-to-a转换,预测了gly323-glu氨基酸替代。


0007大骨骺发育不良,常染色体隐性遗传

第11a2列,第345列
   RCV00018664型

在一个有血亲父母的摩洛哥家庭中,Melkoniemi等人(2000年)发现3例儿童耳脊柱巨骺发育不良(OSMEDB;215150)COL11A2基因第33外显子2492核苷酸的C-to-a颠倒为纯合子,导致了ser345-ter替换。其中一名儿童出生时的身长正常,但发现四肢短小,关节肿大,指间关节僵硬。影像学特征包括椎体冠状裂隙、方形髂骨翼和厚坐骨、长骨的大干骺端、肘部和膝盖的大骨骺端。7岁时,她的身高几乎正常,但不成比例,她的腭极窄,有两排牙齿。眼科检查显示有轻微近视。


.0008耳蜗多囊上皮发育不良,自体染色体显性

患有类似Stickler综合征但无眼部异常疾病的三代家族成员(OSMEDA;184840),Vuoristo等人(2004年)在COL11A2基因的第57外显子中发现了杂合子C-T转换,导致了arg893-to-ter(R893X)替代。该突变导致1个等位基因第57外显子跳跃,导致18个氨基酸的框内缺失。感音神经性耳聋在三代人中均有发生。原告是一名4岁男孩,出生时有罗宾序列。先证者和他的父亲都有一个平坦的颧骨区域和鼻梁,鼻子是向上的。这位父亲从29岁起就有骨关节炎的症状和放射学表现。73岁时,受影响的祖母脊柱出现广泛的骨关节炎变化。她的父亲在成年中期接受过髋关节置换手术。


.0009耳蜗多囊上皮性发育不良,自体染色体凹陷

患有耳脊柱巨骺发育不良(OSMEDB)的男性双胞胎;215150)出生于北欧血统不乐观的父母,Melkoniemi等人(2000年)已确定COL11A2基因中的复合杂合突变:3991C-T转换,导致arg845-to-ter(R845X)替代,遗传自父亲,剪接位点突变(IVS53+5G-a)遗传自母亲。

来自患有OSMED的以色列贝多因人近亲家庭的5名患者,临床诊断为常染色体隐性遗传Weissenbacher-Zweymuller综合征,Harel等人(2005)确定R845X突变的纯合子。


.0010耳聋,自动耳塞53

COL11A2,PRO621THR项目
   RCV00018667。。。

一个非综合征性听力损失的伊朗血亲家庭的2个同胞的5名受累成员(DFNB53;609706),Chen等人(2005)确定了COL11A2基因第21外显子1861C-A颠倒的纯合子,导致在三螺旋区N末端附近发生pro621-to-thr(P621T)替代。4个亲本和1个同胞是突变的杂合子。


.0011耳蜗多囊上皮性发育不良,自体染色体凹陷

COL11A2,1-BP DEL,3962G
   RCV00018668型

一对埃及兄弟姐妹患有B型大骨骺发育不良(OSMEDB;215150),Temtamy等人(2006年)确定COL11A2基因第55外显子中1 bp缺失(3962delG)的纯合子,导致第56外显子出现终止密码子。第一代近亲父母为杂合子;一个弟弟没有受到影响。


.0012纤维软骨生成2

COL11A2、IVS18、1-BP INS、+3
   RCV000022498型

在一名患有纤维软骨生成症-2(FBCG2;614524),由有血缘关系的父母所生,汤普森等人(2012)确定了COL11A2基因内含子18(+3insG)中1-bp插入的纯合性,预测会导致异常的mRNA加工。未受影响的父母和未受影响的同胞都是杂合子。COS-7细胞中的外显子捕获剪接试验表明,RNA中的外显子18从突变结构中跳过,而不是从对照中跳过。


.0013纤维软骨生成2

COL11A2,9-BP DEL,NT2899
   RCV000022499型

在一名患有纤维软骨生成症-2(FBCG2;614524)出生于健康而不乐观的父母,汤普森等人(2012)鉴定了一个新发现的9-bp缺失(28992907del9)的杂合性,预计在三螺旋结构域中会删除3个氨基酸。未受影响的父母中未出现突变。


.0014耳聋,自动耳塞53

突尼斯一大近亲家族(FT3家族)的4名患语前深度感音神经性聋(DFNB53;609706),Chakchouk等人(2015)确定了COL11A2基因中c.109G-T颠倒(c.109G-T,NM_080680.2)的纯合子,导致在NC4结构域α-2螺旋内的高度保守残基处发生ala37-to-ser(A37S)替换。该突变与家族中的疾病完全分离,在113名突尼斯对照组或Exome Variant Server或dbSNP数据库中均未发现。A37S杂合携带者的家庭成员在30岁后表现出明显的进行性感音神经性聋。


.0015耳聋,自动耳塞53

第11a2列,第888列
   RCV000202578型

2名土耳其姐妹(262家)患有语前深度感音神经性聋(DFNB53;609706),Chakchouk等人(2015)确定了COL11A2基因中c.2662C-a颠倒(c.2662C-a,NM_080680.2)的纯合子,导致在三螺旋区高度保守的残基处发生pro888-to-thr(P888T)替换。该突变存在于未受影响的近亲父母和未受影响姐妹的杂合子中,但在178名土耳其对照组或Exome Variant Server或dbSNP数据库中未发现。


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*120290

胶原蛋白,XI型,α-2;COL11A2系列


HGNC批准的基因符号:COL11A2

细胞遗传学位置:6p21.32   基因组坐标(GRCh38):6:33162694-33193519 (来自NCBI)


基因表型关系

位置 表型 表型
MIM编号
继承 表型
映射键
第61.32页 耳聋,常染色体显性13 601868 常染色体显性
耳聋,常染色体隐性遗传53 609706 常染色体隐性遗传
纤维软骨生成2 614524 常染色体显性;常染色体隐性遗传
耳软骨巨骨骺发育不良,常染色体显性遗传 184840 常染色体显性
常染色体隐性耳蜗发育异常 215150 常染色体隐性遗传

文本

说明

XI型胶原是一种主要存在于软骨细胞外基质中的纤维形成胶原,对骨骼的完整性和发育至关重要(Lui等人,1996年总结)。


克隆和表达

Kimura等人(1989年)克隆了人类COL11A2,其编码的推导蛋白质与COL11A1(120280)具有高度序列相似性。通过Northern blot分析,Kimura等人(1989年)表明COL11A2在软骨中表达,但在成人肝脏、皮肤和肌腱中不表达。


映射

Law等人(1989年、1990年)使用含有COL11A2基因的cosmid克隆作为探针,对一组含有不同数量和组合人类染色体的人/仓鼠体细胞杂种的DNA进行Southern blot分析。他们得出结论,该基因位于6号染色体上,而对一个仅含有6q的细胞杂种的研究表明,COL11A2基因位于6p上。

通过结合体细胞杂交图谱和原位杂交,Hanson等人(1989,1989)将COL11A2基因定位为6p21.3。通过使用脉冲场凝胶电泳对II类HLA区域进行物理定位,Hanson等人(1991年)证明,COL11A2基因约为HLA-DPA1(142880)的45 kb着丝粒,并以相反(即端粒)方向转录。

Kimura等人(1989)通过原位杂交将COL11A2基因分配给6p21.2。核苷酸序列显示,尽管XI型胶原属于胶原的纤维形成类,但当比较COL11A2基因与I、II和III型胶原的基因时,该基因的3质点末端的外显子大小存在显著差异。据认为,XI型胶原的α-3链是II型胶原或软骨胶原亚基的翻译后变体,即由COL2A1基因编码(120140)。

Stubbs等人(1993年)表明,小鼠中的同源基因也“嵌入”在17号染色体上的主要组织相容性复合体中。


基因结构

Vuoristo等人(1995年)分析了两个重叠cosmid克隆的COL11A2基因,这两个克隆之前是在搜索人类主要组织相容性区域的过程中分离出来的。核苷酸序列定义超过28000 bp的基因。它被证明含有66个外显子。与大多数纤维胶原基因一样,第一个内含子是最大的,基因5质素端的内含子通常比3质素端大。对编码主要三螺旋结构域的外显子的分析表明,基因结构没有随着主要原纤维胶原基因的进化而进化,外显子数量、外显子大小和密码子使用存在显著差异。该基因位于视黄醇X受体β(180246)基因附近,呈头尾排列,类似于之前在2个小鼠基因中看到的排列。此外,基因间序列具有明显的种间同源性。

Lui等人(1996年)表明,COL11A2包含至少62个外显子,跨越30.5 kb。该基因与其他胶原蛋白的不同之处在于,氨基前肽由14个外显子编码,而不是通常的5到8个外显。启动子富含GC-并且缺少TATA框。作者认为该基因可能经历选择性剪接。该基因位于MHC区域,来自视黄醇X受体β(180246)仅为1.1kb,来自DPB2(142880)约为40kb。


分子遗传学

Melkoniemi等人(2000年)指出,尽管Stickler(见108300)、Marshall(154780)、Weissenbacher-Zweymuller(OSMEDA;184840)和COL2A1(120140)、COL11A1(120280)和COL11A2基因突变导致的耳椎巨骺发育不良(OSMEDB;215150)表型之间存在部分重叠,值得注意的是,携带COL11A2突变的患者没有眼部受累。这最好的解释是发现COL11A2基因在玻璃体中不表达,COL5A2(120190)链取代了眼玻璃体中的COL11A1链(Mayne等人,1993)。

常染色体显性耳蜗发育异常

Pihlajama等人(1998年)证明,最初患有Weissenbacher-Zweymuller综合征(WZS)的患者(Weissenbacher和Zweymumler,1964年)在COL11A2基因中有杂合突变(120290.0004)。他们注意到WZS和一种称为“非眼部Stickler综合征”的疾病之间的表型重叠,这种疾病也被发现是由COL11A2基因的杂合突变引起的。Pihlajama等人(1998)和Spranger(1998)得出的结论是,这些疾病是相同的,并提出了常染色体显性遗传耳脊柱巨骺发育不良(OSMEDA;184840)的命名。

在Brunner等人(1994年)先前报道的具有Stickler综合征骨骼和耳科特征但无眼部异常的荷兰大家族受影响成员中,Vikkula等人(1995年)在COL11A2基因中发现了杂合突变(120290.0001)。

Sirko-Osadsa等人(1998年)在一个Stickler综合征家族的受累成员中发现了COL11A2基因中27-bp缺失的杂合性(120290.0003)。受影响的家庭成员有感音神经性听力损失、腭裂/悬雍垂、小颌畸形、颧骨扁平、关节疼痛和多发性遗传性外生骨疣。

耳软骨大骨骺发育不良,常染色体隐性

Vikkula等人(1995)研究了一个荷兰亲缘关系,其中一个近亲交配的3个同胞患有严重的退行性关节疾病,类似于骨关节炎,这种疾病出现在成年早期,主要影响臀部、膝盖、肘部和肩部(OSMEDB;215150)。Vikkula等人(1995年)发现,这些同胞中的突变是COL11A2基因的纯合gly175-to-arg突变(120290.0002)。van Steensel等人(1997年)描述了这些同胞中耳脊柱巨骺发育不良的临床和影像学特征。

Melkoniemi等人(2000年)报告了7个患有OSMED的家庭。所有受累个体都有一个非常相似的表型:严重的感音神经性听力损失、骨骼发育不良伴肢体缩短和大骨骺、腭裂、面部非常平坦、下颌骨发育不良、鼻孔前倾的短鼻子和鼻梁平坦。COL11A2基因在每个家族中都有不同的突变。在4个家族中,包括3个有近亲父母的家族,突变为纯合子。其他3个家庭的个体为复合杂合子,其父母均为非血缘。在10个确定的突变中,9个被预测会导致翻译提前终止,1个被预测将导致帧内缺失。

在患有OSMED的埃及兄弟姐妹中,Temtamy等人(2006年)确定了COL11A2基因中1 bp缺失的纯合子(120290.0011)。第一代近亲父母为杂合子;一个弟弟没有受到影响。

耳聋,常染色体显性13

在2个常染色体显性、非综合征性耳聋(DFNA13;601868)的家庭中,1个美国人和1个荷兰人先前被定位为6p,McGuirt等人(1999年)确定了COL11A2基因(120290.0005-120290.0006)中的杂合突变,这些突变预计会影响胶原蛋白的三螺旋结构域。McGuirt等人(1999年)发现,Col11a2靶向破坏的小鼠也表现出听力损失。这些小鼠的顶盖膜的电子显微镜显示胶原纤维的组织丢失。该发现揭示了与非综合征性听力损失相关的内耳结构独特的超微结构畸形,并提示顶盖膜异常可能是主要影响中频的感音神经性听力损失的病因之一。

耳聋,常染色体隐性53

Chen等人(2005年)在一个患有非综合征性听力损失的伊朗血亲家庭(DFNB53;609706)的2个同胞的5名受影响成员中,确定了COL11A2基因错义突变的纯合子(P621T;120290.0010)。4个亲本和1个同胞是突变的杂合子。

Chakchouk等人(2015年)在突尼斯一家系和土耳其一家系的非综合征性耳聋患者中,确定了COL11A2基因(120290.0014;120290.0015)中两种不同错义突变的纯合子,这两种突变与各自家族的疾病分离。

纤维软骨生成2

Tompson等人(2012年)在一名由近亲父母所生的患有纤维软骨生成症的已故婴儿(FBCG2;614524)中确定了COL11A2基因剪接位点突变的纯合子(120290.0012)。在另一名患有纤维软骨生成症的死亡婴儿中,该婴儿出生于健康的非血液性父母,他们确定了9 bp缺失的杂合性(120290.0013)。

挂起确认的关联

在日本人中,脊椎后纵韧带骨化(OPLL;602475)是脊髓病的主要原因,表现为椎旁韧带异位骨形成。Maeda等人(2001年)提供了遗传证据,证明COL11A2基因座构成了OPLL的易感性。将COL11A2中发现的五个不同SNP结合起来构建单倍型。发现COL11A2单倍型与OPLL存在雄性特异性关联。在对711名日本OPLL患者和896名对照者进行的病例对照研究中,Horikoshi等人(2006年)发现COL11A2基因中的2个SNP与OPLL之间没有关联。


ALLELIC变体 15个精选示例):

.0001耳蜗多囊上皮发育不良,自体染色体显性

COL11A2、IVSDS、G-A、+1
SNP:rs750995470,gnomAD:rs750995470,临床变量:RCV00018657,RCV001659702

在一个表型类似Stickler综合征但无眼部异常的荷兰大家族中(OSMEDA;184840),Brunner等人(1994年)发现该家族与COL11A2基因映射到6p的同一区域,Vikkula等人(1995年)发现外显子-内显子边界处1-bp变化的杂合性,从而使内含子-供体-侧序列,GTGAG被ATGAG取代。这一变化在基因组序列中产生了一个新的NlaIII限制性位点。G-to-A转换导致54-bp帧内缺失,这表示突变的外显子5质数缺失。该外显子序列位于编码α-2(XI)链的三螺旋结构域和C-前肽结构域的序列之间连接处上游108个核苷酸。


.0002耳蜗多囊上皮性发育不良,自体染色体凹陷

GLY175ARG COL11A2
单号:rs121912945,gnomAD:rs121912945,临床变量:RCV00018658,RCV001851920

Vikkula等人(1995年)研究了一个荷兰家族,其中3个兄弟姐妹患有严重的退行性关节疾病,类似于成年早期出现的骨关节炎,主要影响臀部、膝盖、肘部和肩部(OSMEDB;215150)。脊椎受影响较小,成人身高仅略低于未受影响的同胞。腰椎前凸增加,指间关节突出。3个同胞均发现第五掌骨较短。患者面部特征独特,面部中部发育不全,鼻子短而上翻,眼睛突出,鼻梁凹陷,眶上嵴突出。感音神经性耳聋从出生时就存在,所有3名受累同胞都需要使用助听器。3例患者均无近视或玻璃体视网膜变性。他们的父母是四表亲。在COL11A2基因座附近6p21的7个CA二核苷酸重复序列多态性的扩展单倍型中,发现受影响的同胞是纯合子。通过对异常等位基因频率的保守估计值0.002和标记单倍型频率的保守估算值0.005,Vikkula等人(1995年)在θ=0.0时获得了疾病表型与6p21关联的lod评分3.09。为了找到导致常染色体隐性遗传病的突变,他们使用从EBV转化的淋巴母细胞中提取的总RNA进行RT-PCR,并测定了1个个体的COL11A2基因的完整编码序列。这确定了在α-2(XI)链的三螺旋结构域内的G-to-a转换,将甘氨酰转化为精氨酰密码子。序列的改变消除了一个MspI限制位点。受影响儿童精氨酸密码子纯合子,而未受影响儿童甘氨酸密码子纯合;由于序列改变,双亲均为杂合子。突变发生在Gly-X-Y三联体中。van Steensel等人(1997年)描述了gly175-to-arg错义突变的3个同胞的临床发现。


.0003耳蜗多囊上皮发育不良,自体染色体显性

COL11A2,27-BP戴尔
单号:rs864309477,临床变量:RCV00018659

在一个患有类似Stickler综合征但无眼部异常综合征的家族中(OSMEDA;184840),Sirko-Osadsa等人(1998年)在COL11A2基因第39外显子内发现了杂合27-bp缺失。


.0004耳蜗多囊上皮发育不良,自体染色体显性

COL11A2、GLY955GLU
单号:rs121912946,临床变量:RCV00018660

在Weissenbacher-Zweymuller综合征(WZS;Weissenbacher和Zweymumller,1964)的原发患者中,现在被指定为常染色体显性遗传性耳脊柱巨骨骺发育不良(OSMEDA;184840),Pihlajama等人(1998年)确定了COL11A2基因中G-to-A转换的杂合性,该基因将一个专性甘氨酸(GGG)的密码子955转换成G-A在蛋白质的主要三重螺旋中形成谷氨酸密码子(GAG)。


.0005失聪,自动控制13

COL11A2,银549半胱氨酸蛋白酶
SNP:rs121912947,临床变量:RCV00018662、RCV000605765、RCV001091818、RCV003398542

在一个常染色体显性非综合征感音神经性耳聋(DFNA13;601868)美国家庭的受累成员中,McGuirt等人(1999年)在第42外显子中发现了一个杂合的C-to-T错义突变,该突变预测了arg549-to-cys氨基酸替代。


.0006失聪,自动控制13

GLY323GLU COL11A2
单号:rs121912948,临床变量:RCV00018663

在常染色体显性非综合征感音神经性耳聋(DFNA13;601868)荷兰家系的受累成员中,McGuirt等人(1999年)在外显子31中发现了杂合子G-to-a转变,预测了gly323-glu氨基酸替代。


.0007耳蜗多囊上皮性发育不良,自体染色体凹陷

SER345TER COL11A2
单号:rs121912949,gnomAD:rs121912949,临床变量:RCV00018664

Melkoniemi等人(2000年)在一个有近亲父母的摩洛哥家庭中发现,3名患有耳脊椎巨骺发育不良(OSMEDB;215150)的儿童在COL11A2基因第33外显子2492核苷酸处的C-to-a颠倒是纯合的,导致了一个345-ter的替换。其中一名儿童出生时的身长正常,但发现四肢短小,关节肿大,指间关节僵硬。影像学特征包括椎体冠状裂隙、方形髂骨翼和厚坐骨、长骨的大干骺端、肘部和膝盖的大骨骺端。7岁时,她的身高几乎正常,但不成比例,她的腭极窄,有两排牙齿。眼科检查显示有轻微近视。


.0008耳蜗多囊上皮发育不良,自体染色体显性

ARG893TER COL11A2
单号:rs121912950,临床变量:RCV00018665、RCV000761299、RCV001268065

在一个患有类似Stickler综合征但无眼部异常疾病的三代家族的受影响成员中(OSMEDA;184840),Vuoristo等人(2004年)在COL11A2基因的第57外显子中发现了杂合子C-T转换,导致arg893-to-ter(R893X)替代。该突变导致1个等位基因第57外显子跳跃,导致18个氨基酸的框内缺失。感音神经性耳聋在三代人中均有发生。原告是一名4岁男孩,出生时有罗宾序列。先证者和他的父亲都有一个平坦的颧骨区域和鼻梁,鼻子是向上的。这位父亲从29岁起就有骨关节炎的症状和放射学检查结果。73岁时,受影响的祖母脊柱出现广泛的骨关节炎变化。她的父亲在成年中期接受过髋关节置换手术。


.0009耳蜗多囊上皮性发育不良,自体染色体凹陷

ARG845TER COL11A2
单号:rs121912951,gnomAD:rs121912951,临床变量:RCV00018666、RCV002496405、RCV0002513107

Melkoniemi等人(2000年)在出生于北欧血统非血统父母的患有耳脊椎巨骺发育不良(OSMEDB;215150)的男性双胞胎中,确定了COL11A2基因中的复合杂合突变:3991C-T转换,导致从父亲遗传来的arg845-to-ter(R845X)替代,以及从母亲遗传的剪接位点突变(IVS53+5G-a)。

在来自一个患有OSMED的以色列贝都因血亲家庭的5名患者中,他们被临床诊断为常染色体隐性遗传的Weissenbacher-Zweymuller综合征,Harel等人(2005)确定了R845X突变的纯合性。


0010耳聋,常染色体隐性遗传53

第11a2列,项目621thr
SNP:rs121912952,gnomAD:rs121912952,临床变量:RCV00018667、RCV000217775、RCV00584845、RCV001375391

Chen等人(2005)在一个患有非综合征性听力损失的伊朗血亲家族(DFNB53;609706)的2个同胞的5名受累成员中,确定了COL11A2基因第21外显子1861C-a颠倒的纯合子,导致在三螺旋区的N端附近发生第621位到第1位(P621T)的替换。4个亲本和1个同胞是突变的杂合子。


.0011耳蜗多囊上皮性发育不良,自体染色体凹陷

COL11A2,1-BP DEL,3962G
SNP:rs1562315748,临床变量:RCV00018668

Temtamy等人(2006)在一对患有B型耳脊髓大骨骺发育不良(OSMEDB;215150)的埃及兄弟姐妹中鉴定了COL11A2基因外显子55中1-p缺失(3962delG)的纯合性,导致外显子56中的终止密码子。第一代近亲父母为杂合子;一个弟弟没有受到影响。


.0012纤维软骨生成2

COL11A2、IVS18、1-BP INS、+3
SNP:rs2150577320,临床变量:RCV000022498

Tompson等人(2012年)在一名由近亲父母所生的患有纤维软骨生成症-2(FBCG2;614524)的已故婴儿中,确定了COL11A2基因内含子18(+3insG)中1-bp插入的纯合子,预计会导致mRNA处理异常。未受影响的父母是突变的杂合子,未受影响同胞也是如此。COS-7细胞中的外显子捕获剪接试验表明,RNA中的外显子18从突变结构中跳过,而不是从对照中跳过。


.0013纤维软骨生成2

COL11A2,9-BP DEL,NT2899
SNP:rs2150551158,临床变量:RCV000022499

Tompson等人(2012年)在一名患有纤维软骨生成症-2(FBCG2;614524)的死亡婴儿中,发现了一个新出现的9 bp缺失(2899_2907del9)的杂合性,该缺失预计会删除三个螺旋结构域内的3个氨基酸。未受影响的父母中未出现突变。


.0014耳聋,自动耳塞53

COL11A2、ALA37SER
单号:rs606231410,gnomAD:rs606231410,临床变量:RCV000148342、RCV000202598、RCV003556192

Chakchouk等人(2015)在一个患有语前深度感音神经性聋(DFNB53;609706)的突尼斯大近亲家族(FT3家族)的4名受累成员中,确定了COL11A2基因中c.109G-T颠换(c.109G-T,NM_080680.2)的纯合子,导致ala37-to-ser(A37S)NC4结构域中α-2螺旋内高度保守残基的取代。该突变与家族中的疾病完全分离,在113名突尼斯对照组或Exome Variant Server或dbSNP数据库中均未发现。A37S杂合携带者的家庭成员在30岁后表现出明显的进行性感音神经性聋。


.0015耳聋,自动耳塞53

第11a2列,第888列
SNP:rs864309523,临床变量:RCV000202578

Chakchouk等人(2015)在两个患有语言前深度感音神经性聋(DFNB53;609706)的土耳其姐妹(262家族)中,确定了COL11A2基因中c.2662C-a颠倒(c.2662C-a,NM_080680.2)的纯合子,导致在三螺旋区高度保守的残基上发生pro888-to-thr(P888T)替代。该突变存在于未受影响的近亲父母和未受影响姐妹的杂合子中,但在178名土耳其对照组或Exome Variant Server或dbSNP数据库中未发现。


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