生命地图是一个交互式工具,用于探索整个NCBI分类。中使用的概念生命地图类似于使用Google Maps©或Open Street Maps等工具进行制图时使用的方法:通过缩放和平移进行探索。
当前树包含NCBI分类中存在的所有物种。每周六自动更新。
树中的所有节点都可以单击。这将显示各种信息和选项:
通过单击主页右下角的按钮并填充两个搜索字段,可以计算分类群之间的行程。填满后,在分类群之间绘制路线,返回两个类群/物种的最新共同祖先(MRCA)。用户还可以访问在从一个组到另一个组的过程中遇到的所有节点的列表。此列表可单击。
[新增]由其标识的物种或节点子集的子树出租车可以可视化并下载(Newick格式)。为了简单起见,可以在搜索栏中搜索物种,并使用添加按钮。
生命地图由Damien M.de Vienne编写(网页),CNRS研究员,在生物计量和进化生物学实验室工作(伦敦商业银行)在里昂(法国),得到信息部门(特别是斯蒂芬·德莫特和布鲁诺·斯帕塔罗)的支持。
参考:de Vienne DM(2016)《生命地图:探索生命之树》。PLOS生物学 14(12) :e2001624。https://doi.org/10.1371/journal.pbio.2001624"
如有任何问题、评论、建议或错误报告,请联系Damien de Vienne:damien.de-vienne@univ-lyon1.fr