有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

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国际标准编号:2414-3146

1-甲基-4-苯基-1H(H)-吡唑啉-3,4-d日]嘧啶

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摩洛哥拉巴特穆罕默德五世大学化学系实验室、医学科学研究中心、药理学博士、Av Ibn Battota、BP 1014,b条摩洛哥拉巴特穆罕默德五世大学医药学院药物化学实验室c(c)美国洛杉矶70118新奥尔良杜兰大学化学系
*通信电子邮件:elhafi.mohamed1@gmail.com

编辑:L.Van Meervelt,比利时鲁汶卡托利耶克大学(2017年8月25日收到; 2017年8月26日接受; 2017年9月5日在线)

在晶体中,标题化合物C的分子量12H(H)10N个4,沿b条方向通过ππ吡唑-嘧啶环系统两部分之间的堆积相互作用。

三维视图(正在加载…)
【方案3D1】
化学方案
【方案一】

结构描述

在过去的十年中,吡唑啉的化学受到了极大的关注[3,4-d日]嘧啶。这无疑是由于吡唑啉[3,4的多种生物活性所致-d日]嘧啶衍生物,如其抗结核作用(Trivedi等人。, 2012【Trivedi,A.R.,Dholariya,B.H.,Vakhariya,C.P.,Dodiya,D.K.,Ram,H.K.,Kataria,V.B.,Siddiqui,A.B.&Shah,V.H.(2012),《医学化学研究》第21期,1887-1891年。】),抗菌(Rostamizadeh等人。, 2013【Rostamizadeh,S.、Nojavan,M.、Aryan,R.、Sadeghian,H.和Davoodnejad,M.(2013)。中国化学通讯24,629-632。】)和抗肿瘤药物(Intori等人。, 2015【Intori,C.,Fallacara,A.L.,Radi,M.,Zamperini,C.,Dreassi,E.,Crespan,E.,Maga,G.,Schenone,S.,Musumeci,F.&Brullo,C.(2015),《医学化学杂志》58,347-361。】). 本工作是吡唑并[3,4研究的延续-d日]我们团队报告的嘧啶衍生物(Alsubari等人。, 2011【Alsubari,A.、Ramli,Y.、Essassi,E.M.和Zouihri,H.(2011),《结晶学报》E67,o1926年。】).

熔融杂环系统(图1[链接])显示了通过九个原子的最小二乘平面的最大偏差0.0257(1)和−0.0270(1)Ω(均方根偏差=0.0209Ω)。该平面与苯环平面之间的二面角为33.43(4)°。在晶体中,摩尔沿着b条-轴方向以头对尾的方式通过ππ双环堆芯的堆叠相互作用(图2[链接]). 每个相互作用中五元环和六元环之间的二面角为2.30(7)°,而质心-质心距离沿堆栈在3.509(1)和3.645(1)°之间交替。此外,还有C8-H8­π(环)(环=C7–C12,H­形心=2.93º,C-H­质心=148°)堆栈外部的相互作用,部分导致苯环相对于双环核心的方向(图3[链接]).

[图1]
图1
标题分子,带有原子标记方案和25%概率椭球体。
[图2]
图2
的详细信息ππ堆叠(橙色虚线)和C-H­π(环形)(紫色虚线)相互作用,沿b条方向。为了清楚起见,省略了与相互作用无关的H原子。
[图3]
图3
包装沿b条方向。为了清楚起见,省略了H原子。

合成和结晶

向微波小瓶中添加1-甲基-4-氯-1H(H)-吡咯唑[3,4-d日]嘧啶(50 mg,0.3 mmol),苯基硼酸(40.23 mg,0.33 mmol),K2一氧化碳(124.38 mg,0.9 mmol),[1,1′-双(二苯基膦)二茂铁]二氯钯(II)或PdCl2(dppf)(22 mg,0.03 mmol),THF(3 ml)和H2O(10微升)。将反应混合物在443 K的微波反应器中搅拌加热10 min。将粗反应混合物通过小硅胶塞,用EtOAc洗脱,并用硅胶纯化粗材料色谱法(己烷中0至10%的EtOAc梯度)。标题化合物在室温下从乙醇中再结晶,得到无色晶体(产率80%;熔点388–390 K)。

精炼

水晶和精炼数据如表1所示[链接].

表1
实验细节

水晶数据
化学配方 C类12H(H)10N个4
M(M)第页 210.24
晶体系统,空间组 正交各向异性,P(P)b条c(c)
温度(K) 296
,b条,c(c)(Å) 14.6205 (10), 7.1497 (5), 20.3532 (15)
V(V)) 2127.6 (3)
Z 8
辐射类型 Kα
μ(毫米−1) 0.08
晶体尺寸(mm) 0.29 × 0.20 × 0.16
 
数据收集
衍射仪 Bruker智能APEX CCD
吸收校正 多扫描(SADABS公司; 布鲁克,2016[Bruker(2016),APEX3,SADABS和SAINT.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊])
T型最小值,T型最大值 0.86, 0.99
测量、独立和观察的数量[> 2σ()]反射 18616, 2639, 1725
R(右)整数 0.043
(罪θ/λ)最大值−1) 0.667
 
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司 0.044, 0.139, 1.06
反射次数 2639
参数数量 147
氢原子处理 受约束的氢原子参数
Δρ最大值,Δρ最小值(eó)−3) 0.20, −0.14
计算机程序:4月3日(布鲁克,2016[Bruker(2016).APEX3,SADABS和SAINT.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊]),圣保罗(布鲁克,2016[Bruker(2016),APEX3,SADABS和SAINT.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊]),SHELXT公司(谢尔德里克,2015年【谢尔德里克·G·M(Sheldrick,G.M.)(2015a),《结晶学报》A71,3-8。】),SHELXL2014标准(谢尔德里克,2015年b条[Sheldrick,G.M.(2015b),《结晶学报》,C71,3-8。]),钻石(Brandenburg&Putz,2012)【Brandenburg,K.&Putz,H.(2012)。钻石。Crystal Impact GbR,德国波恩。】)和谢尔克斯特尔(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]).

结构数据


计算详细信息顶部

数据收集:4月3日(布鲁克,2016);细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,2016);数据缩减:圣保罗(Bruker,2016);用于求解结构的程序:SHELXT公司(谢尔德里克,2015年); 用于优化结构的程序:SHELXL2014标准(谢尔德里克,2015年b条); 分子图形:钻石(Brandenburg&Putz,2012);用于准备出版材料的软件:谢尔克斯特尔(布鲁克,2016)。

1-甲基-4-苯基-1H(H)-吡唑啉[3,4-d日]嘧啶顶部
水晶数据 顶部
C类12H(H)10N个4D类x个=1.313毫克
M(M)第页= 210.24Kα辐射,λ= 0.71073 Å
正交各向异性,P(P)b条c(c)4337次反射的细胞参数
= 14.6205 (10) Åθ=2.4–24.3°
b条= 7.1497 (5) ŵ=0.08毫米1
c(c)= 20.3532 (15) ÅT型=296千
V(V)= 2127.6 (3) Å色谱柱,无色
Z= 80.29×0.20×0.16毫米
F类(000) = 880
数据收集 顶部
布鲁克SMART APEX CCD
衍射仪
2639个独立反射
辐射源:细焦点密封管1725次反射> 2σ()
石墨单色仪R(右)整数= 0.043
探测器分辨率:8.3333像素mm-1个θ最大值= 28.3°,θ最小值= 2.0°
φω扫描小时=1919
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,2016年)
k个=99
T型最小值= 0.86,T型最大值= 0.99=2726
18616次测量反射
精炼 顶部
优化于F类2二次原子位置:差分傅里叶映射
最小二乘矩阵:满氢站点位置:从邻近站点推断
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.044受约束的氢原子参数
水风险(F类2) = 0.139 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0655P(P))2+ 0.1279P(P)]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
S公司= 1.06(Δ/σ)最大值< 0.001
2639次反射Δρ最大值=0.20埃
147个参数Δρ最小值=0.14埃
0个约束消光校正:SHELXL2014标准(谢尔德里克,2015年b条),Fc(预测值)*=kFc[1+0.001xFc2λ/罪(2θ)]-1/4
主原子位置定位:结构-变量直接方法消光系数:0.0053(13)
特殊细节 顶部

实验在三组363帧中收集衍射数据(0.5°宽度ω)在φ=0、120和240°。扫描时间为40秒/帧。

几何图形使用全协方差矩阵估计所有esd(除了两个l.s.平面之间二面角的esd)。在估计距离、角度和扭转角的esd时,单独考虑单元esd;细胞参数中esd之间的相关性仅在由晶体对称性定义时使用。细胞esd的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的esd。

精炼.F的细化2对抗所有反射。加权R系数wR和拟合优度S基于F2,传统的R系数R基于F,对于负F,F设置为零2F的阈值表达式2>2西格玛(F2)仅用于计算R系数(gt)等,与选择反射进行细化无关。基于F的R系数2在统计上大约是基于F的因子的两倍,而基于ALL数据的R因子将更大。将附着在碳上的氢原子放置在计算位置(C-H=0.93-0.97 Au)。所有这些都作为骑行贡献包括在内,各向同性位移参数是附加原子的1.2倍。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
N1型0.40768 (7)0.80901 (19)0.41811 (6)0.0650 (4)
氮气20.31476 (8)0.87710 (17)0.51276(6)0.0621 (3)
N3号机组0.15455 (7)0.85635 (16)0.49050 (6)0.0582 (3)
4号机组0.09970 (8)0.8116 (2)0.43846 (6)0.0670 (4)
C1类0.24717 (8)0.80131 (17)0.40626 (6)0.0475 (3)
指挥与控制0.33514 (9)0.78419 (17)0.37892 (7)0.0505 (3)
C3类0.39276 (10)0.8529 (2)0.48141 (8)0.0704 (4)
H3级0.44510.86850.50680.084*
补体第四成份0.24321 (8)0.84873 (17)0.47294 (7)0.0493 (3)
C5级0.15443(9)0.77896 (19)0.38832 (7)0.0574 (4)
H5型0.13460.74550.34650.069*
C6级0.11689 (12)0.8901 (3)0.55525 (7)0.0776(5)
H6A型0.06360.96780.55150.116*
H6B型0.16170.95190.58200.116*
H6C型0.10040.77310.57510.116*
抄送70.35299 (10)0.73913 (17)0.30951 (6)0.0546 (4)
抄送80.29471 (11)0.7977 (2)0.26000 (7)0.0671 (4)
H8型0.24270.86640.27050.081*
C9级0.31320 (15)0.7549(3)0.19521 (8)0.0852 (6)
H9型0.27410.79610.16220.102*
C10号机组0.38869 (16)0.6522 (3)0.17949 (9)0.0936 (6)
H10型0.40030.62190.13580.112*
C11号机组0.44746(14)0.5936 (2)0.22764 (9)0.0861 (5)
H11型0.49900.52420.21660.103*
第12项0.43046 (10)0.6371 (2)0.29249 (7)0.0665 (4)
H12型0.47090.59810.32500.080*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
N1型0.0461 (7)0.0821 (9)0.0667 (7)0.0000(5)0.0014 (5)0.0019 (6)
氮气20.0523 (7)0.0758 (8)0.0583 (7)0.0049 (5)0.0055 (5)0.0033 (6)
N3号机组0.0458 (6)0.0708 (7)0.0580(7)0.0006 (5)0.0031 (5)0.0006 (5)
4号机组0.0459 (7)0.0877(9)0.0675 (8)0.0034 (6)0.0042 (5)0.0008 (6)
C1类0.0454 (7)0.0433 (6)0.0538 (7)0.0003 (5)0.0030 (5)0.0033 (5)
指挥与控制0.0474 (7)0.0452(7)0.0588 (7)0.0016 (5)0.0006 (6)0.0041 (5)
C3类0.0483 (8)0.0932 (11)0.0697 (9)0.0054 (7)0.0108 (7)0.0041 (8)
补体第四成份0.0459 (7)0.0468 (7)0.0553 (7)0.0011 (5)0.0017 (6)0.0032 (5)
C5级0.0494 (7)0.0650 (9)0.0578 (8)0.0032 (6)0.0061 (6)0.0011 (6)
C6级0.0628 (9)0.1040 (13)0.0661 (10)0.0007 (9)0.0138 (7)0.0065 (8)
抄送70.0588 (8)0.0477 (7)0.0573 (8)0.0024 (5)0.0073 (6)0.0046 (6)
抄送80.0747 (10)0.0648 (9)0.0619(9)0.0045 (7)0.0022 (7)0.0096 (7)
C9级0.1075 (15)0.0887 (13)0.0592 (10)0.0010 (10)0.0010 (9)0.0129 (9)
C10号机组0.1308(17)0.0880 (12)0.0620 (10)0.0013 (12)0.0268 (11)0.0010 (9)
C11号机组0.1003 (13)0.0744 (11)0.0835 (11)0.0083 (9)0.0372(10)0.0005 (9)
第12项0.0638 (9)0.0646 (9)0.0712 (10)0.0051 (7)0.0152 (7)0.0054 (7)
几何参数(λ,º) 顶部
N1-C2型1.3388 (17)C6-H6A型0.9600
N1-C3型1.344 (2)C6-H6B型0.9600
N2-C3气体1.3181 (18)C6-H6C型0.9600
N2-C4气体1.3387 (17)C7-C8号机组1.385 (2)
N3-C41.3458 (16)C7-C12型1.391 (2)
N3-N4号机组1.3665 (16)C8-C9型1.380 (2)
编号3-C61.4486 (18)C8-H8型0.9300
编号4-C51.3176 (18)C9-C10型1.363 (3)
C1-C4类1.4001 (19)C9-H90.9300
C1-C2类1.4068 (18)C10-C111.369(3)
C1-C5号机组1.4132 (18)C10-H100.9300
C2-C7型1.4722 (19)C11-C12号机组1.379 (2)
C3至H30.9300C11-H11型0.9300
C5-H5型0.9300C12-H12型0.9300
C2-N1-C3118.27 (11)H6A-C6-H6B型109.5
C3-N2-C4111.29(12)N3-C6-H6C型109.5
C4-N3-N4型110.49 (11)H6A-C6-H6C型109.5
C4-N3-C6127.91 (12)H6B-C6-H6C109.5
N4-N3-C6121.42 (12)C8-C7-C12型118.58 (13)
C5-N4-N3型106.58(11)C8-C7-C2型121.55 (13)
C4-C1-C2型116.25 (11)C12-C7-C2型119.87 (13)
C4-C1-C5103.78 (11)C9-C8-C7120.51 (16)
C2-C1-C5型139.92 (13)C9-C8-H8119.7
N1-C2-C1118.49 (12)C7-C8-H8型119.7
N1-C2-C7型117.41 (12)C10-C9-C8120.14 (18)
C1-C2-C7型124.10 (12)C10-C9-H9型119.9
N2-C3-N1型129.43 (13)C8-C9-H9119.9
N2-C3-H3型115.3C9-C10-C11120.32 (17)
N1-C3-H3型115.3C9-C10-H10119.8
N2-C4-N3125.86 (12)C11-C10-H10型119.8
N2-C4-C1型126.24 (12)C10-C11-C12号机组120.20 (17)
编号3-4-C1107.88 (11)C10-C11-H11号机组119.9
编号4-C5-C1111.26 (12)C12-C11-H11型119.9
编号4-C5-H5124.4C11-C12-C7型120.24 (16)
C1-C5-H5型124.4C11-C12-H12型119.9
N3-C6-H6A型109.5C7-C12-H12型119.9
N3-C6-H6B型109.5
C4-N3-N4-C50.93 (16)C2-C1-C4-N3型179.22 (11)
C6-N3-N4-C5176.30 (14)C5-C1-C4-N31.27 (13)
C3-N1-C2-C11.3 (2)N3-N4-C5-C1型0.09 (16)
C3-N1-C2-C7型179.06 (13)C4-C1-C5-N4型0.73(15)
C4-C1-C2-N1型1.71 (18)C2-C1-C5-N4型177.88 (15)
C5-C1-C2-N1175.20 (15)N1-C2-C7-C8147.81 (14)
C4-C1-C2-C7型178.72 (11)C1-C2-C7-C8型32.62 (19)
C5-C1-C2-C7型4.4 (2)N1-C2-C7-C1231.51(18)
C4-N2-C3-N11.1 (2)C1-C2-C7-C12148.06 (13)
C2-N1-C3-N20.2(3)C12-C7-C8-C90.2 (2)
C3-N2-C4-N3177.61 (13)C2-C7-C8-C9179.54 (14)
C3-N2-C4-C10.6 (2)C7-C8-C9-C100.8 (3)
N4-N3-C4-N2177.11 (13)C8-C9-C10-C11号机组1.1 (3)
C6-N3-C4-N22.1 (2)C9-C10-C11-C120.4 (3)
编号4-N3-C4-C11.41 (14)C10-C11-C12-C70.7 (3)
C6-N3-C4-C1176.39 (14)C8-C7-C12-C111.0 (2)
C2-C1-C4-N2型0.72 (19)C2-C7-C12-C11型179.70 (14)
C5-C1-C4-N2177.24 (13)
 

鸣谢

JTM感谢杜兰大学对杜兰晶体学实验室的支持。

参考文献

第一次引用Alsubari,A.、Ramli,Y.、Essassi,E.M.和Zouihri,H.(2011)。《水晶学报》。E类671926年科学网 CSD公司 交叉参考 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Brandenburg,K.和Putz,H.(2012)。钻石Crystal Impact GbR,德国波恩。 谷歌学者
第一次引用布鲁克(2016)。4月3日,SADABS公司圣保罗.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊谷歌学者
第一次引用Intori,C.、Fallacara,A.L.、Radi,M.、Zamperini,C.、Dreassi,E.、Crespan,E.、Maga,G.、Schenone,S.、Musumeci,F.和Brullo,C.(2015)。医学化学杂志。 58, 347–361. 科学网 公共医学 谷歌学者
第一次引用Rostamizadeh,S.、Nojavan,M.、Aryan,R.、Sadeghian,H.和Davoodnejad,M.(2013)。下巴。化学。莱特。 24, 629–632. 科学网 交叉参考 中国科学院 谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(2008)。《水晶学报》。A类64, 112–122. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(2015年).《水晶学报》。A类71, 3–8. 科学网 交叉参考 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(2015年b条).《水晶学报》。C类71, 3–8. 科学网 交叉参考 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Trivedi,A.R.,Dholariya,B.H.,Vakhariya,C.P.,Dodiya,D.K.,Ram,H.K.,Kataria,V.B.,Siddiqui,A.B.&Shah,V.H.(2012)。医药化学。物件。 21, 1887–1891. 科学网 交叉参考 中国科学院 谷歌学者

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