3-(4-Chloro­but­yl)-3H-indole-5-carbo­nitrile. Corrigendum

Manikandan, D.; Gomathi, S.; Nirmalram, J.S.; Tagore, S.S.; Sethuraman, V.; Agim, J.; Butcher, R.

doi:10.1107/S2414314617011324

补遗和勘误表\（第5em段）

IUCrDATA公司

国际标准编号：2414-3146

第2卷| 第9部分| 2017年9月|x171132像素

https://doi.org/10.107/S2414314617011324

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3-（4-氯丁基）-3H（H）-吲哚-5-碳腈。勘误表

马尼坎丹德瓦库马尔,^一桑达拉穆西·戈马蒂,^一 Jeyaraman Selvaraj Nirmalram公司,^b条萨达西瓦姆·沙米拉·泰戈尔,^一维卢萨米·塞图拉曼,^一 ^* 约瑟夫·阿吉姆 ^c（c）和雷·布彻 ^c（c）

^一印度泰米尔纳德邦Thanjavur 613 403，Periyar Maniamai大学化学系，^b条印度泰米尔纳德邦Thanjavur 613 403，PRIST大学研究与发展中心^c（c）无机与结构化学，霍华德大学，华盛顿特区，20059，美国
^*通信电子邮件：lvsethu13@gmail.com

澳大利亚格里菲斯大学P.C.Healy编辑(2017年7月24日收到； 2017年8月1日接受；在线2017年9月29日)

Manikandan的论文等。[IUCr数据（2017年）。2，x170376]，结构溶液中缺少吲哚N上的质子。现在添加质子并在此处报告变化。标题、方案、图1和2修正了氢键合表、晶体数据表和超分子结构描述。

图1
（I）的非对称单位，用50%概率位移椭球表示。

图2
二维超分子薄片综述通过N-H……N和弱分子间C-H……Cl氢键，芳香族π–π和弱C-Hπ相互作用。[对称代码：（i）1−x个, − $[{1\超过2}]$ + 年, $[{1\超过2}]$ − z（z）; （ii）−x个, 1 − 年, 1 − z（z）; （iii）1−x个, 1 − 年, 1 − z（z）; （iv）x个, $[{3\超过2}]$ − 年, − $[{1\超过2}]$ + z（z）; （v）x个, 1 + 年,z（z）.]

CCDC参考：1573008-1573009;1573008;1573009

结构描述

Manikandan的论文等。(2017 )，吲哚N原子上的质子在结构溶液中丢失。添加了质子，并在此处报告了变化。化合物的名称和化学名称应为“3-（4-氯丁基）-1H（H）-吲哚-5-碳腈'。

吲哚硝基（N1）上的质子与对称相关的相邻分子形成N-H…N氢键，并形成一个R（右）_三^三（23）环形图案，而不是带有C类（9）图形集。

图2的图形说明更新了氢键合表和晶体学数据表。在结构描述部分，句子“在晶体中，相邻分子通过弱C-H…Cl相互作用自组装”（表1)形成之字形超分子C类（9）沿着b条-轴方向，如图2所示一”应替换为“在晶体中，相邻分子通过N-H…N和弱C-H…Cl相互作用自组装”（表1)，导致R（右）_三^三（23）环基序，形成沿b条轴，如图2所示一表2中给出了修改后的实验细节.

表1
氢键几何形状（λ，°）

D类-H月A类	D类-H（H）	H月A类	D类·A类	D类-H月A类
N1-H1和N2^我	0.787 (19)	2.263（19）	3.039（2）	168.7 (19)
C4-H4乙二醇^ii（ii）	0.95	2.80	3.7497 (18)	178
对称代码：（i）x个,年+1,z（z）; （ii） $[-x+1，y-{\script{1\over2}}，-z+{\script}1\over 2}}]$ .

表2
更新实验细节

水晶数据
化学配方	C类₁₃H（H）₁₃氯化铵₂
M（M）_第页	232.70

精炼
R（右）[F类²> 2σ(F类²)],水风险(F类²),S公司	0.034, 0.097, 1.05
参数数量	149
氢原子处理	通过独立和约束精化的混合物处理的H原子
Δρ_最大值,Δρ_最小值（eó）⁻³)	0.29, −0.24

支持信息

CCDC参考：1573008-1573009;1573008;1573009

晶体结构：包含全局数据块，shelx。内政部：https://doi.org/10.107/S2414314617011324/hg9020sup1.cif

结构因素：包含数据块搁置。内政部：https://doi.org/10.107/S2414314617011324/hg9020sup1.hkl

checkCIF报告

计算详细信息顶部

数据收集：4月2日（布鲁克，2008）；细胞精细化： 圣保罗（布鲁克，2008）；数据缩减：圣保罗（布鲁克，2008）；用于求解结构的程序：SHELXL97型（谢尔德里克，2008）；用于优化结构的程序：SHELXL97型（谢尔德里克，2008）；分子图形：铂（斯佩克，2009），水银（麦克雷等。（2008）和POVRay（Cason，2004）；用于准备出版材料的软件：铂（斯佩克，2009）和公共CIF（Westrip，2010）。

3-（4-氯丁基）-1H（H）-吲哚-5-碳腈顶部

水晶数据顶部

C类₁₃H（H）₁₃氯化铵₂	F类(000) = 488
M（M）_第页= 232.70	D类_x个=1.317毫克/米⁻^三
单诊所，对2₁/c（c）	钼K（K）α辐射，λ= 0.71073 Å
大厅符号：-P 2ybc	1952年反射的细胞参数
一= 8.870 (2) Å	θ= 2.6–24.6°
b条= 9.271 (2) Å	µ=0.30毫米⁻¹
c（c）= 14.498 (3) Å	T型=100 K
β= 100.236 (4)°	块，无色
V（V）= 1173.3 (4) Å^三	0.18×0.17×0.15毫米
Z轴= 4

数据收集顶部

布鲁克APEXII 衍射仪	1632次反射我> 2σ(我)
探测器分辨率：18.4像素mm^-1	R（右）_整数= 0.039
ω扫描	θ_最大值= 24.6°,θ_最小值= 2.6°
吸收校正：多扫描（SADABS；谢尔德里克，2008）	小时=−10→10
T型_最小值= 0.618,T型_最大值= 0.745	k个=−10→10
7342测量反射	我=−17→16
1952年独立反射

精炼顶部

优化于F类²	0个约束
最小二乘矩阵：完整	氢站点位置：混合
R（右）[F类²> 2σ(F类²)] = 0.034	用独立和约束精化的混合物处理H原子
水风险(F类²) = 0.097	w个= 1/[Σ²(F类O（运行）²) + (0.0615对)²+ 0.1055对] 哪里对=(F类O（运行）²+2个F类C类²)/3
S公司= 1.05	(Δ/σ)_最大值< 0.001
1952次反射	Δρ_最大值=0.29埃⁻^三
149个参数	Δρ_最小值=−0.24埃⁻^三

特殊细节顶部

几何图形键距离、角度等已使用四舍五入分数坐标计算。所有su都是根据（完全）方差-方差矩阵的方差估计的。在估计距离、角度和扭转角时考虑了单元esd

精炼.F的细化²用于所有反射，但用户标记为潜在系统错误的反射除外。加权R系数wR和所有拟合优度S均基于F²，传统的R系数R基于F，对于负F，F设置为零²F的观测准则²>2西格玛（F²)仅用于计算-R因子obs等，与用于细化的反射的选择无关。基于F的R因子²在统计上大约是基于F的因子的两倍，并且基于ALL数据的R因子将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数²) 顶部

	x个	年	z（z）	U型_{国际标准化组织}*/U型_等式
第1类	0.64036 (6)	0.62781 (5)	0.10556 (3)	0.0373 (2)
N1型	0.17181 (16)	0.77684 (15)	0.56118 (10)	0.0202 (4)
氮气	0.10999 (16)	0.07038（15）	0.64000 (9)	0.0248 (5)
指挥与控制	0.24682 (17)	0.77009 (16)	0.48566 (10)	0.0193（5）
C3类	0.27344 (17)	0.62953 (17)	0.46452 (11)	0.0177 (5)
补体第四成份	0.19953 (17)	0.39623 (17)	0.54478 (10)	0.0160 (5)
C5级	0.12918 (17)	0.34723 (16)	0.61736 (10)	0.0170 (5)
C6级	0.07019 (17)	0.44431 (16)	0.67723 (10)	0.0180 (5)
抄送7	0.07908 (18)	0.59143 (17)	0.66461 (11)	0.0190 (5)
抄送8	0.14877 (17)	0.64002（16）	0.59099（11）	0.0175 (5)
C9级	0.21099 (16)	0.54435 (17)	0.53130 (10)	0.0154 (4)
C10号机组	0.11661 (17)	0.19387 (17)	0.63039 (11)	0.0187 (5)
C11号机组	0.34895 (17)	0.56971（18）	0.38827 (10)	0.0185 (5)
第12项	0.40919 (18)	0.68138 (17)	0.32640 (11)	0.0200 (5)
第13页	0.48445 (18)	0.60781 (16)	0.25127 (10)	0.0189 (5)
第14项	0.54689 (19)	0.71647 (17)	0.19063 (11)	0.0212 (5)
上半年	0.147（2）	0.847 (2)	0.5852 (15)	0.033 (6)*
氢气	0.27584	0.85143	0.45299	0.0230*
H4型	0.23903	0.32991	0.50516	0.0190*
H6型	0.02389	0.40786	0.72672	0.0220*
H7型	0.03936	0.65728	0.70443	0.0230*
H11A型	0.27441	0.50716	0.34779	0.0220*
H11B型	0.43558	0.50800	0.41731	0.0220*
H12A型	0.32349	0.74283	0.29573	0.0240*
H12B型	0.48506	0.74413	0.36573	0.0240*
H13A型	0.40795	0.54624	0.21146	0.0230*
H13B型	0.56878	0.54494	0.28208	0.0230*
H14A型	0.46214	0.77713	0.15787	0.0250个*
H14B型	0.62099	0.78019	0.23049	0.0250*

原子位移参数（²) 顶部

	U型¹¹	U型²²	U型³³	U型¹²	U型¹³	U型²³
第1类	0.0598 (4)	0.0245（3）	0.0364 (3)	0.0068 (2)	0.0329 (2)	0.0054 (2)
N1型	0.0273（8）	0.0099 (7)	0.0255 (7)	0.0006 (6)	0.0108 (6)	−0.0031 (6)
氮气	0.0349 (8)	0.0165 (8)	0.0256 (8)	0.0013 (6)	0.0125 (6)	0.0011 (6)
指挥与控制	0.0227 (8)	0.0148 (8)	0.0217 (8)	−0.0020 (6)	0.0077 (7)	0.0029 (6)
C3类	0.0163 (8)	0.0183 (9)	0.0191 (8)	−0.0002 (6)	0.0046 (6)	0.0012 (6)
补体第四成份	0.0172 (8)	0.0146 (8)	0.0169 (8)	0.0019 (6)	0.0049 (6)	−0.0018 (6)
C5级	0.0191 (8)	0.0136 (8)	0.0182 (8)	0.0003 (6)	0.0032（6）	−0.0002 (6)
C6级	0.0198 (8)	0.0184 (8)	0.0178（8）	−0.0011 (7)	0.0085（6）	0.0012（6）
抄送7	0.0221 (8)	0.0156 (8)	0.0210 (8)	0.0012 (7)	0.0082 (7)	−0.0029 (6)
抄送8	0.0177 (8)	0.0145 (9)	0.0202 (8)	0.0007 (6)	0.0035（6）	−0.0008 (6)
C9级	0.0150 (8)	0.0155 (8)	0.0161 (7)	0.0001 (6)	0.0040 (6)	−0.0002 (6)
C10号机组	0.0203 (8)	0.0191 (9)	0.0184 (8)	0.0019 (7)	0.0079 (7)	0.0000（7）
C11号机组	0.0207 (9)	0.0166 (8)	0.0194 (8)	0.0004 (6)	0.0066 (7)	0.0020 (6)
第12项	0.0224 (9)	0.0177 (8)	0.0211 (8)	0.0006 (7)	0.0072 (7)	0.0025 (7)
第13页	0.0234 (9)	0.0159 (8)	0.0185 (8)	−0.0007 (7)	0.0066 (7)	0.0005 (6)
第14项	0.0278 (9)	0.0171 (8)	0.0214 (8)	0.0007 (7)	0.0114 (7)	−0.0001 (7)

几何参数（λ，º）顶部

氯-1-C14	1.8021 (17)	C11-C12号机组	1.527 (2)
N1-C2型	1.380 (2)	C12-C13型	1.535 (2)
N1-C8型	1.367 (2)	C13至C14	1.506 (2)
N2-C10气体	1.156 (2)	C2-H2型	0.9500
N1-H1型	0.787（19）	C4-H4型	0.9500
C2-C3型	1.369 (2)	C6-H6型	0.9500
C3-C9型	1.435 (2)	C7-H7型	0.9500
C3-C11型	1.497 (2)	C11-H11A型	0.9900
C4至C9	1.393 (2)	C11-H11B	0.9900
C4-C5型	1.392 (2)	C12-H12A型	0.9900
C5至C6	1.414 (2)	C12-H12B型	0.9900
C5至C10	1.441 (2)	C13-H13A型	0.9900
C6至C7	1.380 (2)	C13-H13B型	0.9900
C7-C8号机组	1.400 (2)	C14-H14A型	0.9900
C8-C9型	1.418 (2)	C14-H14B型	0.9900

C2-N1-C8型	109.21 (13)	C5-C4-H4	121
C8-N1-H1型	123.9 (14)	C9-C4-H4	121
C2-N1-H1型	126.9 (14)	C5-C6-H6	120
N1-C2-C3型	110.34 (13)	C7-C6-H6型	120
C2-C3-C11型	129.47 (14)	C6-C7-H7型	121
C2-C3-C9型	105.68 (13)	C8-C7-H7型	121
C9-C3-C11	124.85（14）	C3-C11-H11A型	108
C5-C4-C9	118.78 (14)	C3-C11-H11B型	108
C4-C5-C6	121.40 (14)	C12-C11-H11A型	108
C6-C5-C10型	120.12 (13)	C12-C11-H11B型	108
C4-C5-C10型	118.47 (14)	H11A-C11-H11B型	107
C5-C6-C7	120.77 (14)	C11-C12-H12A型	109
C6-C7-C8型	117.55 (14)	C11-C12-H12B型	109
N1-C8-C7型	130.61 (14)	C13-C12-H12A型	109
N1-C8-C9型	106.93 (13)	C13-C12-H12B型	109
C7-C8-C9	122.46 (14)	H12A-C12-H12B型	108
C3-C9-C4型	133.13 (14)	C12-C13-H13A型	109
C4-C9-C8型	119.01 (13)	C12-C13-H13B	109
C3至C9至C8	107.84 (13)	C14-C13-H13A型	109
N2-C10-C5型	178.25 (17)	C14-C13-H13B型	109
C3-C11-C12型	115.58 (14)	H13A-C13-H13B型	108
C11-C12-C13型	110.93（13）	Cl1-C14-H14A	109
C12-C13-C14型	111.62 (13)	Cl1-C14-H14B	109
氯1-C14-C13	110.86 (11)	C13-C14-H14A型	109
N1-C2-H2型	125	C13-C14-H14B	109
C3-C2-H2	125	H14A-C14-H14B	108

C8-N1-C2-C3	0.28 (18)	C5-C4-C9-C8	−0.9 (2)
C2-N1-C8-C7	179.69 (16)	C4-C5-C6-C7型	0.8 (2)
C2-N1-C8-C9	−0.39 (17)	C10-C5-C6-C7	−178.90 (14)
N1-C2-C3-C9	−0.05 (18)	C5-C6-C7-C8	−0.2 (2)
N1-C2-C3-C11	179.18 (15)	C6-C7-C8-N1	179.00（16）
C2-C3-C9-C4	178.35 (16)	C6-C7-C8-C9	−0.9 (2)
C2-C3-C9-C8	−0.19 (17)	N1-C8-C9-C3	0.35 (17)
C11-C3-C9-C4	−0.9 (3)	N1-C8-C9-C4	−178.43 (14)
C11-C3-C9-C8	−179.47（14）	C7-C8-C9-C3	−179.72（14）
C2-C3-C11-C12型	1.8 (2)	C7-C8-C9-C4	1.5 (2)
C9-C3-C11-C12	−179.05 (14)	C3-C11-C12-C13	179.79 (13)
C9-C4-C5-C6	−0.2 (2)	C11-C12-C13-C14	−179.04 (13)
C9-C4-C5-C10	179.49 (14)	C12-C13-C14-Cl1	178.05 (11)
C5-C4-C9-C3	−179.31 (16)

氢键几何形状（λ，º）顶部

D类-H（H）···A类	D类-H（H）	H（H）···A类	D类···A类	D类-H（H）···A类
N1-H1··N2^我	0.787 (19)	2.263 (19)	3.039 (2)	168.7 (19)
C4-H4··Cl1^ii（ii）	0.95	2.80	3.7497 (18)	178

对称代码：（i）x个,年+1,z（z）; （ii）−x个+1,年−1/2,−z（z）+1/2.

参考文献

Manikandan，D.、Gomathi，S.、Nirmalram，J.S.、Tagore，S.S.，Sethuraman，V.、Agim，J.和Butcher，R.J.（2017）。IUCr数据,2，x170376谷歌学者

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