有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标IUCrDATA公司
国际标准编号:2414-3146

第三种-丁基(2S公司,3R(右),4R(右))-7′-溴-4-甲基-2′,5-二氧代-4,5-二氢-3H(H)-螺氨酸[呋喃-2,3′-吲哚啉]-3-羧酸盐

十字标记_颜色_方形_文本.svg

浙江工业大学绿色化学合成技术国家重点实验室培育基地,杭州310014
*通信电子邮件:xiaaibao@zjut.edu.cn

编辑:D.J.Xu,浙江大学(玉泉校区),中国(2017年3月7日收到; 2017年3月14日接受; 2017年3月24日在线)

在标题化合物中,C17H(H)18溴化氮5,呋喃环有一个包络构象以羧酸取代的C原子为瓣。平面吲哚环与呋喃环的平均平面倾斜87.5(2)°。在晶体中,分子通过N-H…O和C-H…O氢键连接,形成沿-轴方向。

三维视图(正在加载…)
【方案3D1】
化学方案
【方案一】

结构描述

螺环类兴奋剂是许多生物活性分子和天然产物中的重要结构(Cui等。, 1996[Cui,C.B.,Kakeya,H.&Osada,H.J.(1996).四面体,52,12651-12666.]). 这些化合物的关键结构特征是螺环融合在兴都尔核(Cerisoli)的3个位置等。, 2016【Cerisoli,L.,Lombardo,M.,Trombini,C.&Quintavalla,A.(2016),《欧洲化学杂志》22,3865-3872.】)周围有不同程度的替代(Trost和Brennan,2009【Trost,B.M.和Brennan,M.K.(2009),综合,第3003-3025页。】; 等。,2013年[王,Q.-L.,彭,L.,王,F.-Y.,张,M.-L.,贾,L.-N.,田,F.,徐,X.-Y.&王,L.-X.(2013).化学通讯.49,9422-9424.]; 莫拿里等。, 2015【Monari,M.,Montroni,E.,Nitti,A.,Lombardo,M..,Trombini,C.&Quintavalla,A.(2015),《欧洲化学杂志》21,11038-11049。】). 然而,合成具有螺四元中心和多个手性中心的手性螺环吲哚是一个挑战。因此,开发简单、立体选择性高的合成螺环酮的方法仍是化学家的一个重要研究方向。标题化合物很容易通过丙醛和亚甲基吲哚酮的有机催化Michael反应合成,随后H2O(运行)2/K(K)2一氧化碳系统介导的α-油水两相条件下的羟基化/半缩醛级联反应及最终氧化γ-内酯化。

在标题化合物中,图1[链接],呋喃环(O2/C7/C9–C11)具有包络构象以C9原子为瓣。吲哚环(N1/C1–C8)向呋喃环的平均平面倾斜87.5(2)°。在晶体中,分子通过N-H…O和C-H…O氢键连接,形成沿-轴线方向(表1[链接]和图2[链接]).

表1
氢键几何形状(λ,°)

D类-H月A类 D类-H(H) H月A类 D类A类 D类-H月A类
N1-H1和O4 0.86 2.15 2.944 (4) 154
C12-H12型A类2010年1月ii(ii) 0.96 2.59 3.415 (6) 144
对称代码:(i)x个-1,,z(z); (ii)x个+1,,z(z).
[图1]
图1
标题化合物的结构。位移椭球是在50%的概率水平上绘制的。
[图2]
图2
标题化合物的晶体堆积显示出链状结构。氢键被画成虚线。

合成和结晶

对于手性催化剂的溶液(S公司)-2-{二苯基[(三甲基硅基)氧基]甲基}吡咯烷(1.62毫克)、碳氧基苯(1.22毫克)和第三种-丁基(E类)-引入存于0.5 ml乙腈和丙醛(20.0µl)中的2-(7-溴-2-氧吲哚-3-亚乙基)醋酸盐(64.8 mg)通过注射器。在室温下搅拌混合物。反应完成后(由TLC监测),在真空和K下去除溶剂2一氧化碳(1当量),[EtOAc(1 ml)和H2O(0.1毫升)],H2O(运行)2添加(4当量),并在室温下反应4小时。反应完成后,用EtOAc(3×5 ml)萃取混合物,用水冲洗,干燥并浓缩。将残渣和PCC(氯铬酸吡啶,2.0当量)置于干燥DCM(2 ml)中,在室温下搅拌16 h,然后用EtOAc(10 ml)稀释。对混合物进行过滤,滤液在真空下浓缩,残渣通过闪蒸净化色谱法石油醚/乙酸乙酯4:1硅胶洗脱(v(v)/v(v))形成白色固体。通过在石油醚/乙醚5:1中缓慢蒸发溶液获得单晶(v(v)/v(v)).

精炼

晶体数据、数据采集和结构精炼表2总结了详细信息[链接].

表2
实验细节

水晶数据
化学配方 C类17H(H)18溴化氮5
M(M)第页 396.23
晶体系统,空间组 正交各向异性,P(P)212121
温度(K) 296
,b条,c(c)(Å) 7.7040 (18), 9.325 (2), 25.540 (6)
V(V)) 1834.8 (7)
Z轴 4
辐射类型 K(K)α
μ(毫米−1) 2.27
晶体尺寸(mm) 0.2 × 0.18 × 0.15
 
数据收集
衍射仪 布鲁克APEXII CCD
吸收校正 多扫描(SADABS公司; 布鲁克,2009年[Bruker(2009).APEX2,SADABS和SAINT.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊])
T型最小值,T型最大值 0.623, 0.746
测量、独立和观察的数量[> 2σ()]反射 15033、4233、2395
R(右)整数 0.053
(罪θ/λ)最大值−1) 0.651
 
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司 0.042、0.098、1.00
反射次数 4233
参数数量 221
氢原子处理 受约束的氢原子参数
Δρ最大值,Δρ最小值(eó)−3) 0.31, −0.41
绝对结构 Flack公司x个使用776个商确定[(+)−(负极)]/[(+)+(负极)](帕森斯等。(2013【Parsons,S.、Flack,H.D.和Wagner,T.(2013),《水晶学报》B69、249-259。】)
绝对结构参数 0.045 (8)
计算机程序:4月2日圣保罗(布鲁克,2009年[Bruker(2009).APEX2、SAABS和SAINT.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊市]),SHELXT公司(谢尔德里克,2015年【谢尔德里克·G·M(Sheldrick,G.M.)(2015a),《结晶学报》A71,3-8。】),SHELXL2016表(谢尔德里克,2015年b条[Sheldrick,G.M.(2015b),《结晶学报》,C71,3-8。])和有机发光二极管2(多洛曼诺夫等。, 2009[Dolomanov,O.V.,Bourhis,L.J.,Gildea,R.J.,Howard,J.A.K.和Puschmann,H.(2009),《应用晶体》杂志,第42333-341页。]).

结构数据


计算详细信息顶部

数据收集:4月2日(布鲁克,2009);细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,2009);数据缩减:圣保罗(布鲁克,2009);用于求解结构的程序:SHELXT(Sheldrick,2015a);用于优化结构的程序:SHELXL2016表(谢尔德里克,2015b);分子图形:有机发光二极管2(多洛曼诺夫等。, 2009); 用于准备出版材料的软件:有机发光二极管2(多洛曼诺夫等。, 2009).

第三种-丁基(2S公司,3R(右),4R(右))-7'-溴-4-甲基-2'-二氧代-4,5-二氢-3H(H)-螺[furan-2,3'-吲哚]-3-羧酸盐顶部
水晶数据 顶部
C类17H(H)18溴化氮5D类x个=1.434毫克负极
M(M)第页= 396.23K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
正交各向异性,P(P)2121212454次反射的单元参数
= 7.7040 (18) Åθ= 2.7–21.2°
b条= 9.325 (2) ŵ=2.27毫米负极1
c(c)= 25.540 (6) ÅT型=296千
V(V)= 1834.8 (7) Å块状,无色
Z轴= 40.2×0.18×0.15毫米
F类(000) = 808
数据收集 顶部
布鲁克APEXII CCD
衍射仪
2395次反射> 2σ()
石墨单色仪R(右)整数= 0.053
φω扫描θ最大值= 27.6°,θ最小值= 2.3°
吸收校正:多扫描
(SADABS;布鲁克,2009)
小时=负极810
T型最小值= 0.623,T型最大值= 0.746k个=负极1212
15033测量反射=负极3033
4233个独立反射
精炼 顶部
优化于F类2氢站点位置:从邻近站点推断
最小二乘矩阵:完整受约束的氢原子参数
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.042 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0197P(P))2+ 0.3907P(P)]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
水风险(F类2) = 0.098(Δ/σ)最大值= 0.005
S公司= 1.00Δρ最大值=0.31埃负极
4233次反射Δρ最小值=负极0.41埃负极
221个参数绝对结构:Flackx个使用776个商确定[(+)-(-)]/[(+)+(-)](帕森斯等。(2013)
0个约束绝对结构参数:0.045(8)
主原子位置:双
特殊细节 顶部

几何图形使用全协方差矩阵估计所有esd(除了两个l.s.平面之间二面角的esd)。在估计距离、角度和扭转角的esd时,单独考虑单元esd;细胞参数中esd之间的相关性仅在由晶体对称性定义时使用。细胞esd的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的esd。

精炼将H原子放置在计算位置,并在骑行模式下对芳基、亚甲基和甲基H原子的C-H距离进行细化,C-H距离分别为0.93、0.97和0.98º;U型国际标准化组织(H) =1.2U型等式载流子原子。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
溴10.15873 (10)0.22044 (8)0.38775(3)0.1040 (3)
O1公司0.3158 (4)0.7880(4)0.37124 (14)0.0668 (10)
氧气0.5385 (4)0.7426 (3)0.46266 (11)0.0491 (8)
臭氧0.6907 (5)0.9121 (4)0.50236 (13)0.0632 (9)
O4号机组0.9313 (4)0.5704 (4)0.35412 (15)0.0710 (11)
O5公司0.6721 (4)0.5706 (4)0.31393 (12)0.0589 (9)
1个0.2987 (4)0.5445(4)0.38441 (15)0.0456 (9)
上半年0.2003540.5277000.3697010.055*
C1类0.3996 (5)0.4405 (5)0.40811 (16)0.0403 (11)
指挥与控制0.3682 (7)0.2968 (5)0.41343 (19)0.0555(13)
C3类0.4891 (8)0.2103 (6)0.4385(2)0.0669 (15)
H3级0.4679950.1127170.4425480.080*
补体第四成份0.6398 (8)0.2692 (6)0.4573 (2)0.0665 (14)
H4型0.7217800.2105570.4733090.080*
C5级0.6716 (7)0.4152 (5)0.45275 (18)0.0541 (12)
H5型0.7731230.4548720.4661100.065*
C6级0.5513 (5)0.4998 (5)0.42830 (17)0.0393 (10)
抄送70.5467 (5)0.6563 (5)0.41609 (17)0.0390 (10)
抄送80.3726 (5)0.6752 (5)0.38708 (19)0.0438 (10)
C9级0.7002 (5)0.7210(4)0.38479 (17)0.0404 (9)
H9型0.6547550.7983530.3627110.049*
C10号机组0.8135 (5)0.7878 (5)0.42684 (17)0.0445 (10)
H10型0.8915960.7141530.4407590.053*
C11号机组0.6835 (6)0.8254 (5)0.46789 (18)0.0448 (11)
第12项0.9204 (7)0.9154 (6)0.4098 (2)0.0705 (16)
H12A小时1.0039190.8854780.3841450.106*
H12B型0.9795830.9549260.4395600.106*
H12C型0.8455090.9868240.3948790.106美元*
第13条0.7859 (6)0.6122 (5)0.34975(19)0.0468 (12)
第14项0.7091 (8)0.4580 (7)0.2748 (2)0.0746 (17)
第15项0.5424 (9)0.4487 (10)0.2447 (3)0.148 (4)
H15A型0.4476120.4357860.2686900.223*
H15B型0.5472880.3687610.2211000.223*
第15页0.5254430.5355270.2252120.223*
第16号0.7422 (9)0.3181 (8)0.3026 (3)0.101 (2)
H16A型0.8446400.3266570.3238330.151美元*
H16B型0.7584730.2432140.2773160.151*
H16C型0.6447200.2953650.3245140.151*
第17页0.8646 (12)0.5021 (10)0.2419 (3)0.150 (4)
H17A型0.8385990.5894840.2236050.225*
H17B型0.8902770.4278930.2169850.225美元*
H17C型0.9632180.5167520.2642170.225*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
溴10.0990 (5)0.0819 (4)0.1311 (6)负极0.0540 (4)负极0.0142 (5)负极0.0005 (5)
O1公司0.0514 (19)0.056 (2)0.093(3)0.0064 (18)负极0.0066 (19)0.011(2)
氧气0.0485 (17)0.052 (2)0.0472 (18)负极0.0080 (16)0.0063 (15)负极0.0150 (16)
臭氧0.067 (2)0.060 (2)0.063 (2)负极0.0021 (19)负极0.0095 (19)负极0.0219 (19)
O4号机组0.037 (2)0.086 (3)0.090 (3)负极0.0005 (19)负极0.0036 (18)负极0.031 (2)
O5公司0.0500 (18)0.081(2)0.0455 (19)0.004 (2)负极0.0080 (17)负极0.0234 (17)
1个0.0298 (18)0.051 (2)0.056 (2)负极0.0074 (16)负极0.0081 (19)负极0.005 (2)
C1类0.040 (2)0.040 (2)0.041 (3)负极0.004(2)0.008 (2)0.000 (2)
指挥与控制0.062(3)0.045 (3)0.060 (3)负极0.017 (3)0.012 (3)负极0.001 (2)
C3类0.088 (4)0.046 (3)0.067 (4)0.001 (3)0.017 (3)0.011 (3)
补体第四成份0.072 (4)0.063 (4)0.065 (3)0.016 (3)0.006 (3)0.015 (3)
C5级0.052 (3)0.055 (3)0.055 (3)0.005(3)0.000 (3)0.002 (2)
C6级0.033 (2)0.044 (3)0.040 (3)负极0.002 (2)0.003 (2)负极0.002 (2)
抄送70.034(2)0.044 (3)0.039 (3)负极0.0039 (19)0.002 (2)负极0.010 (2)
抄送80.033(2)0.049 (2)0.050 (3)负极0.0010(19)0.000 (2)0.000 (3)
C9级0.035 (2)0.045 (2)0.041 (2)负极0.0041 (19)负极0.001 (2)负极0.002 (2)
C10号机组0.036 (2)0.043 (2)0.055 (3)负极0.007 (2)负极0.005 (2)负极0.005 (2)
C11号机组0.046 (3)0.045 (3)0.043 (3)负极0.003 (2)负极0.010 (2)负极0.001(2)
第12项0.058 (3)0.068 (4)0.085 (4)负极0.024 (3)0.003 (3)负极0.007 (3)
第13条0.037 (3)0.059 (3)0.044 (3)负极0.012 (2)0.004 (2)负极0.001 (2)
第14项0.082 (4)0.091(5)0.051 (3)0.000 (4)0.006(3)负极0.029 (3)
第15项0.127 (6)0.192 (9)0.125 (7)0.047 (7)负极0.081 (6)负极0.092 (7)
第16号0.090 (5)0.096 (6)0.116 (5)负极0.007 (4)0.003 (4)负极0.046 (5)
第17页0.182 (8)0.187 (9)0.081 (5)负极0.037 (8)0.068 (6)负极0.049(6)
几何参数(λ,º) 顶部
溴-1-C21.882 (5)C7-C91.550 (6)
O1-C8型1.209 (5)C9-H90.9800
氧气-C71.438 (5)C9-C10型1.518 (6)
氧气-C111.364 (5)C9-C13型1.506 (6)
臭氧层至C111.196 (5)C10-H10型0.9800
4至131.191 (5)C10-C11号机组1.492 (7)
O5-C13型1.325 (5)C10-C12号机组1.511 (6)
O5-C14型1.478 (6)C12-H12A型0.9600
N1-H1型0.8600C12-H12B型0.9600
N1-C1型1.382 (5)C12-H12C型0.9600
N1-C8型1.347 (5)C14-C15号1.498 (8)
C1-C2型1.369 (6)C14-C16型1.508 (10)
C1-C6号机组1.392 (6)C14-C17号1.520 (9)
C2-C3型1.389 (7)C15-H15A型0.9600
C3-H3型0.9300C15-H15B型0.9600
C3-C4型1.371 (7)十五碳十五烯酸0.9600
C4-H4型0.9300C16-H16A0.9600
C4-C5型1.388 (7)C16-H16B型0.9600
C5-H5型0.9300C16-H16C型0.9600
C5至C61.368 (6)C17-H17A型0.9600
C6至C71.493 (6)C17-H17B型0.9600
C7-C8号机组1.543 (6)C17-H17C型0.9600
C11-O2-C7111.2 (3)C11-C10-H10108.8
C13-O5-C14型123.2 (4)C11-C10-C12号机组112.6 (4)
C1-N1-H1124C12-C10-C9型115.6 (4)
C8-N1-H1型124C12-C10-H10型108.8
C8-N1-C1112.0 (3)氧气-C11-C10110.4(4)
N1-C1-C6110.9 (4)O3-C11-O2119.5 (4)
C2-C1-N1型129.1 (4)臭氧-C11-C10130.2 (4)
C2-C1-C6型120.0 (4)C10-C12-H12A型109.5
C1-C2-Br1型119.2 (4)C10-C12-H12B型109.5
C1-C2-C3119.7 (5)C10-C12-H12C型109.5
C3-C2-溴化物1121.1 (4)H12A-C12-H12B型109.5
C2-C3-H3型120.1H12A-C12-H12C型109.5
C4-C3-C2型119.8 (5)H12B-C12-H12C型109.5
C4-C3-H3型120.1O4-C13-O5型126.2 (5)
C3至C4119.6O4-C13-C9125.2(4)
C3-C4-C5型120.9 (5)O5-C13-C9型108.5 (4)
C5-C4-H4119.6O5-C14-C15型102.9 (5)
C4-C5-H5型120.5O5-C14-C16型109.1 (5)
C6-C5-C4119.0 (5)O5-C14-C17型109.5 (5)
C6-C5-H5型120.5C15-C14-C16109.6 (7)
C1-C6-C7型106.9(4)C15-C14-C17型114.1 (6)
C5-C6-C1120.6 (4)C16-C14-C17型111.2 (6)
C5-C6-C7132.5 (4)C14-C15-H15A型109.5
氧气-C7-C6112.1 (4)C14-C15-H15B109.5
O2-C7-C8型107.2 (3)C14-C15-H15C型109.5
O2-C7-C9104.0 (3)H15A-C15-H15B109.5
C6-C7-C8型103.5 (3)H15A-C15-H15C109.5
C6-C7-C9118.1 (4)H15B-C15-H15C型109.5
C8-C7-C9111.8 (3)C14-C16-H16A型109.5
O1-C8-N1型128.2 (4)C14-C16-H16B型109.5
O1-C8-C7型125.1 (4)C14-C16-H16C109.5
N1-C8-C7型106.8 (4)H16A-C16-H16B型109.5
C7-C9-H9号108.1H16A-C16-H16C型109.5
C10-C9-C7号机组103.5 (3)H16B-C16-H16C109.5
C10-C9-H9型108.1C14-C17-H17A型109.5
C13-C9-C7112.2 (3)C14-C17-H17B109.5
C13-C9-H9108.1C14-C17-H17C型109.5
C13-C9-C10型116.4 (4)H17A-C17-H17B型109.5
C9-C10-H10108.8H17A-C17-H17C型109.5
C11-C10-C9102.0 (3)H17B-C17-H17C型109.5
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
N1-H1··O40.862.152.944(4)154
对称代码:(i)x个负极1,,z(z).
 

资金筹措信息

本研究经费由浙江工业大学浙江化工与技术重点课程提供.

工具书类

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