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结构生物学热门文章(2020年春季)
这期虚拟刊物展示了由生物学委托编辑罗伯托·斯坦纳(Roberto Steiner)挑选的IUCr期刊上发表的一些最佳结构生物学文章。
封面插图:
涵盖结构生物学的IUCr期刊
.
《水晶学报》。
(2015).
D类
71
,
732-741
https://doi.org/10.107/S1399004715000978
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P-糖蛋白中配体进入、可塑性结合和诱导螺旋运动的快照
P.Szewczyk先生
,
H.陶
,
A.P.麦格拉斯
,
M.维拉卢兹
,
S.D.里斯
,
S.C.李
,
R.Doshi(多西)
,
I.L.Urbatsch公司
,
Q.张
和
G.Chang公司
P-糖蛋白与一系列工程配体的共晶体结构揭示了多种配体结合模式,在转运蛋白的外表面有一个配体结合位点,以及可能与ATP水解偶联的构象变化。
PDB参考
:
P-糖蛋白,4q9h
;
与QZ-Ala,4q9i共结晶
;
与QZ-Val共结晶,4q9j
;
与QZ-Leu共结晶,4q9k
;
与QZ-Phe,4q9l共结晶
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《水晶学报》。
(2015).
D类
71
,
1184-1196
https://doi.org/10.107/S1399004715004514
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使用微聚焦和纳米聚焦同步辐射束的光栅扫描串行蛋白质晶体学
科奎尔猪笼草
,
A.S.布鲁斯特
,
U.卡普
,
A.希洛瓦
,
B.魏恩豪森
,
M.Burghammer先生
和
J.-P.科利蒂尔
提出了一种光栅扫描串行蛋白质晶体学方法,其消耗低至200–700
沉淀晶体的nl。
新的串行数据预分析软件,
纳米峰细胞
,介绍了。
PDB参考
:
鸡蛋白溶菌酶,4wg1
;
4周7
;
第4轮第6轮
;
第4轮第7轮
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《水晶学报》。
(2016).
D类
72
,
93-112
https://doi.org/10.107/S2059798315021683
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中尺度原位
低温下可溶性和膜蛋白的连续X射线晶体学
C.-Y.黄
,
V.奥利埃里克
,
P.马
,
N.豪
,
L.沃格利
,
十、刘
,
R.Warshamanage公司
,
T.韦内特
,
E.帕内普奇
,
B.科比尔卡
,
K.Diederichs公司
,
王先生
和
M.Caffrey先生
一种实现高吞吐量的方法
就地
低温(100)下脂质立方相中可溶性和膜蛋白的连续X射线晶体学
K) 如所述。
它可以处理毫微克到一位数微克数量的蛋白质和脂质(以及存在的配体),并且与高分辨率本地数据采集和实验阶段相兼容,而无需进行晶体采集。
PDB参考
:
胰岛素-N,IMISX RT,5d52
;
IMISXcryo公司,5d53
;
环路,5d54
;
DgkA、IMISXcryo、5d56
;
回路,5d57
;
佩普
标准
,IMISX冷冻,5d58
;
环路,5d59
;
β
2
AR、IMISXcryo、5d5a
;
回路,5d5b
;
溶血素-N,IMISX冷冻,5d5c
;
藻类,IMISXcryo,5d5d
;
胰岛素-S,IMISXcryo,5d5e
;
lyso-Br,IMISX冷冻,5d5f
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《水晶学报》。
(2016).
D类
72
,
430-439
https://doi.org/10.107/S2059798316001078
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真空长波大分子晶体学
瓦格纳
,
R.杜曼
,
K·亨德森
和
V.米卡利克
本文介绍了金刚石光源上新型真空长波长MX光束线I23的动机和初步结果。
PDB参考
:
索姆丁,4zg3
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《水晶学报》。
(2015).
D类
71
,
387-397
https://doi.org/10.107/S1399004714026327
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使用缓慢流动的自立高粘度微流在同步辐射X射线源上的室温串行晶体学
S.博塔
,
K.Nass公司
,
T.R.M.巴伦兹
,
W.Kabsch公司
,
B.拉茨
,
F.德沃科夫斯基
,
L.福卡
,
E.帕内普奇
,
王先生
,
R.L.肖曼
,
一、施利钦
和
R.B.多克
在同步加速器源上演示了使用慢流的高通量室温串行晶体学。
数据质量足够好
从头开始
阶段化。
PDB参考
:
溶菌酶,4rlm
;
第4轮
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《水晶学报》。
(2015).
F类
71
,
3-18
https://doi.org/10.107/S2053230X14026843
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脂质立方相或
在中
膜和可溶性蛋白质及复合物的结晶方法
M.Caffrey先生
对脂质立方相或
在中
报道了膜和可溶性蛋白质及复合物的结晶方法。
该方法的最新应用
就地
描述了X射线自由电子激光器和同步加速器的串行结晶学。
阅读文章
《水晶学报》。
(2014).
F类
70
,
2-20
https://doi.org/10.1107/S20533230X13033141
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蛋白质结晶简介
A.麦弗逊
和
J.A.加维拉
X射线晶体学的大门是大分子晶体的生长。
本文试图使研究人员熟悉蛋白质结晶的原理和实践、一些最近的创新,并触及一些剩余的问题。
阅读文章
《水晶学报》。
(2016).
F类
72
,
72-95
https://doi.org/10.107/S2053230X15024619
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蛋白质稳定性:晶体学家的观点
M.C.Deller先生
,
L.Kong(香港)
和
B.卢比
了解蛋白质的稳定性对于优化蛋白质的表达、纯化和结晶至关重要。
在这篇综述中,讨论将集中于在某种实用水平上影响蛋白质稳定性的因素,特别是从蛋白质晶体仪的角度。
阅读文章
《水晶学报》。
(2014).
F类
70
,
1117-1126
https://doi.org/10.107/S2053230X14015507
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蛋白质结晶优化中的微种子基质筛选:我们学到了什么?
A.达西
,
T.Bergfors公司
,
S.W.考恩-雅各布
和
M.马什
微种子基质筛选在优化蛋白质结晶引线方面越来越成功。
阅读文章
《水晶学报》。
(2014).
F类
70
,
1445-1467
https://doi.org/10.107/S2053230X14019670
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生物大分子结晶条件的优化
A.麦弗逊
和
B.库德尼
综述了优化大分子晶体生长条件的策略和程序。
优化的目标是生长出最完美的晶体,并产生最准确和精确的X射线衍射数据。
阅读文章
IUCrJ大学
(2014)
1
,
204-212
https://doi.org/10.107/S2052252514010070
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同步辐射室温高分子系列晶体学
F.斯特拉托
,
D.Oberthür
,
梁先生
,
R.Bean公司
,
C.加蒂
,
O.叶凡诺夫
,
A.巴蒂
,
A.伯克哈特
,
P.菲舍尔
,
L.加利
,
R.A.基里安
,
J.梅耶
,
S.Panneerselvam公司
,
C.H.Yoon先生
,
F.切尔文斯基
,
E.拼写
,
T.A.白色
,
C.贝策尔
,
A.会面
和
H.N.查普曼
溶菌酶的室温结构是通过从液悬浮液中流过同步加速器微焦点光束线的微晶中获得的40000个衍射图样来确定的。
PDB参考
:
溶菌酶4o34连续晶体学
阅读文章
IUCrJ大学
(2014)
1
,
87-94
https://doi.org/10.107/S2052252513033939
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串行晶体学
体内
同步辐射生长微晶
C.加蒂
,
G.布伦科夫
,
M.克林格
,
D.再热器
,
F.斯特拉托
,
D.Oberthür
,
O.叶凡诺夫
,
B.P.Sommer先生
,
S.Mogk公司
,
M.Duszenko先生
,
C.贝策尔
,
T.R.施耐德
,
H.N.查普曼
和
L.重新设计
的结构解决方案
布氏锥虫
组织蛋白酶B来自80
体内
平均体积为9的生长晶体
微米
三
报道了在微焦点束线上通过串行同步辐射晶体学获得的结果。
PDB参考
:
组织蛋白酶B,4n4z
阅读文章
IUCrJ大学
(2015年)
2
,
168-176
https://doi.org/10.107/S2052252514026487
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同步辐射脂质立方相系列毫秒晶体学
P.诺格利
,
D.詹姆斯
,
D.王
,
T.A.怀特
,
N.扎茨平
,
A.希洛瓦
,
G.纳尔逊
,
H.刘
,
L.约翰逊
,
M.海曼
,
K.杰格
,
M.梅茨
,
C.威克斯特兰德
,
W.Wu先生
,
P.伯斯
,
P.伯恩森
,
D.奥伯瑟
,
V.Panneels公司
,
V.切列佐夫
,
H.查普曼
,
G.谢特勒
,
R.纽茨
,
史景迁
,
I.莫莱斯
,
M.Burghammer先生
,
J.斯坦弗斯
和
U.Weierstall公司
本文描述了通过将脂质立方相中的微晶连续注入同步加速器微焦点束来测定膜蛋白的结构。
讨论了在自由电子激光器上进行飞秒连续晶体学的方法。
PDB参考
:
细菌视紫红质使用SMX,4x31
;
细菌视紫红质的常规晶体学研究,4x32
阅读文章
IUCrJ大学
(2017)
4
,
322-339
https://doi.org/10.107/S2052252517005760
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用于生物结构和动力学的XFEL
J.C.H.斯宾塞
综述了X射线激光在生物学中获取结构和分子膜的应用。
方法包括单粒子成像、连续晶体学和室温下的快速溶液散射。
阅读文章
IUCrJ大学
(2015年)
2
,
464-474
https://doi.org/10.107/S2052252515011239
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亚原子分辨X射线晶体学和中子晶体学:前景、挑战和潜力
M.P.布莱克利
,
S.S.哈斯奈
和
S.V.Antonyuk公司
中子晶体学和亚原子X射线晶体学在确定大分子中的氢位置方面相辅相成。
虽然已经取得了重大进展,但如果中子晶体学要成为主流活动,还需要付出很大努力。
PDB参考
:
5千克
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