1.简介
四羧基二合二铵(II)[Rh2(RCOO)4]是由于Rh的稳定性而在生物和化学系统中具有特定应用的化合物24+核心,由“灯笼”结构中四个羧酸桥支撑的单个Rh-Rh键产生。熊组(Erck)最初报告了它们的抗肿瘤活性等。, 1974; 熊等。, 1975). 它们还起到催化剂的作用,特别是与手性配体R(右)促进对映选择性和化学选择性卡宾插入到C-H键中的反应,如环丙烷化和C-H功能化(Hansen&Davies,2008),或插入极性X(X)-H(H)(X(X)=S、N、O、,等。)债券(Miller&Moody,1995; 加西亚等。, 1996; 张等。, 2003). 涉及这类化合物的反应通常从亲核配体形成加合物开始L(左)(路易斯基)以单齿方式与轴向位置相协调,[Rh2(RCOO)4L(左)1–2](参见1如图1所示)(Chifotides和Dunbar,2005年). 例如,[Rh24+]-预计在上述催化插入反应的初始步骤中会形成碳水化合物(加西亚等。, 1996; 张等。, 2003). 虽然轴向配体不稳定且易于交换,但桥联羧酸基团在动力学上是惰性的(Bear等。, 1979),建议逐步进行替换。例如,(N/O)-供体配体与螯合物进行初始轴向配位后(例如双吡啶)和/或桥接能力(例如鸟嘌呤),下一步可能是形成轴赤道(ax–当量)最后等式–等式债券(吉村等。, 2003; 赤潮等。, 2004; 邓巴等。, 1994; Deubel&Chifotides,2007年). 有人建议,羧酸二碘的生物活性需要易于接近的轴向位置(Aguirre等。, 2007).
| 图1 [Rh的结构二2(AcO)4] (1),{纳2[罗三2(S公司-HA)4].7小时2O}(O)n个(即Rh(相对湿度)三–谷胱甘肽)(2),[Rh二2(AcO)2(bpy)2(瑞士三中国)2]2+(三),[Rh二(μ-S公司-C类6H(H)5S)(η1-S公司-C类6H(H)5S) (bpy)]2(4),[Rh三(η2-C类6H(H)7NS)(η1-C类6H(H)7NS)2(邻苯二甲酸)](5),[Rh三(μ-S、 N个-C类6H(H)6NS)(η1-S公司-C类6H(H)6NS)(bpy)]22+(第6页)和[Rh三(S、 N个-C类6H(H)6NS)2(桶/日)]+(6b条); 见正文,Enriquez Garcia&Jalilehvand(2018年),索拉塞尼等。(2002, 2003). |
四羧酸钕(II)与几乎所有常见的施主原子(包括硫)形成加合物(Chifotides&Dunbar,2005)). 而硫醇(-SH)功能群从生物和化学的角度来看都很重要硫醇含二价羧酸盐的硫醇盐是有限的。例如,这些信息将有助于阐明这类抗肿瘤活性化合物与含硫醇生物分子的反应,并促进了几项研究(Erck等。, 1976; 霍华德等。, 1976, 1977; 肺炎和银屑病,1980年; 贾基莫维奇等。, 2000; 索拉塞尼等。, 2002, 2003; Wong&Stillman,2016年; Wong(王)等。, 2017; 贾利勒赫瓦德等。, 2017; Enriquez Garcia&Jalilehvand,2018年).
这类化合物唯一报道的晶体结构是Rh的晶体结构2(AcO)4(1、AcO−=瑞士三首席运营官−)具有轴向配位的苄基硫醇或硫酚基团(Christoph&Tolbert,1980; 费尔豪斯,1982年). 使用来自不同技术的组合数据,如电喷雾电离质谱法(ESI-MS)和扩展X射线吸收精细结构(EXAFS)光谱,我们最近报道了Rh的需氧反应2(AcO)4含半胱氨酸(H2半胱氨酸)和谷胱甘肽(GSH;表示H三在生理pH条件下,在水介质中以三溴化形式存在的A会导致寡聚物{Na的形成2[罗三2(S、 N个-赛斯)4]·5小时2O}(O)米和{Na2[罗三2(S公司-HA)4]·7小时2O}(O)n个(即Rh(相对湿度)三–谷胱甘肽;2如图1所示),分别具有两个和三个硫醇基,桥接两个Rh(III)离子(Jalilehvand等。, 2017; Enriquez Garcia&Jalilehvand,2018年). 此外,在Rh之间反应的早期阶段2(AcO)4和青霉胺(3,3′-二甲基半胱氨酸)在混合pH值(~3.0)时,我们检测到对应于[Rh二2(AcO)4(HPen)]−,[Rh二2(AcO)4(钢笔)]2-和[Rh三2(AcO)4(HPen)2]2-离子,并对与N个-乙酰半胱氨酸(H2NAC)。因此,我们建议二脱质子硫醇基团需要将Rh(II)离子氧化为Rh(III)(Jalilehvand等。, 2017).
Wong(王)等。在另一项最近的研究中,基于ESI-MS和密度泛函理论(DFT)计算,提出当Rh2(AcO)4在厌氧条件下与水溶液中过量的谷胱甘肽反应,脱质子谷胱甘蛋白(GS−)绑定到Rh的轴向位置2(AcO)4形成[Rh二2(AcO)4(GS)(高2O) ]−和[Rh二2(AcO)4(通用)2]2−综合体(Wong等。, 2017). 他们还建议Rh2(AcO)4与反应时释放所有羧酸配体β-人金属硫蛋白结构域(β-MT)1a在厌氧条件下。根据作者的说法,金属化的Rh二2-β-MT保留了Rh-Rh键,“每个Rh替换四个半胱氨酸硫醇质子”,围绕氘核中的每个Rh(II)离子创建了方形金字塔配位几何(Wong&Stillman,2016)). 然而,索拉塞尼等。表明[Rh的厌氧反应二2(AcO)2(bpy)2(瑞士三中国)2](高炉4)2(三)(bpy=2,2′-联吡啶),含有过量的单齿配体苄基硫醇钠,NaC6H(H)5S、 导致形成二价铑(II)络合物[Rh二(μ-S公司-C类6H(H)5S)(η1-S公司-C类6H(H)5S) (bpy)]2·中国三俄亥俄州(4),具有两个桥联硫醇盐和另两个与Rh-Rh键相反的硫醇盐(见图1). 作者将此反应描述为“理解含硫醇的镉抗癌化合物代谢的重要第一步”肽类和蛋白质等。, 2003).
索拉塞尼等。也报道了类似复合物[Rh的需氧反应二2(AcO)2(邻)2(瑞士三中国)2](磅/平方英寸6)2(phen=1,10-菲咯啉)和过量的2-氨基硫代苯酚(C6H(H)7NS,一种具有螯合能力的配体)产生了单核复合物[Rh三(η2-C类6H(H)7NS)(η1-C类6H(H)7NS)2(邻苯二甲酸)](5),而复合物的好氧反应三带四折C6H(H)7NS产生了单核和双核Rh(III)配合物,[Rh三(μ-S、 N个-C类6H(H)6NS)(η1-S公司-C类6H(H)6NS)(bpy)]22+(第6页)和[Rh三(S、 N个-C类6H(H)6NS)2(bpy)]+(6b条),在同一个中共结晶单位电池(索拉塞尼等。, 2002). (N-N)配体bpy和phen的存在可能促进了单体Rh(III)物种的形成5和6b条(贾利勒赫瓦德等。, 2017). 不晶体结构已报道四羧酸二铑与硫醇盐的反应产物。
我们在当前研究中的目标是更好地理解铑离子周围发生的结构变化,当铑(II)四羧酸盐[Rh2(RCOO)4]与…反应硫醇以及在有氧条件下的硫醇。为此,我们使用X射线吸收光谱来研究Rh的反应2(AcO)4含两个硫醇配体乙硫醇(C2H(H)5SH)和二氢硫辛酸(DHLA)以及它们的硫醇盐。我们选择了二硫醇分子DHLA(图2)探索一种能够形成S、 S公司-与金属离子螯合(Ioannou和Tsivgoulis,2014)将有助于Rh的分解2(AcO)4有氧条件下的结构。我们之前已经比较了半胱氨酸的这种影响,半胱氨酸表现为(S、 N个)-或(S、 N,O型)-与铑反应产物中的供体配体2(AcO)4,使用N个-乙酰半胱氨酸,更倾向于作为单齿硫醇盐配体结合,而不是形成S、 O(运行)-螯合物(Jalilehvand等。, 2017). 在当前的研究中,我们还进行了与时间相关的密度泛函理论(TD-DFT)计算,以解释Rh的紫外-可见吸收光谱中观察到的位移2(AcO)4溶于乙硫醇时。
| 图2 二氢硫辛酸(DHLA)。 |
2.实验段
氢氧化钠、乙硫醇(EtSH)、乙硫酸钠(NaEtS),(±)-α-使用硫辛酸(LA),无需进一步纯化。Pressure Company Co.提供了四醋酸二钕(II)。Praxair提供了额外的干氧(99.6%)。二氢硫辛酸(DHLA)及其二硫醇钠钠三(DTLA)根据文献程序(Spuches等。, 2005; 库比奇等。, 1995). 甲醇(MeOH)在氩气气氛下通过在镁屑上回流两次进行干燥,而干燥的四氢呋喃(THF)则通过在钠/二苯甲酮上回流并在使用前立即蒸馏得到。乙醇(EtOH)通过氩气通过煮沸的溶液进行脱气,直到冷却到室温。铑分析由加拿大微量分析服务有限公司进行。
2.1. 样品制备
2.1.1. 钠的合成三(DTLA)
在氩气气氛下,将金属钠(24.0mmol)加入到DHLA(4.80mmol)在干燥THF(20.0ml)中的透明溶液中。将混合物在氩气流下回流(70°C)24小时。形成白色沉淀物,在惰性气氛下过滤并用THF(Kubicki等。, 1995). 固体储存在手套箱以避免分解。
2.1.2. Rh溶液2(AcO)4乙硫醇,Rh2(AcO)4(EtSH)2(7)
Rh的溶解2(AcO)4(0.125 mmol)存于2.50 ml乙硫醇(33.8 mmol,d日=0.839克毫升−1)在氩气流下搅拌30分钟后,产生了清晰的勃艮第溶液,以防止硫醇(-SH)氧化为二硫化物(-S-S-);此解决方案用于EXAFS公司数据收集(C类1=50米M(M)). 对于UV-vis测量,a稀释溶液(C类1=5.0米M(M))通过溶解Rh制备2(AcO)4(0.0025 mmol)存于0.50 ml纯乙硫醇中。另一个紫外-可见光谱收集了1.0 mM(M)Rh溶液2(AcO)4(0.050 mmol)溶于50.0 mM(M)氯代乙硫醇(总体积=50.00 ml)。在物理测量之前或期间,溶液保持在有氧条件下。
2.1.3. [罗2(AcO)4(DHLA)]n个固体(8)
向DHLA在5.0毫升EtOH中的溶液(0.904毫摩尔)中加入Rh的悬浮液2(AcO)4逐滴添加15.0 ml EtOH中的(0.226 mmol),得到蓝绿色溶液。反应是在O中的氩气流下进行的2-无溶剂,避免硫醇基团氧化。在室温下搅拌24小时后,形成紫色沉淀物,在空气中过滤,用EtOH清洗,并在真空干燥器中干燥。该固体不溶于普通溶剂。计算。用于[Rh2(AcO)4(DHLA)]n个(Rh2C类16H(H)28哦10S公司2)n个:C,29.55;H、 4.34。发现:C,29.81;H、 4.34;N、 0.02。
2.1.4. 铑的好氧反应2(AcO)4乙硫醇钠(NaEtS)和钠三(DTLA),DHLA的二硫醇钠(9和10)
将硫醇钠(2.26 mmol)溶于10.0 ml干甲醇中的溶液逐滴添加到Rh完全溶解的溶液中2(AcO)4(0.226 mmol)存于180.0 ml干燥甲醇中,氩气流下。使用干甲醇来避免钠盐质子化。溶液立即变成深橙色-红色,2小时后观察到沉淀。搅拌24小时后,干燥O2在反应混合物中大力鼓泡15分钟,并在O下继续搅拌2将反应混合物浓缩至5 ml,过滤掉沉淀,然后将其重新悬浮在10.0 ml水-甲醇(1:1)混合物中,以冲洗掉任何乙酸钠残留物。过滤悬浮液以收集橙色沉淀,然后用蒸馏水和甲醇清洗,然后在真空下干燥。固体产物是反磁性的,不溶于水和大多数有机溶剂。发现Rh(III)乙硫醇酯产品(9):C,24.02;H、 4.93节;S、 23.80分;Rh,31.49。对Rh(III)、CH的几种组合进行了元素分析计算三中国2S公司−,纳+和CH三COO公司−,最接近实验数据的成分为[Na三Rh(相对湿度)7(C)2H(H)5S)17(瑞士三首席运营官)7(H)2O)4]n个(纳三Rh(相对湿度)7C类48H(H)114哦18S公司17)n个:C,24.92;H、 4.97节;S、 23.56;Rh,31.13。化合物10也是一种结构类似于9(见下文)。
2.2。方法
磁化率使用Johnson Matthey对固体样品进行测量磁化率平衡。
2.2.1. 电子光谱学
使用Cary 300紫外-可见双光束分光光度计测量Rh的紫外-可视光谱2(AcO)4在水中(C类1=1.0米M(M)),纯乙硫醇(C类1=5.0米M(M)),或50.0 mM(M)氯代乙硫醇(C类1=1.0米M(M))以相应的溶剂为空白,以1mm光程长度的石英电池为样品支架,能量分辨率为1.0nm。
2.2.2. 振动光谱学
[Rh的KBr盘的红外光谱2(AcO)4(DHLA)]n个固体(7)使用Thermo Nicolet NEXUS 470 FT-IR ESP光谱仪(4 cm−1分辨率)。将一滴DHLA(油)置于两个BaF之间,即可获得纯DHLA的红外光谱2磁盘(窗口截止870厘米−1).
2.2.3. X射线吸收光谱:数据收集
Rh公司K(K)-在3GeV下操作的斯坦福同步辐射光源(SSRL)在室温下在BL7-3(500mA)下测量边缘X射线吸收光谱。通过失谐a Si(220)抑制高次谐波(直径=0°)双晶单色仪,达到最大强度(I)的50%0)在Rh的末端K(K)-边缘扫描范围。离子室(I0,我1和我2)用硝基(N2)和带有氩气(Ar)的Lytle检测器。通过在吸收光谱Rh箔(放置在I之间1和我2离子室)达到23219.80 eV。X射线吸收近边缘结构(XANES)区域的单色器能量阶跃为0.3 eV2(AcO)4(EtSH)2] (7)将其置于带有Kapton窗口的2 mm针孔样品架内,在120 K下收集数据,以抑制EtSH的强烈气味(沸点=308 K;冰点=125 K)。固体样品1,8,9和10与氮化硼混合(样品:BN=70:30w个/w个)用聚酯薄膜胶带作为窗户材料,精细研磨并压入1 mm铝框中。在传输模式下为每个样本采集五到七次扫描(除了1,在荧光模式下测量)。在计算平均值之前,对所有单个扫描进行比较,以确保在测量期间没有发生辐射损伤。
2.2.5. XANES计算
RhK(K)-边缘XANES模拟通过2010年2月8日程序(Ankudinov等。, 1998),使用DFT优化几何体[Rh的原子坐标2(AcO)4(EtSH)2]和[Rh4(瑞典)15]3−以及重叠15%的松饼锡电位。当Hedin–Lundqvist交换相关电位用于激发态。XANES计算的输入文件显示在支持信息。
2.2.6. 计算计算
电子结构计算使用高斯09包装(Frisch等。, 2016). 初始原子坐标是从晶体结构第页,共页[Rh2(AcO)4(H)2O)2](棉花等。, 1971)和被用作几何优化的起点。Becke–Half和Half–LYP密度泛函用于所有非金属原子的6-31G(d)基组和Rh原子的LANL2DZ赝势。优化几何结构的所有计算振动频率均为正值。[Rh的优化几何2(AcO)4(H)2O)2]将其基态与报道的晶体结构(棉花等。, 1971)测试函数集和基集的组合。所有Rh-Rh和Rh-O等式优化几何结构中的距离在晶体结构中的±0.02Ω范围内。
对[Rh的优化几何结构进行了TD-DFT计算2(AcO)4(H)2O)2],[Rh2(AcO)4(H)2S)2]和[Rh2(AcO)4(EtSH)2]放置在溶剂腔内,考虑前100个最低的垂直激励。溶剂效应通过可极化连续体模型(PCM)(Frisch等。, 2016)所有三个系统都使用水,[Rh也使用氯仿2(AcO)4(EtSH)2].
使用相同的函数重复优化和TD-DFT计算,但这次使用6-311++G(2d,p)基集,包括Rh的LANL2TZ(f)赝势,以研究这种更全面、更灵活的基集组合是否会显著影响结果。这两个模型产生了相似的优化参数和跃迁能,以及激发的一致性,并且TD-DFT报告的状态组成在对激发的分数贡献方面具有可比性。这些结果表明,基本集的原始组合充分描述了系统。
4.结论
目前的研究表明,只有-SH作为单硫醇或二硫醇配体功能组与Rh轴向位置的坐标2(AcO)4,保留Rh24+保持架完好(Rh二-Rh(相对湿度)二= 2.41 ± 0.02 Å). The energy levels of theσ(Rh24+)和π(Rh24+)轨道增加,而σ*(Rh24+)相对于水络合物的相应轨道[Rh2(AcO)4(H)2O)2],由于σ(Rh24+),π(Rh24+)→σ*(Rh24+)和π*(Rh24+)→σ*(铑24+)UV和可见区域中的过渡。
相反,硫醇盐作为其唯一配位位点的配体促进了Rh的氧化2(AcO)4在有氧条件下,打破其笼状结构,形成稳定的低聚物Rh(III)d日6在Rh(III)离子之间具有三个桥联硫醇基的低自旋物种,每个都有一个RhS6协调环境(Rh三·Rh三≃ 3.18 ± 0.02 Å).
尽管目前的研究是在非水介质中进行的,但目前的结果可以作为四羧酸二铑与硫醇和硫醇配体“好氧”反应的一般方案。这些结构模型与我们提出的Rh好氧反应产物的结构一致2(AcO)4生理pH值下的谷胱甘肽,{Na2[罗三2(透明质酸)4]·7小时2O}(O)n个,在二聚体单元中的Rh(III)离子之间有三种桥接硫醇盐(Enriquez-Garcia和Jalilehvand,2018). 本结果也适用于二价铑(II)羧酸盐与富含硫醇的金属硫蛋白(MTs)的相互作用。我们建议在有氧和生理条件下,Rh的反应产物2(AcO)4具有β-MT具有与Rh相似的结构三–GSH化合物(2如图1所示)或模型化合物的二聚体单元9(图7,右),有三个β-MT半胱氨酸硫醇酯桥接两个Rh(III)离子。
支持信息
水中和氯仿中[Rh2(AcO)4(EtSH)2]的模拟紫外可见光谱;在200-350nm和400-700nm区域,水中[Rh2(AcO)4(H2O)2]和[Rh2(AcO)4(EtSH)2]的模拟UV-vis光谱中的主要激发;分子轨道[Rh2(AcO)4]、[Rh2(AcO;[Rh2(AcO)4(H2O)2]和预期吸收波长在200-800nm区域的模拟电子跃迁;叠加Rh K边EXAFS公司化合物9和10的光谱;纯DHLA和固体Rh2(AcO)4、Na(AcO)、8和9的FT-IR光谱;FEFF 8.10输入文件,用于模拟[Rh2(AcO)4(EtSH)2]和[Rh4(Et S)15]^3-的XANES光谱。内政部:https://doi.org/10.107/S160057751900033X/hf5373sup1.pdf
致谢
我们感谢Arvi Rauk教授对理论计算结果的有益讨论。AEG承认卡尔加里大学高等教育学院(University of Calgary Eyes High)和科学学院院长的公开竞赛博士奖学金。这项工作得到了加拿大自然科学与工程研究委员会(NSERC)、加拿大创新基金会(CFI)、阿尔伯塔省(创新与科学部)和卡尔加里大学(URGC SEED Grant)的资助。使用WestGrid提供的计算机资源进行理论计算(https://www.westgrid.ca网站)和计算/计算。加拿大(https://www.computecanada.ca). X射线吸收数据采集在斯坦福同步辐射光源(SSRL;提案编号3637)进行。SLAC国家加速器实验室SSRL的使用得到了美国能源部、科学办公室和基础能源科学办公室的支持,合同编号为DE-AC02-76SF00515。SSRL结构分子生物学项目由美国能源部生物与环境研究办公室、美国国立卫生研究院、美国国立普通医学科学研究所(包括P41GM103393)支持。本出版物的内容仅由作者负责,不一定代表NSERC、NIGMS或NIH的官方观点。
资金筹措信息
以下资金已获认可:加拿大创新基金会(FJ批准号9479);阿尔伯塔省创新与科学部(资助FJ);美国国立卫生研究院(NIH)-美国国立普通医学科学研究所(授予Keith O.Hodgson的P41 GM103393号拨款);加拿大自然科学与工程研究委员会(授予FJ编号RGPIN-2008-250406;授予FJ数量RGPIN-2016-04546);卡尔加里大学大学研究资助委员会(授予编号:SEED Grant 1031019479 to FJ)。
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