在2023年6月9日发表的一篇论文的审查过程中自然通信(https://doi.org/10.1038/s41467-023-39140-x),一位评论员对首字母缩写词“cryo-EM”的含义提出了一个有趣的评论。评论是“正确的术语是电子冷冻显微术,而不是冷冻电子显微镜,因为电子不是低温电子,但显微镜是在低温下进行的。具有讽刺意味的是,手稿中有三处参考文献,包括自然家族期刊在其标题中使用了“低温电子显微镜”,但评论员可能不知道这一术语已经被一些期刊作为标准惯例采用。
考虑到低温EM的增长和分辨率的持续提高(见图1
)很明显,低温EM将成为结构测定高分子及其复合物。已经沉积了近14000个结构,其中许多用于膜蛋白和更大的组件。目前已有大约200个结构以高于2.2º的分辨率可用,其中与质子或电子转移及其调控有关的原子细节变得明显,因此可以解决有关酶机制的基本问题。因此,重要的是要澄清低温EM的定义,以使涉及低温EM不断扩大的文献不被混淆。对于正在进入低温结构生物学这个激动人心的世界的新一代科学家来说,这也很重要。
| 图1 (一)近10年来低温电磁结构的发展。2022年,沉积的低温EM结构的数量接近4000多个,而X射线结构约为9800个。冷冻电镜结构主要由膜蛋白和大型复合物组成。(b条)目前可用的低温EM结构的分辨率为~2.2º,已知近200个结构。 |
首先,重要的是要回顾低温EM的含义是如何演变的。当可以在低温下保持显微镜中的样品网格时,术语“低温电子显微镜”(cryoEM)源于对低温电子显微镜的缩写。在指出电子不冷且不处于低温之前,低温电磁法的应用得到了广泛的推广。包括RH在内的社区继续使用低温EM作为低温电子显微镜和电子低温显微镜的缩写。这方面的示例可以在中的一篇透视图文章中看到美国国家科学院2013年(亨德森,2013
)2017年诺贝尔奖的报道自然标题为“化学奖表彰冷冻电子显微镜的工作”(Cressey&Callaway,2017
)这两种期刊在编辑过程中都实施了这一规定。
现在很清楚,电子冷冻显微镜不应缩写为“croy-EM”;确切的缩写应该是“E-cryomM”。在我们看来,这两个词都不是“低温”电子显微镜或“电子冷冻显微镜”是准确的,因为它们意味着要么电子要么显微镜是冷的。
在第一句中引用的论文中(Flynn等。, 2023
),有人建议将低温EM标准化为“单粒子”e(电子)电子米显微镜检查低温基因样本阶段”,但另一种更简洁的措辞是`低温基因样品E类电子M(M)显微镜(冷冻电镜)”。
通过这封信,我们要求社区考虑是否需要找到一个新的共识,以简明扼要地定义低温EM代表什么。如果是这样,并且可以得出合理的结论,那么可以将其提交给IUCr命名委员会考虑正式采用。