计算机程序\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

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应用
结晶学
国际标准编号:1600-5767

晶体学工具箱(水晶盒子):用于透射电子显微镜和晶体仪的自动化工具

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捷克共和国布拉格8,Na Slovance 2,182 21,ASCR物理研究所纳米结构和纳米材料实验室
*通信电子邮件:klinger@post.cz

编辑:A.Borbély,法国圣埃蒂安国家矿山管理学院(2015年6月24日收到; 2015年9月15日接受; 在线2015年10月21日)

介绍了三种用于电子衍射图案自动分析和晶体可视化的工具。首先,衍射图形用户界面确定分区轴从选定区域衍射、会聚束衍射或纳米衍射图案,并允许对单个反射进行索引。其次,振铃GUI识别与环衍射图案中所示环对应的晶体平面,并可以从候选材料列表中选择样品材料。两者都有衍射GUI振铃GUI采用计算机视觉方法进行快速、稳健和准确的分析。第三,单元格查看器是一个直观的可视化工具,也有助于晶体计算或教育目的。衍射图形用户界面单元格查看器可以在透射电子显微镜会话以确定达到所需的样本架倾斜分区轴。所有工具都提供了图形用户界面。工具箱作为独立应用程序分发,因此可以安装在显微镜计算机上,并直接从数字缩微摄影(Gatan公司)。

1.简介

大多数接触过晶体学领域的人都知道回答这个领域提出的问题是多么令人兴奋。不幸的是,他们中的大多数人也知道回答日常的基本问题是多么乏味,这些问题通常看起来很简单:我在看哪种材料,样本方向是什么?(102)平面如何位于这个方向?我应该如何倾斜TEM(透射电子显微镜)支架,使样品进入[101]区轴?接下来还有许多其他问题。水晶盒子(晶体学工具箱)应该回答这些问题或帮助更快地找到答案。

答案往往隐藏在TEM提供的图像中。这些图像很容易获取;然而,它们的正确解释可能远非直截了当。水晶盒子利用人工智能和计算机视觉,产生了工具,可以在很短的时间内完全自动分析绝大多数输入图像。设置好样品材料后,单击一次约半分钟即可获得分区轴从斑点衍射图像或识别环状衍射图案中的环状。在点衍射的情况下晶格中的方向直接空间可以可视化,并且可以计算导致任意样本方向的支架倾斜。工具箱还提供了一个直观的界面,允许用户查看、命名和解释各种晶体学问题。

有许多用于分析斑点衍射的程序和脚本(Mitchell,2008b条【Mitchell,D.(2008b),《微细研究技术》71,588-593。】; 李,2014[Lábár,J.L.(2009年),《微创肛门》第15、20-29页。]; 等。, 2012[Wu,C.Jr、Reynolds,W.T.Jr和Murayama,M.(2012)。超微显微镜,112,10-14。]; 斯塔德曼,2004[Stadelmann,P.(2004).JEMS-EMS Java V4版。CIME-EPFL,瑞士洛桑。]; 里德等。, 2011【Reid,J.、Crane,D.、Blanton,J.和Crowder,C.、Kabekkodu,S.和Fawcett,T.(2011)。《微生物学》,今日,19,32-37。】; 贝莱蒂等。, 2000【Belletti,D.、Calestani,G.、Gemmi,M.和Migliori,A.(2000)。超微显微镜,81,57-65。】; 拉巴尔,2005年[李小新(2014).微生物学.微肛门.第20期,1486-1487.])和环形衍射图案(Mitchell,2008【Mitchell,D.(2008a)。超显微镜,108367-374。】; 等。, 2011[张,L.,霍尔特,C.M.B.,吕贝尔,E.J.,奥尔森,B.C.,王,H.,达奈,M.,崔,X.,谭,X.Lui,V.W.,卡利斯瓦尔特,W.P.&米特林,D.(2011).物理化学杂志,115,24381-24393.]; 李,2007[Lábár,J.L.(2005)。超微显微镜,103,237-249。]; 里德等。, 2011【Reid,J.、Crane,D.、Blanton,J.和Crowder,C.、Kabekkodu,S.和Fawcett,T.(2011)。《微生物学》,今日,19,32-37。】). 然而,大多数软件都需要大量的用户干预。这些程序要求用户执行部分分析,处理部分结果或定位图像特征(衍射点或圆环中心)。图像特征的手动定位通常很耗时,而且往往不准确。一些工具通过使用一定程度的自动化来克服这些缺点。一种有趣且坚固的戒指工具衍射分析由Mitchell(2008)描述[Mitchell,D.(2008a).超微显微镜,108,367-374.]). 完成环中心定位通过一个霍夫变换,在全自动模式下,它可能是内存和计算密集型的。同一作者提出了一种用于分析斑点衍射图案的工具(Mitchell,2008b条【Mitchell,D.(2008b),《微细研究技术》71,588-593。】)采用以一个衍射点为中心的圆形平均值。这是一种快速而优雅的方法,它将用户本地化的点数量减少到一个。另一方面,它对中心点的定位非常敏感。相反,该方法重建了倒易晶格使用分布在图案上的多个检测点。

另一个有趣的工具,自动SADP,由吴介绍(2012[Wu,C.Jr、Reynolds,W.T.Jr和Murayama,M.(2012)。超微显微镜,112,10-14。]). 它可以以一种非常快速和稳健的方式检测衍射点。几个最亮的点被用来测量d日间距和面间角。这个d日然而,间距是在单个衍射点对之间测量的。相比之下水晶盒子工具衍射图形用户界面在整个衍射图案中,将规则晶格与数十个检测到的反射相匹配,从而获得更高的精度。它还可以成功检测纹理衍射盘[例如会聚束衍射(CBED)光盘]并提供进一步的分析和解释,如全自动分区轴确定和反射索引。

与其他可用软件相比,水晶盒子提供了更高程度的自动化。尽管这些工具被设计为尽可能自动化和健壮,但分析的所有主要步骤都可以由用户控制通过图形用户界面(GUI)。用户可以查看所有相关的部分结果,调整参数,从而在必要时干预分析。

工具箱还包括一个可视化工具,单元格查看器,它为直接和倒易空间。有许多类似的计算机程序(Boudia和Monceau,1998[Boudias,C.和Monceau,D.(1998)。CaRine晶体学。Compiègne:DIVERGENT SA。]; 斯塔德曼,2004[Stadelmann,P.(2004).JEMS-EMS Java V4版。瑞士洛桑CIME-EPFL; 里德等。, 2011【Reid,J.、Crane,D.、Blanton,J.和Crowder,C.、Kabekkodu,S.和Fawcett,T.(2011)。《微生物学》,今日,19,32-37。】; Momma&Izumi,2008年【Momma,K.和Izumi,F.(2008),《应用结晶杂志》,第41期,第653-658页。】; 小泽和康,2004[小泽·T·C·康·S·J(2004),《应用结晶杂志》,第37、679页。]). 虽然它们可能更适合某些任务,但它们并不总是那么互动、直观或免费。

2水晶盒子工具

目前,有三种工具可用于水晶盒子:衍射图形用户界面用于现场衍射分析, 振铃GUI用于环衍射分析单元格查看器用于可视化。其他工具即将发布(例如在双光束条件下使用CBED测量TEM样品厚度的工具)。整个工具箱在MATLAB(The MathWorks,Natick,MA,USA)和C(Mex)中实现。每个工具都配有GUI,允许用户友好的交互和导出部分或最终结果。分析工具(衍射图形用户界面振铃GUI)也可以将结果汇总到HTML报告中。

工具已启动通过 CrystalBox服务器,允许用户或计算机程序启动和控制单个工具实例的应用程序。除了启动工具的按钮外,CrysTBox服务器提供了一个文件浏览器和图像预览器,允许外部应用程序启动工具。启动时,CrysTBox服务器创建一个文本文件(所谓的命令文件),并定期检查其更改。用户或外部应用程序写入此文件的命令可用于启动单个工具,分析指定的图像.

这些工具通常要求用户陈述样本材料和输入图像。使用描述单位电池(晶格参数、晶格角、原子在单位电池以及它们的原子序数)。详细规范可在水晶盒子网页(参见§6[链接]). 可由处理的图像格式水晶盒子包括本机数字缩微摄影(Gatan Inc.,Pleasanton,CA,USA)文件(DM3和DM4)以及所有常用图像格式(JPG、PNG、TIF.).

2.1.衍射图形用户界面:斑点衍射分析

该工具(见图1[链接])可以特别用于自动分区轴使用衍射或高分辨率TEM(HRTEM)图像进行测定。对各个衍射点之间的距离和角度进行量化,并将相应平面的指数指定给这些衍射点。整个过程不会出现轻微的校准误差。它还可以用于验证或微调相机缩放校准。

[图1]
图1
衍射GUI的用户界面。()输入图像细节;(b条)在输入图像中显示部分和最终结果;(c(c))按钮启动整个分析;(d日)按钮启动分析和基本设置的各个步骤;(e(电子))RANSAC发现的晶格参数;((f))理论之间赋值的可视化d日间距(底部)和实验间距(顶部);()带有可能解决方案的弹出菜单(区域轴);(小时)校准系数;()所选解决方案的参数。
2.1.1. 输入

除了样品信息单位电池,需要图像。输入图像类型可以包括选区衍射(SAED)、纳米衍射或CBED图案。也可以使用HRTEM图像,因为工具会自动将其转换为互易空间使用快速傅里叶变换(FFT)。

2.1.2. 算法

加载输入图像后(图2[链接]),遮住光束阻挡器或老化标尺(如有)可能有助于防止衍射斑点检测器被混淆。对于某些挡梁器,这可以手动或自动完成。

[图2]
图2
单个步骤衍射图形用户界面分析。()原始图像(b条)100次最强检测(c(c))RANSAC发现的规则晶格(d日)面间角(e(电子))确定的斑点。

分析的第一个关键步骤是检测图案中的衍射点或衍射盘。SAED或纳米衍射斑点在尺度空间中使用斑点检测进行检测(Lowe,2004[Li,X.(2007).微生物学.Microanal.13,966-967.])包含大约30个刻度。用户可以选择不同的斑点检测技术:高斯检测、黑森响应或高斯差分。在CBED模式的情况下,使用霍夫变换来检测椎间盘(Atherton&Kerbyson,1999【Atherton,T.&Kerbyson,D.(1999)。图像可视化计算17,795-803。】; 等。, 1990【香港元朗、J.普林斯顿、J.伊林沃思和J.基特勒(1990)。图像视觉计算8,71-77。】)如Klinger所述等。(2015【Klinger,M.,Němec,M.、Polívka,L.、Gärtnerová,V.&Jäger,A.(2015)。超微显微镜,150,88-95。】). 使用质心和分数描述检测到的斑点或圆盘。分数是一种反映给定检测质量的度量。由于斑点检测方法提供了大量的检测,其中许多属于同一衍射点,因此应用了非最大值抑制。这种机制只保留那些在26个连接邻域中得分局部最大的检测。换言之,忽略那些相邻(图像平面内或尺度空间内)得分较高的检测。

由于检测仍然可能遭受大量假阳性或假阴性检测,必须使用一些智能机制从检测中提取规则衍射晶格。为此,RANSAC算法(Fischler&Bolles,1981[Fischler,M.A.&Bolles,R.C.(1981)。美国医学会委员会,24,381-395。]; Fischler&Bolles,1987年[Fischler,M.A.&Bolles,R.C.(1987),《计算机视觉阅读:问题、问题、原则和范式》,第726-740页。旧金山:摩根考夫曼出版社。])如Klinger所述等。(2015【Klinger,M.,Němec,M.、Polívka,L.、Gärtnerová,V.&Jäger,A.(2015)。超微显微镜,150,88-95。】). 它需要一些最强的检测(图2[链接]b条)作为输入(默认为50个得分最高的候选),并返回定义规则晶格的两个向量(图2[链接]c(c)). 该晶格的参数(点之间的距离和角度)列于表中(图1[链接]e(电子)和2[链接]d日)并可用于手动评估、验证结果或其他目的。样品知识单位电池提供足够的信息进行理论计算d日-间距值和面间角。这个d日在晶格中测得的间距和面间角可以与在一定范围内的理论值相匹配。与人类相比,计算机可以有效地检查大量与实验测量值相关的理论值的可能断言,并且可以快速验证特定的平面组合是否与给定的平面组合相对应d日间距和面间角可以通过物理方式组合在一起,以获得一个共同的区域轴。

属于最适合实验数据的解决方案的区域轴列在弹出菜单中(图1[链接])根据反映实验和理论差异的总分进行排序d日间距和面间角。当用户选择特定分区轴,与衍射点相对应的平面指数印在相应点的下方(图2[链接]e(电子)),可以直接解释实验图像。

2.1.3. 特征

此工具最重要的优点是自动化。该算法旨在提供快速而轻松的分析。其他优点是精度和鲁棒性。RANSAC算法使用分布在图像上的多个点来生成规则晶格。因此,结果比两个选定衍射点之间的多次手动测量更精确。此外,由于衍射图像的典型动态强度范围,计算机可以看到用户看不到的斑点。

该工具在测量值周围的某个范围内将测量值与理论值相匹配,这一事实使得整个过程对一定程度的相机校准误差具有鲁棒性。此外,该工具还可以用于查找摄像机长度校准的校正系数。

在某些情况下,该工具还可以处理两个或三个重叠图案,例如界面上的衍射图案(孪晶矩阵,由晶界分隔的相邻晶粒.).为了找到多个晶格,重复应用RANSAC算法,同时忽略之前发现的晶格点附近的斑点检测。

结果也可以传递给交互式可视化工具单元格查看器(§2.3[链接]).

2.2.振铃GUI:环形衍射分析

可以使用此工具分析环形衍射图案(图3[链接]). 它可以自动识别单个衍射环。如果样本材料不精确,该工具可以从用户给出的一组可能的候选材料中选择最适合的材料。它还提供了一些图像增强工具,帮助揭示最弱的反射。类似于衍射图形用户界面,它还可以用于查找相机长度校准的校正。

[图3]
图3
的用户界面振铃GUI. ()输入图像中部分和最终结果的可视化;(b条)测量峰值/环(顶部)与理论值之间分配的可视化d日-间距值(底部);(c(c))输入图像细节;(d日)按钮启动整个分析;(e(电子))按钮启动分析程序和基本设置的各个步骤;((f))峰值图的设置;()用于增强输入图像的仪器;(小时)校准系数;()关于峰值的详细信息/d日在峰值图中选择的间距。
2.2.1. 输入

工具的输入是关于样本的信息单位电池和一张实验环衍射图像。环强度不要求沿环周长均匀。该工具可以成功加工部分不完整的环,或包含由不均匀晶粒尺寸或首选晶粒取向导致的可见斑点的环。另一方面,吊环不应明显变形;例如,它们不应该是明显的椭圆形。如果出现明显的椭圆畸变,应在分析之前进行适当的校正(Hou,2008【Hou,V.(2008)。Microc.Microanal.第14期,第1124-1125页。】; 2009年,拉巴尔【Lowe,D.(2004),《国际计算杂志》,第60期,第91-110页。】).

2.2.2. 算法

与以下情况不同衍射图形用户界面,此处必须取消挡梁。否则,它会影响圆环和图像背景的平均强度。在某些情况下,可以手动或自动屏蔽光束阻挡器(基于迭代阈值)。属于光束阻挡器及其邻近区域的所有图像像素均被排除在进一步处理之外。

在下一步中,需要对环的中心进行定位。这是通过比较原始输入图像和围绕某个候选中心点旋转90、180和270°的图像之间的差异来完成的。将三幅旋转图像中的每一幅从原始图像中减去,并对该差值的绝对值进行平均,从而得出旋转图像与原始图像之间的相似性度量。最后,将与所有三个旋转图像相对应的三个相似性度量一起平均,反映出图案相对于候选中心点的四倍旋转对称性。选择平均差最小(对称性最高)的候选者作为环中心。

当圆环中心已知时,可以从衍射信号中计算出圆形平均值。圆形平均值(或轮廓)是平均图像强度,它是距离中心距离的函数(见图3[链接]b条). 轮廓上的单个峰值对应于图像中的圆环。

通常,图像中有一些背景;在图案的中心部分,强度往往较高,并向外逐渐减弱。这也可以在配置文件中看到,因此可以使用配置文件量化背景函数。背景由双曲线函数近似。它的系数是迭代优化的,因此双曲线从下面接触轮廓。

从轮廓中减去背景后,可以处理峰值。对应于最亮环的几个最高峰值(默认为十个)被定位。测量它们与中心的距离,并与样品材料的理论距离进行比较。每个实验峰都使用最近的理论峰进行晶体学鉴定。以与衍射图形用户界面工具振铃GUI该工具计算相机长度校准值。对于已知晶格参数的材料,该值可用于校准显微镜或常规检查现有校准的准确性。

如果样品材料、相机长度校准或两者都不确切,振铃GUI可以找到最符合实验数据的值。校准系数可以指定为可行值的范围,样品材料可以使用可能的元素或化合物列表定义。该工具检查校准系数和材料的所有可能组合,并列出最适合理论峰值的组合。

2.2.3. 特征

的主要优势振铃GUI又是自动化。甚至有斑点的图像(图3[链接])可以快速、方便、准确地进行分析。

另一个好处是图像增强功能。光束阻挡器的阴影可以从原始图像中去除(图4[链接]和4[链接]b条). 阴影对应的区域被替换为图像其余部分强度的圆形平均值。背景不仅可以在轮廓中消除,也可以在图像中消除(图4[链接]c(c)). 可以调整强度对比度,使弱环更加明显(图4[链接]d日). 这些仪器结合在一起,显著提高了图像的可读性(图4[链接]e(电子)和4[链接](f)).

[图4]
图4
的图像增强功能振铃GUI. ()原始图像(b条)梁挡块已拆除(c(c))背景消除(d日)对比度调整(e(电子))所有这些的组合((f))已识别的环。

校准系数的自动测定使振铃GUI摄像机长度校准任务中的一项重要资产。

2.3.单元格查看器:可视化

单元格查看器(图5[链接])提供了交互视图直接空间。它可以用作可视化工具、晶体计算器或只是一种教育辅助工具,允许用户玩某些晶体现象并揭示它们之间的关系。

[图5]
图5
的用户界面单元格查看器–可视化衍射图形用户界面结果如图1所示[链接]. ()衍射视图;(b条)细胞视图;(c(c))材料、衍射和细胞视图的基本设置;(d日)有关所选衍射点或原子、计算器和其他实用程序的详细信息。
2.3.1. 输入

唯一需要的输入是单元间信息。与合作衍射图形用户界面该工具可以接收有关实验衍射晶格的信息,以生成精确的理论对应物和相应的定向原子晶格。

2.3.2. 特征

中有两个主要视图单元格查看器:包含理论衍射图案的衍射视图(图5[链接])以及显示模拟样品中几个原子的细胞视图(图5[链接]b条). 这两种视图都是交互式的。由于它们经常从不同的角度展示同一事物,因此它们联系在一起,使得直接和互易空间更明显。在衍射视图中,单击鼠标最多可以选择两个点。与这些点对应的平面立即显示在原子结构背景下的细胞视图中(如图5所示[链接]和5[链接]b条). 单元视图中的模拟样本可以缩放或旋转。旋转样品时,衍射视图可以保持不变,允许用户从不同的角度检查样品。然而,衍射图案也可以根据样品的实际方向即时更新,从而立即说明样品旋转的影响。单元格视图也是交互式的。用户可以选择一个原子来获取其坐标和元素,选择两个原子来获得有关相应方向向量的信息,选择三个原子来提供有关给定平面及其法线的信息,以及选择四个原子来添加d日-间距值。

单元格查看器还提供了晶体计算器。除其他外,它还提供了晶体坐标系(以米勒指数表示)和笛卡尔坐标系之间的转换。它可以计算d日间距、平面或向量之间的角度、原子散射振幅、,结构系数,和消光距离。可以导出包含选定数量表的文本文件。

单元格查看器可以从以下结果中获益衍射图形用户界面分析。之后衍射图形用户界面已完成对实验衍射图像的分析,它可以将结果传递给单元格查看器衍射视图中的理论衍射图案和细胞视图中模拟样品的方向与实验图像完全对应。这提供了一种快速直观的方法来查看所观察到的晶体中原子的排列。

如果用户提供关于样品架的基本信息(例如αβ用于获取给定实验图像或α轴),可以模拟支架倾斜[另一种工具由Duden描述等。(2011【Duden,T.、Gautam,A.和Dahmen,U.(2011)。超微显微镜,1111574-1580。】)]. 当用户倾斜模拟样本时,所有相关信息都会立即更新;模拟样品倾斜,理论衍射图样相应改变分区轴实现了读出。此外,该工具可以计算αβ达到所需区域轴所需的倾斜。

3.集成

这些工具可以相互独立使用;然而,如果它们彼此合作或与外部应用程序合作,则功能会强大得多。如上所述,衍射图形用户界面可以将结果传递给单元格查看器用于可视化或样品架导航。所有工具还可以与任何能够写入命令文件的应用程序集成。这是由定期检查的标准文本文件CrysTBox服务器,其中可以输入控制工具的命令。

特别的好处是与Gatan的集成数字缩微摄影(DM公司),这是一种常用的图像采集和处理软件透射电子显微镜。它提供了一个非常强大的脚本,使应用程序非常灵活和可定制(Mitchell&Schaffer,2005)【Mitchell,D.&Schaffer,B.(2005)。超微显微镜,103,319-332。】). 除其他外,它允许轻松安装扩展通过DM插件。多亏了DM公司与一起发布的插件水晶盒子,可以直接从以下位置启动图像分析DM公司单击即可。因此,在显微镜荧光屏上看到图像和看到分析结果之间的延迟可以减少到大约五次点击一分钟。

4.计算机人类

为了证明自动化工具的效率和能力,进行了一个小案例研究,重点是斑点/圆盘衍射图案的评估。它包括四幅图像:两幅用FFT变换的HRTEM图像(图6[链接]和6[链接]b条),一个CBED模式(图6[链接]c(c))和单点衍射图案(图6[链接]d日). 分析目标是对斑点/圆盘进行索引,测量相应的d日间隔并确定分区轴。这些图像由两位经验丰富的人类分析师和衍射图形用户界面[在单核上运行的联想ThinkPad E540、Intel Core i7(2.3/3.3 GHz)上进行测试]。提供给分析员的信息是DM3格式的图像、样品材料和相应的表格d日-间距值。除此之外,他们被允许使用任意的文献或软件,但自动执行分析或其部分的软件功能除外。

[图6]
图6
案例研究中涉及的衍射图案。()图1,Mg-in[001]分区轴,(b条)图2,γ-钛in[1[\上一行]0]区域轴,(c(c))图3,Mg-in[[\上一行2]01]分区轴,(d日)图4,Mg-in[[\上一行]11] 分区轴。

区域轴已成功确定,但图2除外,在该图中,分析员2无法找到分区轴。表1[链接]显示了理论值和测量值d日-间距值和相应的偏差。与人类分析师相比衍射图形用户界面平均值略接近理论值。还可以看出,一幅图像中的偏差往往更加一致衍射图形用户界面这种一致性可能表明自动算法实现了较低的方法诱导误差。分析所需时间存在显著差异(表2[链接]). 结果因图像和分析师而异。一般来说,可以得出以下结论:衍射图形用户界面比人类快30-60倍。

表1
这个d日-间距值(d日-特殊情况。,单位:nm),在图6中的四幅图像中测量[链接]通过衍射图形用户界面和两名人体分析人员以及偏差(偏差,单位为pm,理论值和测量值之间的差异)

根据偏差的绝对值计算平均偏差。

  理论 衍射GUI 分析师1 分析员2
  d日-特别是。 d日-特别是。 开发。 d日-特别是。 开发。 d日-特别是。 开发。
图片1 0.2780 0.2762 −1.8 0.2732 −4.8 0.2747 −3.3
0.2780 0.2750 −3.0 0.2747 −3.3 0.2738 −4.2
0.2780 0.2783 0.3 0.2778 −0.2 0.2795 1.5
 
图2 0.2499 0.2481 −1.8 0.2469 −3.0 0.2490 −0.9
0.2499 0.2482 −1.7 0.2487 −1.2 0.2480 −1.9
0.2300 0.2279 −2.1 0.2294 −0.6 0.2293 −0.7
 
图3 0.1901 0.1924 2.3 0.1941 4 0.1900 −0.1
0.2780 0.2802 2.2 0.2762 −1.8 0.2745 −3.5
0.1901 0.1909 0.8 0.1866 −3.5 0.1901 0
 
图4 0.2453 0.2442 −1.1 0.2439 −1.4 0.2402 −5.1
0.2453 0.2444 −0.9 0.2445 −0.8 0.2443 −1.0
0.1901 0.1862 −3.9 0.1866 −3.5 0.1873 −2.8
 
平均     1.8   2.3   2.1

表2
分析图6中的四幅图像所需的时间[链接]以及衍射图形用户界面与人类相比

  衍射图形用户界面 分析师1 分析员2
  时间(s) 时间(s) 加速(×) 时间(s) 加速(×)
图片1 22 480 22 1200 55
图2 12 390 33 2700 225
图3 20 980 49 1320 66
图4 17 650 38 960 56
平均     36   100

5.可用性

有关该软件的更多信息,请访问网页https://www.fzu.cz/CrysTBox网站或参考手册(Klinger,2015【Klinger,M.(2015)。CrysTBox-晶体学工具箱。捷克科学院物理研究所,捷克共和国布拉格。】). 该网站包含安装指南、系统要求、示例视频、视频教程以及输入数据和相应结果的示例。描述样本的文件规范单位电池也可以使用。详细描述了每个工具的图形用户界面,并解释了参数和设置。

水晶盒子可作为Windows平台的独立应用程序按需提供。MATLAB编译器施加的限制不允许软件用于商业目的或商业主题。

6.结论

水晶盒子制造电子衍射分析速度明显更快、更简单、更准确。分析工具,衍射图形用户界面振铃GUI对于每天处理电子衍射的TEM用户来说,尤其值得注意。自动化的程度开启了多种可能的应用,例如在高级仪器或材料表征方面。这些工具可以安装在显微镜计算机上,而且可以与其他计算机程序合作,这一事实使它们成为电子显微镜的理想队友。可视化和教育能力单元格查看器进一步扩大工具箱用户的范围。

虽然棘手的数据总是存在的,但绝大多数图像都可以完全自动分析。这尤其适用于点/盘衍射分析使用衍射图形用户界面因此,使用这些工具可以节省大量时间和精力。即使需要一定程度的人机交互,这些工具仍然很有帮助,因为它们允许对整个分析过程进行舒适且用户友好的控制。

致谢

作者感谢Bernhard Schaffer、Robin Schäublin、Christian Gspan、Walter Guy、Jan Duchoň、Viera Gärtnerová和Martin Němec提供的宝贵反馈、测试、建议、讨论和数据。感谢GACR提供的财务支持,即108/12/G043英镑。

工具书类

第一次引用Atherton,T.和Kerbyson,D.(1999)。图像可视性。计算。 17, 795–803. 科学网 交叉参考 谷歌学者
第一次引用Belletti,D.、Calestani,G.、Gemmi,M.和Migliori,A.(2000年)。超微显微镜,81, 57–65. 科学网 交叉参考 公共医学 中国科学院 谷歌学者
第一次引用Boudia,C.和Monceau,D.(1998年)。CaRine晶体学。公司:DIVERGENT SA谷歌学者
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