有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学的
通信
国际标准编号:2056-9890

1-环己基-6,7-二甲基氧基-1,4-二氢萘

中华人民共和国浙江大学生物技术研究所,b条中华人民共和国浙江大学药学学院,c(c)中华人民共和国浙江大学农业与生物技术学院d日中华人民共和国浙江大学环境与资源科学学院
*通信电子邮件:wyshi@zju.edu.cn

编辑:D.J.Xu,浙江大学(玉泉校区),中国(2014年4月24日收到; 2014年5月6日接受; 在线2014年5月17日)

标题化合物C18H(H)24O(运行)2,是从无花果L.环己烷环呈椅状构象,而环己-1,4-二烯环呈扁平船状构象并在船头和船尾有甲基C原子。在晶体中,分子通过弱的C-H…O氢键连接成沿着b条-轴方向。

相关文献

标题化合物的生物活性参见:Fang等。(2008[方永华、魏永新、赵亚勇、郭强(2008).中国生物化学药学杂志.29,366-369.]); 谢庄(2010)【谢明南、庄文新(2010).生命科学研究14,523-527.】). 用于从中分离的化合物的生物活性无花果五十、 参见:Joseph&Raj(2011【Joseph,B.&Raj,S.J.(2011),《国际药学技术研究》第3期,第8-12页。】).

【方案一】

实验

水晶数据
  • C类18H(H)24O(运行)2

  • M(M)第页= 272.37

  • 单斜的,P(P)21

  • = 9.0635 (4) Å

  • b条= 6.3973 (3) Å

  • c(c)= 13.9872 (7) Å

  • β= 104.241 (5)°

  • V(V)= 786.08 (6) Å

  • Z轴= 2

  • K(K)α辐射

  • μ=0.57毫米−1

  • =294千

  • 0.28×0.15×0.12毫米

数据收集
  • 安捷伦Xcalibur(Atlas,Gemini ultra)衍射仪

  • 吸收校正:多扫描(CrysAlis专业安捷伦,2012【安捷伦(2012),CrysAlis PRO.安捷伦科技,英国雅顿。】)最小值= 0.76,最大值= 0.85

  • 5062次测量反射

  • 2737个独立反射

  • 2318次反射> 2σ()

  • 整数= 0.027

精炼
  • [F类2> 2σ(F类2)] = 0.039

  • 加权平均值(F类2) = 0.114

  • S公司= 1.04

  • 2737次反射

  • 184个参数

  • 1个约束

  • 受约束的氢原子参数

  • Δρ最大值=0.10埃−3

  • Δρ最小值=-0.10埃−3

表1
氢键几何形状(λ,°)

D类-H月A类 D类-小时 H月A类 D类A类 D类-H月A类
C18-H18型A类●氧气 0.96 2.59 3.272 (3) 129
对称代码:(i)[-x+2,y+{\script{1\over 2}},-z+1].

数据收集:CrysAlis专业(安捷伦,2012年【安捷伦(2012),CrysAlis PRO.安捷伦科技,英国雅顿。】); 细胞精细化: CrysAlis专业数据缩减:CrysAlis专业用于求解结构的程序:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于优化结构的程序:SHELXTL公司分子图形:SHELXTL公司用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司.

支持信息


注释顶部

无花果L(左)是一种落叶乔木,属于桑科。已从该植物中分离出不同的生物活性化合物(Joseph&Raj,2011)。无花果叶提取物L(左).显示了抑制癌细胞生长、抗氧化和抗菌的潜在活性(谢和庄,2010;方等。, 2008). 标题化合物是无花果叶提取物之一L(左).

在标题化合物中,环己烷环显示出椅子构象,而环己二烯环采用扁平船构象,甲基C原子(C7和C10)分别位于船头和船尾。在晶体中,分子通过弱的C-H··O氢键连接到沿着b条-轴方向。

相关文献顶部

标题化合物的生物活性参见:Fang等。(2008); 谢庄(2010)。从无花果中分离出的具有生物活性的化合物L(左)参见:Joseph&Raj(2011)。

实验顶部

用石油醚提取无花果叶。过滤并蒸发上相真空中以获得晶体。单晶从己烷溶液中再结晶。

精炼顶部

H原子被放置在计算位置,C-H=0.93–0.98º,并在骑行模式下用U型国际标准化组织(H) =1.5U型等式(C) 对于甲基H原子和1.2U型等式(C) 为其他人。

计算详细信息顶部

数据收集:CrysAlis专业(安捷伦,2012);细胞精细化: CrysAlis专业(安捷伦,2012);数据缩减:CrysAlis专业(安捷伦,2012);用于求解结构的程序:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008);用于优化结构的程序:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008);分子图形:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008);用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

数字顶部
[图1] 图1。(I)具有30%概率位移椭球(H原子的任意球体)的分子结构。
1-环己基-6,7-二甲氧基-1,4-二氢萘顶部
水晶数据 顶部
C类18H(H)24O(运行)2F类(000) = 296
M(M)第页= 272.37D类x个=1.151毫克
单斜的,P(P)21熔点:423 K
大厅符号:P 2ybK(K)α辐射,λ= 1.54180 Å
= 9.0635 (4) Å5062次反射的细胞参数
b条= 6.3973 (3) Åθ= 3.2–67.6°
c(c)= 13.9872 (7) ŵ=0.57毫米1
β= 104.241 (5)°=294千
V(V)= 786.08 (6) Å无色针
Z轴= 20.28×0.15×0.12毫米
数据收集 顶部
安捷伦Xcalibur(阿特拉斯,双子座超级)
衍射仪
2737个独立反射
辐射源:细焦点密封管2318次反射> 2σ()
石墨单色仪整数= 0.027
ω扫描θ最大值= 67.6°,θ最小值= 3.3°
吸收校正:多扫描
(CrysAlis专业安捷伦,2012)
小时=1010
最小值= 0.76,最大值= 0.85k个=77
5062次测量反射=1616
精炼 顶部
优化于F类2二次原子位置:差分傅里叶映射
最小二乘矩阵:满氢站点位置:从邻近站点推断
[F类2> 2σ(F类2)] = 0.039受约束的氢原子参数
加权平均值(F类2) = 0.114 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0621P(P))2+ 0.0278P(P)]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
S公司= 1.04(Δ/σ)最大值< 0.001
2737次反射Δρ最大值=0.10埃
184个参数Δρ最小值=0.10埃
1个约束消光校正:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008),Fc*=kFc[1+0.001xFc2λ/罪(2θ)]-1/4
主原子位置定位:结构-变量直接方法消光系数:0.0191(17)
水晶数据 顶部
C类18H(H)24O(运行)2V(V)= 786.08 (6) Å
M(M)第页= 272.37Z轴= 2
单斜的,P(P)21K(K)α辐射
= 9.0635 (4) ŵ=0.57毫米1
b条= 6.3973 (3) Å=294千
c(c)= 13.9872 (7) Å0.28×0.15×0.12毫米
β= 104.241 (5)°
数据收集 顶部
安捷伦Xcalibur(阿特拉斯,双子座超级)
衍射仪
2737个独立反射
吸收校正:多扫描
(CrysAlis专业安捷伦,2012)
2318次反射> 2σ()
最小值= 0.76,最大值= 0.85整数= 0.027
5062次测量反射
精炼 顶部
[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0391个约束
加权平均值(F类2) = 0.114受约束的氢原子参数
S公司= 1.04Δρ最大值=0.10埃
2737次反射Δρ最小值=0.10埃
184个参数
特殊细节 顶部

几何图形.所有e.s.d.(除了两个l.s.平面之间二面角中的e.s.d.)均使用全协方差矩阵进行估计。在估计e.s.d.的距离、角度和扭转角时,单独考虑单元e.s.d;只有当由晶体对称性定义时,才使用电解槽参数中e.s.d.之间的相关性。单元e.s.d.的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权-因子加权平均值和贴合度S公司基于F类2,常规-因素基于F类,使用F类负值设置为零F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算-因子(gt).与选择反射进行细化无关。-因素基于F类2在统计上大约是基于F类、和-基于所有数据的因素将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
O1公司0.67571 (16)0.5524 (2)0.46174 (9)0.0672 (4)
氧气0.83494(17)0.8807 (2)0.52180 (12)0.0718 (4)
C1类0.2221 (5)0.3458 (6)0.8467 (4)0.1353 (15)
甲型H1A0.25270.37280.91700.162*
H1B型0.11180.33930.82730.162*
指挥与控制0.2869 (5)0.1400 (6)0.8249 (3)0.1189 (12)
过氧化氢0.24630.10530.75590.143*
过氧化氢0.25590.03140.86420.143*
C3类0.4597(4)0.1463 (4)0.8472 (2)0.0911 (8)
H3A型0.49720.01330.82960.109*
H3B型0.50100.16780.91730.109*
补体第四成份0.5140 (3)0.3217 (3)0.78985 (15)0.0649 (5)
H4型0.46710.29580.71990.078*
C5级0.4514 (3)0.5281 (4)0.8149 (2)0.0806(6)
H5A型0.48320.63890.77710.097*
H5B型0.49210.55820.88430.097*
C6型0.2766 (4)0.5223 (6)0.7919 (3)0.1258 (13)
H6A型0.23930.65430.81070.151*
H6B型0.23570.50390.72150.151*
抄送70.6876 (3)0.3242 (3)0.80090 (15)0.0650 (5)
H7型0.71560.18480.78230.078*
抄送80.7775 (3)0.3614 (5)0.90618 (18)0.0876 (8)
H8型0.77450.25880.95280.105*
C9级0.8597 (3)0.5300(6)0.93588 (19)0.0947 (9)
H9型0.90770.54091.00260.114*
C10号机组0.8806 (3)0.7015 (5)0.87079 (18)0.0859 (8)
H10A型0.98820.73430.88370.103*
10小时0.82870.82470.88650.103*
C11号机组0.8579 (2)0.7884 (3)0.69386 (17)0.0616 (5)
H11型0.91690.90590.71590.074*
第12项0.8086 (2)0.7530 (3)0.59475 (15)0.0552 (5)
第13页0.72044 (19)0.5754 (3)0.56185 (13)0.0501 (4)
第14项0.6851 (2)0.4408 (3)0.62918 (14)0.0514 (4)
H14型0.62740.32240.60680.062*
第15项0.7338 (2)0.4775 (3)0.73125 (14)0.0539 (5)
第16号0.8218 (2)0.6528 (3)0.76285 (14)0.0610(5)
第17页0.5812 (3)0.3808 (4)0.42523 (17)0.0823(7)
H17A型0.55600.38260.35440.123*
17亿欧元0.48960.38950.44780.123*
H17C型0.63360.25320.44850.123*
第18号0.9424(3)1.0441 (4)0.5498 (2)0.0919 (8)
H18A型0.95781.11210.49190.138*
H18B型1.03730.98720.58700.138*
H18C型0.90511.14360.58960.138*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
O1公司0.0746 (9)0.0747(10)0.0547 (7)0.0196 (8)0.0205 (6)0.0016 (7)
氧气0.0705 (8)0.0596 (9)0.0941 (11)0.0131 (7)0.0367 (7)0.0036(8)
C1类0.136 (3)0.106 (3)0.203 (4)0.003 (2)0.117 (3)0.007(3)
指挥与控制0.154 (3)0.091 (2)0.141 (3)0.035 (2)0.092 (2)0.010 (2)
C3类0.140 (2)0.0570 (13)0.0913 (17)0.0017 (15)0.0577 (16)0.0064(12)
补体第四成份0.0840 (13)0.0572 (11)0.0592 (11)0.0032 (10)0.0287 (10)0.0082 (9)
C5级0.0939 (16)0.0562 (12)0.1033 (17)0.0071 (12)0.0465 (13)0.0113 (12)
C6型0.097 (2)0.102 (2)0.202(4)0.015 (2)0.081 (2)0.028 (3)
抄送70.0811 (13)0.0583 (11)0.0562 (11)0.0179 (11)0.0183 (9)0.0064 (9)
抄送80.0953(17)0.103 (2)0.0590 (13)0.0274 (17)0.0093 (12)0.0216 (14)
C9级0.0919 (18)0.123 (3)0.0570 (12)0.0246 (19)0.0047 (12)0.0068 (17)
C10号机组0.0874 (16)0.094(2)0.0661 (14)0.0091 (15)0.0004 (11)0.0205 (14)
C11号机组0.0474 (9)0.0562 (12)0.0812 (13)0.0035 (8)0.0157 (9)0.0141 (10)
第12项0.0431 (8)0.0527 (10)0.0743 (12)0.0006 (8)0.0229(8)0.0012 (9)
第13页0.0449 (9)0.0532 (10)0.0545 (10)0.0011 (7)0.0169 (7)0.0041 (8)
第14项0.0488 (9)0.0498 (10)0.0570(10)0.0028 (8)0.0157 (8)0.0043 (8)
第15项0.0546 (10)0.0544 (11)0.0532 (10)0.0115 (8)0.0140 (8)0.0018 (8)
第16号0.0533 (10)0.0637 (12)0.0623 (11)0.0095(9)0.0070 (9)0.0139 (10)
第17页0.0982 (16)0.0818 (16)0.0584 (12)0.0295 (14)0.0032 (11)0.0050 (11)
第18号0.0838 (16)0.0603 (14)0.146 (2)0.0186 (13)0.0553 (16)0.0067(15)
几何参数(λ,º) 顶部
2013年1月1.367 (2)C7-C8号机组1.516 (3)
O1-C17型1.409 (3)C7-H7型0.9800
氧气-C121.373 (2)C8-C9型1.318 (4)
氧气-C181.417(3)C8-H8型0.9300
C1-C2类1.503 (5)C9-C10型1.468 (5)
C1-C6号机组1.514 (5)C9-H90.9300
C1-H1A型0.9700C10-C16号机组1.505 (3)
C1-H1B型0.9700C10-H10A型0.9700
C2-C3型1.520 (5)C10-H10B型0.9700
C2-H2A型0.9700C11-C12号机组1.367 (3)
C2-H2B型0.9700C11-C16号1.395 (3)
C3至C41.529 (3)C11-H11型0.9300
C3-H3A型0.9700C12-C13型1.400(3)
C3-H3B型0.9700C13至C141.371 (3)
C4-C5型1.512 (3)C14-C15号1.406 (3)
C4至C71.543 (3)C14-H14型0.9300
C4-H4型0.9800C15至C161.384 (3)
C5至C61.537 (4)C17-H17A型0.9600
C5-H5A型0.9700C17-H17B型0.9600
C5-H5B型0.9700C17-H17C型0.9600
C6-H6A型0.9700C18-H18A型0.9600
C6-H6B型0.97002018年1月18日0.9600
C7-C15号机组1.512 (3)C18-H18C型0.9600
C13-O1-C17型117.13 (16)C4-C7-H7型106.8
C12-O2-C18型117.82 (19)C9-C8-C7124.2(2)
C2-C1-C6型111.0 (3)C9-C8-H8117.9
C2-C1-H1A型109.4C7-C8-H8型117.9
C6-C1-H1A型109.4C8-C9-C10型124.4 (2)
C2-C1-H1B型109.4C8-C9-H9型117.8
C6-C1-H1B型109.4C10-C9-H9型117.8
H1A-C1-H1B型108C9-C10-C16113.5 (2)
C1-C2-C3111.7 (3)C9-C10-H10A108.9
C1-C2-H2A109.3C16-C10-H10A型108.9
C3-C2-H2A109.3C9-C10-H10B108.9
C1-C2-H2B109.3C16-C10-H10B型108.9
C3-C2-H2B109.3H10A-C10-H10B型107.7
H2A-C2-H2B型107.9C12-C11-C16121.65 (18)
C2-C3-C4111.1 (2)C12-C11-H11119.2
C2-C3-H3A型109.4C16-C11-H11型119.2
C4-C3-H3A型109.4C11-C12-O2125.58 (18)
C2-C3-H3B型109.4C11-C12-C13型119.05 (17)
C4-C3-H3B型109.4氧气-C12-C13115.35 (16)
H3A-C3-H3B型108O1-C13-C14型125.16 (16)
C5-C4-C3109.39 (18)O1-C13-C12型115.19 (15)
C5-C4-C7113.54 (19)C14-C13-C12119.65(16)
C3-C4-C7型114.01 (19)C13-C14-C15型121.65 (17)
C5-C4-H4106.4C13-C14-H14型119.2
C3-C4-H4型106.4C15-C14-H14型119.2
C7-C4-H4型106.4C16-C15-C14型118.14 (17)
C4-C5-C6110.9(3)C16-C15-C7型123.28 (18)
C4-C5-H5A型109.5C14-C15-C7型118.58 (17)
C6-C5-H5A型109.5C15-C16-C11119.85 (17)
C4-C5-H5B型109.5C15-C16-C10121.5 (2)
C6-C5-H5B型109.5C11-C16-C10118.7 (2)
H5A-C5-H5B型108O1-C17-H17A型109.5
C1-C6-C5型111.1 (3)O1-C17-H17B型109.5
C1-C6-H6A型109.4H17A-C17-H17B型109.5
C5-C6-H6A109.4O1-C17-H17C型109.5
C1-C6-H6B型109.4H17A-C17-H17C型109.5
C5-C6-H6B型109.4H17B-C17-H17C型109.5
H6A-C6-H6B型108O2-C18-H18A型109.5
C15-C7-C8型110.8 (2)O2-C18-H18B型109.5
C15-C7-C4112.31 (16)H18A-C18-H18B109.5
C8-C7-C4112.98 (18)氧气-C18-H18C109.5
C15-C7-H7型106.8H18A-C18-H18C型109.5
C8-C7-H7型106.8H18B-C18-H18C型109.5
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-小时H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
C18-H18型A类···氧气0.962.593.272 (3)129
对称代码:(i)x个+2,+1/2,z(z)+1.
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-小时H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
C18-H18A···O20.962.593.272 (3)129
对称代码:(i)x个+2,+1/2,z(z)+1.
 

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衍射数据是在中国浙江大学化学系分析中心收集的。

工具书类

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