有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

二乙基2,2′-双(羟基亚氨基)-3,3′-(肼二酰亚基)二丁酸酯

中华人民共和国西安市现代化学研究所,邮编:710065b条教育部光电技术与智能控制重点实验室(兰州交通大学),兰州730070
*通信电子邮件:saviola1984@163.com

(收到日期:2012年1月10日; 2012年2月18日接受; 2012年2月24日在线)

标题化合物的每个分子量C12H(H)18N个4O(运行)6位于中心N-N键中点的反转中心。希夫碱基团的偶氮基团C=N具有E类构象和肟C=N-O基团中的偶氮基团具有Z轴构象。O–H?O氢键将相邻分子连接成垂直于轴。

相关文献

关于strobilurin A和strobilurin类似物的背景,请参见:Zhao等。(2007[Zhao,P.-L.,Liu,C.-L.,Huang,W.,Wang,Y.-Z.&Yang,G.-F.(2007).农业食品化学杂志.14,5697-5700。]); Balbaa(2007年【Balbaa,H.(2007),《环境科学与健康杂志》B部分,第4期,第441-451页。】); 等。(2010[李,M.,刘,C.-L.,杨,J.-C.,张,G.-B.,李,Z.-N.,张浩&李,Z.-M.(2010).农业食品化学杂志.5,2664-2667.]); 扎克哈里切夫等。(1999【Zakharychev,V.V.、Golubtsova,M.D.和Kovalenko,L.V.(1999)。俄罗斯化学公告。3495-500。】, 2001[Zakharychev,V.V.,Golubtsova,M.D.和Kovalenko,L.V.(2001)。Russ.J.Org.Chem.81184-1185]). 有关键长数据,请参见:Allen等。(1987【Allen,F.H.、Kennard,O.、Watson,D.G.、Brammer,L.、Orpen,A.G.和Taylor,R.(1987)。《化学与社会杂志》珀金分卷2,第S1-19页。】).

【方案一】

实验

水晶数据
  • C类12H(H)18N个4O(运行)6

  • M(M)第页= 314.30

  • 单诊所,P(P)21/c(c)

  • = 10.8587 (11) Å

  • b条= 8.3068 (9) Å

  • c(c)= 8.8465 (9) Å

  • β= 99.782 (2)°

  • V(V)= 786.36 (14) Å

  • Z轴= 2

  • K(K)α辐射

  • μ=0.11毫米−1

  • T型=296千

  • 0.18×0.18×0.1毫米

数据收集
  • 布鲁克APEXII CCD衍射仪

  • 3779次测量反射

  • 1385次独立反射

  • 1235次反射> 2σ()

  • R(右)整数= 0.015

精炼
  • R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.039

  • 水风险(F类2) = 0.110

  • S公司= 1.09

  • 1385次反射

  • 103个参数

  • 受约束的氢原子参数

  • Δρ最大值=0.20埃−3

  • Δρ最小值=-0.24埃−3

表1
氢键几何形状(λ,°)

D类-H月A类 D类-H(H) H月A类 D类A类 D类-H月A类
O3-H3……氧气 0.82 1.95 2.7577 (15) 170
对称代码:(i)[x,-y+{\script{1\over2}},z+{\sscript{1\ower2}}].

数据收集:4月2日(布鲁克,2007年[Bruker(2007),APEX2和SAINT.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊]); 细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,2007年[Bruker(2007),APEX2和SAINT.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊]); 数据缩减:圣保罗; 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 分子图形:谢尔克斯特尔(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于准备出版材料的软件:谢尔克斯特尔.

支持信息


注释顶部

strobilurins(Balbaa,2007;Li等。, 2010; 等。(2007)是最重要的一类农用杀菌剂,以Strobilurin A为先导化合物,可抑制电子转移在线粒体中,破坏代谢并阻止目标真菌的生长。2-羟基亚氨基-3-氧代丁酸的反应酯类水合肼可以生产出结构接近Strobilurin a(Zakharychev)的产品等。, 1999; 扎克哈里切夫等。, 2001). 在此,我们报告了合成和晶体结构该化合物为2,2'-(羟基亚氨基)-3,3'-叠氮二丁酸二乙酯。

图1给出了标题化合物的透视图,显示了原子编号方案。标题化合物的完整分子位于中心N-N键中点的反转中心。希夫碱C中的偶氮基团N组在E类肟C中的构型和偶氮基团N-O组位于Z轴配置。键长(艾伦等。,1987),并且分子中的角度在正常范围内。每个分子中有12个原子,包括C4、C4、C5、C5、C6、C6、N1、N1、氮气、氮气、O3、O3(对称代码:i=-x个, -, -z(z))共面,与它们的平均平面偏差较小,分别为0.090(3)、0.039(4)、0.026(3),0.030(1)、0.088(5)和0.007(1)Ω,与其他原子C1、C1的平均平面的偏差较小、C2、C2、C3、C3、O1、O1和O2、O2分别为0.778(2)、0.545(4)、0.396(5)、0.691(1)和1.523(7)Ω。同时,由C2、C3、C4、O1和O2定义的平面与主平面之间的二面角为87.87(2)°。

在标题化合物每个分子的晶体环境中,存在四个对称的等效分子间氢键O3-H3···O2(表1、图2),其中两个来自每个分子,两个分子充当氢键受体单元。每个分子将相邻分子连接成垂直于轴(图3)。

相关文献顶部

关于strobilurin A和strobilurin类似物的背景,请参见:Zhao等。(2007); Balbaa(2007);等。(2010); 扎克哈里切夫等。(1999, 2001). 有关键长数据,请参见:Allen等。(1987).

实验顶部

向乙酸(32 ml)乙酰乙酸乙酯(15 g)溶液中添加263 K的亚硝酸钠水溶液(25 ml),将反应混合物倒入冰水(100 ml)中,然后用乙醚(50 ml)萃取混合物三次。用水冲洗提取物,然后蒸馏掉溶剂,得到淡黄色的残留物。将该残渣溶解在甲醇(20 ml)中,并将溶液逐滴添加到273 K下水合肼(2.9 g,85%)、甲醇(50 ml)和水(37 ml)的混合物中,并在相同温度下将所得混合物搅拌6小时。用乙酸乙酯(50 ml)将反应混合物萃取两次,然后用水冲洗提取物并在硫酸镁上干燥,过滤并去除溶剂以得到粗产物。标题化合物通过柱色谱法用二氯甲烷和甲醇的混合物制备硅胶(R(右)(f)=0.35,20:1,V/V)作为洗脱液,提供标题化合物4.71 g,收率26.1%。m.p.473–475 K。1核磁共振氢谱(d6-二甲基亚砜):1.24(t,6H,J=7.10赫兹),1.96(s,6H),4.25(q,4H,J=7.08 Hz),12.54(s,2H)。

三周后,通过在室温下从二氯甲烷和甲醇的混合物中缓慢蒸发,获得适合X射线衍射研究的标题化合物的浅黄色块状单晶。

精炼顶部

碳结合氢原子被几何定位并包含在精细化使用距离为C-H=0.96º(CH)的骑行模型)和0.97º(CH2). 氧结合氢原子被定位在不同的傅里叶变换图中,并以0.85Ω的O-H距离进行细化。所有H原子的各向同性位移参数设置为1.2U型等式(适用于CH2)或1.5U型等式(适用于CH和OH)。

计算详细信息顶部

数据收集:4月2日(布鲁克,2007);细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,2007);数据缩减:圣保罗(布鲁克,2007);用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008);分子图形:谢尔克斯特尔(谢尔德里克,2008);用于准备出版材料的软件:谢尔克斯特尔(谢尔德里克,2008)。

数字顶部
[图1] 图1。采用原子编号方案的标题化合物的分子结构[对称代码:i)-x个, -, -z(z)]. 非氢原子的位移椭球以30%的概率水平绘制。
[图2] 图2。标题化合物的分子间氢键轴。为了清楚起见,省略了与氢键无关的氢原子。
[图3] 图3。分子间氢键视图,显示沿b条轴。为了清楚起见,省略了与氢键无关的氢原子。
2,2'-双(羟基亚氨基)-3,3'-(亚肼二亚基)二丁酸二乙酯顶部
水晶数据 顶部
C类12H(H)18N个4O(运行)6F类(000) = 332
M(M)第页= 314.30D类x个=1.327毫克
单诊所,P(P)21/c(c)熔点=473–475 K
大厅符号:-P 2ybcK(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
= 10.8587 (11) Å2318次反射的细胞参数
b条= 8.3068 (9) Åθ= 3.1–28.2°
c(c)= 8.8465 (9) ŵ=0.11毫米1
β= 99.782 (2)°T型=296千
V(V)= 786.36 (14) Å块状,黄色
Z轴= 20.18×0.18×0.1毫米
数据收集 顶部
布鲁克APEXII CCD
衍射仪
1235次反射> 2σ()
辐射源:细焦点密封管R(右)整数= 0.015
石墨单色仪θ最大值= 25.0°,θ最小值= 1.9°
ϕω扫描小时=612
3779次测量反射k个=99
1385次独立反射=1010
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.039氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.110受约束的氢原子参数
S公司= 1.09 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0587P(P))2+ 0.202P(P)]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
1385次反射(Δ/σ)最大值= 0.001
103个参数Δρ最大值=0.20埃
0个约束Δρ最小值=0.24埃
水晶数据 顶部
C类12H(H)18N个4O(运行)6V(V)= 786.36 (14) Å
M(M)第页= 314.30Z轴= 2
单诊所,P(P)21/c(c)K(K)α辐射
= 10.8587 (11) ŵ=0.11毫米1
b条= 8.3068 (9) ÅT型=296千
c(c)= 8.8465 (9) Å0.18×0.18×0.1毫米
β= 99.782 (2)°
数据收集 顶部
布鲁克APEXII CCD
衍射仪
1235次反射> 2σ()
3779次测量反射R(右)整数= 0.015
1385次独立反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0390个约束
水风险(F类2) = 0.110受约束的氢原子参数
S公司= 1.09Δρ最大值=0.20埃
1385次反射Δρ最小值=0.24埃
103个参数
特殊细节 顶部

几何图形所有的e.s.d.(除了两个l.s.平面之间的二面角中的e.s.d.)都是使用全协方差矩阵估计的。在估计距离、角度和扭转角中的e.s.d.时,单独考虑单元e.s.d;只有当e.s.d.的胞内参数由晶体对称性定义时,才使用它们之间的相关性。单元e.s.d.的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险以及贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,使用F类负值设置为零F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt).与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2在统计上大约是基于F类、和R(右)-基于所有数据的因素将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
C1类0.3173 (2)0.3855 (3)0.1974 (3)0.0815 (7)
甲型H1A0.28230.34860.09640.122*
H1B型0.25140.42290.24850.122*
H1C型0.37450.47200.18990.122*
指挥与控制0.38401 (17)0.2522 (2)0.2854 (2)0.0543 (5)
过氧化氢0.41930.28900.38770.065*
过氧化氢0.45200.21590.23550.065*
C3类0.29765 (13)0.00236 (17)0.20059 (16)0.0335 (3)
补体第四成份0.20477 (13)0.12983 (16)0.22471 (16)0.0350 (4)
C5级0.08145 (13)0.12936 (17)0.12596 (17)0.0364 (4)
C6级0.00087 (18)0.2722 (2)0.1254 (3)0.0702 (6)
H6A型0.07990.25110.06150.105*
H6B型0.03770.36360.08620.105*
h6厘米0.01370.29430.22810.105*
O1公司0.29746 (10)0.11865 (13)0.29545 (13)0.0455 (3)
氧气0.36466 (10)0.01499 (13)0.10565 (12)0.0442 (3)
臭氧0.34902 (10)0.22632 (15)0.40794 (13)0.0518 (4)
H3级0.36260.29980.47040.078*
氮气20.22952 (12)0.24201 (15)0.32449 (15)0.0431 (4)
N1型0.05904 (11)0.00033 (14)0.04649 (14)0.0372 (3)
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
C1类0.0890 (16)0.0520 (12)0.0992 (17)0.0159 (11)0.0036 (13)0.0098 (11)
指挥与控制0.0521 (10)0.0444 (10)0.0662 (11)0.0153 (7)0.0097 (9)0.0135 (8)
C3类0.0317 (7)0.0335 (8)0.0333 (7)0.0029 (6)0.0005 (6)0.0018 (5)
补体第四成份0.0343 (8)0.0335 (8)0.0370 (7)0.0025 (6)0.0056 (6)0.0020 (6)
C5级0.0333 (8)0.0356 (8)0.0399 (8)0.0008 (6)0.0051 (6)0.0025 (6)
C6级0.0517 (11)0.0600 (12)0.0899 (15)0.0196 (9)0.0140 (10)0.0303 (11)
O1公司0.0461 (7)0.0393 (6)0.0530 (7)0.0064 (5)0.0133 (5)0.0100 (5)
氧气0.0430 (6)0.0473 (7)0.0441 (6)0.0072 (5)0.0123 (5)0.0068 (5)
臭氧0.0424 (6)0.0549 (7)0.0529 (7)0.0011 (5)0.0065 (5)0.0187 (5)
氮气20.0381 (7)0.0438 (8)0.0458 (7)0.0014 (5)0.0026 (6)0.0101 (6)
N1型0.0318 (6)0.0352 (7)0.0420 (7)0.0003 (5)0.0012 (5)0.0008 (5)
几何参数(λ,º) 顶部
C1-C2类1.472 (3)C4-N2型1.2803 (19)
C1-H1A型0.9600C4-C5型1.469 (2)
C1-H1B型0.9600C5-N1型1.2822 (19)
C1-H1C型0.9600C5至C61.485 (2)
C2-O1型1.4663 (19)C6-H6A型0.9600
C2-H2A型0.9700C6-H6B型0.9600
C2-H2B型0.9700C6-H6C型0.9600
C3-O2型1.2056 (17)O3-N2气体1.3857 (17)
C3-O1型1.3097 (18)臭氧层-30.8200
C3至C41.5024 (19)N1-N1型1.401 (2)
C2-C1-H1A型109.5N2-C4-C3122.92 (13)
C2-C1-H1B型109.5C5-C4-C3118.66 (12)
H1A-C1-H1B型109.5N1-C5-C4113.40 (12)
C2-C1-H1C型109.5N1-C5-C6127.44 (14)
H1A-C1-H1C型109.5C4-C5-C6119.15 (13)
H1B-C1-H1C型109.5C5-C6-H6A109.5
O1-C2-C1型109.77 (16)C5-C6-H6B型109.5
O1-C2-H2A型109.7H6A-C6-H6B型109.5
C1-C2-H2A109.7C5-C6-H6C109.5
O1-C2-H2B型109.7H6A-C6-H6C型109.5
C1-C2-H2B109.7H6B-C6-H6C型109.5
H2A-C2-H2B型108.2C3-O1-C2118.11 (12)
氧气-C3-O1125.45 (13)N2-O3-H3109.5
氧气-C3-C4122.47 (13)C4-N2-O3型111.52 (12)
O1-C3-C4型112.07 (12)C5-N1-N1型113.25 (14)
N2-C4-C5气体118.38 (13)
O2-C3-C4-N2型93.59 (18)O2-C3-O1-C21.0 (2)
O1-C3-C4-N285.26 (17)C4-C3-O1-C2型179.80 (13)
O2-C3-C4-C584.22 (17)C1-C2-O1-C399.25 (19)
O1-C3-C4-C596.93 (15)C5-C4-N2-O3179.79 (12)
N2-C4-C5-N1型170.22 (14)C3-C4-N2-O32.0 (2)
C3-C4-C5-N111.88 (19)C4-C5-N1-N1型179.46 (13)
N2-C4-C5-C6型10.7 (2)C6-C5-N1-N11.6 (3)
C3-C4-C5-C6型167.18 (16)
对称代码:(i)x个,,z(z).
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
O3-H3···O2ii(ii)0.821.952.7577 (15)170
对称代码:(ii)x个,+1/2,z(z)+1/2.

实验细节

水晶数据
化学配方C类12H(H)18N个4O(运行)6
M(M)第页314.30
晶体系统,空间组单诊所,P(P)21/c(c)
温度(K)296
,b条,c(c)(Å)10.8587 (11), 8.3068 (9), 8.8465 (9)
β(°)99.782 (2)
V(V))786.36 (14)
Z轴2
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)0.11
晶体尺寸(mm)0.18 × 0.18 × 0.10
数据收集
衍射仪布鲁克APEXII CCD
衍射仪
吸收校正
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
3779, 1385, 1235
R(右)整数0.015
(罪θ/λ)最大值1)0.595
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.039, 0.110, 1.09
反射次数1385
参数数量103
氢原子处理受约束的氢原子参数
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))0.20,0.24

计算机程序:4月2日(布鲁克,2007),圣保罗(布鲁克,2007),SHELXS97标准(谢尔德里克,2008),SHELXL97型(谢尔德里克,2008),谢尔克斯特尔(谢尔德里克,2008)。

氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
O3-H3···O20.821.952.7577 (15)170
对称代码:(i)x个,+1/2,z(z)+1/2.
 

致谢

作者感谢中国国防工业技术发展计划基金会(批准号:B09201100051)的支持。

工具书类

第一次引用Allen,F.H.、Kennard,O.、Watson,D.G.、Brammer,L.、Orpen,A.G.和Taylor,R.(1987年)。化学杂志。Soc.Perkin事务处理。2第S1-19页交叉参考 科学网 谷歌学者
第一次引用Balbaa,H.(2007)。J.环境。科学。健康B部分,4, 441–451. 谷歌学者
第一次引用Bruker(2007)。4月2日圣保罗.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊谷歌学者
第一次引用Li,M.,Liu,C.-L.,Yang,J.-C.,Zhang,G.-B.,Li,Z.N.,Zang,H.&Li,Z-M.(2010)。《农业杂志》。食品化学。 5, 2664–2667. 科学网 交叉参考 谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(2008)。《水晶学报》。A类64, 112–122. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Zakharychev,V.V.、Golubtsova,M.D.和Kovalenko,L.V.(1999)。俄罗斯化学。牛。 , 495–500. 科学网 交叉参考 谷歌学者
第一次引用Zakharychev,V.V.、Golubtsova,M.D.和Kovalenko,L.V.(2001)。Russ.J.有机化学。 8, 1184–1185. 科学网 交叉参考 谷歌学者
第一次引用Zhao,P.-L.,Liu,C.-L.,Huang,W.,Wang,Y.-Z.和Yang,G.-F.(2007)。《农业杂志》。食品化学。 14, 5697–5700. 科学网 交叉参考 谷歌学者

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