有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

2-[(2-氯苯基)亚氨基甲基]-4,6-二碘苯酚

南京大学药物生物技术国家重点实验室,南京210093,中华人民共和国,江苏天生药业有限公司,江苏句容212415
*通信电子邮件:hailiang_zhu@163.com

(收到日期:2012年2月8日; 2012年2月18日接受; 2012年2月24日在线)

这个非对称单元标题化合物的C13H(H)8氯离子2NO,包含位于镜面上的一半分子。羟基参与分子内O-H…N氢键的形成。ππ相邻分子苯环之间的相互作用[质心-质心距离=3.629(3)沿着b条轴。在晶体中,观察到弱的C-H…O和C-H…Cl相互作用。

相关文献

有关标准粘合距离,请参见:Allen等。(1987【Allen,F.H.、Kennard,O.、Watson,D.G.、Brammer,L.、Orpen,A.G.和Taylor,R.(1987)。《化学与社会杂志》珀金分卷2,第S1-19页。】)。有关化合物的晶体结构,请参见:Francis等。(2003【Francis,S.,Mu­thiah,P.T.,Venkatachalam,G.和Ramesh,R.(2003)。晶体学报E59,o1045-o1047。】); 威瑟等。(2006[Weiser,M.-S.,Wesolek,M.&Mulhaupt,R.(2006)。有机物化学杂志6912945-2952。]); 巴巴等。(2009【Barba,V.、Hernandez,R.、Hopfl,H.、Santillan,R.和Farfan,N.(2009),《有机化学杂志》694、2127-2133。】).

【方案一】

实验

水晶数据
  • C类13H(H)8氯离子2

  • M(M)第页= 483.45

  • 正交各向异性,P(P) n个

  • = 15.8432 (17) Å

  • b条= 6.9942 (8) Å

  • c(c)= 13.1975 (14) Å

  • V(V)= 1462.4 (3) Å

  • Z轴= 4

  • Kα辐射

  • μ=4.47毫米−1

  • T型=296千

  • 0.20×0.10×0.10mm

数据收集
  • Bruker SMART CCD面阵探测器衍射仪

  • 吸收校正:多扫描(SADABS公司; 谢尔德里克,1996年[Sheldrick,G.M.(1996),SADABS,德国哥廷根大学。])T型最小值= 0.468,T型最大值= 0.663

  • 9861次测量反射

  • 1829次独立反思

  • 1659次反射> 2σ()

  • R(右)整数= 0.029

精炼
  • R(右)[F类2> 2σ(F类2)]=0.039

  • 水风险(F类2) = 0.144

  • S公司= 0.98

  • 1829次反射

  • 113个参数

  • 1个约束

  • 用独立和约束精化的混合物处理H原子

  • Δρ最大值=1.13埃−3

  • Δρ最小值=-0.76埃−3

表1
氢键几何形状(λ,°)

D类-H月A类 D类-H(H) H月A类 D类A类 D类-H月A类
O1-H1型A类●N1 0.84 (2) 1.95 (8) 2.568 (8) 130 (9)
C11-H11型A类2010年1月 0.93 2.57 3.496 (8) 178
C12-H12型A类·Cl1 0.93 2.83 3.640 (8) 147
对称代码:(i)[x+{\script{1\over2}},-y+{\sscript{1\ever2}{,-z-{\script}1\over 2}}].

数据收集:智能(布鲁克,1998年[Bruker(1998)。SMART和SAINT。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。]); 细胞精细化: 圣人(布鲁克,1998年[Bruker(1998)。SMART和SAINT。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。]); 数据缩减:圣人; 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 分子图形:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司.

支持信息


注释顶部

希夫碱因其结构和应用而被广泛研究。在本论文中,我们介绍了标题化合物(I)(图1)-一种新的希夫碱化合物。

这个非对称单元(I)包含一半位于镜面上的分子。化合物的分子采用E类关于C=N键的配置。羟基参与分子内O-H··N氢键的形成(表1)。粘合距离在正常值范围内(Allen等。,1987),并与相关化合物的文献中报告的化合物(Weiser等。, 2006; 巴巴多斯等。, 2009; 弗兰西斯等。, 2003).

ππ相邻分子苯环之间的相互作用[中心距=3.629(3)Au]沿轴形成堆叠b条弱的分子间C-H··O和C-H··Cl相互作用(表1)进一步巩固了晶体堆积。

相关文献顶部

有关标准粘合距离,请参见:Allen等。(1987). 有关化合物的晶体结构,请参见:Francis等。(2003); 威瑟等。(2006); 巴巴等。(2009).

实验顶部

将3,5-二碘水杨醛(0.37 g,1 mmol)和2-氯苯胺(0.13 g,1 mm ol)混合在乙醇(20 ml)中。在室温下将混合物搅拌30分钟,得到黄色溶液。通过在空气中缓慢蒸发含有该化合物的溶液获得黄色块状单晶。

精炼顶部

C-束缚H原子被几何定位,并允许骑在其母原子上,C-H=0.93 Au和U国际标准化组织=1.2 U等式(C) ●●●●。原子H1位于差分图上,并进行了各向同性细化。

计算详细信息顶部

数据收集:智能(布鲁克,1998);细胞精细化: 圣人(布鲁克,1998);数据缩减:圣人(布鲁克,1998);用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008);分子图形:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008);用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

数字顶部
[图1] 图1。标题化合物的分子结构,显示了原子标记方案。位移椭球体在30%概率水平下绘制。分子内氢键用虚线表示。
2-[(2-氯苯基)亚氨基甲基]-4,6-二碘苯酚顶部
水晶数据 顶部
C类13H(H)8氯离子2D类x个=2.196毫克
M(M)第页= 483.45Kα辐射,λ= 0.71073 Å
正交各向异性,P(P)n个897次反射的细胞参数
= 15.8432 (17) Åθ= 2.4–24.5°
b条= 6.9942 (8) ŵ=4.47毫米1
c(c)= 13.1975 (14) ÅT型=296千
V(V)= 1462.4 (3) Å块,黄色
Z轴= 40.20×0.10×0.10mm
F类(000) = 896
数据收集 顶部
Bruker SMART CCD区域探测器
衍射仪
1829次独立反思
辐射源:精细聚焦密封管1659次反射> 2σ()
石墨单色仪R(右)整数= 0.029
ω扫描θ最大值= 27.6°,θ最小值=2.0°
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,1996)
小时=2020
T型最小值= 0.468,T型最大值= 0.663k个=99
9861次测量反射=1717
精炼 顶部
优化于F类2二次原子位置:差分傅里叶映射
最小二乘矩阵:完整氢站点位置:从邻近站点推断
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.039用独立和约束精化的混合物处理H原子
水风险(F类2) = 0.144 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.1P(P))2+ 4.5P(P)]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3个
S公司= 0.98(Δ/σ)最大值< 0.001
1829次反射Δρ最大值=1.13埃
113个参数Δρ最小值=0.76埃
1个约束消光校正:SHELXL97型(谢尔德里克,2008),Fc*=kFc[1+0.001xFc2λ/罪(2θ)]-1/4
主原子位置定位:结构-变量直接方法消光系数:0.0030(6)
水晶数据 顶部
C类13H(H)8氯离子2V(V)= 1462.4 (3) Å
M(M)第页= 483.45Z轴= 4
正交各向异性,P(P)n个Kα辐射
= 15.8432 (17) ŵ=4.47毫米1
b条= 6.9942 (8) ÅT型=296千
c(c)= 13.1975 (14) Å0.20×0.10×0.10mm
数据收集 顶部
Bruker SMART CCD区域探测器
衍射仪
1829次独立反思
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,1996)
1659次反射> 2σ()
T型最小值= 0.468,T型最大值= 0.663R(右)整数= 0.029
9861次测量反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0391个约束
水风险(F类2) = 0.144用独立和约束精化的混合物处理H原子
S公司= 0.98Δρ最大值=1.13埃
1829次反射Δρ最小值=0.76埃
113个参数
特殊细节 顶部

几何图形.所有e.s.d.(除了两个l.s.平面之间二面角中的e.s.d.)均使用全协方差矩阵进行估计。在估计e.s.d.的距离、角度和扭转角时,单独考虑单元e.s.d;只有当由晶体对称性定义时,才使用电解槽参数中e.s.d.之间的相关性。单元e.s.d.的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,使用F类负值设置为零F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt)等等.与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2在统计上大约是基于F类、和R(右)-基于所有数据的因素将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
I1类0.19354 (3)0.25000.09648 (5)0.0692 (3)
I2类0.44288 (3)0.25000.43751 (4)0.0582 (3)
C3类0.3198 (4)0.25000.1448 (5)0.0444 (16)
指挥与控制0.3847 (4)0.25000.0744(6)0.0470 (17)
C5型0.4191 (4)0.25000.2817 (5)0.0403(14)
O1公司0.3668 (3)0.25000.0237 (4)0.076 (2)
补体第四成份0.3362 (4)0.25000.2491 (5)0.0395 (13)
H4A型0.29210.25000.29560.047*
C6级0.4851 (4)0.25000.2125 (5)0.0404 (14)
H6A型0.54060.25000.23520.048*
第1类0.46567 (14)0.25000.26597 (17)0.0654 (6)
C10号机组0.6308(6)0.25000.3086 (7)0.056 (2)
H10A型0.61460.25000.37640.068*
N1型0.5265 (4)0.25000.0572 (4)0.0456 (14)
第12项0.7400 (5)0.25000.1822 (9)0.073 (3)
H12A型0.79680.25000.16470.088*
第13页0.6773 (5)0.25000.1049 (8)0.065 (2)
H13A型0.69320.25000.03700.078*
抄送80.5925 (4)0.25000.1305 (6)0.0437 (15)
C1类0.4679 (4)0.25000.1090 (5)0.0353 (13)
C9级0.5697 (4)0.25000.2316 (6)0.0442 (15)
C11号机组0.7168 (7)0.25000.2820 (9)0.078 (3)
H11A型0.75790.25000.33230.094*
抄送70.5388 (4)0.25000.0385 (6)0.0432 (15)
H7A型0.59370.25000.06350.052*
甲型H1A0.404 (5)0.25000.069 (6)0.06 (3)*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
I1类0.0239 (3)0.1386 (7)0.0450 (4)00.00480 (18)0
I2类0.0463 (3)0.0979 (5)0.0303 (3)00.00509 (18)0
C3类0.025(3)0.078 (5)0.030 (3)00.005 (2)0
指挥与控制0.024 (3)0.079(5)0.037 (4)00.006 (3)0
C5型0.028 (3)0.065(4)0.027 (3)00.004(2)0
O1公司0.027 (3)0.171 (7)0.029 (3)00.002 (2)0
补体第四成份0.032 (3)0.055 (4)0.031 (3)00.001 (2)0
C6级0.025 (3)0.054 (4)0.043 (4)00.006 (2)0
第1类0.0433 (10)0.1094 (18)0.0435 (11)00.0023 (8)0
C10号机组0.057(5)0.067 (5)0.046 (4)00.024 (4)0
N1型0.032 (3)0.070 (4)0.035 (3)00.008 (2)0
第12项0.018 (3)0.122 (8)0.081 (7)00.010 (4)0
第13页0.028 (3)0.107 (7)0.060 (6)00.004 (3)0
抄送80.033 (3)0.058 (4)0.041 (4)00.011(3)0
C1类0.023 (3)0.049(3)0.034 (3)00.002 (2)0
C9级0.033 (3)0.060(4)0.039 (4)00.008 (3)0
C11号机组0.070 (6)0.091 (7)0.075 (7)00.050 (6)0
抄送70.023 (3)0.061 (4)0.046 (4)00.003 (3)0
几何参数(Å,º) 顶部
I1-C32.100 (6)C10-C11号机组1.407 (15)
I2-C5型2.090 (6)C10-H10A型0.9300
C3-C2型1.386 (10)N1-C7型1.278 (10)
C3-C4型1.400 (9)N1-C8型1.425 (8)
C2-O1型1.325 (9)C12-C11号机组1.368 (16)
C2-C1型1.395 (9)C12-C13型1.424 (13)
C5-C4类1.383 (9)C12-H12A型0.9300
C5至C61.388 (9)C13-C8型1.385(11)
O1-H1A型0.84 (2)C13-H13A型0.9300
C4-H4A型0.9300C8-C9型1.382 (11)
C6-C1型1.393(9)C1-C7号机组1.459 (9)
C6-H6A型0.9300C11-H11A型0.9300
氯1-C91.709 (7)C7-H7A型0.9300
C10-C9号机组1.404 (9)
C2-C3-C4型121.4 (6)C11-C12-H12A型119.9
C2-C3-I1型120.2 (5)C13-C12-H12A型119.9
C4-C3-I1型118.4 (5)C8-C13-C12号机组120.1 (9)
O1-C2-C3型119.8(6)C8-C13-H13A型120
O1-C2-C1型121.5 (6)C12-C13-H13A型120
C3-C2-C1118.8 (6)C9-C8-C13型119.3 (7)
C4-C5-C6120.7 (6)C9-C8-N1117.6 (6)
C4-C5-I2型118.5 (5)C13-C8-N1型123.0 (7)
C6-C5-I2型120.8 (5)C6-C1-C2120.4 (6)
C2-O1-H1A型123 (7)C6-C1-C7型118.4 (6)
C5-C4-C3118.9 (6)C2-C1-C7型121.3 (6)
C5-C4-H4A型120.6C8-C9-C10型121.2 (7)
C3-C4-H4A型120.6C8-C9-Cl1号机组120.6 (5)
C5-C6-C1119.9 (6)C10-C9-氯1118.2 (7)
C5-C6-H6A120C12-C11-C10120.0 (8)
C1-C6-H6A基因120C12-C11-H11A型120
C9-C10-C11119.1 (8)C10-C11-H11A型120
C9-C10-H10A120.4N1-C7-C1120.8 (6)
C11-C10-H10A型120.4N1-C7-H7A型119.6
C7-N1-C8型124.0 (6)C1-C7-H7A型119.6
C11-C12-C13型120.2 (8)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
O1-H1型A类···N1型0.84 (2)1.95(8)2.568 (8)130 (9)
C11-H11型A类···O1公司0.932.573.496 (8)178
C12-H12型A类···第1类0.932.833.640 (8)147
对称代码:(i)x个+1/2,+1/2,z(z)1/2.

实验细节

水晶数据
化学配方C类13H(H)8氯离子2
M(M)第页483.45
晶体系统,空间组正交各向异性,P(P)n个
温度(K)296
,b条,c(c)(Å)15.8432 (17), 6.9942 (8), 13.1975 (14)
V(V))1462.4 (3)
Z轴4
辐射类型Kα
µ(毫米1)4.47
晶体尺寸(mm)0.20 × 0.10 × 0.10
数据收集
衍射仪布吕克智能CCD区域探测器
衍射仪
吸收校正多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,1996)
T型最小值,T型最大值0.468, 0.663
测量的、独立的和
观察到的[> 2σ()]反射
9861, 1829, 1659
R(右)整数0.029
(罪θ/λ)最大值1)0.652
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.039, 0.144, 0.98
反射次数1829
参数数量113
约束装置数量1
氢原子处理用独立和约束精化的混合物处理H原子
Δρ最大值,Δρ最小值(eó))1.13,0.76

计算机程序:智能(布鲁克,1998),圣人(布鲁克,1998),SHELXS97标准(谢尔德里克,2008),SHELXL97型(谢尔德里克,2008),SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
O1-H1A···N10.84 (2)1.95 (8)2.568(8)130 (9)
C11-H11A···O10.932.573.496 (8)178
C12-H12A··Cl10.932.833.640 (8)147
对称代码:(i)x个+1/2,+1/2,z(z)1/2.
 

工具书类

第一次引用Allen,F.H.、Kennard,O.、Watson,D.G.、Brammer,L.、Orpen,A.G.和Taylor,R.(1987年)。化学杂志。Soc.Perkin事务处理。2第S1-19页交叉参考 科学网 谷歌学者
第一次引用Barba,V.、Hernandez,R.、Hopfl,H.、Santillan,R.和Farfan,N.(2009年)。《有机计量学杂志》。化学。 694,2127–2133科学网 CSD公司 交叉参考 中国科学院 谷歌学者
第一次引用布鲁克(1998)。智能圣人.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊谷歌学者
第一次引用Francis,S.、Mu­thiah,P.T.、Venkatachalam,G.和Ramesh,R.(2003)。《水晶学报》。E类591045年至1047年科学网 CSD公司 交叉参考 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(1996)。SADABS公司。德国哥廷根大学。 谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(2008)。《水晶学报》。A类64,112–122科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Weiser,M.-S.,Wesolek,M.&Mulhaupt,R.(2006)。《有机计量学杂志》。化学。 691, 2945–2952. 科学网 CSD公司 交叉参考 中国科学院 谷歌学者

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通信
国际标准编号:2056-9890