2.1. 设计理念

冰熊是通过用户的web浏览器访问的基于web的应用程序。它是用PHP脚本语言编写的，运行在Apache web服务器上，后台运行MySQL或MariaDB数据库。所有这些组件都运行在低成本的Linux计算机上，最新的Ubuntu Server LTS版本是Linux发行版的首选。

冰熊旨在赋予研究人员权力，而不是妨碍他们。其目的是鼓励研究人员以用户友好的方式尽快提供所有信息，但在必要时不要坚持。压倒一切的理念是提供一个干净且最小的界面，只关注手头的任务。界面可以根据用户的偏好和工作习惯进行配置，包括主页的布局和内容（图3).

图3 这个冰熊主页。“最新板材检查”模块提供了项目业主应分配给项目的最新进口板材检查的信息。“任务”块提醒项目所有者需要注意的任务。“Imager overview”（成像仪概览）砖可可视化成像系统上的负载。右上：搜索框可用于在搜索平板条码、针条码、冰球条码、杜瓦条码、样品名称或PDB代码时查找相关页面。滚轮按钮允许选择此页面的首选配置。问号按钮提供此页面的帮助。操作按钮指向可启动各种操作的页面（见正文）。

除其他方式外，鼓励用户通过突出显示需要注意的动作和在研究人员主页上显示个性化任务列表来执行所需的动作。这种方法超越了冰熊例如，当需要从成像仪中取出结晶板时，将项目添加到用户的任务列表中。

沿着结构确定管道前进时，可以使用灵活的工具记录信息。例如，用户可以添加注释和/或上载包含信息的文件。一旦系统选择了一个晶体并为其指定了样品名称，这一点尤其重要。将文件或注释（例如与电子实验室笔记本的链接）作为与板材相关的元数据，也是保存上游信息（例如样品质量）的好方法。具有写访问权限的项目成员可以添加注释和文件，例如在晶体冷冻期间、数据收集期间或以后。此类注释和文件有助于向其他项目成员通报项目进度。注释还允许将样本链接到其他电子实验室笔记本。

2.2. 安装和更新

冰熊设计为由具有root权限的相当熟练的计算机用户安装冰熊已安装。安冰熊安装程序已经开发完成。初始安装脚本配置服务器，安装任何必要的包和PHP扩展，以及配置基本防火墙。然后在web浏览器中继续安装，其中提供了管理员用户名和密码，以及任何现场成像硬件的连接详细信息。还执行从成像系统批量导入用户的初始操作。

冰熊任何具有管理权限的用户都可以更新到更高版本。这是通过web应用程序本身内的专用用户界面执行的；大多数情况下不需要输入或命令行交互。

标准安装冰熊可以导入Formulatrix（带Rock Maker用户界面）和Rigaku（带CrystalTrak用户界面）成像设备生成的结晶液滴图像。当使用Formulatrix/Rock Maker设置时，其他结晶元数据由项目所有者使用用户友好的GUI提供，如下所述。对于Rigaku/CrystalTrak设置，其他元数据的导入可以以相同的方式执行，根据当地情况进行小的调整。如冰熊网站(https://icebear.fi/)，并根据麻省理工学院许可证分发。这个冰熊该网站提供了大量的文档，并有一个到演示服务器的链接，允许使用中实现的功能和协议进行实践冰熊.冰熊安装在芬兰奥鲁大学、赫尔辛基大学、图尔库大学和奥博·阿卡德米大学以及以色列魏茨曼科学研究所的蛋白质晶体学研究中心。

2.3. 家庭实验室的管理

平稳运行冰熊安装要求当地蛋白质结晶学社区的一名成员充当专家管理者。任务包括处理软件更新以及监视实时系统及其备份使用的磁盘空间。理想情况下，该任务应分配给非常熟悉结晶设施日常操作所涉及协议的人员。训练新人很重要冰熊并指出有关用户权限和操作模式的基本原则。需要为新用户分配用户名和适当的权限。存在多个用户类别。一个特殊类别的用户（发货人）可以协调向ISPyB上传与一个或多个杜瓦瓶到同步加速器的物理装运相对应的元数据。发货人需要访问数据收集会话的ISPyB“提案”。一个关键的用户类别是项目所有者，他可以向项目添加新的蛋白质和序列，也可以向项目组添加具有用户权限的研究人员。第三类用户（具有写权限的项目成员）可以上传笔记和文件，也可以选择水晶。用户的基本类别（项目来宾，具有读取权限）可以查看项目的所有信息，但无法更改。用户管理非常灵活，用户权限可以轻松添加、删除或转移。提供了在线用户手册，并集成了上下文相关的帮助功能。

2.4。这个冰熊主页

主页（图3)提供了一般信息，例如有关成像仪负载的信息，以及过期并应从成像仪中取出的板上的警告。如果结晶信息不完整或同步加速器数据采集所需的其他元数据尚不可用，也会警告用户。主页是可配置的；个人用户可以添加、删除和重新排列元素，以满足他们的需要和工作方式。例如，管理员可以添加磁盘使用情况图，以启用两者使用的磁盘空间冰熊以及将被监控的成像系统。

正如后续章节中所讨论的，主页上的搜索框（图3的右上角)而许多其他页面是一个导航工具，可以访问包含相关信息的页面。通过主页（右上角）上的操作按钮打开一个页面，该页面提供了各种操作的链接，例如开始新项目、新的晶化会话或新发货，以及现有项目的信息（图4)。在此页面上，还提供了与屏幕和板类型信息以及已知容器（别针、圆盘、杜瓦瓶）信息相关的页面链接冰熊.

图4 项目模块。(一)“板材”选项卡列出了该项目的所有板材（Murthy等。, 2018)。“说明”栏提供了钢板所有者提供的简短说明，可在首次检查可用时提供。当该板的一滴被划伤时，“最佳得分”栏突出显示（图5)或者如果选择了一滴中的晶体（图6)在drop-viewer菜单中。(b条)蛋白质选项卡提供了首字母缩写的信息，以及更完整的蛋白质名称，并可以给出描述。每个蛋白质可以有几个结构体，这些结构体可以有多个序列。(c（c）)Crystals（晶体）选项卡突出显示从该板中选择的所有晶体。

2.5. 设置项目

这个冰熊数据库是围绕项目构建的，涉及给定蛋白质或蛋白质组的所有工作。设置项目时，需要名称和简短描述（图4一)。创建项目后，必须在其中创建至少一个蛋白质。创建蛋白质时，项目所有者决定在同步加速器收集数据时用于安全表的缩写词（在ESRF称为a表，在DLS称为ERA表）。软件在生成选定晶体的样本名称时也会使用首字母缩写词，稍后将进行讨论。在一个项目中，可以为不同的蛋白质指定几个缩写词。区分大小写的首字母缩写词应尽可能短（建议最多五个字符），并且不应包含特殊字符。不同的项目可以使用相同的首字母缩写词。

每个蛋白质可以有几个序列集，称为结构（例如野生型序列和点突变序列）。如果所研究的蛋白质是不同序列的多条链的集合，则每个构造都可以有多个序列。在大多数情况下，会有一个序列，但在异二聚体（或通常的异低聚物）的结晶实验中，一组中可能有多个序列。在一个项目中可能有多个序列集，例如，在同一项目中研究突变变体（例如点突变变体）时。在不同的项目中（例如，不同的域）也可能有变异的变体，但仍然使用相同的首字母缩写词。一般来说，良好的做法是蛋白质的蛋白质序列包括已使用的标签，这也是在PDB中沉积结构时所需的(https://www.wwpdb.org/documentation/policy网站)。该序列信息可以作为核苷酸序列（然后将其转换为氨基酸序列）或氨基酸序列提供。设置项目包括为已经拥有冰熊账户，这样就可以组建小型项目小组来监控项目的进度。具有写权限的项目成员可以上传笔记和文件，并可以选择晶体进行数据收集。项目所有者、项目成员和项目来宾可以共同监控项目的可用信息。项目页面还提供了已选择的所有晶体的列表（图4c（c）).

2.6. 设置结晶板，为每个板提供元数据，并导入和分配板检查到项目

在标准工作流程中，结晶板是手动制备或使用纳米分配器制备的。这些板具有96-well标准格式，结晶液滴由自动成像系统成像。每个孔的板可以有一滴或三滴(补充图S1一)。当使用带有三滴的平板时，对于不同的蛋白质浓度、不同的配体或不同的蛋白质，可以使用相同的微孔溶液。此信息可提供给冰熊以用户友好的格式。屏幕上的信息也可以多种格式提供，包括CSV、Rock Maker XML(https://formulatrix.com/lifescience-automation-blog/rock-maker-xml-screen-updates/)和MIMER（布罗德森等。, 2013)格式（图5,补充图S1b条)。一旦板被成像，冰熊将平板信息（由平板条形码识别）从成像仪导入其数据库，设置其温度和平板类型，导入图像并将平板分配给根据成像系统提供的元数据设置的研究人员。这个冰熊软件不断检查成像系统是否生成了新图像。实际上，导入任何新图像都有5分钟的延迟。在平板信息页面（图5)也可以为该板做笔记并上传文件，这些文件可以是包含屏幕信息的文件，也可以是包含与该板相关笔记的任何其他文件（例如添加剂和配体）。平板所有者随后通过设置其蛋白质和结构将平板分配给项目。平板所有者还提供了平板上的附加信息，例如结晶屏幕、滴体积和每个平板使用的蛋白质缓冲液（包括蛋白质浓度）。这可以在第一次板检查可用或以后进行。研究人员制作的屏幕信息也可以作为简单的两列文本文件提供。

图5 平板信息页面。“检查”选项卡列出了此板的所有可用检查。晶体选项卡列出了所有选定的晶体（另请参见图4c（c）)。“蛋白质”选项卡中的黄色三角形(补充图S1一)和屏幕选项卡(补充图S1b条)通知平板所有者，蛋白质缓冲液和屏幕信息尚未分别提供。文件和注释选项卡可用于提供与此铭牌相关的额外信息。

2.7. 监测结晶结果并选择晶体

的关键模块冰熊软件是drop viewer（图6)。下拉查看器的页面可以通过多种方式访问，它有五个主要功能（图6)。（i） 测量和记分，允许快速免提查看平板的所有图像以及记分和（由成像仪提供刻度信息的）晶体尺寸测量。（ii）查看成像历史，可以将滴落内容随时间的变化视为显示不同检查中记录的相同滴落的电影(补充图S2一)。（iii）显示结晶条件和其他关键信息（图7一)。（iv）晶体选择，允许标记晶体以便继续加工。（v） 导航，显示可在可见图像和紫外线图像之间切换的板块概览，以及井内所有子位置的并排比较(补充图S2b条)。通过键盘快捷键可以实现快速交互。

图6 拖放查看器的拖放页面。拖放查看器有五个页面，由右下角的五个图标表示。下拉页面可用于使用右上角的箭头浏览平板上的各个下拉菜单（键盘的箭头键也可用于从一个下拉菜单浏览到另一个下拉列表）。可以选择颜色代码来提供有关拖放内容的信息。其他图标（右下角）表示时间推移(补充图S2一)，结晶条件（图7一)，晶体选择（图7b条)和板块概述(补充图S2b条).

图7 拖放查看器。(一)结晶条件。提供了井液缓冲液和蛋白质缓冲液的组成和pH值。(b条)水晶选择页面。在本例中，选择了一个晶体，并提供了其样品名称（LMTIM_9098A07d1c1），该名称由样品首字母缩写、板条形码、孔、滴和晶体编号构成（见正文）。选择晶体后，可以使用用户选择的扩展名扩展系统生成的样本名称，但样本名称不应超过27个字符（请参阅文本）。此外，在此阶段，将生成一个水晶页面，单击“查看全部详细信息”（右上角）即可访问该页面。QuickFish选项（右上角）允许将水晶连接到条形码引脚，与预定的同步加速器访问无关。ISPyB的信息也可以在此阶段添加到右侧面板“下一次同步加速器跳闸的信息”中。

选择页面上标记的晶体具有独特的样品名称。样品名称由板条形码扩展的首字母缩写以及井号、滴号和晶体号生成（图7b条)。用户可以扩展样本名称，以简化自定义标识和后续导航。对于ISPyB，样本名称最多可以有45个字符，但建议最大长度为27个字符，因为不同的同步加速器具有不同的实现。可以在此阶段（或稍后）指定空间组，单元格尺寸，已知和所需的分辨率，将在装运期间自动上传到ISPyB。还可以在本页面上选择的每个晶体上添加注释，现在通过其样品名称进行识别，也可以在项目的各个后期阶段添加注释，例如在晶体处理步骤（如低温冷却）、数据收集过程中以及随后在晶体页面上添加注释，例如在细化结构时。衍射图像、数据处理日志文件和扫描笔记等文件可以附在晶体上。晶体选择页面上有一个“quick-fish”选项（图7b条)如果晶体被打捞并安装在条形码引脚上，则与运送到同步加速器无关，例如用于在家中采集数据。此选项将水晶链接到冰熊数据库。如果需要同步加速器数据采集，可以将此针加晶体直接移动到晶片模块中的冰球上（或在完成装运时）。

2.8. 使用晶体成膜模块时的晶体冷冻工作台冰熊

在晶体选择页面上，可以在实际晶体观察之前识别带有合适晶体的液滴。为了采集和冷冻选定的晶体，晶体安装工作台区域需要配备一台显微镜，用于观察晶体，并为预选的针和圆盘提供足够的空间，以及一台带有条形码阅读器的计算机，用于读取杜瓦、圆盘、针和板的条形码。建议使用高质量的条形码阅读器，以确保可靠地读取小针脚条形码。水晶捕鱼GUI经过优化，可以与触摸屏一起使用，但也可以与鼠标一起使用。为了运行，计算机应该可以访问互联网冰熊并连接到同步加速器ISPyB网站。晶体安装台上还应提供用于晶体冷冻冷却和存储圆盘的液氮。强烈建议使用条形码管脚，但协议也适用于没有条形码的管脚（在这种情况下，管脚在冰球中的位置是唯一的数据跟踪手段）。

2.9. 晶体成膜模块

晶面图形用户界面（图8)旨在与晶体的冷冻冷却同时使用。此GUI将低温冷却晶体与针条形码和冰球内的编号位置相关联。还支持使用非条形码管脚，在这种情况下，数据跟踪完全依赖于管脚在冰球中的位置。晶体填充图形用户界面的目的是在冷冻晶体时，将与图形用户界面所需的交互减少到绝对最小，其中大的可拖动元素已针对触摸屏进行了优化。这样，水晶钓鱼和更新冰熊数据库可以同时执行。GUI用作虚拟工作台。盘子和容器，如别针、圆盘和杜瓦瓶，通过扫描它们的条形码添加到虚拟工作台中。然后，只需拖放就可以将水晶移到别针上；默认情况下，该管脚会自动添加到第一个冰球的第一个空位置，但在此阶段或稍后阶段，可以将管脚移动到冰球中的另一个位置。从水滴中捕到的第一个晶体的样品名称称为晶体1（c1），随后捕到的晶体称为c2等。对于非条形码的管脚，将水晶直接拖动到冰球将创建一个虚拟管脚。如果条形码别针已经包含水晶，冰熊知道这一点，条形码上会出现一个“水晶”符号（图8)。钓鱼后可以立即添加注释，普通注释可以使用单触按钮，但完成钓鱼操作不需要这样做。对于重复性治疗行动，可使用最新注释进行重复使用。用户可以在此页面的配置选项中选择此协议的特定于用户的功能。

图8 晶体填充模块。用预先选择的水晶从盘子里钓鱼。首先用条形码阅读器扫描别针、冰球和杜瓦瓶的条形码。扫描完平板条形码后，带有选定晶体的液滴将被高亮显示。通过鼠标移动或触摸屏移动，将水晶从选定的位置移到不同的位置，以告知数据库与打捞水晶相关的针的条形码。用红色高亮显示的管脚已经与一个晶体相关联。

水晶图形用户界面的设计非常简单，可以将预先选择的水晶连接到条形码针、圆盘和杜瓦瓶上，而这些水晶是从之前拍摄过的、预先选择了水晶的96块平板上捕获的。然而，如果家庭实验室没有结晶滴成像系统或之前没有对平板成像，也可以使用GUI。在这种情况下，水晶图形用户界面会创建一个虚拟图像和一个唯一的样本名称。如果晶体在广泛的晶体处理协议用于配体结合研究后进行了低温保护，也可以使用GUI（Hassell等。2007年)。例如，将晶体在不同pH、不同沉淀剂或不同浓度的不同配体的液滴中孵育不同的时间跨度，因此在不同的时间点进行冷冻保护。关于这些晶体处理步骤的信息可以记录在注释中，同样的晶体图形用户界面也可以以同样的方式用于通知数据库，在货物元数据上传到ISPyB之前，在方便的时候，哪个样品已经被冷冻，在哪个针上，在哪个冰球中，在哪个杜瓦瓶中。

的数据跟踪选项冰熊当使用自动结晶滴成像设备时，它们得到了最佳利用，但它们的使用并不是严格必要的。在任何情况下，用户也可以手动在他们的盘子上拍摄水滴图像，或者上传显微镜图像（如果可用），或者在不添加任何水滴图像的情况下工作冰熊.

2.10. 发货模块和发货人

这个冰熊装运接口(补充图S3)用于组装货物并将其提交给同步加速器。装满样品的杜瓦瓶可以直接从结晶界面上取下，但可以在装运前添加或移除之前准备好的杜瓦罐、冰球和销，例如，如果在最后一分钟从仓库中取出销或冰球，分别填充冰球或杜瓦瓶中的空槽。通常，运送到同步加速器的杜瓦将包含来自多个研究小组的晶体，这些研究小组都有属于同一提案的晶体，并且参与了相同的数据收集会议。为了确保元数据的上传顺利进行，这由冰熊托运人也在同步加速器注册。实际上冰熊发货人组织发货，并在杜瓦瓶返回时协调活动（图9).

图9 装运模块的杜瓦瓶返回页面。当杜瓦瓶返回实验室时，此页面便于回收针、圆盘和杜瓦瓶。洗过的别针可以用来为下一批货挑选新的水晶。研究人员将突出显示为“保存水晶”的别针放在储存杜瓦中，然后可用于下一次同步加速器跳闸。

在同步加速器的支持下，冰熊可以直接向同步加速器的IT系统提交装运元数据。目前，使用SynchWeb/ISPyB应用程序编程接口（API；Fisher等。, 2015)。在这种情况下，装运的元数据由冰熊托运人，他是同步加速器提案和同步加速器数据收集会议的一部分。发货人使用同步加速器进行身份验证，然后从他/她有权使用的提议和会话中选择，然后再提交发货的元数据。除了同步加速器用户名和密码外，不需要键入其他内容。所有容器和样品的详细信息都会自动传输到同步加速器，无需在同步加速器站点手动输入数据。冰熊对自己的装运数据执行上传前验证，确保没有提交空容器（别针、圆盘或杜瓦瓶）。至关重要的是，如果任何晶体的“蛋白质首字母缩写”安全标识符在本次装运的批准首字母缩写列表中缺失，或者如果任何晶体没有指定蛋白质首字母缩略词，则不会提交装运。元数据上传到DLS完成后，在发送杜瓦瓶之前，使用SynchWeb/ISPyB工具通过快递服务跟踪杜瓦瓶发货。

PDF格式的装运清单(补充图S4)提交装运时生成。如果需要，该格式允许在数据采集期间在打印版本上进行徒手笔记。对于不支持自动上传元数据的同步加速器，也会生成这样的发货清单。此清单包含指向这两者的可点击链接和可扫描QR码冰熊和ISPyB。这个冰熊链接指向水晶页面，ISPyB链接指向提供该水晶上的ISPyB信息的页面。

2.11. 在数据收集过程中做笔记

货物标记后冰熊发送后，装运GUI中会提供一个新的数据收集选项卡。在这里，货物中的每个冰球都显示为一个可单击的按钮。单击冰球打开一组选项卡(补充图S5)，每个销位置一个。在数据采集期间，可以标记在此位置从晶体中采集的数据。也可以为每个样本名称添加注释。一些标准注释模板文本可用作单击按钮。用户还可以在此处指定晶体在返回家庭实验室时应保存还是清洗/丢弃。标记为用于数据采集的针和圆盘，其中所有针都标记为正在使用，以绿色显示，并带有复选标记。

2.12. 杜瓦瓶返回实验室时回收别针、圆盘和杜瓦瓶

当杜瓦瓶返回家庭实验室时，发货人可以进行标记冰熊杜瓦瓶已经返回。装运GUI的数据收集选项卡(补充图S5)然后替换为“发货退回”选项卡（图9)。然后发货人可以打开杜瓦瓶。“发货退回”选项卡显示每个杜瓦瓶和冰球的内容，以及水晶所有者的指定操作，即。`货物中每个样品所示的“保存水晶”或“清洗别针”。这批样品中的研究人员会清洗他们的别针，或将别针和水晶存放起来以备日后使用。打开/清洗容器（杜瓦瓶/圆盘/别针）冰熊使其可用于后续装运。

2.13. 水晶页面和其他导航工具

水晶页面（图10一)为已选择的每个晶体生成（在下拉查看器的选择菜单中；图7b条)并且因此已经为其生成了唯一的样本名称。该页面还记录了同步加速器数据收集会话的信息，并提供了它们的建议ID和会话ID。同一个晶体可以多次运送到同步加速器（图10b条)。可以从装运清单中找到水晶页面，但也可以在搜索框中键入样品名称时找到（图3)。在晶体页面上，有一个链接指向ISPyB中的衍射信息（图10b条)以及下拉查看器（图7)从而了解项目信息和结晶条件。也可以从下拉查看器的晶体选择页面访问晶体页面（图7b条)。如果结构物已沉积在PDB中（Adams等。, 2019)然后可以在此页上提供PDB代码（图10一)，然后还可以通过指定PDB代码的搜索框找到水晶页面。

图10 水晶页面。(一)蛋白质选项卡。本页提供了此样本的关键信息。通过在搜索框中输入样本名称“PSB_93diE01d1c1”，可以导航到此水晶页面。在这种情况下，PDB沉积已使用PDB代码完成6伏（默西等。, 2018)。可以提供多个PDB代码。红色十字是撤销按钮（以防给出错误的PDB代码）。“在拖放查看器中显示”链接指向拖放查看器并提供有关结晶条件的信息访问。(b条)数据收集信息。该晶体已被用作DLS使用束线I03的三个不同快速访问数据采集会话的测试晶体。链接“在钻石光源查看水晶”指向此水晶的相关ISPyB页面。

3.1. DLS的快速访问波束时间数据收集会话

描述的协议已经在DLS的几个数据收集会话中进行了测试和优化（图10b条)。要优化使用开发的系统，需要专家用户进行一些额外的工作。例如，必须提供每个项目的详细信息（序列信息、缩写词），还应定期提供每个平板的相关信息（平板类型、使用的屏幕、滴液条件、蛋白质缓冲液）。关于低温冷却，只需要高度相关的信息，而不必立即提供这些信息，这对专家用户和新手用户都非常有用。一般来说，非常重要的是能够方便地获取有关结晶和晶体处理的所有重要实验信息，以便日后使用，也便于其他人能够重现实验。在项目成员之间轻松共享信息也是有益的。另一个实际优势是杜瓦瓶管理。在冰熊已实施协议，一旦杜瓦瓶返回家庭实验室，即可回收杜瓦瓶内容物，从而更容易跟踪实验室中使用的针、圆盘和杜瓦瓶。通过水晶页面显示提案ID和会话ID（图10b条)用于从特定样本收集数据。最重要的是，在优化结构时检查数据收集详细信息（在ISPyB中可用）现在变得透明了。这允许用户返回并检查是否存在冰环、是否存在空间群模糊性或辐射损伤、各向异性、分辨率或自动化数据处理管道记录的任何其他问题，以确保对数据收集信息进行更详细的检查。

3.2. 导航选项

提供了广泛的导航选项以查找相关信息。搜索框可用于使用其条形码搜索板、针、圆盘和杜瓦瓶，并且在项目的结晶和数据收集阶段经常使用。关键标识符是样品名称：使用样品名称可以找到特定晶体的所有信息，该名称也可以用作搜索框中的搜索项。从水晶页面可以链接到相关的ISPyB页面，也可以链接到下拉查看器，在这里可以找到结晶条件。反之亦然，可以从drop viewer的晶体选择页面访问晶体页面，其中包含样本是否已发送到同步加速器的信息；如果是这样，并且已经收集了衍射信息，那么也可以从该页面获得ISPyB衍射信息的链接。在同步加速器收集数据后，还可以使用装运清单中提供的特定晶体链接访问晶体页面(补充图S4).

在项目的后期阶段，良好的导航选项也很重要，例如在优化结构和编写手稿时。在结晶和数据收集完成后的几年内，进行这种写作并不罕见。对于项目此阶段的数据跟踪，重要的是找到相关的水晶页面，可以使用搜索框找到，并指定样本名称（也可以在ISPyB页面上找到）或PDB代码。如果样本名称已由用户选择的字符集（例如配体名称）扩展，则可以通过搜索框仅指定相关配体名称来查找该配体的相关晶体页面。在水晶页面中，还可以使用所用构造的信息找到项目页面。

3.3. 数据跟踪

相关的冰熊使用PDB代码可以找到水晶页面。这使得很容易在ISPyB中找到衍射信息以及与PDB代码相关的结晶和晶体处理信息。在水晶页面上，可以上传各个样本的注释和文件。如果研究人员将用于数据处理的原始数据存档在开放存取存档系统中，则可以使用相关水晶页面上可用的注释和文件选项记录DOI和其他相关信息。同样，相关出版物的链接可以存储在数据库中，并可供项目成员使用。“注释和文件”选项还可用于记录中间结果，例如，当项目成员在结构尚未存放时离开项目时。

3.4. 教育工具

冰熊围绕项目组织。在大学环境中，项目通常由学生、直接主管、高级主管和其他小组成员以及校内和校外合作者组成。冰熊提供信息技术工具，以促进专家讨论项目进展，包括（i）结晶实验，以及重要的（ii）采集晶体的衍射特性，包括衍射数据质量，这可以从数据处理管道的日志文件中推断出来。这些工具可以优化利用家庭实验室和同步加速器的可用人力和硬件资源。