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生物学
国际标准编号:2059-7983

2018年6月发布

第三次诉讼CCP-EM公司春季研讨会

汤姆·伯恩利、保拉·达·丰塞卡和兰迪·里德编辑

突出显示的插图

封面插图:低温电磁法现在可用于获取各种生物标本的高分辨率结构信息。然而,对于许多单粒子低温电子显微镜项目来说,一个主要的瓶颈仍然存在于样品制备阶段,例如样品聚集、优选取向和支撑膜亲和力等问题阻碍了高质量低温电子显微镜数据的收集(参见德鲁莱特等。,第560页,了解详细信息)。此封面图像突出显示了样品显示首选方向(右侧)的效果,这导致一些傅里叶分量采样不足,最终重建中的整体分辨率降低,而与定向更均匀的样品(左侧)相比,最终重建的分辨率更高。

介绍


阿克塔·克里斯特。(2018).D类74,490-491
https://doi.org/10.107/S2059798318008239
链接到html
第三届CCP-EM春季研讨会会议纪要介绍。

研究论文


阿克塔·克里斯特。(2018).D类74,492-505
https://doi.org/10.107/S2059798318007313
链接到html
REFMAC公司5和相关工具,用于将原子模型细化为低温电子显微镜重建CCP-EM公司已审查。确定了观测和计算傅里叶系数之间相关性的上界,并讨论了地图模糊/锐化的实用性。这个分而治之并行精炼大型综合体的管道,以及ProSHADE公司为了识别给定地图或坐标集中的对称性,提出了。

阿克塔·克里斯特。(2018).D类74,506-518
https://doi.org/10.107/S2059798318007726
链接到html
适应DIALS(刻度盘)描述了使其成为处理具有挑战性的连续旋转电子衍射数据的合适选择的封装。针对一个由七个示例数据集组成的案例,给出了使用扩展包的结果。

阿克塔·克里斯特。(2018).D类74,519-530
https://doi.org/10.107/S2059798318002425
链接到html
ISOLDE公司是一个交互式分子动力学环境,用于根据实验低温电子显微镜或晶体学图重建模型。对其结果的分析表明,在验证低分辨率数据中内置的模型时,需要格外小心。

阿克塔·克里斯特。(2018).D类74,531-544
https://doi.org/10.107/S2059798318006551
链接到html
描述了在菲尼克斯·real_space_refine来自的程序菲尼克斯套件及其在重新定义低温EM衍生模型中的应用。

阿克塔·克里斯特。(2018).D类74,545-559
https://doi.org/10.107/S2059798318004655
链接到html
开发了一种基于最大化地图细节水平和连通性的优化地图锐化的程序,并应用于361对沉积的低温电子显微镜地图和相关模型。

阿克塔·克里斯特。(2018).D类74,560年-571年
https://doi.org/10.107/S2059798318006496
链接到html
本文描述了低温电子显微镜用户可以采取的不同方法,以提高高分辨率单粒子低温电子显微镜的样品分布和冰的质量。

阿克塔·克里斯特。(2018).D类74,572-584年
https://doi.org/10.107/S2059798318001948
链接到html
电子显微镜是研究微管结构和组织的关键方法。这里,低温电子断层扫描实验的结果在体外-描述了聚合微管及其与细胞内微管超微结构的比较。

阿克塔·克里斯特。(2018).D类74,585-594
https://doi.org/10.107/S2059798318007945
链接到html
高吞吐量的使用就地综述了电子冷冻断层扫描和亚序列平均技术在研究细菌鞭毛运动结构和多样性方面的应用。结合表型分析,这些信息可以用于更好地理解分子机器的进化。
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