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结构
生物学
第69卷
|
第2部分
国际标准编号:2059-7983
2013年2月发布
封面插图:
ATP、Mg的排列
2+
和活性位点中的关键氨基酸残基
腾冲木霉
DppD(第。
256
)作为卡通的表现和表面。
黄色残余物与ATP和Mg相互作用
2+
并形成装订袋。
社论
《水晶学报》。
(2013).
天
69
,
141
https://doi.org/10.107/S090744913000255
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期望偏差和信息内容
Z.道特
,
M.S.Weiss先生
,
H.艾恩斯帕尔
和
E.N.贝克
编辑。
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研究论文
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142-149
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人EpsAB融合蛋白周质结构域的研究
创伤弧菌
II型分泌系统
D.马丁诺夫斯基
,
P.格罗丘尔斯基
和
P.S.霍华德
天然融合蛋白EpsAB的晶体结构
创伤弧菌
如所述。
PDB参考
以下为:
乙酰胆碱酯酶,4g54
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150至167
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配体电子密度分析的技术、工具和最佳实践及其在沉积晶体结构中的应用结果
E.波扎尔斯基
,
C.X.魏钦伯格
和
B.卢比
分析了大量蛋白质-配体结构复合物中配体电子密度严重误解的潜在原因。
本文介绍了一些技术和工具,并提出了一些良好实践的建议,旨在尽量减少蛋白质-配体结构模型中的过度解释和错误。
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168-175
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全长结构
狮子弓蛔虫
具有两个碳水化合物再认识域的半乳糖凝集素
M.S.Jeong先生
,
Hwang先生
,
H.S.余
和
张世民
全长晶体结构
弓形虫狮子座
半乳糖凝集素(Tl-gal)是半乳糖凝蛋白-9的同源蛋白,测定分辨率为2.0º。
Tl-gal的NCRD类似于人类galectin-7,其CCRD类似于人galectin-9,但NCRD和CCRD的界面和环路区域中的残基是灵活的,与相互作用有关。
PDB参考
以下为:
半乳糖凝集素,4hl0
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176-183
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平移非晶体对称性存在下的强度统计
R.J.里德
,
P.D.亚当斯
和
A.J.McCoy公司
平移非晶体对称性的统计效应可以通过在似然函数中最大化描述非晶体对称的参数来表征,从而揭示孪晶的竞争统计效应。
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184-193
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非标准核苷三磷酸焦磷酸酶的结构和功能表征
海洋热托加
K.Awwad公司
,
A.德赛
,
C.史密斯
和
M.Sommerhalter先生
给出了TM0159的2.15μl分辨率的晶体结构以及结合IMP和酶动力学数据。
这种非经典核苷三磷酸酶来自
马里蒂玛锥虫
有助于维持正确的DNA和RNA前体分子库。
PDB参考
以下为:
TM0159,第86页
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194-212年
https://doi.org/10.107/S09074491204454X
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PurE晶体相对湿度环境变化引起的弹性和非弹性衍射变化
R.奥列特
,
J.Pous公司
,
S.Rodríguez-Puente
,
C.阿巴德·萨帕特罗
和
A.瓜什
报道了对酶PurE的三种不同晶型的观察结果,并试图推断一些关于溶剂、结晶剂(主要是盐和聚乙二醇)的作用的初步结论
蛋白质结构内的相互作用决定了晶体外部相对湿度改变时衍射图案的变化。
PDB参考
以下为:
PurE、,
P(P)
三
1
2013年4月21日
;
P(P)
6
5
22,4年4月4日
;
C类
2、4b4k
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213-226
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具有意外磷脂酶活性的植物多功能核酸酶TBN1:结构研究和反应机理分析
T.科瓦尔
,
P.Lipovová
,
T.Podzimek公司
,
J.马图舍克
,
J.杜什科娃
,
T.斯卡洛娃
,
A.Štěpánková
,
J.哈塞克
和
J.多纳莱克
介绍了一种杂乱植物核酸酶的结构、反应机理和行为。
通过在多晶型上结合MAD和MR获得结构解。
PDB参考
以下为:
TBN1,野生型,3sng
;
N211D突变体,4dj4
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227-236
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维生素B的进化
2
生物合成:真细菌RibG和真菌Rib2脱氨酶
S.-C.陈
,
C.-Y.沈
,
T.-M.Yen(日元)
,
H.-C.于
,
T.-H.Chang先生
,
W.-L.赖
和
S.-H.Liaw公司
晶体结构
枯草芽孢杆菌
测定了与脱氨酶产物络合的RibG,并模拟了酵母Rib2的结构。
随后进行突变分析以说明其独特的底物特异性。
还鉴定出一个重要的氨基结合孔,该孔在RNA/DNA编辑脱氨酶中保守。
PDB参考
以下为:
肋骨,4g3m
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《水晶学报》。
(2013).
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69
,
237-246
https://doi.org/10.107/S090744912045040
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人XPB解旋酶C端半结构及致病突变XP11BE的影响
E.希拉里奥
,
Y.Li(李彦宏)
,
Y.Nobumori先生
,
十、刘
和
L.风扇
人XPB解旋酶C末端半体的晶体结构被测定为1.8º分辨率。
C末端的致病突变(XP11BE)产生可溶性较低的XPB突变,显著降低TFIIH复合物的细胞水平。
PDB参考
以下为:
人类XPB解旋酶C端半,4位
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《水晶学报》。
(2013).
天
69
,
247-255
https://doi.org/10.107/S090744912045039
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与三种核苷酸类似物结合的癌蛋白Rcl的结构
A.帕迪拉
,
C.亲切
,
S.Pochet公司
,
P.-A.卡明斯基
和
G.拉巴斯
利用NMR、SAXS和折叠识别的综合信息,通过分子替换解决了与凋亡核苷酸复合物中癌蛋白Rcl的高分辨率晶体结构。
PDB参考
以下为:
Rcl,与磷酸三氯滨复合物,4fyh
;
含6-环戊基-AMP,4fyi的络合物
;
与5′-磷酸腺苷4fyk的复合物
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《水晶学报》。
(2013).
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69
,
256至265
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二肽ABC转运蛋白的核苷酸结合域结构揭示了一个新的铁硫簇结合域
十、李
,
W.Zhuo(W.卓)
,
J.余
,
J.Ge公司
,
J.顾
,
Y.Feng先生
,
杨先生
,
L·王
和
N.王
二肽ABC转运体的核苷酸结合域DppD的晶体结构
腾冲木霉
,与铁硫团簇结合,分辨率为2.89º。
PDB参考
以下为:
DppD、4fwi
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《水晶学报》。
(2013).
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69
,
266-275
https://doi.org/10.107/S090744912045520
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槲皮素作为p90 S6核糖体激酶(RSK)抑制剂的鉴定:其与RSK2 N末端结构域复合体的结构,分辨率为1.8º
U.德雷温达
,
M.阿尔塔莫诺夫
,
G.Szukalska公司
,
D.乌提贝格诺夫
,
N.奥列克诺维奇
,
H.I.Parikh公司
,
G.E.凯洛格
,
A.V.Somlyo公司
和
Z.S.德雷温达
槲皮苷是一种天然黄酮醇糖苷,其晶体结构已在与小鼠RSK2的N-末端激酶结构域的复合物中测定。
结构显示,槲皮素以与另一已知抑制剂SL0101相同的方式抑制RSK2激酶。
PDB参考
以下为:
小鼠RSK2的N-末端激酶结构域,与槲皮素复合,4gue
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《水晶学报》。
(2013).
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69
,
276-283
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通过同源建模和扭角模拟退火确定结构:应用于来自
蜡样芽孢杆菌
V.E.Fadouloglou公司
,
M.Kapanidou先生
,
A.Agiomirgianaki
,
S.Arnaouteli公司
,
五、布尔奥的斯
,
N.M.Glykos公司
和
M.科基尼迪斯
多糖脱乙酰酶的结构
蜡状芽孢杆菌
已通过一种冒险的分子置换程序确定。
PDB参考
以下为:
多糖脱乙酰酶,4hd5
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(2013).
天
69
,
284-297
https://doi.org/10.107/S090744912046008
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分子置换法在蛋白质晶体中定位和定向重原子簇化合物
S.O.Dahms公司
,
M.库斯特
,
C.街道
,
C.罗斯
,
N.Sträter公司
和
M.E.Than先生
提出了一种新的方法,通过分子替换程序,可以有效定位和定向用于实验阶段的重原子簇化合物。
这允许计算有意义的相位,直至衍射数据的最高分辨率。
阅读文章
《水晶学报》。
(2013).
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69
,
298-307
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诱导活性位点孔的突变
根瘤菌
蔗糖异构酶具有水解活性
A.利普斯基
,
H.瓦兹拉威克
,
S.拉沃
,
X.罗伯特
,
M.瑞米
,
R.哈瑟
,
R.马特
和
N.阿加贾里
X射线结构
根瘤菌
蔗糖异构酶突变体提高了对酶机制的理解,并使控制这一重要工业酶水解活性的因素得以明确。
PDB参考
以下为:
蔗糖异构酶,R284C突变体,4h2c
;
用脱氧诺吉霉素浸泡,4gin
;
F164L突变体,用葡萄糖浸泡,4gi6
;
用蔗糖浸泡,4gi8
;
用异麦芽糖浸泡,4gia
;
用海藻果糖浸泡,4gi9
阅读文章
短通信
《水晶学报》。
(2013).
天
69
,
308-312
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单个高压冷冻病毒晶体的结构测定
A.伯克哈特
,
瓦格纳
,
M.加热器
,
R.雷默
,
H.霍恩伯格
,
J.Ren(任正非)
,
E.E.油炸食品
,
D.I.斯图亚特
和
A.会面
高压冷冻可以从单个病毒晶体中收集低温数据,但无法建立标准的低温保护。
阅读文章
@ActaCrystD推文
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