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结构
生物学

第68卷| 第5部分

国际标准编号：2059-7983

2012年5月发布

封面插图：A型肉毒神经毒素轻链与有效肽抑制剂RRGF的共晶体结构(第511页). 此处显示了毒素及其结合肽抑制剂的电子密度活性部位。绘制了毒素与各种肽抑制剂的分子相互作用图，推导了结构-活性关系，并建立了药效团模型。这项研究可能会导致发现对抗已知最强毒素肉毒杆菌神经毒素的药物。

研究论文

除洗涤剂作用外：哺乳动物脱铁蛋白中十二烷基硫酸钠（SDS）的结合位点

R.刘,W.Bu公司,J.Xi（习近平）,S.R.Mortazavi公司,J.C.Cheung-Lou先生,I.J.德莫乔夫斯基和P.J.Loll先生

利用X射线晶体学和等温滴定量热法，我们发现十二烷基硫酸钠（SDS）与马脾脱铁蛋白中预先形成的内腔特异结合。

PDB参考:SDS–载脂蛋白复合物，3u90

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蛋白质晶体的X射线激发光致发光：衍射数据采集中研究辐射损伤的新工具

R.L.欧文,B.A.约克和A.R.皮尔逊

大分子晶体在X射线照射下发光。这种发光，以及它如何随着吸收剂量的变化而变化，已经对几种不同的蛋白质进行了表征。

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A型肉毒神经毒素肽抑制剂：设计、抑制、共晶结构、构效关系和药效团建模

G.库马尔,D.库马兰,S.A.艾哈迈德和S.斯瓦米纳坦

肉毒杆菌神经毒素因其剧毒性被疾病控制和预防中心宣布为a类毒剂，是潜在的生物武器和生物恐怖主义毒剂。为了发现解毒剂，确定了抑制肽-酶复合物的结构，确定了结构-活性关系，并开发了药效团。

PDB参考:余额424–RRGF，3qw5；Balc424–RYGC，3qw6；Balc424–RRFC，第三季度7；Balc424–CRGC，3qw8

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SAXS对死亡受体6及其溶液构象的S-SAD分期研究

H.Ru公司,L.赵,丁伟,焦立中,N.肖,W.Liang先生,L.Zhang先生,L.-W.洪,松垣猪笼草,S.Wakatsuki公司和Z.-J.刘

利用在2.0和2.7º波长下收集的数据，对死亡受体6（DR6）的硫相位进行了比较分析。SAXS对未标记DR6的分析将二聚体定义为溶液中的最小物理单位。

PDB参考:死亡受体6，数据集A类1，3u3p；数据集A类2、3u3q；数据集B类1，3个u3；数据集C类1，3 u3伏；数据集D类1，3u3吨

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YLR301w的新型β-结构酿酒酵母

K.-H.金,H.J.Ahn先生,W.-K.李,C.李,M.-H.余和E.E.金

报道了未标记蛋白YLR301w的结构。

PDB参考:YLR301w，3卢比

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天冬氨酸蛋白酶晶体堆积的亚结构域取向、构象变化和无序性分析

D.贝利,E.P.卡彭特,A.焦化装置,S.焦化,J.阅读,A.T.琼斯,P.厄斯金,C.F.阿吉拉尔,巴达索先生,L.托尔多,F.里普曼,桑兹·阿帕里西奥,A.阿尔伯特,T.L.布伦德尔,N.B.罗伯茨,S.P.木材和J.B.库珀

报道了一些天然的和抑制剂复合的天冬氨酸蛋白酶晶体结构。对与该酶的大多数抑制剂复合物所采用的晶体形式相同的天然内毒素胃蛋白酶的结构分析表明，以前归因于抑制剂结合的刚体运动可能至少部分是硫酸根阴离子晶体堆积的结果。

PDB参考:内毒素胃蛋白酶-DB5，3uri；内毒素胃蛋白酶-DB4，3urj；内毒素胃蛋白酶–DB6，3url；胃蛋白酶3b，3utl

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磷酸丝氨酸氨基转移酶的结构结核分枝杆菌

F.库利巴利,E.拉萨尔,H.M.贝克和E.N.贝克

丝氨酸合成必需酶磷酸丝氨酸氨基转移酶的晶体结构结核分枝杆菌，已以1.5º的分辨率进行了求解。该结构揭示了与等效人类酶相比，底物结合区的差异，为基于结构的药物设计提供了机会。

PDB参考:磷酸丝氨酸氨基转移酶；3呕吐物

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辐射诱导还原和辐射分解引起的结构变化：真菌多铜氧化酶中X射线吸收剂量的影响

E.德拉莫拉,J.E.洛维特,C.F.布兰福德,E.F.加曼,B.巴尔德拉马和E.鲁迪诺·皮涅拉

分析了几种真菌中辐射诱导的还原、铜位点的辐射分解、pH值的影响以及活性中心伴随的几何畸变(鸡C.gallica)低温下收集的漆酶结构。本研究强调了在描述金属蛋白的晶体结构时仔细解释的重要性。

PDB参考:Cg L，4a2d公司；4a2e公司；4a2f型；4a2克；4小时

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核糖体工程促进新的晶体形态

M.塞尔默,Y.-G.高,A.魏斯鲍默和V.罗摩克里希南

核糖体蛋白L9的截短嗜热杆菌允许产生新的晶体形式和核糖体GTPase复合物的结晶。

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溶菌酶结晶对浓度微小变化的敏感性

R.-Q.陈,D.C.尹,Q.——Q.Lu,史建勇（J.-Y.Shi）和X.-L.马

研究了蛋白质溶液浓度的微小变化对溶菌酶结晶成功率的影响，发现蛋白质浓度的微小差异低至0.13%（0.026 mg ml⁻¹在目前的研究中）可能会对溶菌酶的结晶产生重大影响。

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现场微束分子晶体学

D.阿克斯福德,R.L.欧文,J.艾岛,J.Foadi公司,A.W.摩根,J.I.罗宾逊,J.E.无网船舶,R.J.欧文斯,I.莫莱斯,E.E.油炸食品,J.M.格里姆斯,K.哈洛斯,A.科特卡,J.Ren（任正非）,G.萨顿,T.S.沃尔特,D.I.斯图亚特和G.埃文斯

在金刚石光源微焦点光束线I24上开发了安装结晶托盘的样品环境。描述了技术发展和几个案例研究。

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二甲基亚砜（DMSO）对顺铂和卡铂与蛋白质中组氨酸结合作用的结构研究

S.W.M.坦利,A.M.M.施鲁尔斯,L.M.J.Kroon Batenburg公司,J.梅雷迪斯,R.普伦德加斯特,D.沃尔什,P.布莱恩特,C.征税和J.R.海利维尔

抗癌复合物顺铂和卡铂靶向DNA主沟，但有毒性副作用。研究表明，在二甲基亚砜存在下，顺铂或卡铂的两个分子与其His15残基结合。在对这些药物进行毒性评估时，应考虑使用二甲基亚砜（一种广泛用于药物输送的超固体）观察这种效果。

PDB参考:HEWL，第4天；第4天1；第4天2；第4天3；第4天；第4天6；第4天7；第4天9；第4天；第4天；第4天

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散文

蛋白质晶体仪的注释：PDB生长速率的高分辨率结构

C.阿巴德·萨帕特罗

对PDB的增长率进行了详细分析，表明在某些时期沉积率发生了明显变化，可能与技术创新或大分子晶体学领域发展中的社会事件有关。

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