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生物
结晶学
第61卷
|
第10部分
国际标准编号:1399-0047
2005年10月发行
封面插图:
人类Keap1的Kelch结构域的带状图显示了在每个叶片中发现的保守水分子
-螺旋桨(
第1335页
).
研究论文
《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
1313-1319
doi:10.1107/S0907444905022523
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转甲状腺素二聚体-二聚体界面上的配体结合:2.2℃分辨率下转甲状旁腺素-T4Ac复合物的结构
P.诺依曼
,
V.科迪
和
A.沃伊特扎克
测定了人转甲状腺素-四碘甲酰乙酸配合物的晶体结构。
配体位于一个不寻常的位置,穿透二聚体-二聚体界面,同时与三个TTR单体相互作用。
PDB参考
:
转甲状腺素-T4Ac复合物,1z7j,r1z7jsf
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《水晶学报》。
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61
,
1320-1334
doi:10.1107/S0907444905022638
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的结构
新生隐球菌
胸苷酸合成酶建议使用靶动力学进行物种特异性抑制的策略
J.S.芬纳-摩尔
,
A.C.安德森
,
R.H.奥尼尔
,
M.P.科斯蒂
,
S.法拉利
,
J.克鲁辛斯基
和
R.M.斯特劳德
三元配合物结构
C.新生代
TS和人类TS高度保守。
一种选择性抑制
C.新生代
和
大肠杆菌
人类TS上的TS与开放构象结合
大肠杆菌
人类脱辅基酶中抑制剂结合位点的紊乱可以解释抑制剂的特异性。
PDB参考
:
CnTS–dUMP–CB3717(
C类
2空间组),2aaz,r2aazsf
;
EcTS–dUMP–GA9、2a9w、r2a9wsf
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《水晶学报》。
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61
,
1335-1342
doi:10.1107/S0907444905022626
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Keap1 Kelch结构域1.35μl结构中的保守溶剂和侧链相互作用
L.J.比默
,
十、李
,
C.A.底部
和
M.汉宁克
使用1.35ºSAD数据
从头开始
描述了Kelch畴的结构测定和原子分辨率下的精细化。
PDB参考
:
Keap1,1zgk,r1zgksf的Kelch域
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,
1343-1347
doi:10.1107/S090744490502264X
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假设的结构
支原体
蛋白MPN555具有伴侣功能
U.Schulze-Gahmen公司
,
S.Aono公司
,
S.陈
,
H.横田
,
R.金
和
S.-H.金
假设蛋白质(MPN555)的晶体结构
肺炎支原体
揭示了一个具有至少一个中央结合囊或通道的三叶分子。
该分子与两种细菌伴侣蛋白具有结构同源性,这表明MPN555具有类似的伴侣功能。
PDB参考
:
MPN555,1zxj,r1zxjsf
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61
,
1348-1353
doi:10.1010/S0907444905022997
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两种与d(CGCGAATTCGCG)配合的小沟槽喹啉季铵盐的结构
2
分辨率为1.6和1.8º
A.亚当斯
,
C.梁
,
W.A.丹尼
和
J.M.格斯
两种抗癌小沟槽结合喹啉季铵盐与十二碳化合物d(CGCGAATTCG)配合物的高分辨X射线晶体结构
2
已报告。
PDB参考
:
SN8315–d(CGCGAATTCGCG)
2
,1zph,r1zphsf
;
SN8224–d(CGCGAATTCGCG)
2
,1zpi,r1zpisf
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,
1354-1363
doi:10.1107/S0907444905023152
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利用电子密度等值面的中轴变换自动构建晶体配体
J.艾岛
,
D.S.拉塞尔
,
L.J.吉巴斯
,
P.D.亚当斯
和
A.T.Brunger公司
描述了中轴在自动晶体建模中的应用。
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,
1364-1372
doi:10.1107/S0907444905023565
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以色列结构蛋白质组学中心(ISPC)与人类健康相关的蛋白质在功能背景下的三维结构测定
S.阿尔贝克
,
Y.伯斯坦
,
O.动力
,
雅各布维奇
,
N.列维
,
R.梅格德
,
Y.迈克尔
,
Y.佩莱
,
J.普里卢斯基
,
G.施赖伯
,
一、西尔曼
,
T.昂格
和
J.L.苏斯曼
描述了以色列结构蛋白质组学中心(ISPC)在功能背景下确定与人类健康相关的蛋白质结构的工作。
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(2005).
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61
,
1373-1377
doi:10.1107/S0907444905023358
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牛心细胞色素X射线结构分析测定血红素A羟基法尼乙基的绝对构型
c(c)
氧化酶,使用适用于2.8Å分辨率的方法
E.山下
,
H.青山
,
姚明(M.Yao)
,
K.穆拉莫托
,
K.Shinzawa-Itoh公司
,
S.吉川
和
T.筑原
细胞色素修复基团血红素A的绝对构型
c(c)
氧化酶,被测定为
S公司
通过分析结合角。
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,
1378-1385
doi:10.1107/S0907444905023590
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一种灵活且经济的蛋白质生产和结晶介质吞吐量策略
N.莫尔兰
,
R.阿什顿
,
H.M.贝克
,
I.伊万诺维奇
,
S.帕特森
,
V.L.Arcus公司
,
E.N.贝克
和
J.S.洛特
已经为学术结构生物学制定了一个中等吞吐量策略,以满足研究产出和研究生发展的双重目标。
该平台集成了Gateway克隆和96-well方法,用于溶解度筛选和结晶。
阅读文章
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,
1386-1394
doi:10.1107/S0907444905023851
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NNA7 Fab的晶体学分析及对人类血型识别模式的建议
K·谢
,
S.-C.宋
,
S.L.斯皮塔尼克
和
J.E.Wedekind公司
NNA7 Fab抗体片段识别人类N血型抗原,而NNA7-G91S突变表现出抗原结合减少。
为了深入了解这些Fab片段是如何识别这种临床相关糖肽抗原的,我们解决了这两个Fab片段的晶体结构。
结果提供了一个基于晶体接触的肽和糖识别模型,以及结合2-(
N个
-吗啉)乙磺酸(MES)分子被捕获在抗原结合位点。
PDB参考
:
NNA7、1t2q、r1t2qsf
;
NNA7-G91S,2d03,r2d03sf
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《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
1395-1401
doi:10.1107/S0907444905024194
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游离富马酸酶C的结构
大肠杆菌
T.韦弗
富马酸酶C的晶体结构在没有抑制剂和底物类似物的情况下得到了解决。
这种新颖的晶体结构报告了变构B位点的pH-敏感位移,并保存了保守活性位点水周围的结构。
PDB参考
:
富马酸酶C,1yfe,r1yfesf
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《水晶学报》。
(2005).
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61
,
1402-1405
doi:10.1107/S0907444905024029
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重组蛋白的结构研究
吨
=3个田菁花叶病毒外壳蛋白突变体衣壳
V.桑吉塔
,
G.L.洛克什
,
P.S.萨瑟什库玛
,
V.萨拉瓦南
,
C.S.维杰
,
H.S.萨维提里
和
M.R.N.Murthy先生
纯化的田菁花叶病毒外壳蛋白颗粒已结晶,并测定了其突变衣壳的X射线晶体结构。
PDB参考
:
rCP,1x33,r1x33sf
;
CP-P53A,1x35,r1x35sf
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《水晶学报》。
(2005).
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61
,
1406-1412
doi:10.1107/S090744490502030
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突变体的结构
吨
田菁花叶病毒=1衣壳:水分子在衣壳结构和完整性中的作用
V.桑吉塔
,
P.S.萨瑟什库玛
,
H.S.萨维提里
和
M.R.N.Murthy先生
分析了水分子在田菁花叶病毒结构中的作用。
PDB参考
:
CP-NΔ31,1x36,r1x36sf
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《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
1413-1417
doi:10.1107/S0907444905024285
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晶体体积极小的高分辨率中子蛋白质晶体学:全氘化在人醛糖还原酶中的应用
I.哈兹曼
,
M.T.道弗涅
,
M.P.布莱克利
,
F.梅勒尔
,
M.Haertlein先生
,
A.范多塞拉尔
,
A.米施勒
,
D.A.A.迈尔斯
和
A.波贾尼
从0.15 mm的
三
水晶。
氘原子在中子散射密度图中清晰可见。
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(2005).
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61
,
1418-1425
doi:10.1107/S0907444905024340
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突变表面残基以促进活化因子XI作为苯甲脒络合物的结晶:因子XI抑制剂基于结构的迭代设计的关键步骤
L.Jin(李·金)
,
P.潘迪
,
R.E.巴宾
,
D.T.韦弗
,
S.S.Abdel-Meguid公司
和
J.E.斯特里克勒
通过表面残基突变,凝血因子XI的结晶性得到了改善,生成了一个在苯甲脒存在下容易结晶的四重突变,并促进了因子XI选择性抑制剂基于结构设计的迭代过程。
PDB参考
:
rhFXI型
370-607
-S434A,T475A,K437A–苯甲脒,1zhm,r1zhmsf
;
rhFXI型
370-607
-S434A、T475A、K505A–苯甲脒、1zhp、r1zhpsf
;
rhFXI型
370-607
-S434A、T475A、C482S、K437A–苯甲脒、1zhr、r1zhrsf
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61
,
1426-1431
doi:10.1107/S09074449905024984
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实现中小型学术实验室结晶筛选的合理化:PACT/JCSG+战略
J.纽曼
,
D.伊根
,
T.S.沃尔特
,
R.梅格德
,
I.浆果
,
M.Ben Jelloul先生
,
J.L.苏斯曼
,
D.I.斯图尔特
和
A.佩拉基斯
提出并讨论了一种使用纳升液滴以及稀疏矩阵筛(JCSG+)和新型系统筛(PACT)组合的结晶筛分策略。
阅读文章
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,
1432-1435
网址:10.1107/S090744490502473X
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蛋白质晶体学家笔记:我与演员的夜晚
C.阿巴德·萨帕特罗
本文从历史的角度介绍了当前可用于晶体安装和数据采集的机器人技术的发展步骤。
简要讨论了对该领域未来的影响。
阅读文章
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61
,
1436
doi:10.1107/S0907444905029410
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