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用随机矩阵理论分析基因相互作用网络的异质结构

作者

上市的:
  • 北卡罗来纳州阿拉哈里。
  • A.侯赛尼。
  • 北卡罗来纳州阿贝德普尔。
  • G.R.贾法里。

摘要

为了理解基因的集体行为,人们付出了巨大的努力。在这方面,广泛的研究集中于成对相互作用。在这一研究领域中,了解两两互动之外的集体表现是一个伟大的目标。在这项工作中,我们旨在通过随机矩阵理论分析基因相互作用网络的结构。我们重点研究了酿酒酵母约6000个基因的皮尔逊相关系数网络。通过比较相互作用网络本身特征值的谱和洗牌网络的谱,我们观察到明确的证据,揭示了基因网络中除了成对相互作用之外的结构的存在。即使排除轮毂,这种差异也会保留。在全局网络中,我们识别出140个具有非正常大特征值的特征向量。然后,我们根据节点参与率(NPR)指数推导出基因谱。我们再次观察到与随机结构的明显偏差。我们指出大约500个基因具有较高的NPR值。与洗牌网络的记录相比,我们提供了明确的证据,证明NPR的这些高值是网络结构的结果。

建议引用

  • Allahyari,N.&Hosseini,A.&Abedpour,N.和Jafari,G.R.,2024年。"用随机矩阵理论分析基因相互作用网络的异质结构,"物理学A:统计力学及其应用爱思唯尔,第641(C)卷。
  • 手柄:RePEc:eee:phsmap:v:641:y:2024:i:c:s0378437124002577
    内政部:10.1016/j.physa.2024.129748
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