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作为吸引子的微生物组丰度模式及其对微生物相互作用网络推断的影响

作者

上市的:
  • 伊莎贝拉·希尔达·门德勒
  • 芭芭拉·德罗塞尔
  • 休特,马克·托尔斯滕

摘要

从丰度模式推断微生物相互作用网络是提高我们对微生物群落,特别是人类微生物群的理解的重要途径。这里我们建议区分微生物丰度数据中包含的两个层次的信息:(1)数量丰度值和(2)微生物存在和缺失的模式。后者允许对微生物组数据进行二元视图,并将微生物数据解释为布尔网络的吸引子,或者更准确地说是不动点。

建议引用

  • 曼德勒、伊莎贝拉·希尔达和德罗塞尔、芭芭拉和休特、马克·托尔斯滕,2024年。"作为吸引子的微生物组丰度模式及其对微生物相互作用网络推断的影响,"物理学A:统计力学及其应用,爱思唯尔,第639卷(C)。
  • 手柄:RePEc:eee:phsmap:v:639:y:2024:i:c:s0378437124001675
    DOI:10.1016/j.physa.2024.129658
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