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信息概述
简历
环境保护主义
艺术
生物化学网络的复杂线性不变量
罗伯特·L·卡普。
;
佩雷斯·米兰,梅赛德斯·索莱达
;
达斯古普塔,如来
;
艾丽西娅·马塞拉·狄肯斯坦
;
Jeremy Gunawardena
公共事务部:
10/2012
编辑:
学术出版社有限公司-爱思唯尔科学有限公司
修订版:
理论生物学杂志
国际标准编号:
0022-5193年
成语:
英格里斯
递归Tipo de recurso:
公共艺术
Clasificación temática:
马特马提卡·普拉
简历
分子网络中发现的非线性通常阻碍了对网络行为的数学分析,而网络行为主要是通过数值模拟进行研究的。
这可能导致参数确定的困难问题。
然而,分子网络通过质量作用动力学产生多项式动力学系统,其稳态是一组多项式方程的零点。
这些方程可以通过代数方法进行分析,其中参数被视为符号表达式,其数值不必预先知道。
例如,网络的“不变量”是选定状态变量的多项式表达式,在任何稳态下都会消失。
已经发现对关键网络属性进行编码并区分不同网络结构的不变量。
虽然不变量可以通过计算代数方法计算,例如Gröbner基,但这些方法在计算上对于生物现实网络是不可行的。
在这里,我们利用化学反应网络理论(CRNT)开发了一种有效的程序来计算不变量,这些不变量是“络合物”的线性组合,或来自质量作用的单项式。
我们展示了如何使用该程序来证明霍恩和杰克逊以及希纳尔和范伯格对最多一个缺陷网络的早期结果。
然后,我们将我们的方法应用于酶的双功能性,包括细菌EnvZ/OmpR渗透压调节器和哺乳动物6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶糖酵解调节器,其网络缺陷多达四个。
我们表明,双功能性导致不同形式的浓度控制,对初始条件或总量的变化具有鲁棒性。
最后,我们概述了使用络合线性不变量分析任何缺陷分子网络的系统程序。
帕拉布拉斯峡谷:
双功能酶
,
化学反应网络理论
,
不变量
,
稳健性
版本注册表完成
阿西亚多斯群岛
塔马尼奥:
391.3千桶
格式:
PDF格式
.
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许可证
Excepto donde se diga explícitatement,este item se publica bajo la siguiente descripcion:
阿根廷Atribución-NoComercial-SinDerivatas 2.5(CC BY-NC-ND 2.5 AR)
识别码
URI(URI):
http://hdl.handle.net/11336/68434
内政部:
http://dx.doi.org/10.1016/j.jtbi.2012.07.004
网址:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022519312003384
科尔奇酮类
关节(IMAS)
投资数学研究所“LUIS A.SANTALO”
关节(OCA CIDAD UNIVERSITARIA)
CIDAD大学行政协调机构
Citación公司
罗伯特·L·卡普。;
佩雷斯·米兰(Pérez Milán),梅赛德斯·索莱达(Mercedes Soledad);
达斯古普塔,如来;
艾丽西娅·马塞拉(Alicia Marcela),狄更斯坦(Dickenstein);
Jeremy Gunawardena;
生化网络的复杂线性不变量;
学术出版社有限公司-爱思唯尔科学有限公司;
理论生物学杂志;
311;
2012年10月;
130-138
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阿尔特梅特里卡斯
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