公民科学家见树不见林

2024年3月6日

很少有国家的生物多样性可以与巴西媲美，包括在其他地方鲜为人知的植物性食物来源。即使在大城市，你也可以直接从树上摘下各种水果，这对植物学家来说既美味又有趣。公民科学项目“Pomar Urbano”收集巴西城市果树的数据。第一批结果现已于千兆字节.

除了在当地公园种植免费食物的明显好处外，市中心的果树也“通过促进与自然的联系促进人类健康和福祉”，作为新的千兆字节纸张笔记。作者Filipi Miranda Soares及其同事决定进一步了解这些城市生物多样性珍宝。他们让当地城市居民参与探索：使用自然主义者平台上，他们启动了一个名为“波马尔·乌尔巴诺”（意为“城市果园”），收集巴西所有主要城市的果树观察结果。也不要错过他们中的注释Giga科学，谈论他们使用公民科学iNaturalist平台的经验。

在他们的千兆字节数据发布他们用英语和葡萄牙语展示了这个项目的第一个结果（阅读更多关于我们的多语言文章在这里).数据包括，首先，一份由专家组织的巴西429种果树物种的列表，包括本地和引进的。第二组数据显示了公民科学家在iNaturalist应用程序中收集的来自巴西27个主要城市的约11000个对这些物种的观察结果。

城市前十名：本土和引进植物

巴西城市常见的植物包括本地物种，如Pekea Nut、，巴西香车也是巴西利亚首都观察次数最多的物种。然而，作者也注意到了城市之间有趣的差异：与首都巴西利亚不同，巴西利亚的特点是存在许多当地物种，例如，在圣保罗，“十大”观察结果中只有四个是本土的；在圣保罗经常观察到许多引进的植物，例如原产于亚洲的枇杷（顺便说一句，枇杷的染色体尺度基因组组装发布于Giga科学).

这个生物多样性项目成功的核心是iNaturalist平台。通过该应用程序，各行各业的用户无需分类学知识可以轻松上传他们的自然观察结果。通常，观测是一张照片（但也可以是鸟类的语音记录），以及包括观测日期和地点在内的元数据。应用程序中内置的人工智能识别模型有助于识别，但重要的是，初步识别由iNaturalist用户中的专家社区进行验证。来自该平台的经验证（“研究级”）数据也与GBIF维护的全球生物多样性数据集共享(生物多样性信息机构)使生物多样性研究人员能够访问这些数据。（另请参阅我们与GBIF的合作人类疾病媒介系列，并阅读博客文章在这里).

Taioba tortelli和jaboticaba果酱

因此，iNaturalist不仅有助于识别物种以满足您的需要，还将公众观察、专家鉴定和科学界联系起来。正如作者在千兆字节文件及其附件Giga科学评论称，公民科学家收集的数据具有很大的重复使用潜力。除了测绘果树生物多样性的明显好处外，与公民合作还建立了科学家与更广泛社会之间的联系；甚至基于“城市果园”水果的鼓舞人心的食谱，包括基于太白黄原虫或“jaboticaba果酱”，由秘鲁普利尼亚.

甚至创意产业也加入了进来：一群来自圣保罗贝拉斯艺术中心大学制作了一个瓷杯，上面有夜花仙人掌(昙花)室内设计专业的学生卢西亚娜·门登萨（Luciana Mendonça）以番石榴树花为灵感制作了一幅桌布印花，番石榴。

在科学部门，公民收集的数据可以用于机器学习应用程序，用于从图像中识别水果。

使用GigaByte移动生物多样性数据

在GigaScience出版社，我们是社区项目的热心支持者——例如，请记住我们的众筹紫荆项目对香港的标志性物种进行排序或出版众筹资金的波多黎各鹦鹉基因组波多黎各亚马逊鹦鹉。凭借我们的创新千兆字节杂志和我们的相关数据库GigaDB，我们正在使共享和动员公民科学的成果变得更容易，例如波马尔·乌尔巴诺。对于千兆字节为了发表论文，该项目不需要对科学问题给出“最终答案”，这通常超出了公民的数据收集范围。我们选择多语言文章有助于使当地社区能够获得科学成果。

了解更多关于我们调动生物多样性数据的工作，以及它们如何符合教科文组织关于开放科学的建议，通过观看我们的主编Scott Edmunds的演讲：

 

 

参考文献：

Filipi Miranda Soares、Luis Ferreira Pires、Maria Carolina Garcia、Lidio Coradin、Natalia Pirani Ghilardi-Lopes、Rubens Rangel Silva等人：城市可食植物的市民科学数据：巴西的一个案例研究，千兆字节，2024https://doi.org/10.46471/gigabyte.107

Filipi Miranda Soares、Luis Ferreira Pires、Maria Carolina Garcia、Lidio Coradin、Natalia Pirani Ghilardi-Lopes、Rubens Rangel Silva等人：利用公民科学监测城市可采植物GigaScience giae007，https://doi.org/10.1093/gigascience/giae007

Filipi Miranda Soares、Luis Ferreira Pires、Maria Carolina Garcia、Lidio Coradin、Natalia Pirani Ghilardi-Lopes、Rubens Rangel Silva等人：“城市可食植物的公民科学数据：巴西的案例研究”的支持数据“GigaScience数据库，2024年http://dx.doi.org/10.5524/102499

人类疾病媒介（千兆字节主题系列）https://doi.org/10.46471/GIGABYTE_SERIES_0002

奥布莱恩SJ。波多黎各鹦鹉的基因组授权——Amazona vittataGigaScience。2012;1(1):13.https://doi.org/10.1186/2047-217X-1-13

Corey T.Callaghan、Thomas Mesaglio、John S.Ascher、Thomas-M.Brooks、Analyn A.Cabras、Mark Chandler等人。为公民科学平台贡献的好处iNaturalist作为一个标识符PLOS生物学https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3001843

蒋爽，安海山，徐方杰，张雪英，枇杷（Eriobotrya japonica）基因组的染色体水平基因组组装和注释，GigaScience giaa015，https://doi.org/10.1093/gigascience/giaa015

教科文组织关于开放科学的建议 https://doi.org/10.54677/MNMH8546