“端粒-端粒（T2T）基因组前胡Dunn提供了对基因组进化和香豆素生物合成的见解”

前胡Dunn（Apiaceae）在中药中的应用已经很长时间了。各种香豆素，包括主要的根成分前胡素（A-D）是白头翁先前的转录组学和代谢组学研究试图阐明这些药用价值化合物的分布和生物合成网络。然而，缺乏高质量的参考基因组阻碍了对遗传特征的深入了解，从而阻碍了更好的育种策略的发展。
结合PacBio HiFi、ONT超长和Hi-C数据，构建了端粒-端粒基因组。最终的基因组组装约为1.798 Gb，分配给11条染色体，基因组完整性>98%。比较基因组分析表明白头翁经历了两次与豌豆科植物相同的WGD事件。通过香豆素代谢途径的转录组学和代谢组学分析，我们展示了香豆素类化合物的时空分布以及其生物合成关键基因的表达模式。值得注意的是，COSY基因和细胞色素P450基因在多条染色体上显示出串联重复，这可能是香豆素积累量高的原因。
T2T基因组白头翁为香豆素生物合成基因的染色体分布提供了分子见解。这种高质量的基因组是设计工程策略以改进这些有价值化合物生产的重要资源。

关键词：

• 白花前胡
• t2t基因组
• 香豆素生物合成

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生物项目：PRJNA1011536项目
百万分位数：MTBLS8679型