支持“解密成年猕猴基底神经节细胞的独特转录组和基因调控图”的数据

基底神经节是哺乳动物大脑皮层下相互连接的皮层下结构的复合体。基底节多巴胺能神经元变性是帕金森病的主要病理特征。由于缺乏对基底节多个脑区的多组学数据集的综合分析，对该区域的调控机制知之甚少。
我们利用高通量转录组学和表观基因组分析对超过270000个单核细胞进行分析，以创建基底神经节的细胞图谱，表征成年猕猴大脑基底神经节四个区域的细胞组成，包括纹状体（STR）、黑质（SN）、苍白球（GP）、，杏仁核（AMY）。我们发现基底节区神经元和非神经元细胞的基因表达有明显的表观遗传调控。我们鉴定了一组与神经退行性疾病相关的SN特异性星形胶质细胞，并进一步探索了人类、猕猴和小鼠SN细胞类型中的保守和灵长类特异性转录组学。最后，我们将基底节细胞的表观遗传景观与人类疾病遗传力相结合，并确定了一个包含候选基因的调控模块顺式-中棘神经元特有的与精神分裂症（SCZ）相关的调节元件。
总的来说，我们的猕猴基底神经节图谱为了解猕猴基底节中最重要和最密集的细胞群的综合转录组和表观基因组提供了有价值的见解。我们已经定义了50多种具有转录组和表观基因组特征的细胞类型，其中一些具有区域特异性，并描述了这些大脑区域的分子关系。

关键词：

• snrna-seq
• 基底神经节
• 单个电池
• 蜗牛座

阅读同行评审出版物：

• Li，Z.、Sun，Y.、Ding，L.、Yang，J.、Huang，J.、Cheng，M.、Wu，L.、Zhuang，Z.、Chen，C.、Huang，Y.、Zhu，Z.、Jiang，S.、Huang，F.、Wang，C.、Liu，S.、Liu，L.和Lei，Y.（2022）。解读成年猕猴基底神经节细胞中独特的转录组和基因调控图。GigaScience，12。https://doi.org/10.1093/gigascience/giad095（公共医学：38091510)

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