网站：将网站用于学术、商业或其他用途无需许可

这是一个公共网站。无需许可证或权限即可使用网站和网站上的任何数据。您也可以将自己的数据加载到我们的网站并在那里查看，然后使用轨道集线器或自定义轨道进行配置如何以商业、非商业或任何其他实体的形式显示。然而，当你在工作中使用UCSC基因组浏览器时，请引用我们的出版物.


图形：无需许可即可复制基因组浏览器生成的图形

允许重新使用生成的所有图形由UCSC基因组浏览器网站提供。无需联系我们获得许可。如果您的出版商，尤其是爱思唯尔，坚持要获得批准，请将他们引导到这个网页。然而，当你在工作中使用UCSC基因组浏览器时，请引用我们的一个出版物.


数据：基因组浏览器使用的数据文件和数据库表无需许可证

就UCSC Genome Browser组而言，原始表数据和二进制浏览器用于创建图形的文件可免费用于公共和商业用途。这适用于通过下载为文件的数据http、https、ftp或rsync，以及通过访问数据时公共MySQL服务器或通过web API。唯一的例外是liftOver链文件，它们可以链接、下载、使用和重新发布，但只能用于非商业用途请参阅liftOver自述文件.

有时，源数据库或作者会对数据进行限制。非常罕见在案例中，基因组具有引用要求。中的README.txt文件每个程序集的下载目录显示与基因组有关的最初限制由原作者自行排序；大多数程序集没有任何限制。

某些基因组注释数据，主要是关于人类的基因组和临床遗传学领域都有特定的限制。对于其中一些，我们不允许提供数据。通常，数据必须直接从原始格式或许可，而不是UCSC。例如HGMD、LOVD、OMIM、Decipher、，Genomenon、Genehancer和COSMIC。对于病毒基因组，任何GISAID序列或任何数据我们无法共享从GISAID序列派生的。请参阅相应的通过选择以下选项来跟踪这些程序集上的文档页面以了解更多详细信息组装并单击基因组浏览器中的曲目标题。他们通常列出或链接到确切的许可条件。这些曲目的文件不是可从我们的下载服务器下载，如果您有任何问题或需要一个指向Github代码中相应转换脚本的指针存储库。


软件：大多数命令行工具和目录都可以免费使用

基因组浏览器的大部分源代码可在麻省理工学院许可证，请参阅源代码存储库中的LICENSE文件因此Unix命令行实用程序需要构建跟踪、跟踪中心文件、计算管道和我们的数百种工具用于筛选、排序、重排、连接和处理基因组注释文件可以自由使用和重新分发通过包管理器和安装工具，甚至用于商业用途（BLAT/LiftOver除外）。值得注意的例子有bedToBigBed、wigToBigWig、overlappeSelect、featureBits、，pslMap、pslFilter和pslCDnaFilter。

例外情况是源代码目录中包含特殊的LICENSE文件。这些是肯特/斯科特/布拉特,肯特/src/isPcr,kent/src/jk自己的库、和生成图形图像或用户界面的程序用于UCSC基因组浏览器。这包括以下子目录肯特/src/hg:

cgilib hgApi hgCollection hgFile搜索hgFileUi hgGateway hgGenehg基因组hg整合器hgPal hgPcr hgPhyloPlace hgPublicSessions hgSession hgSuggesthgTables hgTrackUi hgTrack hgVai hgc hubApi近visiGene liftOver

有关以下内容的列表，请参阅源代码顶层的LICENSE文件许可证及其应用的目录：https://github.com/ucscGenomeBrowser/kent/blob/master/LICENSE.非商业许可证下的目录中包含启动的LICENSE文件带有“LicenseRef-proprientary”SPDX标签。

当你在工作中使用UCSC基因组浏览器时，请引用其中一个我们的出版物.


软件：下载并安装图形化基因组浏览器软件非商业用途而非商业用途可以免费访问源代码

基因组浏览器图形界面的非商业用途（主要是“hgTracks”程序），包括下载和本地安装，也就是设置“镜像”，是免费的。当您使用UCSC时基因组浏览器在您的工作中，请引用我们的出版物.

对于商业用途，下载和本地安装某些基因组浏览器Web服务器CGI二进制文件和源代码。在源代码中代码存储库，相应的目录用特殊的LICENSE标记文件。如上所述，这适用于肯特/斯科特/布拉特,肯特/src/isPcr,kent/src/jk自己的库，以及以下子目录和下的程序肯特/src/hg。大多数受许可证保护的文件是生成图形图像和图形用户界面的程序对于UCSC基因组浏览器：


cgilib hgApi hgCollection hgFile搜索hgFileUi hgGateway hgGene hgGenomehg集成器hgPal hgPcr hgPhyloPlace hgPublicSessions hgSession hg建议hgTables hgTrackUihgTracks hgVai hgc hubApi近visiGene liftOver

此外，BLAT和isPCR（如果需要）由单独的许可证覆盖（见下文）。这关系到源代码目录肯特/斯科特/布拉特,肯特/src/isPcr和kent/src/jk自己的库.

要购买Genome Browser源代码、LiftOver、GBiB或GBiC的商业许可证，请访问基因组浏览器存储.

我们还有一个许可问题常见问答这可能有助于澄清关于如何许可代码的问题。我们还有文档如何选择本地安装的最佳选项基因组浏览器“镜像”.

如果您想在不经过我们商店的情况下购买Genome Browser源代码，请遵循这些说明：

  1. 阅读并签署许可协议.
  2. 通过电子邮件将许可协议的签名副本发送给UCSC IP管理办公室(genomebrowser@ucsc.edu).
  3. 按照许可协议中的说明提交签名的原件，并付款。
  4. 处理完您的许可证申请后，您将收到下载说明浏览器软件和数据。

基因组浏览器许可问题应发送至genome-www@soe.ucsc.edu.有关Blat和In-Silico PCR工具商业许可的信息，请参阅肯特信息学网站或联系人kent@soe.ucsc.edu.

有关许可证和它们应用于的目录：https://github.com/ucscGenomeBrowser/kent/blob/master/LICENSE.


致谢

该软件包括由开源项目制作的软件：