UCSC的基因型组织表达(GTEx)项目资源
这个基因型组织表达(GTEx)项目是由国立卫生研究院共同基金,为了研究基因变异和基因表达之间的关系各种人体组织。共研究了近1000个人的53个组织通过基因组和RNA测序。这些资源对于探索人类疾病。广泛的数据访问和可视化功能可从GTEx门户,由提供的资源GTEx实验室,布罗德研究所数据分析和协调中心。
UCSC基因组浏览器为选定的摘要数据提供可视化资源GTEx项目,包括这些轨道和枢纽:
- GTEx基因追踪
- 8555份样本(570名供体)GTEx RNA-seq中53个组织的基因表达
- GTEx成绩单轨道
- 8555份样本(570名供体)GTEx RNA-seq中53个组织的转录表达
- GTEx组合eQTL轨道
- 44个GTEx组织的联合表达QTL
- GTEx Tissue eQTL跟踪
- 44个GTEx组织中的QTL表达
- GTEx信号集线器
- 53个组织的GTEx RNA-seq(570个供体)
- GTEx分析中心
- GTEx分析中53个组织的等位基因特异性表达
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- GTEx分析中影响基因表达的远距离变异(trans-eQTLs)
- GTEx V8基因轨迹
- 17382份样本(948名供体)GTEx RNA-seq中54个组织的基因表达
GTEx组织体图
这张互动图确定了GTEx为基因表达研究取样的组织。一些GTEx浏览器轨迹在轨迹配置页面中包含Body Map,以便于将轨迹显示限制为感兴趣的组织。带有交互式的独立页面图形是在这里.
来源:jwestdesign