跟踪搜索

基因组浏览器的轨迹搜索功能允许用户查找和显示感兴趣的轨迹快速方便。

搜索

曲目搜索功能为用户提供了两个搜索选项,“搜索”和“高级。”如果输入了多个术语,则只有包含所有术语的曲目才是结果。我们目前不支持任何/或搜索(例如a或b)。

搜索选项卡:“搜索”是曲目搜索功能的默认选项卡。收件人搜索曲目,在框中输入搜索词,然后单击搜索。此搜索查找曲目名称、描述、组和元数据中的用户术语。元数据是信息,例如作为细胞系、实验类型和处理,关于ENCODE数据。

高级选项卡:“高级”选项卡允许用户在轨道的特定方面(例如轨道名称、描述和轨道组),可以通过在“ENCODE”中设置特定标准,特别有助于查找ENCODE轨迹术语”部分。

这个ENCODE术语“高级”选项卡的部分(并非在所有程序集中都可用)允许用户使用ENCODE元数据进一步优化对ENCODE轨迹的搜索。默认情况下,有两行ENCODE元数据搜索条件,但可以通过单击“+”按钮。要删除添加的元数据搜索行,请单击“-”按钮。每个行由一个下拉菜单组成,后跟第二个下拉菜单或文本字段。第一个下拉菜单包含可用的可搜索元数据类别。的类型在第一个下拉列表中选择的元数据术语决定了可用的搜索类型。一些元数据将有第二个下拉列表,其中包含该类别中可能的元数据术语可在上搜索。大多数下拉列表都是多选列表,因此用户可以选择一个或多个术语。其他元数据类型将有一个文本字段供用户输入特定搜索条款。有两种类型的文本字段。如果文本字段前面的短语是“包含”,则该字段是一个自由文本字段,可以选择使用百分比符号(%)作为通配符。如果文本字段前面有短语“is between”,则可以输入一个以逗号分隔的列表,以查找列表中包含任何值的所有曲目元数据类别。此逗号分隔的列表还接受百分号(%)作为通配符。由于这些元数据下拉列表依赖于程序集,因此可用的选项可能与程序集到程序集。如果有更多类别,则某些类别会链接到行的最右侧有关条款的可用信息。

结果

单击“搜索”按钮后,符合搜索条件的前100首曲目如下显示。

复选框/可见性:浏览器中当前显示的曲目将选中其复选框。要打开或关闭轨迹,请选择或取消选择关联的复选框。要打开或关闭当前结果页面上列出的所有曲目,请单击“+”或列顶部的“-”按钮。默认情况下,选中轨迹的复选框只要pack是轨道的有效视图模式,就将轨道转向pack。如果不是,轨道设置为完全或显示。选中轨迹的复选框后,可以更改可见性使用可见性列中的下拉菜单。

这个偶像指定可以通过单击图标配置的“容器轨迹”。集装箱曲目本身没有数据;相反,它们包含其他有数据的曲目。以下示例容器轨迹是复合轨迹,在搜索结果中具有浅橙色背景,和超磁道,它们有一个褐色的背景;包含数据的轨迹具有黄色背景。虽然容器中的轨迹可能会显示在搜索结果中,并且可以从以下位置进行配置在搜索结果页面上,情况并非总是如此。点击打开容器轨迹配置页面,允许容器轨迹中的所有轨迹查看和配置。请注意,由于集装箱轨道没有自己的数据打开via曲目搜索可能导致浏览器中没有其他曲目。如果发生这种情况,是因为集装箱内的轨道都没有打开。

曲目信息:要了解有关曲目的更多信息,请单击曲目姓名。将弹出轨迹或容器轨迹的描述。单击弹出窗口顶部或底部的“确定”按钮将其关闭。对于包含元数据的曲目,此时主要是ENCODE磁道,在右侧有一个“…”链接跟踪结果行。单击此链接可展开行以显示曲目的元数据。

排序:默认情况下,生成的轨迹按相关性顺序列出。然而,在结果列表的蓝色标题中,可以通过选择其中一个来更改排序顺序单选按钮,“按字母顺序”或“按层次”(首先列出的超级跟踪,然后是复合轨道,然后是数据轨道)。

返回浏览器/在浏览器中查看:“返回浏览器”按钮表示没有打开或关闭任何曲目。单击按钮可将用户返回到浏览器。使用复选框打开或关闭任何轨迹后,按钮标签更改为“View in Browser”(在浏览器中查看)(表示已进行更改),然后单击按钮显示新曲目选择的浏览器的用户。