着色基因的密码子预测和注释

基因组浏览器的密码子着色功能允许用户快速验证和比较基因预测和注释。要启用密码子着色，请选择基因组密码子选项来自密码子的颜色轨迹下拉菜单。

颜色图例

• 亮绿色密码子/线条：蛋氨酸，包括起始密码子
• 青色文本：部分密码子，拼接或截断
• 红色“*”：停止密码子
• 黑色“X”：错误（例如截断最后一个密码子）

所有其他密码子以原始轨迹颜色显示，密码子边界由浅色和深色交替出现。

细节
每个密码子都是按照转录方向着色和标记的。此颜色仅适用于基因预测和注释轨迹；因此密码子序列是参照基因组着色的而不是相关的mRNA。没有CDS的基因预测不会被着色；这些可以是非蛋白编码RNA或预测，其中CDS注释未在原始版本中提供数据。

要查看密码子着色，必须打开该选项，轨迹必须为压扁、压缩或满显示模式，浏览器必须放大到每个像素至少有一个像素的水平密码子。当放大到基因组的大区域时，浏览器将不会显示密码子着色。要查看标签，必须将轨迹缩放到基准标高的3倍以内。