Experimentally evolving Drosophila erecta populations may fail to establish an effective piRNA-based host defense against invading P-elements

Divya Selvaraju; Filip Wierzbicki; Robert Kofler

doi:10.1101/gr.278706.123

实验性发展直立果蝇种群可能无法建立有效的基于piRNA的宿主防御入侵P（P）-元素

¹奥地利维也纳1210年维特梅杜尼维也纳人口研究所；
²维也纳人口遗传学研究生院，Vetmeduni维也纳，1210维也纳，奥地利

通讯作者：罗科夫勒{点击}gmail.com

摘要

为了防止转座因子（TE）的传播，宿主开发了复杂的防御机制。在哺乳动物和无脊椎动物是一种主要的防御机制，通过PIWI相互作用RNA（piRNAs）发挥作用。调查机构在主机防御方面，我们引入了P（P）-元素是研究最广泛的真核生物转座子之一，转化为直立果蝇我们通过对基因组DNA进行测序（使用短和长阅读）、小RNA和定期转录组。基于piRNA的宿主防御迅速建立在两个重复（R1、R4）中，但不在第三个重复（R2）中，其中P（P）-50多代以来，元素拷贝数一直在增加。我们发现乒乓球循环在R2，尽管乒乓球周期对其他TEs完全有效。此外，R2在piRNA簇中都有插入和siRNAs，表明它们都不足以触发宿主防御。我们的工作表明，对入侵的控制TE需要激活乒乓球循环，而这种激活是一种随机事件，在某些人群中可能会失败，导致TEs的增殖，最终威胁宿主基因组的完整性。

脚注

[本文有补充材料。]
文章印刷前在网上发布。文章、补充材料和发布日期位于https://www.genome.org/cgi/doi/10.1101/gr.278706.123.
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收到2023年11月7日。
认可的2024年3月7日。

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实验性发展直立果蝇种群可能无法建立有效的基于piRNA的宿主防御入侵P（P）-元素

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