FlyBase：当前版本

FB2024_02型 , 2024年4月23日发布

联邦调查局2024_02 , 2024年4月23日发布

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主要数据集

Postgres Chado数据库转储

Chado数据库(http://ftp.flybase.net/releases/FB2024_02/psql)

序列数据和XML文件

当前FTP存储库(http://ftp.flybase.net/releases/FB2024_02/)
当前Chado-XML存储库(http://ftp.flybase.net/releases/FB2024_02/chado-xml)
基因组FTP存档(http://ftp.flybase.net/genomes网站/)

同义词

项目

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其他

FlyBase同义词

fb_同义词_fb_2024_02.tsv.gz

基因

项目

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其他

基因数据

遗传相互作用表

发电机发电机相互作用fb_2024_02.tsv.gz

RNA-Seq RPKM值

基因rpkm-report_fb_2024_02.tsv.gz

RNA-Seq基因对RPKM矩阵

gene_rpkm_矩阵_fb_2024_02.tsv.gz

物理交互表MITAB

物理交互mitab_fb_2024_02.tsv.gz

功能互补表

通用功能实现fb_2024_02.tsv.gz

FBgnбDB接入ID

fbgn_NAseq_Uniprot_fb_2024_02.tsv.gz

FBgn注释ID

fbgn_注释_ID_fb_2024_02.tsv.gz

FBgnмGLEANR ID

fbgn_gleanr_fb_2024_02.tsv.gz

FBgńFBtŕFBpp ID

fbgn_fbbtr_fbpp_fb_2024_02.tsv.gz

FBgnüFBtrбFBpp ID（扩展）

fbgn_fbbtr_fbpp膨胀_fb_2024_02.tsv.gz

FBgn外显子事件1

fbgn_exons2afy1覆盖.tsv.gz

FBgn外显子事件2

fbgn_exons2afy2_重叠.tsv.gz

基因GO数据

通用汽车协会.fb.gz

GO基因产品信息图谱

gp_信息.fb.gz

基因SO注释

dmel_gene_sequence_ontology_annotations_fb_2024_02.tsv.gz

基因图谱表

通用映射表fb_2024_02.tsv.gz

最佳基因摘要

最佳基因摘要fb_2024_02.tsv.gz

自动基因摘要

自动生成摘要.tsv.gz

基因快照

通用快照_fb_2024_02.tsv.gz

独特的蛋白质异构体

dmel唯一保护源_fb_2024_02.tsv.gz

酶数据

Dmel_酶_数据_fb_2024_02.tsv.gz

非编码RNA（JSON）

ncRNA_基因_fb_2024_02.json.gz

表达式

项目

其他

高通量基因表达

高吞吐量gene表达式fb2024_02.tsv.gz

单细胞RNA-Seq基因表达

scRNA-Seq_gene_expression_fb_2024_02.tsv.gz

单细胞RNA-Seq基因表达

Fly CellAtlas_slimmed_gene_expression_fb_2024_02.tsv.gz飞行单元地图

基因群

项目

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其他

基因组数据

发电机组数据fb_2024_02.tsv.gz

具有HGNC ID的基因组

基因组_HGNC_fb_2024_02.tsv.gz

路径组数据

路径_组_数据_fb_2024_02.tsv.gz

互动

项目

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其他

遗传相互作用

等位基因相互作用fb2024_02.tsv.gz

遗传相互作用表

发电机发电机相互作用fb_2024_02.tsv.gz

物理交互表MITAB

物理交互mitab_fb_2024_02.tsv.gz

小巷和股票

项目

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其他

Allele数据

库存数据

库存_FB2024_02.tsv.gz

表型数据

基因型_表型_数据_fb_2024_02.tsv.gz

等位基因

fbal_to_fbgn_fb_2024_02.tsv.gz

同系物

项目

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其他

D.黑腹果蝇旁系同源

dmel_paralogs_fb_2024_02.tsv.gz

人体正交仪

dmel_人类_理科_疾病_fb_2024_02.tsv.gz

人类疾病

项目

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其他

人类疾病模型数据

疾病模型注释fb_2024_02.tsv.gz

人类骨科

dmel_人类_理科_疾病_fb_2024_02.tsv.gz

生物体

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其他

物种列表

组织_列表_fb_2024_02.tsv.gz

本体术语

用于此版本FlyBase的冻结文件

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其他

FBbt：（飞行_解剖）

fly_anatomy.obo.gz

FBdv：（fly_development）

飞行开发.obo.gz

FBcv：（FlyBase控制词汇表）

flybase受控词汇.obo.gz

FBsv：（股票本体）

flybase_stock词汇.obo.gz

GO:（基因本体）

go-basic.obo.gz公司

FBbi：（图像本体）

SO:（序列本体）

so-simple.obo.gz软件

DO:（人类疾病本体）

doid.obo.gz文件

PSI-MI：（分子相互作用）

psi-mi.obo.gz标准

当前“实时”文件

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其他

FBbt：（飞行_解剖）

fly_anatomy.obo

FBdv：（fly_development）

fly_development.obo（飞行开发.obo）

FBcv：（FlyBase控制词汇表）

flybase_controled词汇库.obo

GO:（基因本体）

FBbi：（图像本体）

SO:（序列本体）

so-simple.obo软件

DO:（人类疾病本体）

PSI-MI：（分子相互作用）

本体版本

本体论

版本/日期

ChEBI（生物感兴趣的化学实体）

2024-03-28

DO（人类疾病本体）

2024-01-31

图像本体

2005年8月10日

FBbt（飞行解剖学）

2024-02-22

FBdv（fly_development）

2019-10-21

FBcv（FlyBase控制词汇表）

2023-08-02

FBsv（股票本体）

2022-09-26

GO（基因本体）

2024-01-17

PSI-MI（分子相互作用）

2015-08-11

SO（序列本体）

2021-11-22

基因组：注释和序列

所有果蝇序列

当前FTP存储库(http://ftp.flybase.net/releases/FB2024_02/)
FTP存档(http://ftp.flybase.net/genomes网站/)
发行说明

紧急物种

FlyBase不再反映非-D.黑腹果蝇果蝇种类。有关这些基因模型注释的状态，请参阅NCBI页面NCBI上注释的真核基因组。FlyBase存档版本FB2017_05型包括为这些物种导入FlyBase的最后一次NCBI注释更新。

黑腹果蝇

当前的Dmel FTP存储库(http://ftp.flybase.net/genomes/Drosophila_melanogaster/current/)
当前Dmel FastA FTP存储库(http://ftp.flybase.net/genomes/果蝇_melanogaster/current/fasta/)
当前Dmel GFF存储库(http://ftp.flybase.net/genomes/Drosophila_melanogaster/current/gff/)
Dmel FTP存档(http://ftp.flybase.net/genomes/Drosophila_melanogaster/)

美国金融服务贸易协会

全球金融论坛

转录和多肽

项目

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其他

成绩单数据

多肽数据

非编码RNA（JSON）

ncRNA_基因_fb_2024_02.json.gz

转座子、转基因结构和插入

项目

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其他

插入

转基因构建物

转基因构建图

construct_maps.zip

用于插入的地图数据

插入_映射_fb_2024_02.tsv.gz

转置元素（规范集）

转置序列集.fa.gz 转置序列集.gff.gz

常用GAL4驱动程序表（JSON）

fu_gal4_表格_fb_2024_02.json.gz

像差

项目

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其他

像差数据

平衡器数据

大型数据集元数据

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其他

数据集元数据成员

数据集_元数据_fb_2024_02.tsv.gz

克隆

项目

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其他

克隆数据

cDNAs:FBclбacc.ID（根据ID）

cDNA克隆数据_fb_2024_02.tsv.gz

基因组：FBclбacc.ID

基因组克隆数据fb2024_02.tsv.gz

参考文献

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其他

综合参考数据

FlyBase FBrf公司公共医疗ID公司PMCID公司DOI

fbrf_pmid_pmcid_doi_fb_2024_02.tsv.gz

FlyBase实体出版物协会

实体_发布_fb_2024_02.tsv.gz

地图转换表

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其他

细胞学的́序列

基因组-细胞-txt.gz

细胞学和遗传学

细胞表.txt.gz

细胞基因序列

细胞遗传学-seq.tsv.gz

基因图谱表

通用映射表fb_2024_02.tsv.gz