共表达簇以下为：C279型

完整标识：C279_parietal_sechinetal_occipital_temoral_middle_duodenum_medial

第一阶段CAGE峰值

Hg19:：chr10:13141974..13141997-	p3@CCDC3
Hg19:：chr11:33424626..33424658+	p1@ENST00000532231
Hg19:：chr11:70463500..70463520-	电话：chr11:70463500..70463520 -
Hg19:：chr12:78063535.78063545+	电话：chr12:78063535..78063545 +
Hg19:：chr12:99361526..99361530-	电话：chr12:99361526..99361530 -
Hg19:：chr12:99384339..99384342-	电话：chr12:99384339..99384342 -
Hg19:：chr13:26511516..26511519+	电话：chr13:26511516..26511519 +
Hg19:：chr14:23982540..23982582+	p1@ENST00000554403 p1@uc001wkc.1页
Hg19:：chr16:6536107..6536111+	电话：chr16:6536107..6536111 +
Hg19:：chr16:6706532..6706568+	电话：chr16:6706532..6706568 +
Hg19:：chr16:6742581..6742607+	电话：chr16:6742581..6742607 +
Hg19:：chr16:6742644..6742656+	电话：chr16:6742644..6742656 +
Hg19:：chr16:6742665..6742685+	电话：chr16:6742665..6742685 +
Hg19:：chr16:6742720.6742775+	电话：chr16:6742720..6742775 +
Hg19:：chr16:6742782..6742813+	电话：chr16:6742782..6742813 +
Hg19:：chr16:6742892..6742925+	p@chr16:6742892..6742925 +
Hg19:：chr16:6742966..6743000+	电话：chr16:6742966..6743000 +
Hg19:：chr16:6743276.6743304+	电话：chr16:6743276.6743304 +
Hg19:：chr16:6743318..6743394+	电话：chr16:6743318..6743394 +
Hg19:：chr16:6913753..6913756+	电话：chr16:6913753..6913756 +
Hg19:：chr16:7117462..7117465+	电话：chr16:7117462..7117465 +
Hg19:：chr16:7150584..7150589+	电话：chr16:7150584..7150589 +
Hg19:：chr16:7182015..7182018+	电话：chr16:7182015..7182018 +
Hg19:：chr16:7199503..7199506+	电话：chr16:7199503..7199506 +
Hg19:：chr16:7438669..7438673+	电话：chr16:7438669..7438673 +
Hg19:：chr17:44047160..44047193+	电话：chr17:44047160..44047193 +
Hg19:：chr19:36288768..36288814-	p1@ENST00000433059 p1@uc002obw.1页
Hg19:：chr1:16796987..16797016-	电话：chr1:16796987..16797016 -
Hg19:：chr1:241436474..241436478-	电话：chr1:241436474..241436478 -
Hg19:：chr21:15421332..15421334+	p@基督21:15421332.15421334 +
Hg19:：chr2:1946780..1946825+	p@chr2:1946780..1946825 +
Hg19:：chr2:203726992..203726997-	电话：chr2:203726992..203726997 -
Hg19:：chr2:51057134..51057137-	p1@ENST00000426912
Hg19:：chr3:134514187..134514201+	第3页@EPHB1
Hg19:：chr3:49706223..49706234+	电话：chr3:49706223..49706234 +
Hg19:：chr3:96772914..96772943+	电话：chr3:96772914…96772943 +
Hg19:：chr4:6437090..6437101-	电话：chr4:6437090..6437101 -
Hg19:：chr7:158037602..158037617-	电话：chr7:158037602..158037617 -
Hg19:：chr7:45675228.45675230+	电话：chr7:45675228…45675230 +
Hg19:：chr7:82582997..82583024-	电话：chr7:82582997..82583024 -
Hg19:：chr8:10221208..10221236+	p@chr8:10221208.10221236 +
Hg19:：chr8:10316929..10316947+	电话：chr8:10316929..10316947 +
Hg19:：chr8:133358414..133358435-	电话：chr8:133358414..133358435 -
Hg19:：chr8:85285149..85285159+	电话：chr8:85285149..85285159 +
Hg19:：chr8:85398264..85398268+	电话：chr8:85398264..85398268 +
Hg19:：chr9:68418929..68418958+	电话：chr9:68418929..68418958 +

此共表达簇上的丰富路径<b>摘要：典型路径基因集是从Reactome、Wikipathys和KEGG中编译而来的。对于主要的信号通路，转录调控基因（下游靶点）是从Netpath获得的。综合起来，典型途径和下游靶点总计489个人类基因集。利用同源基因数据库通过同源性推断出相应的小家鼠基因集。通过超几何概率评估共表达簇中包括的489个经典途径和基因集中的每一个的富集度。然后，采用Benjamini-Hochberg方法对所得P值进行调整，以进行多重比较<br><b>分析师：Emmanuel Dimont链接到源数据集数据

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此共表达无结果

此共表达簇上的丰富基因本体术语<b>摘要：共表达簇的GOStat分析结果。使用GOStat（PMID:14962934）和默认参数对启动子映射到至少两个不同基因的每个簇进行分析<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据

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无GOStat结果

此共同表达集群上的丰富示例本体术语<b>摘要：</b>为了总结1000个样本中的启动子活性（TSS区域的表达谱），我们基于FANTOM5样本本体（FF本体）进行了富集分析。这里的问题是“在哪种类型的样本中启动子更活跃”。为了回答这个问题，我们使用Mann-Whitney秩和检验比较了与样本本体术语相关的样本和其余样本中的表达式（TPM）。为了总结在这个共表达集群中丰富的本体，我们对组成的所有启动子的平均表达谱进行了相同的分析<b> 分析师：Hideya Kawaji链接到源数据集uberon_data（超级数据）<br><br>

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优步解剖

本体术语	p值	n个
神经管	2.86e-107	56
神经棒	2.86e-107	56
未来脊髓	2.86e-107	56
神经龙骨	2.86e-107	56
神经系统区域部分	7.77e-99号文件	53
大脑区域部分	7.77e-99号文件	53
中枢神经系统	7.66e-88页	81
神经系统	1.09e-84页	89
脑灰质	1.91e-84页	34
灰质	1.91e-84页	34
端脑	2.88e-84页	34
前脑区域部分	2.78e-83页	41
前脑	2.78e-83页	41
前神经管	2.78e-83页	41
未来前脑	2.78e-83页	41
大脑半球	6.79电子79	32
端脑区域部分	1.29e-78	32
脑	1.71e-77页	68
未来大脑	1.71e-77页	68
神经板	2.37e-73页	82
假定神经板	2.37e-73页	82
神经外胚层	1.17e-72页	86
大脑皮层区域部分	2.86电子-66	22
新皮质	4.80e-60	20
外髓氦	2.60e-58页	104
大脑皮层	6.67e-58号	25
大脑皮层	6.67e-58号	25
弦前神经板	第1.21页至第56页	61
成体生物	8.64e-45岁	114
外胚层衍生结构	1.55e-44号	171
外胚层	1.55e-44号	171
推测外胚层	1.55e-44号	171
神经嵴对发育有贡献的结构	1.02e-43页	132
器官系统细分	6.50e-33页	223
基底神经节	3.23e-28段	9
神经轴核复合体	3.23e-28段	9
大脑的聚集区域部分	3.23e-28段	9
基底神经节集合	3.23e-28段	9
大脑皮层下	3.23e-28段	9
神经核	1.24e-27	9
大脑核	1.24e-27	9
管	2.12e-26日	192
后神经管	8.18e-24日	15
弦神经板	8.18e-24日	15
端脑核	5.08e-22日	7
脑回	4.61e-20页	6
解剖导管	7.29至19	240
颞叶	3.55e-17页	6
枕叶	5.55e-17号	5
顶叶	6.76e-17	5
边缘系统	7.22e-17日	5
后脑节段性细分	2016年2月20日	12
后脑	2016年2月20日	12
推定后脑	2016年2月	12
解剖簇	1.33e-15号机组	373
器官部分	3.67e-15页	218
神经系统节段性细分	5.16e-15页	13
上皮	4.76至14	306
纹状体	7.17e-14日	4
纹状体	7.17e-14日	4
端脑腹侧	7月17日至14日	4
未来纹状体	7.17e-14日	4
细胞层	8.42e-14日	309
脑干	4.92e-13号文件	6
后脑局部	5.60e-13年	9
后脑	5.60电子-13	9
未来后脑	5.60e-13年	9
额叶皮层	2011年4月40日	三
尾壳核	5月20日-11日	三
背侧纹状体	5月20日-11日	三
脑桥	3.21e-10段	三
多组织结构	5.81e-10条	342
脊髓	8.78e-10段	三
背区元件	8.78e-10段	三
背部	8.78e-10段	三
额叶中回	4.88e-08	2
颞中回	2008年5月23日	2
尾状核	2008年6月40日	2
未来尾状核	2008年6月40日	2
扁桃形结构	6.62e-08	2
阿蒙角	8.64e-08年	2
大脑皮层的叶部	8.64e-08年	2
海马结构	8.64e-08年	2
边缘叶	8.64e-08年	2
蓝斑	2007年6月26日	2
脑干核	2007年6月26日	2
后脑核	2007年6月26日	2
胚层	2007年9月4日	560
胚层/神经嵴	2007年9月4日	560
胚胎组织	2007年4月29日	560
假定结构	2007年9月4日	560
胚层/神经嵴衍生结构	2007年9月4日	560
表皮母细胞（普通）	2007年9月4日	560
苍白球	2007年9月8日	2
苍白球	2007年9月8日	2
胚胎结构	4.10e-07日	564

此共表达簇上过度表达的TFBS（DNA）基序<b>摘要：</b>显示的值是该共表达簇中基序过度表达的p值。因此，较小的p值意味着强烈的过度代表性<b> 分析师：Michiel de Hoon链接到源数据数据<br><br>茉莉花图案<br>数据

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新颖的图案

JASPAR图案

Motifs公司	-log10（p值）
MA0003.1号机组	9.31629e-10号机组
MA0004.1号机组	0.149807
MA0006.1号机组	0.0418213
MA0007.1号机组	0.0330293
MA0009.1号机组	0.282049
MA0014.1号	30608-08年3月3日
MA0017.1号	0.326942
MA0019.1号	0.308124
MA0024.1号机组	0.209896
MA0025.1号文件	0.383675
MA0027.1号机组	1.77546
MA0028.1号机组	0.00983297
MA0029.1号机组	0.633517
MA0030.1型	0.215031
MA0031.1号文件	0.51788
电话0038.1	0.254626
MA0040.1型	0.226506
MA0041.1号	0.675054
MA0042.1号	2.29739
MA0043.1号	0.282278
MA0046.1号	0.753137
MA0048.1号	3.87469电子-05
马0050.1	0.324596
MA0051.1号	0.249836
MA0052.1号	0.2291
MA0055.1号	8.00362e-06
马0056.1	0
MA0057.1号	0.440606
MA0058.1号	0.0766141
MA0059.1号	0.0757992
马0060.1	0.00788673
MA0061.1号	0.190797
MA0063.1号	0
MA0066.1号	0.0732172
MA0067.1号	0.537012
MA0068.1号	0.443922
马0069.1	0.271442
MA0070.1号	2.06451
MA0071.1号	0.0583578
MA0072.1号	0.260306
MA0073.1号	0.981738
MA0074.1号	0.0710606
MA0076.1号	0.0870507
MA0077.1号	0.254892
MA0078.1号	1.22624
MA0081.1号	0.629296
MA0083.1号	0.783458
MA0084.1号	0.703837
MA0087.1号	0.258584
MA0088.1号	0.0345497
马0089.1	0
MA0090.1号	0.240463
MA0091.1号机组	0.350729
MA0092.1号	0.287028
MA0093.1号	0.0431902
马0095.1	0
马0098.1	0
MA0100.1型	0.0787315
MA0101.1号机组	0.449727
MA0103.1号	0.108723
MA0105.1号	0.0279116
MA0106.1号	0.0905927
MA0107.1号	0.253705
MA0108.2号	0.172469
MA0109.1号	0
MA0111.1号	0.0252311
MA0113.1号	0.66502
MA0114.1号	0.0546908
MA0115.1号	0.471806
MA0116.1号	0.0190182
MA0117.1号	0.309701
马0119.1	0.0660527
MA0122.1号机组	1.57815
MA0124.1号机组	0.437263
MA0125.1号机组	0.966786
MA0130.1号机组	0
马0131.1	0.12559
MA0132.1号机组	0
MA0133.1号机组	0
MA0135.1号机组	0.821509
MA0136.1号机组	0.0759094
MA0139.1号	0.0139421
MA0140.1号机组	0.0574137
MA0141.1号	0.192805
MA0142.1号	0.155551
MA0143.1号	0.323899
MA0144.1号机组	0.54022
MA0145.1号	0.0012993
MA0146.1号	4.85067e-07
MA0147.1号	0.003339
MA0148.1号	0.390676
MA0149.1号	0.769503
MA0062.2号	0.00402933
MA0035.2号	0.208625
MA0039.2号	1.00116e-06
MA0138.2号机组	0.11686
MA0002.2号机组	0.128802
马0137.2	0.291852
MA0104.2号	0.00777397
MA0047.2号	1.50548
MA0112.2号	0.00324659
MA0065.2号	0.00468678
MA0150.1号机组	0.716372
MA0151.1号	0
MA0152.1号	2.89109
MA0153.1号机组	0.93763
MA0154.1号机组	0.0531342
MA0155.1号	0.00251611
MA0156.1号机组	0.0537852
MA0157.1号	0.140121
MA0158.1号	0
MA0159.1号机组	0.145708
MA0160.1号	0.187803
MA0161.1号机组	0
MA0162.1号机组	1.71584e-05年
MA0163.1号机组	3.73016e-07号
MA0164.1号机组	0.339401
MA0080.2号	0.121711
马0018.2	0.30505
MA0099.2号机组	0.0598901
MA0079.2号	3.96917e-07号
MA0102.2号机组	0.737926
马0258.1	0.190277
马0259.1	0.0224311
马0442.1	0

ENCODE TF ChIP-seq峰富集分析<b>摘要：</b>对于每个TF和每个共表达簇，使用Fisher精确检验将带有ENCODE TF ChIP信号的启动子数量与稳健集的其他启动子进行比较。Benjamini-Hochberg校正后，保留了ChIP显著富集（q<=0.05）的聚类<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据

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没有此群集的分析结果

共表达簇的相对表达<b>总结：</b>将共表达簇与FANTOM5样本进行比较，以获得相对表达<br><b>分析师：不适用<br><br>链接到数据源数据

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