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共表达簇以下为：C272型

来自FANTOM5_SSTAR

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完整id:C272_CD19_CD4_CD8_Whole_Peripheral_lymph_tonsil



第一阶段CAGE峰值

Hg19:：chr10:111836795..111836820+p5@添加3
Hg19:：chr11:10562868..10562896+p1@ENST00000529979
Hg19:：chr11:64511738..64511759+p@chr11:64511738..64511759
+
Hg19:：chr11:64512273..64512337-第3页@RASGRP2
Hg19:：chr11:94964744..94964758+p1@ENST00000540692
Hg19:：chr12:103835454..103835475-p4@C12或f42
Hg19:：chr12:103835494..103835510-p5@C12orf42
Hg19:：chr12:12867280..12867310+电话：chr12:12867280..12867310
+
Hg19:：chr12:92539858..92539862+p1@uc001tca.2
Hg19:：chr12:92539926..92539990+p1@ENST00000499685
Hg19:：chr12:92540055..92540069+电话：chr12:92540055..92540069
+
Hg19:：chr13:103498907..103498922-电话：chr13:103498907..103498922
-
Hg19:：chr15:75081804..75081827-电话：chr15:75081804..75081827
-
Hg19:：chr15:89178835..89178856+p7@ISG20时
Hg19:：chr15:89178857..89178898+第3页@ISG20
Hg19:：chr17:26874766.26874781-p5@UNC119
Hg19:：chr17:38020516..38020544-p5@IKZF3
Hg19:：chr17:76128488..76128519-第4页@TMC6
Hg19:：chr19:16482478..16482486-电话：chr19:16482478..16482486
-
Hg19:：chr19:50004358..50004377-p2@MIR150
Hg19:：chr19:7413915..7413935+电话：chr19:7413915..7413935
+
Hg19:：chr1:157670686..157670730-p2@FCRL3
Hg19:：chr1:157670738..157670753-第3页@FCRL3
Hg19:：chr1:207085241..207085281-电话：chr1:207085241..207085281
-
Hg19:：chr1:207095279..207095310-第一页@传真3
Hg19:：chr1:207095324..207095357-第2页@传真3
Hg19:：chr1:207096529.207096554-第5页@传真3
Hg19:：chr1:207096713..207096727+电话：chr1:207096713..207096727
+
Hg19:：chr20:57698436..57698458+电话：chr20:57698458
+
Hg19:：chr20:62266805.62266812-电话：chr20:62266805..62266812
-
Hg19:：chr20:62273068..62273079-p10@STMN3
Hg19:：chr20:62273138..62273178-第5页@STMN3
Hg19:：chr2:234327537..234327560+第6页@DGKD
Hg19:：chr3:32433154..32433217+第3页@CMTM7
Hg19:：chr3:71355163..71355209-第5页@FOXP1
Hg19:：chr5:118668891..118668933+第5页@TNFAIP8
Hg19:：chr6:133084580..133084605-VNN2时为p2
Hg19:：chr6:24936227..24936236-第5页@FAM65B
Hg19:：chr6:26285304..26285323-HIST1H4H时的第12页
Hg19:：chr6:31540403..31540430-p1@LOC100287329
Hg19:：chr7:139929994..139930043+p@克：13992994…139930043
+
Hg19:：chr7:99819057..99819097+电话：chr7:99819057…99819097
+
Hg19:：chr8:134511587..134511621-p6@ST3GAL1
Hg19:：chr9:36144997..36145021-p@基督：36144997..36145021
-
Hg19:：chrX:134429952..134429971-p3@ZNF75D
Hg19:：chrX:78200673..78200687-p@chrX:78200673..78200687
-
Hg19:：chrX:78200857..78200909+p1@P2RY10


此共表达簇上的丰富路径<b>摘要：典型路径基因集是从Reactome、Wikipathys和KEGG中编译而来的。对于主要的信号通路，转录调控基因（下游靶点）是从Netpath获得的。综合起来，典型途径和下游靶点总计489个人类基因集。利用同源基因数据库通过同源性推断出相应的小家鼠基因集。通过超几何概率评估共表达簇中包括的489个经典途径和基因集中的每一个的富集度。然后，采用Benjamini-Hochberg方法对所得P值进行调整，以进行多重比较<br><b>分析师：Emmanuel Dimont链接到源数据集数据

p.值财务总监n基因n通道姓名
0.0001427065529831310.0451666240191609三133T细胞受体信号通路（Wikipaths）：WP69
7.05821870032124e-05号0.04467852437303344295IL-2向下注册目标（Netpath）：Netpath_14



此共表达簇上的丰富基因本体术语<b>摘要：共表达簇的GOStat分析结果。使用GOStat（PMID:14962934）和默认参数对启动子映射到至少两个不同基因的每个簇进行分析<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据

无GOStat结果

此共同表达集群上的丰富示例本体术语<b>摘要：</b>为了总结1000个样本中的启动子活性（TSS区域的表达谱），我们基于FANTOM5样本本体（FF本体）进行了富集分析。这里的问题是“在哪种类型的样本中启动子更活跃”。为了回答这个问题，我们使用Mann-Whitney秩和检验比较了与样本本体术语相关的样本和其余样本中的表达式（TPM）。为了总结在这个共表达集群中丰富的本体，我们对组成的所有启动子的平均表达谱进行了相同的分析<b> 分析师：Hideya Kawaji链接到源数据集单元格_数据<br>uberon_data（超级数据）<br><br>

单元格类型
本体术语p值n个
淋巴细胞1.33e-55页53
淋巴样祖细胞1.33e-55页53
淋巴系限制性祖细胞2.87e-54页52
有核细胞5.17e-53页55
白细胞1.94e-39号文件136
非鳞状白细胞2.02e-37页115
造血系限制性祖细胞2.00e-30岁120
成熟α-βT细胞2.36e-29号18
α-βT细胞2.36e-29号18
未成熟T细胞2.36电子2918
成熟T细胞2.36e-29号18
未成熟α-βT细胞2.36e-29号18
造血干细胞4.84e-28168
血管母细胞间充质细胞4.84e-28168
B系淋巴细胞6.02e-2724
祖B细胞6.02e-2724
造血细胞1.34e-25号机组177
造血低能祖细胞2.76e-24161
造血多能干祖细胞2.76e-24161
T细胞1.15e-2325
T前细胞1.15e-23页25
B电池1.25e-2014
CD8-阳性，α-βT细胞1.92e-18号机组11
CD4阳性，α-βT细胞2.13e-11日6
中间单核细胞3.79e-07日9
CD14-阳性，CD16-阳性单核细胞3.79e-07日9
原始T细胞9.73e-07号三
优步解剖
本体术语p值n个
血8.76e-15页15
血淋巴液8.76e-15页15
生物物质8.76e-15页15
造血器官3.87e-08年7
免疫器官3.87e-08年7
造血系统2007年5月1日98
血岛1.05e-07日98
溶血性软脑膜系统1.31e-07号108
胸腺4.83e-074
溶血性软脑膜系统腺体4.83e-074
胸腺区4.83e-074
咽腺4.83e-074
胸腺原基4.83e-074


此共表达簇上过度表达的TFBS（DNA）基序<b>摘要：</b>显示的值是该共表达簇中基序过度表达的p值。因此，较小的p值意味着强烈的过度代表性<b> 分析师：Michiel de Hoon链接到源数据数据<br><br>茉莉花图案<br>数据

新颖的图案



JASPAR图案

Motifs公司-log10（p值）
MA0003.1号机组0.017388
MA0004.1号机组0.333048
MA0006.1号机组0.234536
MA0007.1号机组0.876808
MA0009.1号机组0.756713
MA0014.1号0.597102
MA0017.1号0.312079
MA0019.1号0.298267
MA0024.1号机组0.590327
MA0025.1号文件0.982453
MA0027.1号机组1.7662
MA0028.1号机组0.0460597
MA0029.1号机组0.216921
MA0030.1型0.602396
MA0031.1号文件2.21548
电话0038.10.245663
MA0040.1型0.22078
MA0041.1号0.653748
MA0042.1号0.567488
MA0043.1号0.757231
MA0046.1号0.267991
MA0048.1号1.7409
马0050.10.132387
MA0051.1号0.0682529
MA0052.1号0.635267
MA0055.1号0.560601
马0056.10
MA0057.1号0.289703
MA0058.1号0.187307
MA0059.1号0.185595
马0060.10.245515
MA0061.1号0.441038
MA0063.1号0
MA0066.1号0.899742
MA0067.1号0.529198
MA0068.1号0.101199
马0069.10.732638
MA0070.1号0.257372
MA0071.1号0.0556134
MA0072.1号0.707234
MA0073.1号0.966412
MA0074.1号0.51581
MA0076.1号0.98182
MA0077.1号0.694833
MA0078.1号0.729893
MA0081.1号1.26097
MA0083.1号0.281174
MA0084.1号0.695499
MA0087.1号0.703294
MA0088.1号0.219244
马0089.10
MA0090.1号0.229679
MA0091.1号机组0.610215
MA0092.1号0.816938
MA0093.1号0.420362
马0095.10
马0098.10
MA0100.1型0.075437
MA0101.1号机组0.117887
MA0103.1号1.19122
MA0105.1号0.788969
MA0106.1号0.0870163
MA0107.1号0.125877
MA0108.2号0.967713
MA0109.1号0
MA0111.1号0.470228
MA0113.1号0.313585
MA0114.1号0.575644
MA0115.1号0.464275
MA0116.1号0.408271
MA0117.1号0.303182
马0119.10.0129611
MA0122.1号机组0.322548
MA0124.1号机组0.429905
MA0125.1号机组0.362554
MA0130.1号机组0
马0131.10.384838
MA0132.1号机组0
MA0133.1号机组0
MA0135.1号机组0.297838
MA0136.1号机组1.90944
MA0139.1号0.150236
MA0140.1号机组0.44418
MA0141.1号0.183298
MA0142.1号0.150759
MA0143.1号1.59314
MA0144.1号机组0.197368
MA0145.1号0.1252
MA0146.1号0.226882
MA0147.1号1.17617
MA0148.1号1.04091
MA0149.1号0.0514353
MA0062.2号1.62199
MA0035.2号0.44283
MA0039.2号5.26493
MA0138.2号机组0.362512
MA0002.2号机组0.717689
马0137.20.277891
MA0104.2号0.567911
MA0047.2号0.988232
MA0112.2号0.928748
MA0065.2号0.533795
MA0150.1号机组0.0879472
MA0151.1号0
MA0152.1号0.208064
MA0153.1号机组0.349438
MA0154.1号机组0.763515
MA0155.1号2.85041
MA0156.1号机组2.73457
MA0157.1号1.95087
MA0158.1号0
MA0159.1号机组0.422206
MA0160.1号0.0477329
MA0161.1号机组0
MA0162.1号机组0.185583
MA0163.1号机组0.353492
MA0164.1号机组1.64551
MA0080.2号2.5118
马0018.20.295242
MA0099.2号机组0.0571009
MA0079.2号2.26551
MA0102.2号机组0.729507
马0258.10.474019
马0259.10.448852
马0442.10



ENCODE TF ChIP-seq峰富集分析<b>摘要：</b>对于每个TF和每个共表达簇，使用Fisher精确检验将带有ENCODE TF ChIP信号的启动子数量与稳健集的其他启动子进行比较。Benjamini-Hochberg校正后，保留了ChIP显著富集（q<=0.05）的聚类<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据

（#promoters=该共表达簇中具有TF的ChIP信号的启动子数量）

TF公司#发起人丰富p值q值
BCL11A#53335116.639659705099525.56664771744241e-07号2.57473481382626e-05
BCLAF1号977473.224862410018150.00553807199974510.0250700317099986
CHD2#1106号102.200855922152520.0130322744598420.0462385416602609
EBF1号1879193.600486597549172.70249283007159e-07号1.39105790379422e-05号
ELF1#1997201.811956578215970.002962197311299230.0157897680291318
GATA1#262392.596654750940510.006727721148173810.0285950052496388
MEF2A#4205114.386713617150742.88179123592645e-050.000603754051933645
MEF2C#420887.031719913638141.58699131059788e-050.000371123568041944
NFKB1#4790232.685648058648051.61968458039418e-066.14673829548646e-05号
PAX5#5079141.98667909439340.007381490951806610.0305047298795398
PBX3#509083.730129819020280.001195053091432750.00810718738656347
POLR2A#5430411.873310217848536.97304015138524e-095.43070350761016e-07号
POU2F2#5452163.099957126040012.33354936079437e-05号0.000509115441178197
RAD21#5885型102.203198701160920.01294132403334750.0465179466776382
RDBP编号7936三9.806706637661160.003603461139133730.0182424565152684
SPI1号6688254.364001866235491.34287519443163e-111.6558269472402e-09
SREBF2号6721三27.88999547306470.0001790788414701220.0021719678462778
TAF1号6872251.778216109438990.0007179730170939880.00573669833465527
TBP编号6908221.735084151406820.002814118596580680.0154037595444596
TCF12号6938122.715182528217810.001077559157677460.00760862692641989
ZEB1编号693593.233955067189250.0015577425405251390.00988850093616934



共表达簇的相对表达<b>总结：</b>将共表达簇与FANTOM5样本进行比较，以获得相对表达<br><b>分析师：不适用<br><br>链接到数据源数据

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