全名:C266_acute_chronic_leukemia_small_绒毛膜癌_hepatoma_st
第一阶段CAGE峰值
此共表达簇上的丰富路径<b>摘要:典型路径基因集是从Reactome、Wikipathys和KEGG中编译而来的。对于主要的信号通路,转录调控基因(下游靶点)是从Netpath获得的。综合起来,典型途径和下游靶点总计489个人类基因集。利用同源基因数据库通过同源性推断出相应的小家鼠基因集。通过超几何概率评估共表达簇中包括的489个经典途径和基因集中的每一个的富集度。然后,采用Benjamini-Hochberg方法对所得P值进行调整,以进行多重比较<br><b>分析师:Emmanuel Dimont链接到源数据集数据
此共表达无结果
此共表达簇上的丰富基因本体术语<b>摘要:共表达簇的GOStat分析结果。使用GOStat(PMID:14962934)和默认参数对启动子映射到至少两个不同基因的每个簇进行分析<br><b>分析师:Erik Arner链接到源数据集数据
此共同表达集群上的丰富示例本体术语<b>摘要:</b>为了总结1000个样本中的启动子活性(TSS区域的表达谱),我们基于FANTOM5样本本体(FF本体)进行了富集分析。这里的问题是“在哪种类型的样本中启动子更活跃”。为了回答这个问题,我们使用Mann-Whitney秩和检验比较了与样本本体术语相关的样本和其余样本中的表达式(TPM)。为了总结在这个共表达集群中丰富的本体,我们对组成的所有启动子的平均表达谱进行了相同的分析<b> 分析师:Hideya Kawaji链接到源数据集疾病数据<br>
疾病
本体术语 | p值 | n个 |
髓系白血病 | 2008年7月41日 | 31 |
此共表达簇上过度表达的TFBS(DNA)基序<b>摘要:</b>显示的值是该共表达簇中基序过度表达的p值。因此,较小的p值意味着强烈的过度代表性<b> 分析师:Michiel de Hoon链接到源数据数据<br><br>茉莉花图案<br>数据
新颖的图案
JASPAR图案
Motifs公司 | -log10(p值) |
MA0003.1号机组 | 0.111394 |
MA0004.1号机组 | 0.0321488 |
MA0006.1号机组 | 0.00619213 |
MA0007.1号机组 | 0.516216 |
MA0009.1号机组 | 0.263756 |
MA0014.1号 | 9.83564电子05 |
MA0017.1号 | 0.487315 |
MA0019.1号 | 0.0819566 |
MA0024.1号机组 | 0.193834 |
MA0025.1号文件 | 0.3631 |
MA0027.1号机组 | 1.74826 |
MA0028.1号机组 | 0.239827 |
MA0029.1号机组 | 1.12232 |
MA0030.1型 | 0.198787 |
MA0031.1号文件 | 0.15963 |
电话0038.1 | 0.228762 |
MA0040.1型 | 0.209871 |
MA0041.1号 | 0.0369855 |
MA0042.1号 | 0.0289066 |
MA0043.1号 | 0.263979 |
MA0046.1号 | 0.256123 |
MA0048.1号 | 0.0627077 |
马0050.1 | 0.0291141 |
MA0051.1号 | 0.224229 |
MA0052.1号 | 0.609377 |
MA0055.1号 | 0.101147 |
马0056.1 | 0 |
MA0057.1号 | 0.162473 |
MA0058.1号 | 0.0134788 |
MA0059.1号 | 0.013294 |
马0060.1 | 0.720202 |
MA0061.1号 | 0.392691 |
MA0063.1号 | 0 |
MA0066.1号 | 2.36099 |
MA0067.1号 | 0.514146 |
MA0068.1号 | 0.151529 |
马0069.1 | 0.253439 |
MA0070.1号 | 1.27393 |
MA0071.1号 | 3.31611 |
MA0072.1号 | 1.26233 |
MA0073.1号 | 0.00846835 |
MA0074.1号 | 0.223426 |
MA0076.1号 | 0.919936 |
MA0077.1号 | 0.6681 |
MA0078.1号 | 0.340465 |
MA0081.1号 | 0.0634322 |
MA0083.1号 | 0.269067 |
MA0084.1号 | 0.679402 |
MA0087.1号 | 0.240948 |
MA0088.1号 | 0.181032 |
马0089.1 | 0 |
MA0090.1号 | 0.0824972 |
MA0091.1号机组 | 0.0328063 |
MA0092.1号 | 0.103168 |
MA0093.1号 | 0.00645236 |
马0095.1 | 0 |
马0098.1 | 0 |
MA0100.1型 | 0.522734 |
MA0101.1号机组 | 0.104492 |
MA0103.1号 | 0.195176 |
MA0105.1号 | 0.0397821 |
MA0106.1号 | 0.0803211 |
MA0107.1号 | 0.109939 |
MA0108.2号 | 0.477395 |
MA0109.1号 | 0 |
MA0111.1号 | 0.228735 |
MA0113.1号 | 0.0873401 |
MA0114.1号 | 0.0126519 |
MA0115.1号 | 0.449785 |
MA0116.1号 | 0.368435 |
MA0117.1号 | 0.290704 |
马0119.1 | 1.46638 |
MA0122.1号机组 | 0.833799 |
MA0124.1号机组 | 0.415762 |
MA0125.1号机组 | 0.349207 |
MA0130.1号机组 | 0 |
马0131.1 | 0.113217 |
MA0132.1号机组 | 0 |
MA0133.1号机组 | 0 |
MA0135.1号机组 | 1.42091 |
MA0136.1号机组 | 0.236422 |
MA0139.1号 | 0.495226 |
MA0140.1号机组 | 3.9567 |
MA0141.1号 | 8.90482 |
MA0142.1号 | 0.860025 |
MA0143.1号 | 0.613856 |
MA0144.1号机组 | 0.0871497 |
MA0145.1号 | 0.060301 |
MA0146.1号 | 0.0447471 |
MA0147.1号 | 0.0152484 |
MA0148.1号 | 0.350475 |
MA0149.1号 | 2.60366 |
MA0062.2号 | 0.240243 |
MA0035.2号 | 3.94993 |
MA0039.2号 | 0.00770712 |
MA0138.2号机组 | 0.342023 |
MA0002.2号机组 | 1.41774 |
马0137.2 | 0.00830828 |
MA0104.2号 | 0.0055454 |
MA0047.2号 | 0.261058 |
MA0112.2号 | 1.65992 |
MA0065.2号 | 0.16838 |
MA0150.1号机组 | 0.644059 |
MA0151.1号 | 0 |
MA0152.1号 | 0.1926 |
MA0153.1号机组 | 0.336269 |
MA0154.1号机组 | 0.853625 |
MA0155.1号 | 0.176093 |
MA0156.1号机组 | 0.256234 |
MA0157.1号 | 0.39953 |
MA0158.1号 | 0 |
MA0159.1号机组 | 2.1494 |
MA0160.1号 | 1.04202 |
MA0161.1号机组 | 0 |
MA0162.1号机组 | 0.015859 |
MA0163.1号机组 | 0.0853647 |
MA0164.1号机组 | 0.309505 |
MA0080.2号 | 0.871864 |
马0018.2 | 0.581793 |
MA0099.2号机组 | 1.15075 |
MA0079.2号 | 2017年6月3日-05日 |
MA0102.2号机组 | 0.713248 |
马0258.1 | 2.12315 |
马0259.1 | 0.0559863 |
马0442.1 | 0 |
ENCODE TF ChIP-seq峰富集分析<b>摘要:</b>对于每个TF和每个共表达簇,使用Fisher精确检验将带有ENCODE TF ChIP信号的启动子数量与稳健集的其他启动子进行比较。Benjamini-Hochberg校正后,保留了ChIP显著富集(q<=0.05)的聚类<br><b>分析师:Erik Arner链接到源数据集数据
(#promoters=该共表达簇中具有TF的ChIP信号的启动子数量)
TF公司 | #发起人 | 丰富 | p值 | q值 |
GATA1#2623 | 13 | 3.59763277284502 | 3.96023418025606e-05 | 0.000738576602771004 |
GATA2#2624 | 12 | 3.12120777148261 | 0.000318891361545543 | 0.00326452606434571 |
STAT2#6773 | 4 | 5.32765479072985 | 0.00673933989550124 | 0.0286432230230844 |
TAL1号6886 | 12 | 7.31476326794454 | 5.70523040920804e-08 | 3.56795544136095e-06 |
共表达簇的相对表达<b>总结:</b>将共表达簇与FANTOM5样本进行比较,以获得相对表达<br><b>分析师:不适用<br><br>链接到数据源数据