完整id:C251_gall_tonsil_trachea_CD14_salivary_throat_tongue
第一阶段CAGE峰值
此共表达簇上的丰富路径<b>摘要：典型路径基因集是从Reactome、Wikipathys和KEGG中编译而来的。对于主要的信号通路，转录调控基因（下游靶点）是从Netpath获得的。综合起来，典型途径和下游靶点总计489个人类基因集。利用同源基因数据库通过同源性推断出相应的小家鼠基因集。通过超几何概率评估共表达簇中包括的489个经典途径和基因集中的每一个的富集度。然后，采用Benjamini-Hochberg方法对所得P值进行调整，以进行多重比较<br><b>分析师：Emmanuel Dimont链接到源数据集数据
此共表达无结果
此共表达簇上的丰富基因本体术语<b>摘要：共表达簇的GOStat分析结果。使用GOStat（PMID:14962934）和默认参数对启动子映射到至少两个不同基因的每个簇进行分析<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据
此共同表达集群上的丰富示例本体术语<b>摘要：</b>为了总结1000个样本中的启动子活性（TSS区域的表达谱），我们基于FANTOM5样本本体（FF本体）进行了富集分析。这里的问题是“在哪种类型的样本中启动子更活跃”。为了回答这个问题，我们使用Mann-Whitney秩和检验比较了与样本本体术语相关的样本和其余样本中的表达式（TPM）。为了总结在这个共表达集群中丰富的本体，我们对组成的所有启动子的平均表达谱进行了相同的分析<b> 分析师：Hideya Kawaji链接到源数据集uberon_data（超级数据）<br>疾病数据<br>
此共表达簇上过度表达的TFBS（DNA）基序<b>摘要：</b>显示的值是该共表达簇中基序过度表达的p值。因此，较小的p值意味着强烈的过度代表性<b> 分析师：Michiel de Hoon链接到源数据数据<br><br>茉莉花图案<br>数据
新颖的图案
JASPAR图案
| Motifs公司 | -log10（p值） |
|---|
| MA0003.1号机组 | 0.374947 |
| MA0004.1号机组 | 0.510805 |
| MA0006.1号机组 | 0.522608 |
| MA0007.1号机组 | 10.1928 |
| MA0009.1号机组 | 0.247013 |
| MA0014.1号 | 3.6815电子-05 |
| MA0017.1号 | 0.957254 |
| MA0019.1号 | 2.50228 |
| MA0024.1号机组 | 0.179268 |
| MA0025.1号文件 | 0.344113 |
| MA0027.1号机组 | 1.7227 |
| MA0028.1号机组 | 0.206267 |
| MA0029.1号机组 | 0.558569 |
| MA0030.1型 | 0.184045 |
| MA0031.1号文件 | 0.146399 |
| 电话0038.1 | 0.0561953 |
| MA0040.1型 | 0.194748 |
| MA0041.1号 | 0.0315298 |
| MA0042.1号 | 0.0243105 |
| MA0043.1号 | 0.24723 |
| MA0046.1号 | 0.239588 |
| MA0048.1号 | 0.0837579 |
| 马0050.1 | 0.0244947 |
| MA0051.1号 | 0.0547588 |
| MA0052.1号 | 0.197173 |
| MA0055.1号 | 0.85053 |
| 马0056.1 | 0 |
| MA0057.1号 | 1.55379 |
| MA0058.1号 | 2.31311 |
| MA0059.1号 | 5.06651 |
| 马0060.1 | 0.000516773 |
| MA0061.1号 | 0.122917 |
| MA0063.1号 | 0 |
| MA0066.1号 | 0.20618 |
| MA0067.1号 | 1.23427 |
| MA0068.1号 | 0.594877 |
| 马0069.1 | 0.236979 |
| MA0070.1号 | 0.229464 |
| MA0071.1号 | 1.48939 |
| MA0072.1号 | 0.22647 |
| MA0073.1号 | 24.0992 |
| MA0074.1号 | 0.443106 |
| MA0076.1号 | 0.552661 |
| MA0077.1号 | 1.18148 |
| MA0078.1号 | 2.17157 |
| MA0081.1号 | 0.0107166 |
| MA0083.1号 | 0.252183 |
| MA0084.1号 | 0.656589 |
| MA0087.1号 | 0.224848 |
| MA0088.1号 | 1.33898 |
| 马0089.1 | 0 |
| MA0090.1号 | 1.64916 |
| MA0091.1号机组 | 0.115952 |
| MA0092.1号 | 0.426145 |
| MA0093.1号 | 1.07299 |
| 马0095.1 | 0 |
| 马0098.1 | 0 |
| MA0100.1型 | 1.25551 |
| MA0101.1号机组 | 0.0290862 |
| MA0103.1号 | 1.67902 |
| MA0105.1号 | 0.323545 |
| MA0106.1号 | 5.31261 |
| MA0107.1号 | 0.30552 |
| MA0108.2号 | 0.144705 |
| MA0109.1号 | 0 |
| MA0111.1号 | 1.32154 |
| MA0113.1号 | 0.959234 |
| MA0114.1号 | 0.453617 |
| MA0115.1号 | 0.42937 |
| MA0116.1号 | 2.30531 |
| MA0117.1号 | 0.273271 |
| 马0119.1 | 0.996978 |
| MA0122.1号机组 | 0.291885 |
| MA0124.1号机组 | 0.395861 |
| MA0125.1号机组 | 0.330489 |
| MA0130.1号机组 | 0 |
| 马0131.1 | 0.684278 |
| MA0132.1号机组 | 0 |
| MA0133.1号机组 | 0 |
| MA0135.1号机组 | 0.268144 |
| MA0136.1号机组 | 0.0586412 |
| MA0139.1号 | 0.583451 |
| MA0140.1号机组 | 0.16556 |
| MA0141.1号 | 0.756874 |
| MA0142.1号 | 0.129252 |
| MA0143.1号 | 0.0779387 |
| MA0144.1号机组 | 0.0698001 |
| MA0145.1号 | 5.09337 |
| MA0146.1号 | 3.48773 |
| MA0147.1号 | 2.34686 |
| MA0148.1号 | 0.314662 |
| MA0149.1号 | 0.0402234 |
| MA0062.2号 | 0.196268 |
| MA0035.2号 | 0.0428087 |
| MA0039.2号 | 3.12449 |
| MA0138.2号机组 | 5.07114 |
| MA0002.2号机组 | 4.81045 |
| 马0137.2 | 0.00650365 |
| MA0104.2号 | 1.36674 |
| MA0047.2号 | 0.0666578 |
| MA0112.2号 | 5.22272 |
| MA0065.2号 | 0.269935 |
| MA0150.1号机组 | 0.0141424 |
| MA0151.1号 | 0 |
| MA0152.1号 | 0.0449747 |
| MA0153.1号机组 | 0.317813 |
| MA0154.1号机组 | 13.1065 |
| MA0155.1号 | 0.192339 |
| MA0156.1号机组 | 0.00670135 |
| MA0157.1号 | 1.2199 |
| MA0158.1号 | 0 |
| MA0159.1号机组 | 0.72134 |
| MA0160.1号 | 0.340065 |
| MA0161.1号机组 | 0 |
| MA0162.1号机组 | 0.319829 |
| MA0163.1号机组 | 1.80066 |
| MA0164.1号机组 | 0.0830315 |
| MA0080.2号 | 0.533766 |
| 马0018.2 | 0.25124 |
| MA0099.2号机组 | 0.0450826 |
| MA0079.2号 | 0.148297 |
| MA0102.2号机组 | 0.690195 |
| 马0258.1 | 1.92676 |
| 马0259.1 | 2.04356 |
| 马0442.1 | 0 |
ENCODE TF ChIP-seq峰富集分析<b>摘要：</b>对于每个TF和每个共表达簇，使用Fisher精确检验将带有ENCODE TF ChIP信号的启动子数量与稳健集的其他启动子进行比较。Benjamini-Hochberg校正后，保留了ChIP显著富集（q<=0.05）的聚类<br><b>分析师：Erik Arner链接到源数据集数据
没有此群集的分析结果
共表达簇的相对表达<b>总结：</b>将共表达簇与FANTOM5样本进行比较，以获得相对表达<br><b>分析师：不适用<br><br>链接到数据源数据
